Малая ядрышковая РНК SNORD34
| Малая ядрышковая РНК SNORD34 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD34 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД34 |
| Альт. Символы | U34 |
| Рфам | RF00147 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U34 (также известная как SNORD34 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U34 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
мякоРНК U34 изначально была охарактеризована с помощью компьютерного скрининга и в геноме человека кодируется в интроне 5 гена рибосомального белка L13a. [ 2 ] Предполагается, что U34 управляет сайт-специфическим 2'-O-метилированием 25S рРНК. Что необычно для мякРНК, хотя для выбора целевого нуклеотида требуется антисмысловой элемент и консервативный блок D или D' мякРНК, в случае мякРНК U34 считается, что метилтрансферазная активность находится в одном из белковых компонентов. [ 1 ] СноРНК U34 имеет гомологи у мышей Arabidopsis (обозначенных как snoR4) и в нескольких копиях у риса (альтернативно называемых snoZ181). [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Николозо М., Цюй Л.Х., Мишо Б., Бачеллери Дж.П. (1996). «Кодируемые интронами антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников 2'-О-рибозо-метилирования рРНК». Дж. Мол. Биол . 260 (2): 178–95. дои : 10.1006/jmbi.1996.0391 . ПМИД 8764399 .
- ^ Чен CL, Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю., Цюй Л.Х. (2003). «Высокое разнообразие мякРНК у растений: идентификация и сравнительное исследование 120 генов мякРНК Oryza sativa» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (10): 2601–13. дои : 10.1093/нар/gkg373 . ПМК 156054 . ПМИД 12736310 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |