Корархеота

Корархеота
	Сканирующая электронная микрофотография обогащающей культуры Обсидианового бассейна , на которой изображены Корархеоты.
Научная классификация
Домен:	Архея
Королевство:	« Протеоархеота »
Супертип:	ТАК
Тип:	« Корархеота » ; Барнс и др. 1996 год
Сорт:	"Корархея" ; Rinke et al. 2020
Заказ:	«Корархеалес» ; Петижан и др. 2015 год
Семья:	«Корархеевые» ; Rinke et al. 2020
Разновидность
	" Ка. Корархеум " ; " Ка. Метанодесульфокор " ;
Синонимы
	«Ксенархея» ; «Ксенархеота» ;

Korarchaeota тип предполагаемый — внутри Archaea . ^[3] Название происходит от греческого существительного «корос» или «коре», что означает «молодой мужчина или молодая женщина», и греческого прилагательного «архаос», что означает «древний». ^[4] Они также известны как Xenarchaeota . Название эквивалентно Candidatus Korarchaeota, и они также носят название Xenarchaeota или Xenarchaea. ^[5]

Таксономия

Korarchaeota — предполагаемый тип в домене Archaea . ^[6] Считается, что они разошлись относительно рано во время зарождения архей и относятся к числу глубоко разветвленных линий. ^[6] Корархеоты также известны как Ксенархеота. Korarchaeaota, наряду с Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, относятся к надтипу под названием TACK. ^[7] Эволюционная связь между архей Асгарда и корархеотами TACK (Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, Korarchaeota) пока неизвестна. ^[7]

Первым представителем Korarchaeota, геном которого был реконструирован, был Korarchaeum cryptofilum , который был найден в горячем источнике в Йеллоустонском национальном парке и описан в 2008 году. ^[8] С тех пор было описано лишь несколько геномов корархей. ^[9] Для проверки на Корархеоту были собраны образцы из различных горячих источников Исландии и Камчатки. По данным образцов и анализа, исландские образцы содержали около 87 различных последовательностей 16S рибосомальных нуклеиновых кислот , тогда как камчатские образцы содержали около 33. ^[10]

На основании белковых последовательностей и филогенетического анализа консервативных одиночных генов корархеоты были идентифицированы как «глубинная архейная линия» с возможным родством с кренархеотами. ^[11] Более того, учитывая известный генетический состав архей, корархеоты, возможно, сохранили набор биологических черт, которые соответствуют самой ранней известной форме архей. ^[11]

Анализ последовательностей их генов 16S рРНК позволяет предположить, что они представляют собой глубоко разветвленную линию, не принадлежащую основным группам архей, Thermoproteota и Euryarchaeota . ^[12] Анализ генома одного корархеота, обогащенного смешанной культурой, выявил ряд черт, сходных как с Crenarchaeota, так и с Euryarchaeota, и подтверждает гипотезу о глубоко разветвленном происхождении. ^[13]

Разновидность

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI).

Ниже перечислены известные виды Korarcheota. ^[14] Кандидат Корархеота

Род Candidatus Korarchaeota археон. ^[15]
Род Candida Korarchaeota археон NZ13-K. ^[15]
Род Кандида Корархеум ^[6]
- Вид Candida Korarchaeum cryptophilum ^[6]
  - Кандидат Korarchaeum cryptophilus OPF8. ^[6]
Род Candida Methanodesulfokores. ^[16]
- Вид Candidatus Methanodesulfokoreswashburnensis. ^[16]
Род Korarchaeote SRI-306. ^[15]
рода Образцы окружающей среды ^[15]
- некультивируемый корархеот pBA5 ^[15]
- некультивируемый корархеот pJP27 ^[15]
- некультивируемый корархеот pJP78 ^[15]

Эталонные виды

Штамм Korarchaeum cryptofilum был выращен из накопительной культуры горячего источника в Йеллоустонском национальном парке, США, и описан в 2008 году. ^[13] Клетки длинные и игольчатые, что и дало виду название, намекающее на его «загадочные нити». У этого организма отсутствуют гены для биосинтеза пуриновых нуклеотидов , и поэтому он полагается на источники окружающей среды для удовлетворения своих потребностей в пуринах. ^[17]

