Малая ядрышковая РНК R66
Малая ядрышковая РНК R66 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности snoR66 | |
Идентификаторы | |
Символ | сноР66 |
Рфам | РФ00202 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК R66 (также известная как snoR66 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
snoR66 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
snoR66 был идентифицирован в результате компьютерного скрининга генома риса Oryza sativa и, как предполагается, действует в качестве проводника метилирования 18S рибосомальной РНК в растениях. [ 2 ] Рис snoR66 также получил альтернативное название snoZ269. Ее также не следует путать с мякРНК, идентифицированной у дрожжей ( Saccharomyces cerevisiae ) и названной snR66 . [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Чен CL, Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю., Цюй Л.Х. (2003). «Высокое разнообразие мякРНК у растений: идентификация и сравнительное исследование 120 генов мякРНК Oryza sativa» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (10): 2601–13. дои : 10.1093/нар/gkg373 . ПМК 156054 . ПМИД 12736310 .
- ^ Лоу, ТМ; Эдди, СР (февраль 1999 г.). «Вычислительный скрининг мяРНК, направляющих метилирование, в дрожжах». Наука . 283 (5405): 1168–1171. Бибкод : 1999Sci...283.1168L . дои : 10.1126/science.283.5405.1168 . ПМИД 10024243 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]