Белок, связанный с доменом трансформации/транскрипции

ЛОВУШКА
Идентификаторы
Псевдонимы	TRRAP , PAF350/400, PAF400, STAF40, TR-AP, Tra1, белок, связанный с доменом трансформации/транскрипции, LAW, DFNA75
Внешние идентификаторы	Опустить : 603015 ; МГИ : 2153272 ; Гомологен : 39246 ; GeneCards : TRRAP ; OMA : TRRAP — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	99,050,831 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	144,796,588 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; sural nerve; ; ganglionic eminence; ; anterior pituitary; ; buccal mucosa cell; ; skin of thigh; ; testicle; ; stromal cell of endometrium; ; right hemisphere of cerebellum; ; granulocyte;
	Top expressed in
	yolk sac; ; Rostral migratory stream; ; ventricular zone; ; internal carotid artery; ; neural layer of retina; ; anterior amygdaloid area; ; stroma of bone marrow; ; maxillary prominence; ; mandibular prominence; ; nucleus accumbens;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transcription coregulator activity; protein binding; thiol-dependent deubiquitinase; kinase activity;
Cellular component	Golgi apparatus; transcription factor TFTC complex; NuA4 histone acetyltransferase complex; nucleoplasm; nucleus; Swr1 complex; histone acetyltransferase complex; SAGA complex;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; histone H2A acetylation; transcription, DNA-templated; histone deubiquitination; histone H4 acetylation; phosphorylation; beta-catenin-TCF complex assembly; histone acetylation; protein deubiquitination; DNA repair; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8295
	100683
	ENSG00000196367
	ENSMUSG00000045482
	Q9Y4A5
	Q80YV3
	НМ_003496 ; НМ_001244580 ; НМ_001375524
	НМ_001081362 ; НМ_133901
	НП_001231509 ; НП_003487 ; НП_001362453
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок, ассоциированный с доменом трансформации/транскрипции , также известный как TRRAP , представляет собой белок , который у человека кодируется TRRAP геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} TRRAP принадлежит к семейству белков киназ, родственных фосфатидилинозитол-3-киназам .

Функция

TRRAP — белок-адаптер , который обнаруживается в различных мультибелковых комплексах хроматина с активностью гистон-ацетилтрансферазы (HAT), которая, в свою очередь, отвечает за активацию эпигенетической транскрипции . TRRAP играет центральную роль в активации транскрипции MYC (c-Myc), а также участвует в трансформации клеток с помощью MYC. Он необходим для активации транскрипции, опосредованной p53/ TP53- , E2F1- и E2F4 . Он также участвует в активации транскрипции, опосредованной аденовирусом Е1А, вирусным онкобелком , который дерегулирует транскрипцию ключевых генов. ^{[ 7 ]}

TRRAP также необходим для митотической контрольной точки и нормального развития клеточного цикла . Комплекс MRN (состоящий из MRE11 , RAD50 и NBS1 ) участвует в обнаружении и восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК (DSB). TRRAP связывается с комплексом MRN, и когда TRRAP удаляется, комплекс демонстрирует снижение активности соединения концов кДНК. Следовательно, TRRAP может функционировать как связующее звено между репарацией DSB и ремоделированием хроматина. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что белок, связанный с доменом трансформации/транскрипции, взаимодействует с:

ACTL6A , ^{[ 10 ]}
EP400ЭП400 ^{[ 11 ]}
МАКС , ^{[ 5 ]}^{[ 12 ]}
Мик , ^{[ 5 ]}^{[ 10 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}
ПКАФ , ^{[ 11 ]}^{[ 13 ]}
СУПТ3Х , ^{[ 14 ]} и
ТАФ9 . ^{[ 14 ]} и