Характеристики

Korarchaeota представляют собой предполагаемый тип внутри домена Archaea и, следовательно, обладают такими характеристиками, как наличие клеточной стенки без пептидогликана, а также липидных мембран, связанных эфирной связью. ^[18] Они имеют поверхностный слой паракристаллического белка. ^[19] Этот поверхностный слой, известный как S-слой, плотно упакован и состоит из 1-2 белков, образующих различные решетчатые структуры и, скорее всего, поддерживающих структурную целостность клеток. ^[18]^[19] Обычно они имеют стержнеобразную форму, однако было обнаружено, что эта морфология может измениться и стать более толстой в присутствии более высоких концентраций додецилсульфата натрия (ДСН). ^[20] Клетки корархеоты имеют ультратонкую нитевидную морфологию, длина которой может различаться. ^[6] Обычно они составляют в среднем 15 мкм в длину и 0,16 мкм в диаметре, но могут достигать длины до 100 мкм. ^[20] Некоторые археи могут связывать углекислый газ по пути 3-гидроксипропионат/4-гидроксибутират в органические соединения. ^[21]

Экология

Корархеоты были обнаружены только в гидротермальных средах, начиная от наземных, включая горячие источники. ^[6]^[22] до морских, включая мелководные гидротермальные жерла и глубоководные гидротермальные жерла. ^[23] Предыдущие исследования показали большее разнообразие корархей, обитающих в наземных горячих источниках, по сравнению с морской средой. ^[23] Корархеоты встречаются в природе лишь в небольших количествах. ^[24]^[25]^[26] Корархеота, вероятно, возникла в морской среде, а затем адаптировалась к наземной. ^[27]

Географически корархеота была обнаружена в различных местах по всему миру, включая Японию, Йеллоустонский национальный парк, Калифорнийский залив, Исландию и Россию. ^[18]^[23]

Корархеоты — термофилы , обитающие при температуре до 128 градусов по Цельсию. ^[23] Самая низкая температура, при которой они были обнаружены, составляет 52 градуса по Цельсию. ^[18] Хотя их часто наблюдали живущими в кислых условиях, они также были обнаружены живущими в условиях с pH до 10. ^[28]^[23]

Исследователи идентифицировали вирус, который потенциально может заразить Корархеоту. ^[29]

В каждом из этих шести горячих источников (слева вверху по часовой стрелке: Узон4, Узон7, Узон8, Узон9, Мут11, Мут13) на Камчатке были обнаружены корархеоты. — В каждом из этих шести горячих источников (по часовой стрелке сверху слева: Узон4, Узон7, Узон8, Узон9, Мут11, Мут13) на Камчатке были обнаружены корархеоты. ^[24]

См. также

Список родов архей

Ссылки

^ Разрешение широко распространенных неполных и неравномерных классификаций архей на основе нормализованной по рангу таксономии, основанной на геноме.
^ Укоренение домена архей с помощью филогеномного анализа поддерживает основу протеоархеот Нового царства
^ См . веб-страницу NCBI о Корархеоте . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
^ Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .
^ Бун Д.Р., Бреннер Д.Д., Кастенхольц Р.В., Де Вос П., Гаррити ГМ, Криг Н.Р., Гудфеллоу М. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. ISBN 978-0-387-21609-6 . OCLC 619443681 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Лю Ю, Ли М (июнь 2022 г.). «Нестабильное эволюционное положение Корархеоты и ее взаимоотношения с другими архей TACK и Асгарда» . mLife . 1 (2): 218–222. дои : 10.1002/mlf2.12020 . ISSN 2770-100X . ПМЦ 10989867 . S2CID 249298036 .
^ Миллер-Коулман Р.Л., Додсворт Дж.А., Росс К.А., Шок Э.Л., Уильямс А.Дж., Хартнетт Х.Э. и др. (04 мая 2012 г.). «Разнообразие, биогеография и численность корархеот в горячих источниках Йеллоустона и Большого Бассейна, а также моделирование экологической ниши на основе машинного обучения» . ПЛОС ОДИН . 7 (5): e35964. дои : 10.1371/journal.pone.0035964 . ПМЦ 3344838 . ПМИД 22574130 .
^ Барнс С.М., Делвич К.Ф., Палмер Дж.Д., Пейс Н.Р. (август 1996 г.). «Перспективы разнообразия архей, термофилии и монофилии на основе последовательностей рРНК окружающей среды» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (17): 9188–9193. Бибкод : 1996PNAS...93.9188B . дои : 10.1073/pnas.93.17.9188 . ПМК 38617 . ПМИД 8799176 .
^ Рейгстад Л.Дж., Йоргенсен С.Л., Шлепер С. (март 2010 г.). «Разнообразие и численность корархеот в наземных горячих источниках Исландии и Камчатки» . Журнал ISME . 4 (3): 346–356. дои : 10.1038/ismej.2009.126 . ПМИД 19956276 . S2CID 6951841 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .
^ Барнс С.М., Делвич К.Ф., Палмер Дж.Д., Пейс Н.Р. (август 1996 г.). «Перспективы разнообразия архей, термофилии и монофилии на основе последовательностей рРНК окружающей среды» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (17): 9188–9193. Бибкод : 1996PNAS...93.9188B . дои : 10.1073/pnas.93.17.9188 . ПМК 38617 . ПМИД 8799176 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .
^ Шох К.Л., Чуфо С., Домрачев М., Хоттон К.Л., Каннан С., Хованская Р. и др. (январь 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах» . База данных . 2020 : baaa062. дои : 10.1093/база данных/baaa062 . ПМК 7408187 . ПМИД 32761142 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Шох К.Л., Чуфо С., Домрачев М., Хоттон К.Л., Каннан С., Хованская Р. и др. (январь 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах» . База данных . 2020 : baaa062. дои : 10.1093/база данных/baaa062 . ПМК 7408187 . ПМИД 32761142 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Маккей Л.Дж., Длакич М., Филдс М.В., Дельмонт Т.О., Эрен А.М., Джей З.Дж. и др. (апрель 2019 г.). «Совместная геномная способность к анаэробному метаболизму метана и диссимиляционному метаболизму серы обнаружена у корархеот». Природная микробиология . 4 (4): 614–622. дои : 10.1038/s41564-019-0362-4 . ОСТИ 1779059 . ПМИД 30833730 . S2CID 256705892 .
^ Браун А.М., Хупс С.Л., Уайт Р.Х., Сариски Калифорния (декабрь 2011 г.). «Биосинтез пуринов у архей: вариации на тему» . Биология Директ . 6:63 . дои : 10.1186/1745-6150-6-63 . ПМК 3261824 . ПМИД 22168471 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Миллер Р.Л. (январь 2008 г.). «Разнообразие, биогеография и геохимическая среда обитания Korarchaeota в континентальных горячих источниках» . Ретроспективные тезисы и диссертации UNLV . дои : 10.25669/6h98-vit6 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Родригес-Оливейра Т., Бельмок А., Васконселлос Д., Шустер Б., Чьяу СМ (2017). «Археальные S-слои: обзор и современное состояние» . Границы микробиологии . 8 : 2597. дои : 10.3389/fmicb.2017.02597 . ПМК 5744192 . ПМИД 29312266 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Элкинс Дж.Г., Кунин В., Андерсон И., Барри К., Гольцман Э., Лапидус А. и др. (май 2007 г.). Корархеоты: архейные сироты, представляющие наследственную линию жизни (Отчет). Беркли, Калифорния (США): Национальная лаборатория Лоуренса Беркли. (ЛБНЛ). дои : 10.2172/960397 . ОСТИ 960397 .
^ Берг И.А., Кокелькорн Д., Бакель В., Фукс Г. (декабрь 2007 г.). «Путь автотрофной ассимиляции углекислого газа 3-гидроксипропионата / 4-гидроксибутирата у архей». Наука . 318 (5857): 1782–1786. дои : 10.1126/science.1149976 . ПМИД 18079405 . S2CID 13218676 .
^ Такай К., Ёсихико С (1 февраля 1999 г.). «Молекулярный взгляд на разнообразие архей в морской и наземной среде с горячей водой» . Микробиология Экология . 28 (2): 177–188. дои : 10.1111/j.1574-6941.1999.tb00573.x . S2CID 84495991 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Рейгстад Л.Дж., Йоргенсен С.Л., Шлепер С. (март 2010 г.). «Разнообразие и численность корархеот в наземных горячих источниках Исландии и Камчатки» . Журнал ISME . 4 (3): 346–356. дои : 10.1038/ismej.2009.126 . ПМИД 19956276 . S2CID 6951841 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Аухтунг Т.А., Шындряева Г., Кавано К.М. (январь 2011 г.). «Филогенетический анализ 16S рРНК и количественная оценка корархеот, обитающих в горячих источниках Камчатки, Россия». Экстремофилы . 15 (1): 105–116. дои : 10.1007/s00792-010-0340-5 . ПМИД 21153671 . S2CID 12091232 .
^ Рейгстад Л.Дж., Йоргенсен С.Л., Шлепер С. (март 2010 г.). «Разнообразие и численность корархеот в наземных горячих источниках Исландии и Камчатки» . Журнал ISME . 4 (3): 346–356. дои : 10.1038/ismej.2009.126 . ПМИД 19956276 .
^ Аухтунг ТА (2007). Экология гидротермального кандидатного архейного отдела Корархеота (кандидатская диссертация). Гарвардский университет.
^ Миллер-Коулман Р.Л., Додсворт Дж.А., Росс К.А., Шок Э.Л., Уильямс А.Дж., Хартнетт Х.Э. и др. (04 мая 2012 г.). Мормил М.Р. (ред.). «Разнообразие, биогеография и численность корархеот в горячих источниках Йеллоустона и Большого Бассейна, а также моделирование экологической ниши на основе машинного обучения» . ПЛОС ОДИН . 7 (5): e35964. дои : 10.1371/journal.pone.0035964 . ПМЦ 3344838 . ПМИД 22574130 .
^ Мартейнссон В.Т., Кристьянссон Дж.К., Кристмансдоттир Х., Дальквист М., Самундссон К., Ханнингтон М. и др. (февраль 2001 г.). «Открытие и описание гигантских подводных смектитовых конусов на морском дне Эйяфьордура, северная Исландия, и новой среды обитания термальных микробов» . Прикладная и экологическая микробиология . 67 (2): 827–833. дои : 10.1128/АЕМ.67.2.827-833.2001 . ПМК 92654 . ПМИД 11157250 .
^ Лю Ю, Брандт Д., Ишино С., Ишино Ю., Кунин Е.В., Калиновский Дж. и др. (июнь 2019 г.). «Новые архейные вирусы, обнаруженные путем метагеномного анализа вирусных сообществ в накопительных культурах» . Экологическая микробиология . 21 (6): 2002–2014. дои : 10.1111/1462-2920.14479 . ПМЦ 11128462 . ПМИД 30451355 . S2CID 53950297 .

