Малая ядрышковая РНК SNORD24
Малая ядрышковая РНК SNORD24 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD24 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРД24 |
Альт. Символы | U24 |
Рфам | RF00069 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии U24 является членом класса C/D мякоРНК , которые содержат мотивы C (UGAUGA) и D (CUGA). [ 1 ] Было показано, что snoRNA C/D-бокса действуют как проводники метилирования для ряда РНК-мишеней. [ 2 ] [ 3 ] U24 кодируется в интроне гена рибосомального белка L7a у млекопитающих, кур и фугу. [ 4 ] МпРНК U76/SNORD76 обнаруживается в интроне гена транскрипта специфической остановки роста 5 гена хозяина мРНК (UHG) (GAS5). [ 5 ] мякРНК Z20 и U76 мякРНК демонстрируют явное сходство с U24.
Эксперимент, в котором изучались 22 различные ткани немелкоклеточного рака легких , показал, что SNORD33 , SNORD66 и SNORD76 сверхэкспрессируются по сравнению с соответствующими нераковыми тканями легких. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Цюй Л.Х., Анри Ю., Николозо М., Мишо Б., Азум М.К., Реналье М.Х., Кайзерг-Феррер М., Бачеллери Ж.П. (июль 1995 г.). «U24, новая малая ядрышковая РНК, кодируемая интроном, с двумя филогенетически консервативными комплементарностями длиной 12 нуклеотидов к 28S рРНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 23 (14): 2669–76. дои : 10.1093/нар/23.14.2669 . ПМК 307091 . ПМИД 7651828 .
- ^ Николозо М., Цюй Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (июль 1996 г.). «Кодируемые интронами антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников 2'-О-рибозо-метилирования рРНК». Журнал молекулярной биологии . 260 (2): 178–95. дои : 10.1006/jmbi.1996.0391 . ПМИД 8764399 .
- ^ Кисс-Ласло З., Генри Ю., Бачеллери ЖП, Кайзерг-Феррер М., Кисс Т. (июнь 1996 г.). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК» . Клетка . 85 (7): 1077–88. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . ПМИД 8674114 . S2CID 10418885 .
- ^ Гилли Дж., Фрид М. (июль 1998 г.). «Эволюция мякРНК U24 и U36, кодируемых в интронах гомологов гена rpL7a позвоночных: уникальные особенности вариантов U36 млекопитающих». ДНК и клеточная биология . 17 (7): 591–602. дои : 10.1089/dna.1998.17.591 . ПМИД 9703018 .
- ^ Хиросе Т., Стейц Дж. А. (ноябрь 2001 г.). «Положение внутри интрона хозяина имеет решающее значение для эффективного процессинга мякРНК бокса C/D в клетках млекопитающих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (23): 12914–9. Бибкод : 2001PNAS...9812914H . дои : 10.1073/pnas.231490998 . JSTOR 3057015 . ПМК 60799 . ПМИД 11606788 .
- ^ Ляо Дж., Ю Л., Мэй Ю., Гуарнера М., Шен Дж., Ли Р., Лю З., Цзян Ф. (июль 2010 г.). «Маленькие ядрышковые РНК как биомаркеры немелкоклеточного рака легких» . Молекулярный рак . 9 :198. дои : 10.1186/1476-4598-9-198 . ПМК 2919450 . ПМИД 20663213 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]