Первоначально (около 2016 г.) предполагалось, что CPR составляет более 15% всего бактериального разнообразия и может состоять из более чем 70 различных типов. [1] Однако, База данных таксономии генома (2018), основанная на относительном эволюционном расхождении, показала, что CPR представляет собой один тип, [2] более ранние цифры были завышены из-за быстрой эволюции рибосомальных белков. [3] Линии CPR обычно характеризуются небольшими геномами и отсутствием нескольких путей биосинтеза и рибосомальных белков. Это привело к предположению, что они, вероятно, являются облигатными симбионтами . [4] [5]
В более ранней работе был предложен супертип под названием Patescibacteria , который включал несколько типов, позже отнесенных к группе CPR. [6] Поэтому Patescibacteria и CPR часто используются как синонимы. [7] Первое название не обязательно устарело: например, GTDB использует это имя, потому что они считают группу CPR типом. [2]
Хотя есть несколько исключений, у представителей типов излучения-кандидатов обычно отсутствует несколько путей биосинтеза некоторых аминокислот и нуклеотидов. На сегодняшний день не получено геномных доказательств того, что они способны продуцировать липиды, необходимые для формирования клеточной оболочки. [5] Кроме того, у них, как правило, отсутствуют полные циклы ТСА и комплексы цепи переноса электронов, включая АТФ-синтазу. Отсутствие нескольких важных путей, обнаруженных у большинства свободноживущих прокариот, указывает на то, что тип радиации-кандидат состоит из облигатных ферментативных симбионтов. [8]
Более того, члены CPR обладают уникальными рибосомными особенностями. Хотя члены CPR, как правило, некультивируются и поэтому не учитываются культурально-зависимыми методами, их также часто пропускают в независимых от культуры исследованиях, основанных на последовательностях 16S рРНК . Их гены рРНК, по-видимому, кодируют белки и имеют интроны самосплайсинга — особенности, которые редко наблюдаются у бактерий, хотя о них сообщалось ранее. [9] Благодаря этим интронам члены CPR не выявляются 16S-зависимыми методами. Кроме того, у всех членов CPR отсутствует рибосомальный белок L30 — черта, которая часто наблюдается у симбионтов. [8]
Многие из его характеристик сходны или аналогичны характеристикам сверхмелких архей ( DPANN ). [5]
Древо жизни 2016 года на основе рибосомальных белков. [4] Филогения бактерий и архей на основе рибосомальных белков и субъединиц РНК-полимеразы [10]
Согласно некоторым ранним филогенетическим анализам этой группы, основанным на профилях встречаемости рибосомальных белков и семейств белков, радиация типа-кандидата оказалась наиболее базально-ветвящейся линией у бактерий. Эти исследования выявили следующую филогению между типами и супертипами. Суперфилы выделены жирным шрифтом. [5] [4]
Однако несколько недавних исследований показали, что CPR принадлежит Terrabacteria и более тесно связан с Chloroflexota . [11] [12] [13] Эволюционные взаимоотношения, которые обычно подтверждаются этими исследованиями, заключаются в следующем.
Поскольку многие представители CPR некультивируются, их нельзя официально включить в бактериальную таксономию , но ряд предварительных названий, или Candidatus , в целом согласован. [6] [14] По состоянию на 2017 год два супертипа обычно выделяются как CPR: Parcubaacteria и Microgenomates. [1] Типы при СЛР включают:
Arc.Ask3.Ru Номер скриншота №: e387f72469490cb9f3290bf8f98d1a39__1709168340 URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/e3/39/e387f72469490cb9f3290bf8f98d1a39.html Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1: Candidate phyla radiation - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)