Дальнейшее чтение

Стакебрандт Э., Фредериксен В., Гаррити Г.М., Гримонт П.А., Кемпфер П., Мейден М.С. и др. (май 2002 г.). «Отчет специального комитета по переоценке определения видов в бактериологии». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (Часть 3): 1043–1047. дои : 10.1099/ijs.0.02360-0 . ПМИД 12054223 .
Гюртлер В., Мэйалл, Британская Колумбия (январь 2001 г.). «Геномные подходы к типированию, таксономии и эволюции бактериальных изолятов». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Часть 1): 3–16. дои : 10.1099/00207713-51-1-3 . ПМИД 11211268 .
Далеви Д., Хугенхольц П., Блэколл Л.Л. (март 2001 г.). «Подход с использованием множественных внешних групп к разрешению филогенетических отношений на уровне деления с использованием данных 16S рДНК» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Часть 2): 385–391. дои : 10.1099/00207713-51-2-385 . ПМИД 11321083 .
Кесвани Дж., Уитмен В.Б. (март 2001 г.). «Связь сходства последовательности 16S рРНК с гибридизацией ДНК у прокариот» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Часть 2): 667–678. дои : 10.1099/00207713-51-2-667 . ПМИД 11321113 .
Молодой Дж. М. (май 2001 г.). «Значения альтернативных классификаций и горизонтального переноса генов для бактериальной таксономии». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Часть 3): 945–953. дои : 10.1099/00207713-51-3-945 . ПМИД 11411719 .
Кристенсен Х., Бисгаард М., Фредериксен В., Маттерс Р., Кунерт П., Олсен Дж.Э. (ноябрь 2001 г.). «Достаточно ли характеристики одного изолята для действительной публикации нового рода или вида? Предложение об изменении рекомендации 30b Бактериологического кодекса (редакция 1990 г.)» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 51 (Часть 6): 2221–2225. дои : 10.1099/00207713-51-6-2221 . ПМИД 11760965 .
Кристенсен Х., Анген О., Маттерс Р., Олсен Дж.Э., Бисгаард М. (май 2000 г.). «Гибридизация ДНК-ДНК, определенная в микролунках с использованием ковалентного присоединения ДНК» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (3): 1095–1102. дои : 10.1099/00207713-50-3-1095 . ПМИД 10843050 .
Сюй ХХ, Кавамура Ю, Ли Н, Чжао Л, Ли ТМ, Ли ЗЮ и др. (июль 2000 г.). «Экспресс-метод определения содержания G+C в бактериальных хромосомах путем мониторинга интенсивности флуоресценции при денатурации ДНК в капиллярной трубке» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (4): 1463–1469. дои : 10.1099/00207713-50-4-1463 . ПМИД 10939651 .
Молодой Дж.М. (июль 2000 г.). «Предложения по избежанию продолжающейся путаницы с Бактериологическим кодексом» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (4): 1687–1689. дои : 10.1099/00207713-50-4-1687 . ПМИД 10939677 .
Хансманн С., Мартин В. (июль 2000 г.). «Филогения 33 рибосомальных и шести других белков, закодированных в древнем кластере генов, который консервативен во всех геномах прокариот: влияние исключения из анализа плохо выравниваемых участков» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (4): 1655–1663. дои : 10.1099/00207713-50-4-1655 . ПМИД 10939673 .
Тиндалл Б.Дж. (июль 1999 г.). «Предложение об изменении Правил обозначения типовых штаммов, депонированных под номерами коллекций культур, выделенных для патентных целей» . Международный журнал систематической бактериологии . 49, ч. 3 (3): 1317–1319. дои : 10.1099/00207713-49-3-1317 . ПМИД 10490293 .
Тиндалл Б.Дж. (июль 1999 г.). «Предложение изменить Правило 18a, Правило 18f и Правило 30, чтобы ограничить обратную силу изменений, принятых ICSB» . Международный журнал систематической бактериологии . 49 (3): 1321–1322. дои : 10.1099/00207713-49-3-1321 . ПМИД 10425797 .
Тиндалл Б.Дж. (июль 1999 г.). «Непонимание бактериологического кода» . Международный журнал систематической бактериологии . 49 (3): 1313–1316. дои : 10.1099/00207713-49-3-1313 . ПМИД 10425796 .
