Гомолог белка инициации транскрипции SPT3

СУПТ3H
Идентификаторы
Псевдонимы	SUPT3H , SPT3, SPT3L, гомолог SPT3, комплексный компонент SAGA и STAGA
Внешние идентификаторы	Опустить : 602947 ; МГИ : 1923723 ; Гомологен : 121570 ; Генные карты : SUPT3H ; OMA : SUPT3H — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	45,377,953 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	45,430,177 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gonad; ; sperm; ; testicle; ; oocyte; ; left testis; ; sural nerve; ; right testis; ; cartilage tissue; ; ventricular zone; ; left ovary;
	Top expressed in
	hand; ; interventricular septum; ; muscle of thigh; ; primary oocyte; ; zygote; ; seminiferous tubule; ; spermatid; ; otolith organ; ; granulocyte; ; utricle;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein heterodimerization activity; histone acetyltransferase activity; transcription coactivator activity; DNA binding; transcription coregulator activity;
Cellular component	transcription factor TFTC complex; nucleus; nucleoplasm; SAGA complex; transcription factor TFIID complex;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription, DNA-templated; histone deubiquitination; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; histone H3 acetylation; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8464
	109115
	ENSG00000196284
	ENSMUSG00000038954
	О75486
	н/д
showНМ_001261823 ; НМ_003599 ; НМ_181356 ; НМ_001350324 ; НМ_001350325 ;
	NM_001350326; NM_001350327; NM_001350329
	НМ_178652 ; НМ_001357320
showНП_001248752 ; НП_003590 ; НП_852001 ; НП_001337253 ; НП_001337254 ;
	NP_001337255; NP_001337256; NP_001337258
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Гомолог белка инициации транскрипции SPT3 — это белок , который у человека кодируется SUPT3H геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что гомолог белка инициации транскрипции SPT3 взаимодействует с GCN5L2 . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} ТАФ6Л , ^{[ 9 ]} ТАДА3Л , ^{[ 9 ]} ТАФ5Л , ^{[ 9 ]} СФ3Б3 , ^{[ 9 ]} СУПТ7Л , ^{[ 9 ]} Мик , ^{[ 10 ]} ТАФ9 , ^{[ 9 ]} ассоциированный с доменом трансформации/транскрипции , Белок , ^{[ 9 ]} ТАФ12 , ^{[ 9 ]} ТАФ10 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} ТАФ4 ^{[ 8 ]} и ДДБ1 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196284 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038954 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Огрызко В.В., Котани Т., Чжан X, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян XJ, Ховард Б.Х., Цинь Дж., Накатани Ю. (июль 1998 г.). «Гистоноподобные TAF в комплексе гистон-ацетилазы PCAF» . Клетка . 94 (1): 35–44. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . ПМИД 9674425 . S2CID 18942972 .
^ Мартинес Э., Кунду Т.К., Фу Дж., Родер Р.Г. (сентябрь 1998 г.). «Комплекс ацетилазы человека SPT3-TAFII31-GCN5-L, отличный от транскрипционного фактора IID» . Журнал биологической химии . 273 (37): 23781–5. дои : 10.1074/jbc.273.37.23781 . ПМИД 9726987 .
^ «Ген Энтрез: супрессор SUPT3H гомолога Ty 3 (S. cerevisiae)» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Брэнд М., Моггс Дж.Г., Улад-Абдельгани М., Лежен Ф., Дилворт Ф.Дж., Стивенин Дж., Альмузни Г., Тора Л. (июнь 2001 г.). «Поврежденный УФ-излучением ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждения ДНК с ацетилированием нуклеосомы» . Журнал ЭМБО . 20 (12): 3187–96. дои : 10.1093/emboj/20.12.3187 . ПМК 150203 . ПМИД 11406595 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Хаит Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами, связывающими повреждение ДНК, in vivo» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (20): 6782–95. дои : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ПМК 99856 . ПМИД 11564863 .
^ Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .

Дальнейшее чтение

Ю Дж., Мэдисон Дж. М., Мундлос С., Уинстон Ф., Олсен Б. Р. (октябрь 1998 г.). «Характеристика человеческого гомолога транскрипционного фактора Saccharomyces cerevisiae spt3 (SUPT3H)». Геномика . 53 (1): 90–6. дои : 10.1006/geno.1998.5500 . ПМИД 9787080 .
Василев А., Ямаути Дж., Котани Т., Привес С., Авантаджиати М.Л., Цинь Дж., Накатани Ю. (декабрь 1998 г.). «Субъединица гистон-ацетилазного комплекса PCAF массой 400 кДа принадлежит к суперсемейству ATM» . Молекулярная клетка . 2 (6): 869–75. дои : 10.1016/S1097-2765(00) 80301-9 ПМИД 9885574 .
Брэнд М., Ямамото К., Стауб А., Тора Л. (июнь 1999 г.). «Идентификация субъединиц комплекса, не содержащего ТАТА-связывающий белок, содержащего TAFII, предполагает их роль в ацетилировании нуклеосом и передаче сигнала» . Журнал биологической химии . 274 (26): 18285–9. дои : 10.1074/jbc.274.26.18285 . ПМИД 10373431 .
Спик М (март 2001 г.). «Антисмысловой промотор ретротранспозона L1 человека управляет транскрипцией соседних клеточных генов» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (6): 1973–85. дои : 10.1128/MCB.21.6.1973-1985.2001 . ПМК 86790 . ПМИД 11238933 .
Брэнд М., Моггс Дж.Г., Улад-Абдельгани М., Лежен Ф., Дилворт Ф.Дж., Стивенин Дж., Альмузни Г., Тора Л. (июнь 2001 г.). «Поврежденный УФ-излучением ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждения ДНК с ацетилированием нуклеосомы» . Журнал ЭМБО . 20 (12): 3187–96. дои : 10.1093/emboj/20.12.3187 . ПМК 150203 . ПМИД 11406595 .
Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Хаит Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами, связывающими повреждение ДНК, in vivo» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (20): 6782–95. дои : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ПМК 99856 . ПМИД 11564863 .
Чавушоглу Н., Бранд М., Тора Л., Ван Дорселер А. (февраль 2003 г.). «Новые субъединицы транскрипционного комплекса, свободного от TATA-связывающего белка, содержащего TAFII, идентифицированные с помощью матричной лазерной десорбции / ионизации и времяпролетной масс-спектрометрии после одномерного гель-электрофореза». Протеомика . 3 (2): 217–23. дои : 10.1002/pmic.200390030 . ПМИД 12601814 . S2CID 6035986 .
Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196284 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038954 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9674425-5] Огрызко В.В., Котани Т., Чжан X, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян XJ, Ховард Б.Х., Цинь Дж., Накатани Ю. (июль 1998 г.). «Гистоноподобные TAF в комплексе гистон-ацетилазы PCAF» . Клетка . 94 (1): 35–44. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . ПМИД 9674425 . S2CID 18942972 .

[pmid9726987-6] Мартинес Э., Кунду Т.К., Фу Дж., Родер Р.Г. (сентябрь 1998 г.). «Комплекс ацетилазы человека SPT3-TAFII31-GCN5-L, отличный от транскрипционного фактора IID» . Журнал биологической химии . 273 (37): 23781–5. дои : 10.1074/jbc.273.37.23781 . ПМИД 9726987 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: супрессор SUPT3H гомолога Ty 3 (S. cerevisiae)» .

[pmid11406595-8] Jump up to: ^а ^б ^с Брэнд М., Моггс Дж.Г., Улад-Абдельгани М., Лежен Ф., Дилворт Ф.Дж., Стивенин Дж., Альмузни Г., Тора Л. (июнь 2001 г.). «Поврежденный УФ-излучением ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждения ДНК с ацетилированием нуклеосомы» . Журнал ЭМБО . 20 (12): 3187–96. дои : 10.1093/emboj/20.12.3187 . ПМК 150203 . ПМИД 11406595 .

[pmid11564863-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Хаит Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами, связывающими повреждение ДНК, in vivo» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (20): 6782–95. дои : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ПМК 99856 . ПМИД 11564863 .

[pmid12660246-10] Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]