Малая ядрышковая РНК sR8
| sR8 | |
|---|---|
 Консенсусная последовательность sR8 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | sR8 |
| Рфам | RF01311 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | мякРНК; коробка для компакт-дисков |
| Домен(ы) | Сульфолобовые , Термококковые |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК sR8 представляет собой некодирующую РНК, принадлежащую к C/D-бокса классу мякРНК . sR8, наряду с другими мякРНК C/D-бокса, осуществляет 2'- - метилирование рибозы на O целевой цепи рибосомальной РНК . [ 1 ] [ 2 ] Нацеливание достигается за счет компонентов C и D-боксов, которые представляют собой короткие участки консервативных последовательностей , а также C'/D'-боксов (внутренних эквивалентов C и D-боксов). Эти последовательности соединяются в пары оснований с нуклеотидами целевой рРНК, чтобы управлять их метилированием. [ 3 ]
РНК sR8 действует вместе с белковыми компонентами в рибонуклеопротеиновом (РНП) комплексе. sR8 способен управлять метилированием мишеней, обнаруженных в структурированных петлях стеблей , что означает, что компонент комплекса способен раскручивать такие структуры. [ 3 ]
В качестве модельной системы
[ редактировать ]sR8 считается «моделью» [ 3 ] мРНК C/D-бокса и использовалась в нескольких экспериментах по изучению природы мякРНК C/D-бокса и рибонуклеопротеиновых комплексов. [ 4 ] [ 5 ] Это особенно полезно в исследованиях, поскольку РНП можно полностью сконструировать in vitro . [ 3 ]
РНК sR8 гипертермофила Methanocaldococcus jannaschii была использована для выяснения трехмерной структуры C/D-бокса RNP. [ 6 ] Неожиданно выяснилось, что структура является димерной, в которой две молекулы РНК связываются с несколькими белками в одном комплексе. [ 6 ] [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Кисс-Ласло, З; Генри Ю; Холостяк JP; Кайзерг-Феррер М; Поцелуй Т (1996). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК» . Клетка . 85 (7): 1077–1088. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . ПМИД 8674114 . S2CID 10418885 .
- ^ Jump up to: а б с д Компакт-диск Appel, Maxwell ES (июнь 2007 г.). «Структурные особенности направляющей: дуплекс РНК-мишени, необходимый для архейного бокса C/D мРНК-направляемого нуклеотидного 2'-O-метилирования» . РНК . 13 (6): 899–911. дои : 10.1261/rna.517307 . ПМК 1869030 . ПМИД 17438123 .
- ^ Тран, Э.; Чжан, X.; Лакей, Л.; Максвелл, ES (2005). «Консервативное расстояние между боксом C/D и C'/D' РНП архейного комплекса бокса C/D sRNP необходимо для эффективного 2'-O-метилирования целевых РНК» . РНК . 11 (3): 285–293. дои : 10.1261/rna.7223405 . ПМК 1370718 . ПМИД 15661846 .
- ^ Рашид Р., Айтталеб М., Чен К., Шпигель К., Демелер Б., Ли Х. (октябрь 2003 г.). «Функциональные требования для симметричной сборки небольших частиц рибонуклеопротеина архейного бокса C/D». Дж. Мол. Биол . 333 (2): 295–306. дои : 10.1016/j.jmb.2003.08.012 . ПМИД 14529617 .
- ^ Jump up to: а б Блейхерт Ф., Ганьон К.Т., Браун Б.А. и др. (сентябрь 2009 г.). «Димерная структура малых рибонуклеопротеинов C/D архейного бокса» . Наука . 325 (5946): 1384–7. Бибкод : 2009Sci...325.1384B . дои : 10.1126/science.1176099 . ПМЦ 2975540 . ПМИД 19745151 .
- ^ «Исследование раскрывает неожиданную древнюю клеточную структуру» . PhysOrg.com.
Внешние ссылки
[ редактировать ]