Тиндалл Б.Дж. (июль 1999 г.). «Предложения по актуализации и внесению изменений в Бактериологический кодекс» . Международный журнал систематической бактериологии . 49, ч. 3 (3): 1309–1312. дои : 10.1099/00207713-49-3-1309 . ПМИД 10425795 .
Палис Т., Накамура Л.К., Кохан FM (октябрь 1997 г.). «Открытие и классификация экологического разнообразия в мире бактерий: роль данных о последовательностях ДНК» . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (4): 1145–1156. дои : 10.1099/00207713-47-4-1145 . ПМИД 9336922 .
Эзеби Ж.П. (апрель 1997 г.). «Список названий бактерий, имеющих номенклатурное положение: папка доступна в Интернете» . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (2): 590–592. дои : 10.1099/00207713-47-2-590 . ПМИД 9103655 .
Бургграф С., Хейдер П., Эйс Н. (февраль 1997 г.). «Основная группа архей» . Природа . 385 (6619): 780. Бибкод : 1997Natur.385..780B . дои : 10.1038/385780a0 . ПМИД 9039908 . S2CID 4357113 .
Барнс С.М., Делвич К.Ф., Палмер Дж.Д., Пейс Н.Р. (август 1996 г.). «Перспективы разнообразия архей, термофилии и монофилии на основе последовательностей рРНК окружающей среды» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (17): 9188–9193. Бибкод : 1996PNAS...93.9188B . дои : 10.1073/pnas.93.17.9188 . ПМК 38617 . ПМИД 8799176 .
Клейтон Р.А., Саттон Дж., Хинкль П.С., Балт С., Филдс С. (июль 1995 г.). «Внутривидовая изменчивость последовательностей малых субъединиц рРНК в GenBank: почему отдельные последовательности не могут адекватно представлять таксоны прокариот» . Международный журнал систематической бактериологии . 45 (3): 595–599. дои : 10.1099/00207713-45-3-595 . ПМИД 8590690 .
Барнс С.М., Фундига Р.Э., Джеффрис М.В., Пейс Н.Р. (март 1994 г.). «Замечательное разнообразие архей обнаружено в горячих источниках Йеллоустонского национального парка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (5): 1609–1613. Бибкод : 1994PNAS...91.1609B . дои : 10.1073/pnas.91.5.1609 . ПМК 43212 . ПМИД 7510403 .
Мюррей Р.Г., Шлейфер К.Х. (январь 1994 г.). «Таксономические заметки: предложение по регистрации свойств предполагаемых таксонов прокариотов» . Международный журнал систематической бактериологии . 44 (1): 174–176. дои : 10.1099/00207713-44-1-174 . ПМИД 8123559 .
Винкер С., Везе CR (1991). «Определение доменов Archaea, Bacteria и Eucarya с точки зрения характеристик малых субъединиц рибосомальной РНК». Систематическая и прикладная микробиология . 14 (4): 305–310. дои : 10.1016/s0723-2020(11)80303-6 . ПМИД 11540071 .
Вёзе Ч.Р., Кандлер О., Уилис М.Л. (июнь 1990 г.). «На пути к естественной системе организмов: предложение по доменам архей, бактерий и эукариев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–4579. Бибкод : 1990PNAS...87.4576W . дои : 10.1073/pnas.87.12.4576 . ПМК 54159 . ПМИД 2112744 .
Ахенбах-Рихтер Л., Вёзе Ч.Р. (1988). «Спейсерная область рибосомального гена у архебактерий». Систематическая и прикладная микробиология . 10 (3): 211–214. дои : 10.1016/s0723-2020(88)80002-x . ПМИД 11542149 .
Макгилл Т.Дж., Юрка Дж., Собески Дж.М., Пикетт М.Х., Везе Ч.Р., Фокс Дж.Э. (1986). «Характерные архебактериальные олигонуклеотиды 16S рРНК». Систематическая и прикладная микробиология . 7 (2–3): 194–197. дои : 10.1016/S0723-2020(86)80005-4 . ПМИД 11542064 .
Вёзе Ч.Р., Гупта Р., Хан С.М., Зиллиг В., Ту Дж. (1984). «Филогенетические взаимоотношения трех серозависимых архебактерий». Систематическая и прикладная микробиология . 5 : 97–105. дои : 10.1016/S0723-2020(84)80054-5 . ПМИД 11541975 .
Woese CR, Fox GE (ноябрь 1977 г.). «Филогенетическая структура прокариотического домена: первичные царства» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 74 (11): 5088–5090. Бибкод : 1977PNAS...74.5088W . дои : 10.1073/pnas.74.11.5088 . ПМК 432104 . ПМИД 270744 .

