Малая ядрышковая РНК SNORD83
Малая ядрышковая РНК SNORD83 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD83 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРД83 |
Альт. Символы | U83 |
Рфам | RF00137 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК SNORD83 (также известная как U83 и U84 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК. мякРНК SNORD83 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] мякРНК SNORD83 сплайсированы из интронов 5 и 4 гена BAT1 млекопитающих. [ 2 ] [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Джейди Б.Е., Kiss T (2000). «Характеристика малых ядрышковых РНК U83 и U84: две новые РНК, направляющие метилирование 2'-О-рибозы, которым не хватает комплементарности рибосомальным РНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (6): 1348–54. дои : 10.1093/нар/28.6.1348 . ПМК 111033 . ПМИД 10684929 .
- ^ Дуга С., Ассельта Р., Малковати М., Тенчини М.Л., Рончи С., Симоник Т. (2000). «Ген рибосомального белка L3, содержащий интрон (RPL3): анализ последовательности и идентификация U43 и двух новых интронных малых ядрышковых РНК». Биохим Биофиз Акта . 1490 (3): 225–36. дои : 10.1016/S0167-4781(99)00237-7 . ПМИД 10684968 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]