Малая ядрышковая РНК SNORD38
Малая ядрышковая РНК SNORD38 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD38 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРД38 |
Альт. Символы | U38 |
Рфам | RF00212 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U38 (также известная как SNORD38 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U38 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'- O- метилированием . субстратных РНК [ 1 ]
U38 локализован в интронах 4 и 5 рибосомного белка S8 человека и в гомологичных генах мыши и коровы. [ 2 ] Предполагается, что U38 управляет метилированием остатков 2'-O-рибозы в 28S рибосомальной РНК (рРНК). Также был идентифицирован мышиный гомолог U38 (MBII-329). [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Николозо М., Цюй Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (июль 1996 г.). «Кодируемые интронами антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников 2'-О-рибозо-метилирования рРНК». Журнал молекулярной биологии . 260 (2): 178–95. дои : 10.1006/jmbi.1996.0391 . ПМИД 8764399 .
- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]