[1] Разрешение широко распространенных неполных и неравномерных классификаций архей на основе нормализованной по рангу таксономии, основанной на геноме.

[2] Укоренение домена архей с помощью филогеномного анализа поддерживает основу протеоархеот Нового царства

[3] См . веб-страницу NCBI о Корархеоте . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.

[4] Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .

[5] Бун Д.Р., Бреннер Д.Д., Кастенхольц Р.В., Де Вос П., Гаррити ГМ, Криг Н.Р., Гудфеллоу М. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. ISBN 978-0-387-21609-6 . OCLC 619443681 .

[Elkins-2008-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .

[Liu_218–222-7] Перейти обратно: ^а ^б Лю Ю, Ли М (июнь 2022 г.). «Нестабильное эволюционное положение Корархеоты и ее взаимоотношения с другими архей TACK и Асгарда» . mLife . 1 (2): 218–222. дои : 10.1002/mlf2.12020 . ISSN 2770-100X . ПМЦ 10989867 . S2CID 249298036 .

[8] Миллер-Коулман Р.Л., Додсворт Дж.А., Росс К.А., Шок Э.Л., Уильямс А.Дж., Хартнетт Х.Э. и др. (04 мая 2012 г.). «Разнообразие, биогеография и численность корархеот в горячих источниках Йеллоустона и Большого Бассейна, а также моделирование экологической ниши на основе машинного обучения» . ПЛОС ОДИН . 7 (5): e35964. дои : 10.1371/journal.pone.0035964 . ПМЦ 3344838 . ПМИД 22574130 .

[9] Барнс С.М., Делвич К.Ф., Палмер Дж.Д., Пейс Н.Р. (август 1996 г.). «Перспективы разнообразия архей, термофилии и монофилии на основе последовательностей рРНК окружающей среды» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (17): 9188–9193. Бибкод : 1996PNAS...93.9188B . дои : 10.1073/pnas.93.17.9188 . ПМК 38617 . ПМИД 8799176 .

[10] Рейгстад Л.Дж., Йоргенсен С.Л., Шлепер С. (март 2010 г.). «Разнообразие и численность корархеот в наземных горячих источниках Исландии и Камчатки» . Журнал ISME . 4 (3): 346–356. дои : 10.1038/ismej.2009.126 . ПМИД 19956276 . S2CID 6951841 .

[Elkins_8102–8107-11] Перейти обратно: ^а ^б Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .

[12] Барнс С.М., Делвич К.Ф., Палмер Дж.Д., Пейс Н.Р. (август 1996 г.). «Перспективы разнообразия архей, термофилии и монофилии на основе последовательностей рРНК окружающей среды» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (17): 9188–9193. Бибкод : 1996PNAS...93.9188B . дои : 10.1073/pnas.93.17.9188 . ПМК 38617 . ПМИД 8799176 .

[Elkins_2008-13] Перейти обратно: ^а ^б Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–8107. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК 2430366 . ПМИД 18535141 .

[14] Шох К.Л., Чуфо С., Домрачев М., Хоттон К.Л., Каннан С., Хованская Р. и др. (январь 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах» . База данных . 2020 : baaa062. дои : 10.1093/база данных/baaa062 . ПМК 7408187 . ПМИД 32761142 .

[Schoch-2020-15] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Шох К.Л., Чуфо С., Домрачев М., Хоттон К.Л., Каннан С., Хованская Р. и др. (январь 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах» . База данных . 2020 : baaa062. дои : 10.1093/база данных/baaa062 . ПМК 7408187 . ПМИД 32761142 .

[McKay-2019-16] Перейти обратно: ^а ^б Маккей Л.Дж., Длакич М., Филдс М.В., Дельмонт Т.О., Эрен А.М., Джей З.Дж. и др. (апрель 2019 г.). «Совместная геномная способность к анаэробному метаболизму метана и диссимиляционному метаболизму серы обнаружена у корархеот». Природная микробиология . 4 (4): 614–622. дои : 10.1038/s41564-019-0362-4 . ОСТИ 1779059 . ПМИД 30833730 . S2CID 256705892 .

[17] Браун А.М., Хупс С.Л., Уайт Р.Х., Сариски Калифорния (декабрь 2011 г.). «Биосинтез пуринов у архей: вариации на тему» . Биология Директ . 6:63 . дои : 10.1186/1745-6150-6-63 . ПМК 3261824 . ПМИД 22168471 .

[Miller-2008-18] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Миллер Р.Л. (январь 2008 г.). «Разнообразие, биогеография и геохимическая среда обитания Korarchaeota в континентальных горячих источниках» . Ретроспективные тезисы и диссертации UNLV . дои : 10.25669/6h98-vit6 .

[Rodrigues-Oliveira-2017-19] Перейти обратно: ^а ^б Родригес-Оливейра Т., Бельмок А., Васконселлос Д., Шустер Б., Чьяу СМ (2017). «Археальные S-слои: обзор и современное состояние» . Границы микробиологии . 8 : 2597. дои : 10.3389/fmicb.2017.02597 . ПМК 5744192 . ПМИД 29312266 .

