Сфингобактерии (тип)

Сфингобактерии
	Бактероиды виды.
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Клэйд :	Группа ФКБ
Фила
	Группа Бактероидота-Хлоробиота. Бактероидота ; Бальнеолота ; Хлоробиота ; Игнавибактериота ; Родотермота ; " Капабабактерии " ; " Ка. Криптония " ; ; Калдитрихота ; Фибробактерита ; Одаренный драгоценными камнями ; " Ка. эгирибактерии " ; " Ка. Клоасимонетес " ; " Ка. Дельфибактерии " ; " Ca. Ферментибактерии " ; " Ка. Гидрогенедентес " ; " Калатсибактерии " ; " Ка. Маринимикробия " ; " Ка. " Зиксибактерии " ;
Синонимы
	Сфингобактерии Кавальер-Смит, 1987 г.

Группа FCB представляет собой супертип бактерий , названный в честь основных представителей типов Fibrobacterota , Chlorobiota и Bacteroidota . Считается, что члены образуют кладу из-за ряда сохранившихся сигнатур . ^[2]

Кавалье-Смит называет эквивалентную группу типом сфингобактерий . Он содержит классы Chlorobiota , Fibrobacterota , Bacteroidota и Flavobacteria . Однако большая научная общественность не придерживается этой мегаклассификации. ^[3]^[4]^[5]

Группа ФКБ ^[2]^[6]^[7]

на основе 16S рРНК ДП _12_2021 ^[8]^[9]^[10]

GTDB 07-RS207 по базе данных таксономии генома ^[11]^[12]^[13]

ФКБ

" Гидрогенедентес "

« Ферментибактерии »

	Одаренный драгоценными камнями

	« Лацецибактерии ».

Фибробактерита

« Дельфибактерии »

	« Клоацимонет »

	« Зиксибактерии »

	Калдитрихота

	« Маринимикробия »

Бактероидота-Хлоробиота

	Игнавибактериота

	« Криптония »

« Капабактерии »

Хлоробиота

	Родотермота

	Бактероидота

	Фибробактерита

	Одаренный драгоценными камнями

Калдитрихота

	Игнавибактериота

	Хлоробиота

Родотермота

	Бальнеолота

	Бактероидота

« Лацецибактерии (в т.ч. « Handelsmanbacteria »)

	" Эдвардсбактерии ""

	« Зиксибактерии »

	« Эйзенбактерия »

	« Крумхользибактериота » (в т.ч. « Дельфибактерия »)

	« Ферментибактерии » (в т.ч. « Эгирибактерии »)

	Гемматимонадота (в т.ч. « Глассбактерии »)

« Гидротермота » (в т.ч. « Стальбактерии », « Пиропристинус »)

	« Клоацимонет »

	Фибробактерии (в т.ч. « Раймондбактерии »)

	« Криптония »

	« Игнавибактерии »

" Хлоробия "

	Родотермия (в т.ч. Balneolales )

	Бактероидии

Аналогичная ситуация наблюдается и с группой ПВХ/планктобактерий .

