Томас Кавальер-Смит
Томас Кавальер-Смит | |
---|---|
![]() | |
Рожденный | Лондон, Великобритания | 21 октября 1942 г.
Умер | 19 марта 2021 г. | (78 лет)
Национальность | Британский |
Альма-матер | Колледж Гонвилл и Кайус в Кембридже , Королевский колледж Лондона |
Известный | Система классификации всех организмов Кавальера-Смита. |
Награды | Член Королевского общества (1998). Международная премия по биологии (2004 г.) ( Медаль Линнея 2007) Медаль Фринка (2007) |
Научная карьера | |
Поля | Зоология |
Учреждения | Королевский колледж Лондона , Университет Британской Колумбии , Оксфордский университет |
Диссертация | Развитие органелл у Chlamydomonas Reinhardii (1967) |
Веб-сайт | www |
Томас ( Том ) Кавальер-Смит , FRS , FRSC , NERC (21 октября 1942 г. - 19 марта 2021 г.) научный сотрудник [1] ), был профессором эволюционной биологии на факультете зоологии Оксфордского университета . [2]
Его исследования привели к открытию ряда одноклеточных организмов ( протистов ) и пропагандировали различные основные таксономические группы, такие как Chromista , Chromalveolata , Opisthokonta , Rhizaria и Excavata . Он был известен своими системами классификации всех организмов .
Жизнь и карьера
[ редактировать ]Кавальер-Смит родился 21 октября 1942 года в Лондоне. Его родителями были Мэри Мод (урожденная Брэтт) и Алан Хейлс Спенсер Кавалер Смит. [3]
Он получил образование в Норвичской школе , колледже Гонвилл и Кайус в Кембридже (магистратура) по биологии и Королевском колледже Лондона (доктор философии) по зоологии. В период с 1964 по 1967 год он работал под руководством сэра Джона Рэндалла над докторской диссертацией; его диссертация называлась « Развитие органелл у Chlamydomonas Reinhardii». [4]
С 1967 по 1969 год Кавальер-Смит был приглашенным исследователем в Университете Рокфеллера . В 1969 году он стал преподавателем биофизики в Королевском колледже Лондона. В 1982 году ему было присвоено звание читателя.С начала 1980-х годов Смит продвигал взгляды на таксономические отношения между живыми организмами. Он был плодовитым человеком, опираясь на почти беспрецедентное количество информации, чтобы предложить новые отношения.В 1989 году он был назначен профессором ботаники в Университете Британской Колумбии .В 1999 году он поступил в Оксфордский университет , став профессором эволюционной биологии в 2000 году. [5]
Томас Кавалье-Смит умер в марте 2021 года от рака.
Таксономия
[ редактировать ]Кавальер-Смит был плодовитым систематиком, опиравшимся на почти беспрецедентное количество информации, чтобы предложить новые взаимоотношения. Его предложения были преобразованы в таксономические концепции и классификации, с которыми он связал новые имена или, в некоторых случаях, повторно использовал старые имена.Кавалье-Смит не следовал и не поддерживал четкой таксономической философии, но его подход был наиболее близок к эволюционной таксономии. Он и несколько других коллег были против кладистических подходов к таксономии, утверждая, что цели классификации и классификации разные; [6] его подход был аналогичен подходу многих других широкомасштабных методов лечения протистов. [7] [8]
Объем таксономических предложений Кавальер-Смита был велик, но численность и состав компонентов (таксонов), а зачастую и их отношения, не были стабильными. Предложения часто были двусмысленными и недолговечными; он часто вносил поправки в таксоны без изменения названия. Его подход не был общепринятым: другие пытались подкрепить таксономию протистов с помощью вложенной серии атомизированных, фальсифицируемых положений, следуя философии трансформированной кладистики. [9] Однако такой подход больше не считается оправданным. [10]
Идеи Кавалье-Смита, приведшие к таксономическим структурам, обычно сначала представлялись в виде таблиц и сложных аннотированных диаграмм . Представленные на научных конференциях, они иногда были слишком насыщенными и зачастую написанными слишком мелко, чтобы идеи можно было легко уловить. Некоторые такие диаграммы попали в публикации, где было возможно тщательное изучение и где предположительность некоторых утверждений была очевидна. Богатство его идей, их продолжающаяся эволюция и переход в таксономии придали исследованиям Кавалье-Смита путей эволюции ( филогении ) и возникающим на их основе классификациям своеобразный характер.