[Elkins-2007-20] Перейти обратно: ^а ^б Элкинс Дж.Г., Кунин В., Андерсон И., Барри К., Гольцман Э., Лапидус А. и др. (май 2007 г.). Корархеоты: архейные сироты, представляющие наследственную линию жизни (Отчет). Беркли, Калифорния (США): Национальная лаборатория Лоуренса Беркли. (ЛБНЛ). дои : 10.2172/960397 . ОСТИ 960397 .

[21] Берг И.А., Кокелькорн Д., Бакель В., Фукс Г. (декабрь 2007 г.). «Путь автотрофной ассимиляции углекислого газа 3-гидроксипропионата / 4-гидроксибутирата у архей». Наука . 318 (5857): 1782–1786. дои : 10.1126/science.1149976 . ПМИД 18079405 . S2CID 13218676 .

[22] Такай К., Ёсихико С (1 февраля 1999 г.). «Молекулярный взгляд на разнообразие архей в морской и наземной среде с горячей водой» . Микробиология Экология . 28 (2): 177–188. дои : 10.1111/j.1574-6941.1999.tb00573.x . S2CID 84495991 .

[Reigstad-2010-23] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Рейгстад Л.Дж., Йоргенсен С.Л., Шлепер С. (март 2010 г.). «Разнообразие и численность корархеот в наземных горячих источниках Исландии и Камчатки» . Журнал ISME . 4 (3): 346–356. дои : 10.1038/ismej.2009.126 . ПМИД 19956276 . S2CID 6951841 .

[KamKors-24] Перейти обратно: ^а ^б Аухтунг Т.А., Шындряева Г., Кавано К.М. (январь 2011 г.). «Филогенетический анализ 16S рРНК и количественная оценка корархеот, обитающих в горячих источниках Камчатки, Россия». Экстремофилы . 15 (1): 105–116. дои : 10.1007/s00792-010-0340-5 . ПМИД 21153671 . S2CID 12091232 .

[25] Рейгстад Л.Дж., Йоргенсен С.Л., Шлепер С. (март 2010 г.). «Разнообразие и численность корархеот в наземных горячих источниках Исландии и Камчатки» . Журнал ISME . 4 (3): 346–356. дои : 10.1038/ismej.2009.126 . ПМИД 19956276 .

[26] Аухтунг ТА (2007). Экология гидротермального кандидатного архейного отдела Корархеота (кандидатская диссертация). Гарвардский университет.

[27] Миллер-Коулман Р.Л., Додсворт Дж.А., Росс К.А., Шок Э.Л., Уильямс А.Дж., Хартнетт Х.Э. и др. (04 мая 2012 г.). Мормил М.Р. (ред.). «Разнообразие, биогеография и численность корархеот в горячих источниках Йеллоустона и Большого Бассейна, а также моделирование экологической ниши на основе машинного обучения» . ПЛОС ОДИН . 7 (5): e35964. дои : 10.1371/journal.pone.0035964 . ПМЦ 3344838 . ПМИД 22574130 .

[28] Мартейнссон В.Т., Кристьянссон Дж.К., Кристмансдоттир Х., Дальквист М., Самундссон К., Ханнингтон М. и др. (февраль 2001 г.). «Открытие и описание гигантских подводных смектитовых конусов на морском дне Эйяфьордура, северная Исландия, и новой среды обитания термальных микробов» . Прикладная и экологическая микробиология . 67 (2): 827–833. дои : 10.1128/АЕМ.67.2.827-833.2001 . ПМК 92654 . ПМИД 11157250 .

[29] Лю Ю, Брандт Д., Ишино С., Ишино Ю., Кунин Е.В., Калиновский Дж. и др. (июнь 2019 г.). «Новые архейные вирусы, обнаруженные путем метагеномного анализа вирусных сообществ в накопительных культурах» . Экологическая микробиология . 21 (6): 2002–2014. дои : 10.1111/1462-2920.14479 . ПМЦ 11128462 . ПМИД 30451355 . S2CID 53950297 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]

[26]

[27]

[28]

[29]