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196367 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045482 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с МакМахон С.Б., Ван Бускирк Х.А., Дуган К.А., Коупленд Т.Д., Коул, доктор медицинских наук (август 1998 г.). «Новый белок TRRAP, родственный ATM, является важным кофактором онкопротеинов c-Myc и E2F» . Клетка . 94 (3): 363–74. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81479-8 . ПМИД 9708738 . S2CID 17693834 .
^ Василев А., Ямаути Дж., Котани Т., Привес С., Авантаджиати М.Л., Цинь Дж., Накатани Ю. (декабрь 1998 г.). «Субъединица гистон-ацетилазного комплекса PCAF массой 400 кДа принадлежит к суперсемейству ATM» . Мол. Ячейка 2 (6): 869–75. дои : 10.1016/S1097-2765(00) 80301-9 ПМИД 9885574 .
^ Мурр Р., Васьер Т., Саван С., Шукла В., Герцег З. (август 2007 г.). «Оркестровка процессов, основанных на хроматине: помните о TRRAP». Онкоген . 26 (37): 5358–72. дои : 10.1038/sj.onc.1210605 . ПМИД 17694078 . S2CID 22598445 .
^ Роберт Ф., Харди С., Надь З., Балдейрон С., Мурр Р., Дери Ю., Массон Дж. Я., Пападопуло Д., Герцег З., Тора Л. (январь 2006 г.). «Транскрипционный кофактор гистонацетилтрансферазы TRRAP связывается с комплексом репарации MRN и играет роль в восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК» . Мол. Клетка. Биол . 26 (2): 402–12. дои : 10.1128/MCB.26.2.402-412.2006 . ПМЦ 1346889 . ПМИД 16382133 .
^ Герцег З., Ван ЗК (март 2005 г.). «Свидание при митозе: ловушка в хроматине» . Клеточный цикл . 4 (3): 383–7. дои : 10.4161/cc.4.3.1546 . ПМИД 15711126 .
^ Jump up to: ^а ^б Парк Дж., Вуд Массачусетс, Коул Доктор медицины (март 2002 г.). «BAF53 образует отдельные ядерные комплексы и действует как критический ядерный кофактор, взаимодействующий с c-Myc, для онкогенной трансформации» . Мол. Клетка. Биол . 22 (5): 1307–16. дои : 10.1128/mcb.22.5.1307-1316.2002 . ПМЦ 134713 . ПМИД 11839798 .
^ Jump up to: ^а ^б Фукс М., Гербер Дж., Драпкин Р., Сиф С., Икура Т., Огрызко В., Лейн В.С., Накатани Ю., Ливингстон Д.М. (август 2001 г.). «Комплекс p400 является важной мишенью трансформации E1A» . Клетка . 106 (3): 297–307. дои : 10.1016/s0092-8674(01)00450-0 . ПМИД 11509179 . S2CID 15634637 .
^ Jump up to: ^а ^б МакМахон С.Б., Вуд Массачусетс, Коул Мэриленд (январь 2000 г.). «Незаменимый кофактор TRRAP рекрутирует гистон-ацетилтрансферазу hGCN5 в c-Myc» . Мол. Клетка. Биол . 20 (2): 556–62. дои : 10.1128/mcb.20.2.556-562.2000 . ПМК 85131 . ПМИД 10611234 .
^ Jump up to: ^а ^б Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .
^ Jump up to: ^а ^б Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Хаит Б.Т., Редер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами, связывающими повреждение ДНК, in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. дои : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ПМК 99856 . ПМИД 11564863 .

