Деферрибактерии

Деферрибактерии
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Деферрибактериота ; Гаррити и Холт 2021
Сорт:	Деферрибактерии ; Хубер и Стеттер, 2002 г.
Заказ:	Деферрибактерии ; Хубер и Стеттер, 2002 г.
Семья:	Деферрибактерии ; Хубер и Стеттер, 2002 г.
Роды
	Кальдитерривибрио ; Деферривибрио ; Денитровибрион ; Деферрибактер ; Флекситипы ; Геовибрио ; Лимисалсивибрио ; Муциспириллы ; Петротермобактер ; Селен Брио ;
Синонимы
	Деферрибактериаты: «Деферрибактерии» Гаррити и Холт, 2001 г. ; «Деферрибактерита» Whitman et al. 2018 год ; «Деферрибактериоза» Орен и др. 2015 год ; ; Деферрибактерии: Ферробактерии Кавальер-Смит 2002 г. ; «Деферрибактерии» Кавальер-Смит 2020 ; ; Деферрибактерии: Geovibriales (так в оригинале) Кавальер-Смит, 2002 г. ; ;

Deferribacteraceae , — семейство грамотрицательных бактерий которые производят энергию посредством анаэробного дыхания . ^[2]

Описание

Деферрибактерии имеют палочковидную форму , хотя палочки могут быть прямыми или изогнутыми. Они грамотрицательны . Деферрибактерии осуществляют анаэробное дыхание с использованием железа, марганца или нитратов . Они также могут производить энергию путем ферментации . Типовой род семейства — Deferribacter . ^[2]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LSPN). ^[3]^[4]

Тип Deferribacterota Гаррити и Холт 2021
- Класс Деферрибактерии Хубер и Стеттер, 2002 г.
  - Заказ Deferribacterales Huber & Stetter 2002
    - Род? Петротермобактер Тамазава и др. 2017 год
    - Семейство Calditerrivibrionaceae Spring et al. 2022 год
    - Семейство Deferribacteraceae Huber & Stetter 2002
    - Семейство Deferrivibrionaceae Zavarzina et al. 2023 год
    - Семейство Flexistipitaceae Spring et al. 2022 год
    - Семейство Geovibrionaceae Кавальер-Смит 2020
    - Семейство Mucispirillaceae Spring et al. 2022 год

на основе 16S рРНК ДП _08_2023 ^[5]^[6]^[7]

120 однокопийных маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^[8]^[9]^[10]

Деферрибактерии

	Фиала др и . 2000 г.

	Деферрибактер Грин и др . 1997 год

Муциспириллы Робертсон и др . 2005 г.

Calditerrivibrio Iino et al . 2008 год

	Деферривибрио Заварзина и др. 2023 год

	Петротермобактер Тамазава и др. 2017 год

	Лимисалсивибрио Спринг и др. 2022 год

	Геовибрио Каккаво и др . 2000 г.

	Денитровибрио Мир и Торсвик 2000

	Селениивибрио Раушенбах и др. 2013 год

Деферрибактерии

Флексистипитовые	Флекситипы

Кальдитерривибрионовые	Кальдитерривибрио

Деферривибрионовые	Деферривибрио

Деферрибактерии	Деферрибактер

Муциспирилловые

Муциспириллы

Геовибрионовые

	Лимисалсивибрио

	Геовибрио

	Денитровибрион

	Селен Брио

История

Семейство было впервые описано в 2001 году и включало роды Deferribacter , Flexistipes и Geovibrio . ^[2]

См. также

Ссылки

^ Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 . S2CID 239887308 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Хубер Х. и Стеттер К.О. «Семейство I. Deferribacteraceae fam. nov.». В: Руководство Берджи по систематической бактериологии, 2-е изд., том. 1 ( Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии) (Д. Р. Бун и Р. В. Кастенхольц, ред.), Springer-Verlag, Нью-Йорк (2001). стр. 465-466.
^ См . Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре . Данные, извлеченные из «Деферрибактерии» . Проверено 20 марта 2013 г.
^ См. веб-страницу NCBI , посвященную данным деферрибактерий, извлеченным из «Обозреватель таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 20 марта 2013 г.
^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

Эта бактериях статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 . S2CID 239887308 .

[Bergey-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с Хубер Х. и Стеттер К.О. «Семейство I. Deferribacteraceae fam. nov.». В: Руководство Берджи по систематической бактериологии, 2-е изд., том. 1 ( Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии) (Д. Р. Бун и Р. В. Кастенхольц, ред.), Springer-Verlag, Нью-Йорк (2001). стр. 465-466.

[3] См . Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре . Данные, извлеченные из «Деферрибактерии» . Проверено 20 марта 2013 г.

[4] См. веб-страницу NCBI , посвященную данным деферрибактерий, извлеченным из «Обозреватель таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 20 марта 2013 г.

[LTP-5] «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[6] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[7] «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[about-8] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-9] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-10] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]