Стиль повествования Кавальера-Смита
[ редактировать ]Кавальер-Смит смело придерживался раннего традиционалистского стиля, характерного для Чарльза Дарвина , который опирался на повествования. Одним из примеров была его защита Chromista , которая объединяла линии, которые имели пластиды с хлорофиллами a и c (в первую очередь хризофиты и другие страменопилы , криптофиты и гаптофиты), несмотря на явные доказательства того, что группа соответствовала кладе.
Кавальер-Смит утверждал, что произошло единственное эндосимбиотическое событие, в результате которого хлорофилл-ас-содержащие пластиды были приобретены общим предком всех трех групп, и что различия (такие как цитологические компоненты и их расположение) между группами были результатом последующие эволюционные изменения. Эта интерпретация монофилетичности хромистов также требовала, чтобы гетеротрофные ( простейшие ) представители всех трех групп произошли от предков с пластидами.
Альтернативная гипотеза заключалась в том, что три хромофитные линии не были тесно связаны (за исключением других линий) (т.е. были полифилетическими), вероятно, что все они изначально не имели пластид, и что отдельные симбиотические события установили хлорофилловые пластиды a/c, страменопилы, криптомонады. и гаптофиты. Полифилия хромистов была подтверждена в последующих исследованиях. [11]
Отсутствие у Кавалье-Смита объективной и воспроизводимой методологии, которая могла бы воплотить эволюционные идеи в таксоны и иерархические схемы, часто сбивало с толку тех, кто не следил внимательно за его публикациями. Многие из его таксонов требуют частой корректировки, как показано ниже. В свою очередь, это привело к путанице в отношении объема таксонов, к которым применялось таксономическое название.
Кавальер-Смит также повторно использовал знакомые названия (например, Protozoa) для инновационных таксономических концепций. Это создало путаницу, потому что Protozoa использовалось и до сих пор используется в старом смысле: [12] наряду с его использованием в новых смыслах. Из-за склонности Кавальер-Смита быстро публиковаться и часто менять свои повествования и таксономические обзоры, его подход и утверждения часто обсуждались.
Palaeos.com описал его стиль письма следующим образом:
Профессор Кавальер-Смит из Оксфордского университета написал большой объем работ, которые получили высокую оценку. Тем не менее, он противоречив, и его сложно описать. Проблема может быть в стиле письма. Кавальер-Смит имеет тенденцию делать заявления там, где другие использовали бы повествовательные предложения, использовать повествовательные предложения там, где другие выражали бы свое мнение, и выражать мнения там, где ангелы боялись бы ступить. Кроме того, он может звучать высокомерно, реакционно и даже извращенно. С другой стороны, у него долгая история того, как он был прав, когда все остальные ошибались. На наш взгляд, все это затмевается одним несравненным достоинством: тем, что он разбирается в деталях. Это приводит к созданию очень длинных и очень сложных статей и вызывает всевозможные мрачные ропоты, рвение на себе волос и скрежет зубов среди тех, кому поручено попытаться объяснить его взгляды на молодость. См., например: Зрзавы (2001). [13] [и] Паттерсон (1999). [14] [15] [16] Тем не менее, он имеет дело со всеми соответствующими фактами. [17]
Вклад Кавальер-Смита
[ редактировать ]
Кавалье-Смит много писал о таксономии и классификации всех форм жизни, особенно протистов . Одним из его главных вкладов в биологию было предложение нового царства жизни: Хромиста , хотя его монофилетичность не получила широкого признания (см. выше).
Он также представил новые таксономические группы эукариот, такие как Chromalveolata (1981), Opisthokonta (1987), Rhizaria (2002) и Excavata (2002). Хотя его утверждения хорошо известны, многие из его утверждений были спорными и не получили широкого признания в научном сообществе . Его таксономические изменения часто влияли на общую классификацию всех форм жизни.