Дальнейшее чтение

Герцег З., Ван ZQ (2006). «Свидание при митозе: ловушка в хроматине» . Клеточный цикл . 4 (3): 383–7. дои : 10.4161/cc.4.3.1546 . ПМИД 15711126 .
Мурр Р., Васьер Т., Саван С., Шукла В., Герцег З. (2007). «Оркестровка процессов, основанных на хроматине: помните о TRRAP». Онкоген . 26 (37): 5358–72. дои : 10.1038/sj.onc.1210605 . ПМИД 17694078 . S2CID 22598445 .
МакМахон С.Б., Ван Баскирк Х.А., Дуган К.А., Коупленд Т.Д., Коул, доктор медицинских наук (1998). «Новый белок TRRAP, родственный ATM, является важным кофактором онкопротеинов c-Myc и E2F» . Клетка . 94 (3): 363–74. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81479-8 . ПМИД 9708738 . S2CID 17693834 .
Василев А, Ямаути Дж, Котани Т, Привес С, Авантаджиати МЛ, Цинь Дж, Накатани Ю (1999). «Субъединица гистон-ацетилазного комплекса PCAF массой 400 кДа принадлежит к суперсемейству ATM» . Мол. Ячейка 2 (6): 869–75. дои : 10.1016/S1097-2765(00) 80301-9 ПМИД 9885574 .
Брэнд М., Ямамото К., Стауб А., Тора Л. (1999). «Идентификация субъединиц комплекса, не содержащего ТАТА-связывающий белок, содержащего TAFII, предполагает их роль в ацетилировании нуклеосом и передаче сигнала» . Ж. Биол. Хим . 274 (26): 18285–9. дои : 10.1074/jbc.274.26.18285 . ПМИД 10373431 .
МакМахон С.Б., Вуд Массачусетс, Коул Мэриленд (2000). «Незаменимый кофактор TRRAP привлекает гистон-ацетилтрансферазу hGCN5 к c-Myc» . Мол. Клетка. Биол . 20 (2): 556–62. дои : 10.1128/MCB.20.2.556-562.2000 . ПМК 85131 . ПМИД 10611234 .
Икура Т., Огрызко В.В., Григорьев М., Гройсман Р., Ван Дж., Хорикоши М., Скалли Р., Цинь Дж., Накатани Ю. (2000). «Участие комплекса гистонацетилазы TIP60 в репарации ДНК и апоптозе» . Ячейка 102 (4): 463–73. дои : 10.1016/S0092-8674(00) 00051-9 ПМИД 10966108 . S2CID 18047169 .
Брэнд М., Моггс Дж.Г., Улад-Абдельгани М., Лежен Ф., Дилворт Ф.Дж., Стивенин Дж., Альмузни Г., Тора Л. (2001). «Поврежденный УФ-излучением ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждения ДНК с ацетилированием нуклеосомы» . ЭМБО Дж . 20 (12): 3187–96. дои : 10.1093/emboj/20.12.3187 . ПМК 150203 . ПМИД 11406595 .
Ли Ю.Дж., Чунг Т.С., Юн Ю.С., Ли М.С., Хан Ш., Сон Г.Дж., Ан К.Дж. (2001). «Роль функциональной МР-томографии у пациентов с ишемией зрительной коры» . Американский журнал нейрорадиологии . 22 (6): 1043–9. ПМЦ 7974786 . ПМИД 11415895 .
Лэнг С.Э., МакМахон С.Б., Коул, доктор медицинских наук, Hearing P (2001). «Активация транскрипции E2F требует кофакторов TRRAP и GCN5» . Ж. Биол. Хим . 276 (35): 32627–34. дои : 10.1074/jbc.M102067200 . ПМИД 11418595 .
Пак Дж., Кунджибетту С., МакМахон С.Б., Коул, доктор медицинских наук (2001). «ATM-связанный домен TRRAP необходим для рекрутирования гистон-ацетилтрансферазы и Myc-зависимого онкогенеза» . Генс Дев . 15 (13): 1619–24. дои : 10.1101/gad.900101 . ПМК 312730 . ПМИД 11445536 .
Фукс М., Гербер Дж., Драпкин Р., Сиф С., Икура Т., Огрызко В., Лейн В.С., Накатани Ю., Ливингстон Д.М. (2001). «Комплекс p400 является важной мишенью трансформации E1A» . Клетка . 106 (3): 297–307. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00450-0 . ПМИД 11509179 . S2CID 15634637 .
Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Хаит Б.Т., Редер Р.Г. (2001). «Человеческий комплекс STAGA представляет собой хроматин-ацетилирующий коактиватор транскрипции, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами, связывающими повреждение ДНК, in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. дои : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ПМК 99856 . ПМИД 11564863 .
Парк Дж., Вуд Массачусетс, Коул Мэриленд (2002). «BAF53 образует различные ядерные комплексы и действует как критический ядерный кофактор, взаимодействующий с c-Myc, для онкогенной трансформации» . Мол. Клетка. Биол . 22 (5): 1307–16. дои : 10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002 . ПМЦ 134713 . ПМИД 11839798 .
Никифоров М.А., Чандриани С., Парк Дж., Котенко И., Матеос Д., Джонссон А., МакМахон С.Б., Коул М.Д. (2002). «TRRAP-зависимая и TRRAP-независимая активация транскрипции онкопротеинами семейства Myc» . Мол. Клетка. Биол . 22 (14): 5054–63. дои : 10.1128/MCB.22.14.5054-5063.2002 . ПМК 139788 . ПМИД 12077335 .
Ард П.Г., Чаттерджи С., Кунджибетту С., Адсайд Л.Р., Гралински Л.Е., МакМахон С.Б. (2002). «Регуляция транскрипции онкогена mdm2 с помощью p53 требует наличия ацетилтрансферазных комплексов TRRAP» . Мол. Клетка. Биол . 22 (16): 5650–61. дои : 10.1128/MCB.22.16.5650-5661.2002 . ПМЦ 133988 . ПМИД 12138177 .
Чавушоглу Н., Бранд М., Тора Л., Ван Дорселер А. (2003). «Новые субъединицы транскрипционного комплекса, свободного от TATA-связывающего белка, содержащего TAFII, идентифицированные с помощью матричной лазерной десорбции / ионизации и времяпролетной масс-спектрометрии после одномерного гель-электрофореза». Протеомика . 3 (2): 217–23. дои : 10.1002/pmic.200390030 . ПМИД 12601814 . S2CID 6035986 .
Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (2003). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196367 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045482 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9708738-5] Jump up to: ^а ^б ^с МакМахон С.Б., Ван Бускирк Х.А., Дуган К.А., Коупленд Т.Д., Коул, доктор медицинских наук (август 1998 г.). «Новый белок TRRAP, родственный ATM, является важным кофактором онкопротеинов c-Myc и E2F» . Клетка . 94 (3): 363–74. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81479-8 . ПМИД 9708738 . S2CID 17693834 .

