Малая ядрышковая РНК SNORA11
| Малая ядрышковая РНК SNORA11 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SNORA11 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРА11 |
| Рфам | RF00614 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; H/ACA-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000594 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК SNORA11 (также известная как U107 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мяРНК).
U107 имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост» и, как предполагается, является членом класса H/ACA-бокса мякРНК, которые направляют сайты модификации уридинов в псевдоуридины. [ 1 ] Эта мякРНК была идентифицирована с помощью RT-PCR из клеток крови, и ее экспрессия подтверждена Нозерн-блот -анализом. [ 2 ] Для этой направляющей мяРНК не существует предсказанной РНК-мишени. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–5807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .
- ^ Гу А.Д., Чжоу Х., Юй Ч., Цюй Л.Х. (декабрь 2005 г.). «Новый экспериментальный подход к систематической идентификации мякРНК бокса H/ACA у эукариот» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (22): e194. дои : 10.1093/nar/gni185 . ПМЦ 1316117 . ПМИД 16361266 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORA11 в Rfam
- Запись для SNORA11 на snorBase
- Страница HGNC для малой ядрышковой РНК SNORA11
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |