МРЭ11А

МРЭ11
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3T1I
Идентификаторы
Псевдонимы	MRE11 , ATLD, HNGS1, MRE11B, MRE11A, гомолог A MRE11, нуклеаза восстановления двухцепочечного разрыва, гомолог MRE11, нуклеаза восстановления двухцепочечного разрыва
Внешние идентификаторы	Опустить : 600814 ; МГИ : 1100512 ; Гомологен : 4083 ; Генные карты : MRE11 ; ОМА : MRE11 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11q21 Start 94,415,570 bp End 94,493,885 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 9 (mouse) Band 9|9 A2 Start 14,695,950 bp End 14,748,419 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in Achilles tendon oocyte secondary oocyte testicle sural nerve gonad epithelium of colon monocyte rectum ventricular zone Top expressed in ectoderm otic vesicle otic placode spermatid spermatocyte saccule epiblast tail of embryo primitive streak genital tubercle More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA binding manganese ion binding DNA helicase activity single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity protein C-terminus binding protein binding 3'-5' exonuclease activity nuclease activity endonuclease activity double-stranded DNA binding endodeoxyribonuclease activity exonuclease activity hydrolase activity cadherin binding identical protein binding 3'-5'-exodeoxyribonuclease activity 5'-3' exonuclease activity Cellular component site of double-strand break cytosol PML body nucleus cytoplasm nucleoplasm telomere chromosome Mre11 complex replication fork Biological process reciprocal meiotic recombination DNA recombination telomere maintenance via telomerase positive regulation of kinase activity mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling telomeric 3' overhang formation negative regulation of apoptotic process chromosome organization sister chromatid cohesion cellular response to DNA damage stimulus positive regulation of telomere maintenance DNA duplex unwinding homologous chromosome pairing at meiosis negative regulation of DNA endoreduplication double-strand break repair meiosis double-strand break repair via homologous recombination positive regulation of protein autophosphorylation cell population proliferation mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling viral process double-strand break repair via nonhomologous end joining positive regulation of type I interferon production regulation of mitotic recombination DNA repair nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis DNA double-strand break processing strand displacement DNA replication DNA synthesis involved in DNA repair regulation of signal transduction by p53 class mediator telomere maintenance meiotic DNA double-strand break formation mitochondrial double-strand break repair via homologous recombination DNA strand resection involved in replication fork processing Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 4361 17535 Вместе ENSG00000020922 ENSMUSG00000031928 ЮниПрот P49959 Q61216 RefSeq (мРНК) НМ_005590 НМ_005591 НМ_001330347 НМ_018736 НМ_001310728 RefSeq (белок) НП_001317276 НП_005581 НП_005582 НП_001297657 НП_061206 Местоположение (UCSC) Чр 11: 94,42 – 94,49 Мб Chr 9: 14,7 – 14,75 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок восстановления двухцепочечного разрыва MRE11 представляет собой фермент , который у человека кодируется геном MRE11 . Ген был обозначен MRE11A , чтобы отличить его от псевдогена MRE11B , который в настоящее время называется MRE11P1 .

Функция

Этот ген кодирует ядерный белок, участвующий в гомологичной рекомбинации , поддержании длины теломер и восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК . Сам по себе белок обладает 3'-5'- экзонуклеазной активностью и эндонуклеазной активностью. Белок образует комплекс с гомологом RAD50 ; этот комплекс необходим для негомологичного соединения концов ДНК и обладает повышенной активностью одноцепочечной эндонуклеазы ДНК и 3'-5' экзонуклеазной активности. В сочетании с ДНК- лигазой этот белок способствует соединению некомплементарных концов in vitro, используя короткие гомологии вблизи концов фрагментов ДНК. Этот ген имеет псевдоген на хромосоме 3 . Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию двух вариантов транскрипта, кодирующих разные изоформы.

Ортологи

Mre11, ортолог человеческого MRE11, встречается у прокариотических архей Sulfolobus acidocaldarius . В этом организме белок Mre11 взаимодействует с белком Rad50 и, по-видимому, играет активную роль в восстановлении повреждений ДНК, экспериментально вызванных гамма-излучением. Аналогично, во время мейоза у эукариотических простейших Tetrahymena Mre11 необходим для восстановления повреждений ДНК, в данном случае двухцепочечных разрывов . процессом, который, вероятно, включает гомологичную рекомбинацию . Эти наблюдения позволяют предположить, что MRE11 человека происходит от предковых белков Mre11 прокариот и простейших, которые играли роль в ранних процессах восстановления повреждений ДНК.

Сверхэкспрессия при раке

MRE11 играет роль в микрогомологическом восстановлении двухцепочечных разрывов (MMEJ). Это один из 6 ферментов, необходимых для этого пути восстановления ДНК, подверженного ошибкам. MRE11 сверхэкспрессируется при раке молочной железы.

Рак очень часто страдает от недостаточной экспрессии одного или нескольких генов репарации ДНК, но сверхэкспрессия гена репарации ДНК при раке встречается реже. Например, по меньшей мере 36 ферментов репарации ДНК при мутационной дефектности в клетках зародышевой линии вызывают повышенный риск развития рака (наследственные раковые синдромы ). (Также см. «Нарушение репарации ДНК» .) Аналогичным образом, по крайней мере 12 генов репарации ДНК часто оказываются эпигенетически репрессированными при одном или нескольких видах рака. (См. также «Эпигенетическое снижение репарации ДНК и рак ».) Обычно недостаточная экспрессия фермента репарации ДНК приводит к увеличению количества невосстановленных повреждений ДНК, которые из-за ошибок репликации ( синтез транслейкоза ) приводят к мутациям и раку. Однако репарация MMEJ , опосредованная MRE11 , очень неточна, поэтому в этом случае избыточная экспрессия, а не недостаточная экспрессия, по-видимому, приводит к раку.

Взаимодействия

Было показано, что MRE11 взаимодействует с:

• банкомат ,
• БРЦА1 ,
• Ку70 ,
• МДЦ1 ,
• НБН ,
• Рад50 , и
• ТЕРФ2 .

