Малая ядрышковая РНК SNORD18
| Малая ядрышковая РНК SNORD18 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SNORD18 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД18 |
| Альт. Символы | U18 |
| Рфам | RF00093 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии SNORD18 ( также известный как U18 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
U18 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
У людей и Xenopus laevis существуют три близкородственные копии U18 (называемые U18A, U18B, U18C), которые кодируются в интронах рибосомального белка L1. [ 2 ] У дрожжей U18 расположен в интронах фактора элонгации 1 бета (EF1-бета). Родственные мякРНК у Arabidopsis thaliana и риса Oryza sativa были названы R63 и Z106 соответственно. Недавно были выяснены факторы, участвующие в процессинге интронной мякРНК. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Прислей С., Мичиенци А., Пресутти С., Фрагапане П., Боццони I (1993). «Две разные мякРНК кодируются в интронах генов рибосомального белка L1 амфибии и человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (25): 5824–30. дои : 10.1093/нар/21.25.5824 . ПМК 310460 . ПМИД 7507233 .
- ^ Джорджи С., Фатика А., Нагель Р., Боццони I (2001). «Высвобождение мякРНК U18 из интрона хозяина требует взаимодействия Nop1p с эндонуклеазой Rnt1p» . ЭМБО Дж . 20 (23): 6856–65. дои : 10.1093/emboj/20.23.6856 . ПМЦ 125767 . ПМИД 11726521 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD18 в Rfam
- Запись для SNORD18A на сайте snorBase
- Запись для SNORD18B на snoRNABase
- Запись о SNORD18C на сайте snoRNABase
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |