Малая ядрышковая РНК SNORD64
| Малая ядрышковая РНК SNORD64 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD64 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | ШНУР64 |
| Альт. Символы | сноHBII-13 |
| Рфам | RF00570 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии SNORD64 ( также известный как HBII-13 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
SNORD64 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
мякРНК HBII-13 экспрессируется главным образом в тканях головного мозга, но также находится в легких, почках и мышцах; [ 2 ] однако HBII-13 не имеет идентифицированной целевой РНК. [ 3 ] Ген HBII-13 расположен в интроне размером 460 т.п.н. большой транскрипционной единицы, экспрессируемой по отцовской линии ( SNURF-SNRNP -UBE3A AS), вместе с несколькими другими мякРНК HBII-436, HBII-437, HBII-438A/B и кластерами HBII-13. ГБII-85, ГБII-52. [ 4 ] Этот ген-хозяин представляет собой антисмысловой транскрипт материнского гена UBE3A.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Кавайе Дж., Бьютинг К., Кифманн М., Лаланд М., Браннан С.И., Хорстемке Б., Бачеллери Дж.П., Брозиус Дж., Хюттенхофер А. (декабрь 2000 г.). «Идентификация специфичных для мозга и импринтированных генов малых ядрышковых РНК, демонстрирующих необычную геномную организацию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14311–6. дои : 10.1073/pnas.250426397 . ЧВК 18915 . ПМИД 11106375 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Рунте М., Хюттенхофер А., Гросс С., Кифманн М., Хорстемке Б., Бьютинг К. (ноябрь 2001 г.). «Транскрипт IC-SNURF-SNRPN служит хозяином для множества малых видов ядрышковой РНК и антисмысловой РНК для UBE3A». Молекулярная генетика человека . 10 (23): 2687–700. дои : 10.1093/hmg/10.23.2687 . ПМИД 11726556 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |