Пирококк
Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( март 2024 г. ) |
Пирококк | |
---|---|
![]() | |
Пирококк безумный | |
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Тип: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Пирококк Фиала и Стеттер, 1986 г. |
Типовой вид | |
Пирококк безумный Фиала и Стеттер, 1986 г. | |
Разновидность | |
|
Pyrococcus — род термококковых архей . [1]
Описание и значение
[ редактировать ]Pyrococcus имеет сходные характеристики с другими термоавтотрофными архей, такими как Archaeoglobus и Methanococcus, в том отношении, что все они термофильны и анаэробны. Однако Pyrococcus отличается тем, что его оптимальная температура роста составляет около 100 ° C, и он обитает на большей глубине моря, чем другие археи. Изучение Pyrococcus помогает понять возможные механизмы, используемые для выживания в экстремальных условиях окружающей среды, таких как высокие температуры и высокое давление.
Филогения
[ редактировать ]на основе 16S рРНК ДП _06_2022 [2] [3] [4] | 53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 [5] [6] [7] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Структура генома
[ редактировать ]три вида Pyrococcus Были секвенированы . P. Furiosus является самым крупным из них, содержащим 1,9 МБ, за ним следуют P. abyssi с 1,8 МБ и P. horikoshii с 1,7 МБ. [ нужна ссылка ] Геномы , кодируют множество различных метаболических ферментов что обеспечивает более широкий спектр условий жизни, поскольку они могут транспортировать и метаболизировать широкий спектр органических веществ. Вариации были обнаружены и между видами.
Структура клетки и метаболизм
[ редактировать ]Клетки Pyrococcus имеют размер около 0,8–2 мкм и представляют собой кокки слегка неправильной формы. Они имеют полярную группу жгутиков и окружены S-слоем, охватывающим периплазматическое пространство вокруг цитоплазматической мембраны . Pyrococcus Виды анаэробны , но их метаболизм незначительно различается. Пептидная ферментация является основным метаболическим путем наблюдался , однако рост P. Furiosus и P. abyssi на крахмале , мальтозе и пирувате , но не у P. horikoshii . Хотя присутствие элементарной серы для роста не требуется, рост усиливается добавлением S. тот .
Экология
[ редактировать ]Виды Pyrococcus обитают в средах с чрезвычайно высокими температурами, таких как гидротермальные источники . Оптимальные условия роста включают уровень pH около 7, концентрацию соли около 2,5% и температуру около 98 °C. Растущие при таких высоких температурах, легко понять, почему они являются анаэробами, поскольку при таких температурах кипения кислород практически не доступен. В примере с гидротермальными источниками, где был обнаружен P. abyssi , помимо чрезвычайно высокой температуры, нет солнечного света и давление около 200 атм.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ См. веб-страницу NCBI о пирококке . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Эльшавадфи, Ашраф М.; Кейт, Брайан Дж.; Оой, Х'Нг Э; Кинсман, Томас; и др. (27 мая 2014 г.). «Гибриды ДНК-полимеразы, полученные из ферментов семейства B Pyrococcus Furiosus и Thermococcus Kodakarensis: улучшение характеристик полимеразной цепной реакции» . Границы микробиологии . 5 : 224–. дои : 10.3389/fmicb.2014.00224 . ПМЦ 4034419 . ПМИД 24904539 .
- Фиала Дж; Стеттер КО (1986). «Pyrococcus Furiosus sp. Nov. представляет собой новый род морских гетеротрофных архебактерий, оптимально растущий при 100 ° C». Арх. Микробиол . 145 : 56–61. дои : 10.1007/BF00413027 . S2CID 41589578 .
- Зиллиг В; Хольц I; Кленк ХП; Трент Дж; и др. (1987). «Pyrococcus woesei, sp. nov., ультратермофильная морская архебактерия, представляющая новый отряд Thermococcales». Сист. Прил. Микробиол . 9 (1–2): 62–70. дои : 10.1016/S0723-2020(87)80057-7 .