[pmid9885574-6] Василев А., Ямаути Дж., Котани Т., Привес С., Авантаджиати М.Л., Цинь Дж., Накатани Ю. (декабрь 1998 г.). «Субъединица гистон-ацетилазного комплекса PCAF массой 400 кДа принадлежит к суперсемейству ATM» . Мол. Ячейка 2 (6): 869–75. дои : 10.1016/S1097-2765(00) 80301-9 ПМИД 9885574 .

[pmid17694078-7] Мурр Р., Васьер Т., Саван С., Шукла В., Герцег З. (август 2007 г.). «Оркестровка процессов, основанных на хроматине: помните о TRRAP». Онкоген . 26 (37): 5358–72. дои : 10.1038/sj.onc.1210605 . ПМИД 17694078 . S2CID 22598445 .

[pmid16382133-8] Роберт Ф., Харди С., Надь З., Балдейрон С., Мурр Р., Дери Ю., Массон Дж. Я., Пападопуло Д., Герцег З., Тора Л. (январь 2006 г.). «Транскрипционный кофактор гистонацетилтрансферазы TRRAP связывается с комплексом репарации MRN и играет роль в восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК» . Мол. Клетка. Биол . 26 (2): 402–12. дои : 10.1128/MCB.26.2.402-412.2006 . ПМЦ 1346889 . ПМИД 16382133 .

[pmid15711126-9] Герцег З., Ван ЗК (март 2005 г.). «Свидание при митозе: ловушка в хроматине» . Клеточный цикл . 4 (3): 383–7. дои : 10.4161/cc.4.3.1546 . ПМИД 15711126 .

[pmid11839798-10] Jump up to: ^а ^б Парк Дж., Вуд Массачусетс, Коул Доктор медицины (март 2002 г.). «BAF53 образует отдельные ядерные комплексы и действует как критический ядерный кофактор, взаимодействующий с c-Myc, для онкогенной трансформации» . Мол. Клетка. Биол . 22 (5): 1307–16. дои : 10.1128/mcb.22.5.1307-1316.2002 . ПМЦ 134713 . ПМИД 11839798 .

[pmid11509179-11] Jump up to: ^а ^б Фукс М., Гербер Дж., Драпкин Р., Сиф С., Икура Т., Огрызко В., Лейн В.С., Накатани Ю., Ливингстон Д.М. (август 2001 г.). «Комплекс p400 является важной мишенью трансформации E1A» . Клетка . 106 (3): 297–307. дои : 10.1016/s0092-8674(01)00450-0 . ПМИД 11509179 . S2CID 15634637 .

[pmid10611234-12] Jump up to: ^а ^б МакМахон С.Б., Вуд Массачусетс, Коул Мэриленд (январь 2000 г.). «Незаменимый кофактор TRRAP рекрутирует гистон-ацетилтрансферазу hGCN5 в c-Myc» . Мол. Клетка. Биол . 20 (2): 556–62. дои : 10.1128/mcb.20.2.556-562.2000 . ПМК 85131 . ПМИД 10611234 .

[pmid12660246-13] Jump up to: ^а ^б Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК 4031917 . ПМИД 12660246 .

[pmid11564863-14] Jump up to: ^а ^б Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Хаит Б.Т., Редер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами, связывающими повреждение ДНК, in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. дои : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ПМК 99856 . ПМИД 11564863 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]