См. также

• Гомологичная рекомбинация

Дальнейшее чтение

• Долганов Г.М., Мазер Р.С., Новиков А., Тосто Л., Чонг С., Брессан Д.А., Петрини Дж.Х. (сентябрь 1996 г.). «Человеческий Rad50 физически связан с человеческим Mre11: идентификация консервативного мультибелкового комплекса, участвующего в рекомбинационной репарации ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (9): 4832–41. дои : 10.1128/MCB.16.9.4832 . ПМК   231485 . ПМИД   8756642 .
• Карни Дж.П., Мазер Р.С., Оливарес Х., Дэвис Э.М., Ле Бо М., Йейтс Дж.Р. и др. (май 1998 г.). «Белковый комплекс hMre11/hRad50 и синдром разрыва Неймегена: связь восстановления двухцепочечного разрыва с реакцией на повреждение клеточной ДНК» . Клетка . 93 (3): 477–86. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81175-7 . ПМИД   9590181 . S2CID   14548642 .
• Полл Т.Т., Геллерт М. (июнь 1998 г.). «Экзонуклеазная активность Mre 11 от 3’ до 5’ способствует восстановлению двухцепочечных разрывов ДНК» . Молекулярная клетка . 1 (7): 969–79. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80097-0 . ПМИД   9651580 .
• Трухильо К.М., Юань С.С., Ли Э.Ю., Сун П. (август 1998 г.). «Активность нуклеазы в комплексе факторов рекомбинации и репарации ДНК человека Rad50, Mre11 и p95» . Журнал биологической химии . 273 (34): 21447–50. дои : 10.1074/jbc.273.34.21447 . ПМИД   9705271 .
• Чаманха М., Вэй Ю.Ф., Сяо В. (декабрь 1998 г.). «Выделение hMRE11B: неспособность компенсировать дефекты mre11 дрожжей из-за видовоспецифичных белковых взаимодействий». Джин . 225 (1–2): 107–16. дои : 10.1016/S0378-1119(98)00530-7 . ПМИД   9931460 .
• Чжун Ц., Чен К.Ф., Ли С., Чен Ю., Ван К.С., Сяо Дж. и др. (июль 1999 г.). «Ассоциация BRCA1 с комплексом hRad50-hMre11-p95 и реакция на повреждение ДНК». Наука . 285 (5428): 747–50. дои : 10.1126/science.285.5428.747 . ПМИД   10426999 .
• Гедеке В., Эйпе М., Оффенберг Х.Х., ван Алдерен М., Хейтинг К. (октябрь 1999 г.). «Mre11 и Ku70 взаимодействуют в соматических клетках, но дифференциально экспрессируются в раннем мейозе». Природная генетика . 23 (2): 194–8. дои : 10.1038/13821 . ПМИД   10508516 . S2CID   13443404 .
• Ким С.Т., Лим Д.С., Канман С.Э., Кастан М.Б. (декабрь 1999 г.). «Специфичность субстратов и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства ATM-киназ» . Журнал биологической химии . 274 (53): 37538–43. дои : 10.1074/jbc.274.53.37538 . ПМИД   10608806 .
• Стюарт Г.С., Мазер Р.С., Станкович Т., Брессан Д.А., Каплан М.И., Джасперс Н.Г. и др. (декабрь 1999 г.). «Ген восстановления двухцепочечного разрыва ДНК hMRE11 мутирует у людей с расстройством, подобным атаксии-телеангиэктазии» . Клетка . 99 (6): 577–87. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81547-0 . ПМИД   10612394 . S2CID   14434655 .
• Ван Ю, Кортес Д., Язди П., Нефф Н., Элледж С.Дж., Цинь Дж. (апрель 2000 г.). «BASC, суперкомплекс белков, связанных с BRCA1, участвующих в распознавании и восстановлении аберрантных структур ДНК» . Гены и развитие . 14 (8): 927–39. дои : 10.1101/gad.14.8.927 . ПМК   316544 . ПМИД   10783165 .
• Гатей М., Янг Д., Черосалетти К.М., Десаи-Мехта А., Спринг К., Козлов С. и др. (май 2000 г.). «АТМ-зависимое фосфорилирование нибрина в ответ на радиационное воздействие». Природная генетика . 25 (1): 115–9. дои : 10.1038/75508 . ПМИД   10802669 . S2CID   23521589 .
• Чжу XD, Кюстер Б, Манн М, Петрини Дж. Х., де Ланге Т (июль 2000 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50/MRE11/NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Природная генетика . 25 (3): 347–52. дои : 10.1038/77139 . PMID   10888888 . S2CID   6689794 .
• де Врис Х, Рюгсеггер У, Хюбнер В, Фридлейн А, Ланген Х, Келлер В (ноябрь 2000 г.). «Фактор расщепления II (m) пре-мРНК человека содержит гомологи дрожжевых белков и соединяет два других фактора расщепления» . Журнал ЭМБО . 19 (21): 5895–904. дои : 10.1093/emboj/19.21.5895 . ПМК   305781 . ПМИД   11060040 .
• Фукуда Т., Сумиёси Т., Такахаши М., Катаока Т., Асахара Т., Инуи Х. и др. (январь 2001 г.). «Изменения гена восстановления двухцепочечного разрыва MRE11 при раке». Исследования рака . 61 (1): 23–6. ПМИД   11196167 .
• Десаи-Мехта А., Черосалетти К.М., Конкэннон П. (март 2001 г.). «Различные функциональные домены нибрина опосредуют связывание Mre11, формирование фокуса и ядерную локализацию» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (6): 2184–91. дои : 10.1128/MCB.21.6.2184-2191.2001 . ПМЦ   86852 . ПМИД   11238951 .
• Полл Т.Т., Кортес Д., Бауэрс Б., Элледж С.Дж., Геллерт М. (май 2001 г.). «Прямое связывание ДНК с помощью Brca1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (11): 6086–91. дои : 10.1073/pnas.111125998 . ПМК   33426 . ПМИД   11353843 .
• Хопфнер К.П., Керхер А., Крейг Л., Ву Т.Т., Карни Дж.П., Тайнер Дж.А. (май 2001 г.). «Структурная биохимия и архитектура взаимодействия нуклеазы восстановления двухцепочечного разрыва ДНК Mre11 и Rad50-АТФазы» . Клетка . 105 (4): 473–85. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00335-X . ПМИД   11371344 . S2CID   15913630 .
• Питтс С.А., Куллар Х.С., Станкович Т., Стюарт Г.С., Ласт Дж.И., Беденхэм Т. и др. (май 2001 г.). «hMRE11: геномная структура и нулевая мутация, выявленная в транскрипте, защищенном от нонсенс-опосредованного распада мРНК» . Молекулярная генетика человека . 10 (11): 1155–62. дои : 10.1093/hmg/10.11.1155 . ПМИД   11371508 .
• Чиба Н., Парвин Дж.Д. (октябрь 2001 г.). «Перераспределение BRCA1 между четырьмя различными белковыми комплексами после блокировки репликации» . Журнал биологической химии . 276 (42): 38549–54. дои : 10.1074/jbc.M105227200 . ПМИД   11504724 .
• Бейкзаде М., член парламента Латама (октябрь 2020 г.). «Динамическая природа комплекса восстановления разрывов ДНК Mre11-Rad50» . Прогресс биофизики и молекулярной биологии . 163 : 14–22. doi : 10.1016/j.pbiomolbio.2020.10.007 . ПМК   8065065 . ПМИД   33121960 .