TAF6L

TAF6L
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF6L , PAF65A, TATA-BOX-связывающий белок, связанный с фактором 6, подобным
Внешние идентификаторы	Омим : 602946 ; MGI : 2444957 ; Гомологен : 4728 ; GeneCards : TAF6L ; OMA : TAF6L - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	62,787,342 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	8,763,781 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right lobe of thyroid gland; ; right lobe of liver; ; apex of heart; ; left lobe of thyroid gland; ; anterior pituitary; ; left uterine tube; ; right ovary; ; body of pancreas; ; gastrocnemius muscle; ; muscle of thigh;
	Top expressed in
	saccule; ; tail of embryo; ; otic vesicle; ; spermatid; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; genital tubercle; ; embryo; ; yolk sac; ; right kidney;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA binding; transcription coactivator activity; protein binding; protein heterodimerization activity; histone acetyltransferase activity; DNA-binding transcription factor activity;
Cellular component	histone deacetylase complex; extracellular exosome; nucleoplasm; nucleus; SAGA complex; transcription factor TFIID complex; SLIK (SAGA-like) complex;
Biological process	regulation of transcription by RNA polymerase II; chromatin remodeling; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of DNA-binding transcription factor activity; histone H3 acetylation; transcription, DNA-templated; DNA-templated transcription, initiation; chromatin organization; transcription by RNA polymerase II; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; positive regulation of nucleic acid-templated transcription; RNA polymerase II preinitiation complex assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10629
	225895
	ENSG00000162227
	Ensmusg00000003680
	Q9Y6J9
	Q8R2K4
	NM_006473
	NM_001177798 ; NM_146092
	NP_006464
	NP_001171269 ; NP_666204
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Таф6-подобная РНК-полимераза II P300/CBP-ассоциированный фактор, связанный с фактором 65 кДа, субъединица 6L 6L является ферментом , который у людей кодируется TAF6L геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Инициирование транскрипции с помощью РНК -полимеразы II требует активности более 70 полипептидов. Белок, который координирует эти действия, является транскрипционным фактором IID (TFIID), который связывается с промотором ядра для правильного расположения полимеразы, служит каркасом для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса и действует в качестве канала для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, функционировать в распознавании промотора или изменять общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сложного сборки и инициации транскрипции. Этот ген кодирует белок, который является компонентом комплекса гистон ацетилазы PCAF и структурно сходным с одним из гистоноподобных TAF, TAF6. Комплекс гистон ацетилазы PCAF, который состоит из более чем 20 полипептидов, некоторые из которых представляют собой TAF, требуется для миогенной транскрипции и дифференцировки. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TAF6L взаимодействует с TAF9 ^{[ 7 ]} и транскрипционная инициация белка SPT3 гомолог . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000162227 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003680 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Огризко В.В., Котани Т., Чжан Х, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян Х.Дж., Говард Б.Х., Цинь Дж., Накатани Ю (август 1998). «Гистоноподобные TAF в комплексе гистон ацетилазы PCAF» . Клетка . 94 (1): 35–44. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81219-2 . PMID 9674425 . S2CID 18942972 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: TAF6L TAF6-подобная РНК-полимераза II, фактор, связанный с коэффициентом P300/CBP (PCAF), 65 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (октябрь 2001 г.). «Человеческий комплекс Staga представляет собой хроматин-ацетилирующий транскрипционный коактиватор, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и повреждения ДНК in vivo» . Мол Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. doi : 10.1128/mcb.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .

Дальнейшее чтение

Struhl K, Moqtaderi Z (1998). «Тафы в шляпе» . Клетка . 94 (1): 1–4. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81213-1 . PMID 9674419 . S2CID 14869072 .
Бренд М., Моггс Дж.Г., Оулад-Абдельгани М., Лежен Ф., Дилворт Ф.Дж., Стивенин Дж., Альмузни Г., Тора Л (2001). «Ультрафиолетовый ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждения ДНК с ацетилированием нуклеосом» . Embo j . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093/emboj/20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (2001). «Человеческий комплекс Staga представляет собой хроматин-ацетилирующий транскрипционный коактиватор, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и повреждения ДНК in vivo» . Мол Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. doi : 10.1128/mcb.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .
Cavusoglu N, Brand M, Tora L, Van Dorsselaer A (2003). «Новые субъединицы транскрипционного транскрипционного транскрипционного комплекса, не содержащего TATA-связывающего белка. Протеомика . 3 (2): 217–23. doi : 10.1002/pmic.200390030 . PMID 12601814 . S2CID 6035986 .
Pitkans J, Rebane A, Rowel J, Merwell A, Strible P, Möll K, Sare M, Heikkila J, Docas V, Marx A, Petersson P (2005). «Медная активация или транскрипция аутоиммунным регулятором Aire и CBP». Бим. Биофиз. Отдых. Коммуникация . 333 (3): 944–53. doi : 10,1016/j.bbrc.birc.2005.05,187 . PMID 15964547 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Ламошас Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х. , Смоляр А., Босак С., Процессов Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Лим Дж., Хао Т, Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаси А.Л., Видаль М., Зогби Х. Х. Х. (2006). «Белковая сеть взаимодействия для унаследованных человеческих атаксий и расстройства дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 11 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000162227 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003680 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9674425-5] Огризко В.В., Котани Т., Чжан Х, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян Х.Дж., Говард Б.Х., Цинь Дж., Накатани Ю (август 1998). «Гистоноподобные TAF в комплексе гистон ацетилазы PCAF» . Клетка . 94 (1): 35–44. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81219-2 . PMID 9674425 . S2CID 18942972 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: TAF6L TAF6-подобная РНК-полимераза II, фактор, связанный с коэффициентом P300/CBP (PCAF), 65 кДа» .

[pmid11564863-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (октябрь 2001 г.). «Человеческий комплекс Staga представляет собой хроматин-ацетилирующий транскрипционный коактиватор, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и повреждения ДНК in vivo» . Мол Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. doi : 10.1128/mcb.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]