Примечания

См. также

Ссылки

^ Кавалер-Смит, Т. (1987). Происхождение клеток: симбиоз генов, катализаторов и мембран. Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии 52, 805-24, [1] , [2] .
^ Jump up to: ^а ^б Гупта, Р.С. (2004). «Филогения и характеристики сигнатурных последовательностей Fibrobacteres, Chlorobi и Bacteroidetes». Критические обзоры по микробиологии . 30 (2): 123–143. дои : 10.1080/10408410490435133 . ПМИД 15239383 . S2CID 24565648 .
^ Кавалер-Смит Т. (2006). «Укоренение древа жизни посредством анализа переходов» . Биол. Прямой . 1:19 . дои : 10.1186/1745-6150-1-19 . ПМК 1586193 . ПМИД 16834776 .
^ Криг, Северная Каролина; Людвиг, В.; Уитмен, ВБ; Хедлунд, BP; Пастер, Би Джей; Стейли, Джей Ти; Уорд, Н.; Браун, Д.; Парте, А. (24 ноября 2010 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae и Planctomycetes . Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 908. ИСБН 978-0-387-95042-6 . Британская библиотека №. GBA561951.
^ Классификация в ЛПСН ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .
^ Эмили А. Элоэ-Фадрош и др. 2017 г., Глобальное метагеномное исследование выявило новый тип бактерий-кандидатов в геотермальных источниках. Nature Communications 7 · Январь 2016 г. DOI: 10.1038/ncomms1047
^ Киркегор, Расмус Хансен; Дюхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Нерихло, Марта; Карст, Сорен Майкл; Альбертсен, Мэдс; Нильсен, Пер Халкьер (октябрь 2016 г.). «Геномная информация о членах кандидатного типа Hyd24-12, распространенного в мезофильных анаэробных ферментерах» . Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. дои : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . ПМК 5030696 . ПМИД 27058503 .
^ «ЛТП» . Проверено 23 февраля 2021 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 23 февраля 2021 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_12_2021» (PDF) . Проверено 23 февраля 2021 г.
^ «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ "ar53_r207.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ Обнимаю, Лаура А.; Бейкер, Бретт Дж.; Анантараман, Картик; Браун, Кристофер Т.; Пробст, Александр Дж.; Кастель, Синди Дж.; Баттерфилд, Кристина Н.; Хернсдорф, Алекс В.; Амано, Юки; Исе, Котаро; Сузуки, Йохей; Дудек, Наташа; Релман, Дэвид А.; Финстад, Кари М.; Амундсон, Рональд; Томас, Брайан С.; Банфилд, Джиллиан Ф. (11 апреля 2016 г.). «Новый взгляд на древо жизни» . Природная микробиология . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . ПМИД 27572647 .

Эта бактериях статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Кавалер-Смит, Т. (1987). Происхождение клеток: симбиоз генов, катализаторов и мембран. Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии 52, 805-24, [1] , [2] .

[FCB-2] Jump up to: ^а ^б Гупта, Р.С. (2004). «Филогения и характеристики сигнатурных последовательностей Fibrobacteres, Chlorobi и Bacteroidetes». Критические обзоры по микробиологии . 30 (2): 123–143. дои : 10.1080/10408410490435133 . ПМИД 15239383 . S2CID 24565648 .

[pmid16834776-3] Кавалер-Смит Т. (2006). «Укоренение древа жизни посредством анализа переходов» . Биол. Прямой . 1:19 . дои : 10.1186/1745-6150-1-19 . ПМК 1586193 . ПМИД 16834776 .

[4] Криг, Северная Каролина; Людвиг, В.; Уитмен, ВБ; Хедлунд, BP; Пастер, Би Джей; Стейли, Джей Ти; Уорд, Н.; Браун, Д.; Парте, А. (24 ноября 2010 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae и Planctomycetes . Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 908. ИСБН 978-0-387-95042-6 . Британская библиотека №. GBA561951.

[5] Классификация в ЛПСН ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[6] Эмили А. Элоэ-Фадрош и др. 2017 г., Глобальное метагеномное исследование выявило новый тип бактерий-кандидатов в геотермальных источниках. Nature Communications 7 · Январь 2016 г. DOI: 10.1038/ncomms1047

[7] Киркегор, Расмус Хансен; Дюхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Нерихло, Марта; Карст, Сорен Майкл; Альбертсен, Мэдс; Нильсен, Пер Халкьер (октябрь 2016 г.). «Геномная информация о членах кандидатного типа Hyd24-12, распространенного в мезофильных анаэробных ферментерах» . Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. дои : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . ПМК 5030696 . ПМИД 27058503 .

[8] «ЛТП» . Проверено 23 февраля 2021 г.

[9] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 23 февраля 2021 г.

[10] «Примечания к выпуску LTP_12_2021» (PDF) . Проверено 23 февраля 2021 г.

[about-11] «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[tree-12] "ar53_r207.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[taxon_history-13] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[14] Обнимаю, Лаура А.; Бейкер, Бретт Дж.; Анантараман, Картик; Браун, Кристофер Т.; Пробст, Александр Дж.; Кастель, Синди Дж.; Баттерфилд, Кристина Н.; Хернсдорф, Алекс В.; Амано, Юки; Исе, Котаро; Сузуки, Йохей; Дудек, Наташа; Релман, Дэвид А.; Финстад, Кари М.; Амундсон, Рональд; Томас, Брайан С.; Банфилд, Джиллиан Ф. (11 апреля 2016 г.). «Новый взгляд на древо жизни» . Природная микробиология . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . ПМИД 27572647 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]