Фузобактериота
| Фузобактериота | |
|---|---|
 | |
| Новая фузобактерия в жидкой культуре | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Фузобактериота Гаррити и Холт 2021 [2] |
| Сорт: | Фузобактерии Стейли и Уитмен, 2012 г. |
| Заказ: | Фузобактериалы Стейли и Уитмен, 2012 г. |
| Семьи [1] | |
| Синонимы | |
| |
Fusobacteriota — облигатно анаэробные неспорообразующие грамотрицательные палочки . Со времени первых сообщений в конце девятнадцатого века этим организмам давались различные названия, иногда одно и то же название применялось к разным видам. Совсем недавно произошли не только изменения в номенклатуре , но и были предприняты попытки дифференцировать виды, которые считаются либо патогенными, либо комменсалами, либо и тем, и другим. Из-за их асахаролитической природы и общего отсутствия положительных результатов в рутинных биохимических тестах лабораторная идентификация Fusobacteriota затруднена. Однако применение новых молекулярно-биологических методов к таксономии выявило ряд новых видов, включая подвиды Fusobacterium некрофорум и F. nucleatum , и предоставило новые методы идентификации. Участие Fusobacteriota в широком спектре инфекций у человека, вызывающих некроз тканей и сепсис, давно признано, а совсем недавно сообщалось об их значении при внутриамниотических инфекциях, преждевременных родах и тропических язвах.
Со времени первых сообщений о Fusobacteriota в конце девятнадцатого века разнообразие названий видов привело к некоторой путанице внутри родов Fusobacterium и Leptotrichia . Однако новые методы исследования привели к лучшему пониманию таксономии благодаря описанию нескольких новых видов Fusobacteriota. Среди новых описанных видов — F.ulcerans из тропических язв и несколько видов из полости рта. подвидование важных видов F. negrophorum и F. nucleatum Также возможно . Вполне вероятно, что систематика Fusobacteriota получит дальнейшее развитие в будущем. [3]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN). [4] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [5]
| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [6] [7] [8] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [9] [10] [11] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Роль в болезнях человека
[ редактировать ]Появляются новые доказательства того, что эта бактерия может вызывать рак толстой кишки человека или быть связана с ним. В 2011 году исследователи сообщили о присутствии Fusobacteriota в тканях рака толстой кишки (Genome Res 2012; 22:292), а новое многоцентровое исследование предоставило доказательства того, что некоторые случаи, особенно правосторонние, могут быть вызваны инфекцией Fusobacteriota. [12]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Фузобактерии» . Таксономия NCBI . Бетесда, Мэриленд: Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 3 января 2019 г.
- ^ Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 .
- ^ Беннетт, КВ; Эли, А. (1 октября 1993 г.). «Фузобактерии: Новая систематика и родственные заболевания» . Журнал медицинской микробиологии . 39 (4): 246–254. дои : 10.1099/00222615-39-4-246 . ПМИД 8411084 .
- ^ Ж. П. Эзеби. «Фузобактерии» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 марта 2016 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Фузобактерии» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2016 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных таксономии генома . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ Буллман С , Педамаллу CS , Сичинска Е , Клэнси ТЭ , Чжан Х , Кай Д , Нойберг Д , Хуанг К , Гевара Ф , Нельсон Т , Чипашвили О , Хаган Т , Уокер М , Рамачандран А , Диосдадо Б , Серна Дж , Мулет Н , Ландольфи С., Рамон и Кахал С., Фасани Р., Агирре А.Дж., Нг К., Элез Е., Огино С., Табернеро Дж., Фукс К.С., Хан В.К., Нусифоро П., Мейерсон М. (2017). «Анализ персистенции фузобактерий и ответа на антибиотики при колоректальном раке» . Наука 358 (6369): 1443–1448. Бибкод : 2017Наука... 358.1443B дои : 10.1126/science.aal5240 . ПМЦ 5823247 . ПМИД 29170280 .