Модель восьми королевств
[ редактировать ]Первой крупной классификационной системой Кавалье-Смита было разделение всех организмов на восемь царств. В 1981 году он предположил, что путем полного пересмотра системы Пяти Королевств Роберта Уиттекера можно было бы создать восемь царств: Бактерии, Эуфунги, Цилиофунги, Животные, Билифиты, Виридиплантае, Криптофиты и Эвгленозоа. [18]
В 1983 году он пересмотрел свою систему, особенно в свете растущих доказательств того, что архебактерии представляют собой отдельную группу от бактерий. [19] включить ряд линий, которые были исключены из его лечения 1981 года, заняться проблемами полифилии и продвигать новые идеи взаимоотношений. Кроме того, были обнаружены некоторые протисты, лишенные митохондрий. [20] Поскольку было известно, что митохондрии являются результатом эндосимбиоза протеобактерий , в считалось, что эти амитохондриальные эукариоты изначально были таковыми, что знаменует собой важный этап эукариогенезе . В результате эти амитохондриальные протисты получили особый статус протозанского подцарства Archezoa , которое он позже повысил до статуса королевства. [20] Позже это было названо гипотезой Archezoa . [21] В 1993 году восемь царств стали: Eubacteria, Archaebacteria, Archezoa, Protozoa, Chromista, Plantae, Fungi и Animalia. [22]
Царство Архезоа претерпело множество изменений в составе из-за свидетельств полифилии и парафилии, прежде чем было заброшено. [23] [24] Он отнес некоторых бывших представителей царства Archezoa к типу Amoebozoa . [25]
Модели шести королевств
[ редактировать ]К 1998 году Кавальер-Смит сократил общее количество царств с восьми до шести: Animalia , Protozoa , Fungi , Plantae (включая глаукофиты, красные и зеленые водоросли ), Chromista и Bacteria. [26] Тем не менее, он уже впервые представил эту упрощенную схему в своей статье 1981 года. [18] и одобрил его в 1983 году. [27]

Пять королевств Кавальера-Смита классифицируются как эукариоты , как показано на следующей схеме:
- Эубактерии
- Не умирай
- Архебактерии
- Эукариоты
- Королевство простейших
- Униконы ( гетеротрофы )
- Королевство животных
- Королевство Грибов
- Биконты (прежде всего фотосинтезирующие )
- Королевство Plantae (включая красные и зеленые водоросли)
- Королевство Хромиста
Царство Animalia было разделено на четыре подцарства: Radiata (типы Porifera , Cnidaria , Placozoa и Ctenophora ), Myxozoa , Mesozoa и Bilateria (все остальные типы животных).
Он создал три новых типа животных: Acanthognatha ( коловратки , скребни , гастротрихи и гнатостомулиды ), Brachiozoa ( брахиоподы и форониды ) и Lobopoda ( онихофоры и тихоходки ).и признал в общей сложности 23 типа животных. [26]
Классификационная схема Кавальер-Смита 2003 года: [28]
- Юниконт
- тип простейших Amoebozoa (предки одноресничные)
- опистоконты
- Биконцы
- protozoan infrakingdom Rhizaria
- тип Церкозоа
- тип Retaria ( Radiozoa и Foraminifera )
- protozoan infrakingdom Excavata
- тип Лукозоа
- тип Метамонада
- тип Euglenozoa
- тип Перколозоа
- тип простейших Apusozoa ( Thecomonadea и Diphylleida )
- хромальвеолатов клада
- царство Хромиста ( Cryptista , Heterokonta и Haptophyta )
- protozoan infrakingdom Alveolata
- тип Цилиофора
- тип Miozoa ( Protalveolata , Dinozoa и Apicomplexa )
- царство Plantae ( Viridaeplantae , Rhodophyta и Glaucophyta )
- protozoan infrakingdom Rhizaria
Модель семи королевств
[ редактировать ]Кавалье-Смит и его коллеги пересмотрели классификацию в 2015 году и опубликовали ее в PLOS ONE . В этой схеме они вновь ввели разделение прокариот на два царства: бактерии (ранее «эубактерии») и археи (ранее «архебактерии»). Это основано на консенсусе в « Таксономическом очерке бактерий и архей» (TOBA) и « Каталоге жизни» . [29]
Предлагаемый корень древа жизни
[ редактировать ]В 2006 году Кавальер-Смит предположил, что последним универсальным общим предком всей жизни была нежгутиковая грамотрицательная бактерия («негибактерия») с двумя мембранами (также известная как дидермическая бактерия ). [30]
Награды и почести
[ редактировать ]Кавальер-Смит был избран членом Лондонского Линнеевского общества (FLS) в 1980 году, Института биологии (FIBiol) в 1983 году, Королевского общества искусств (FRSA) в 1987 году, Канадского института перспективных исследований (CIFAR) в 1988 году. , Королевское общество Канады (FRSC) в 1997 году и Лондонское королевское общество (FRS) в 1998 году. [31]
Он получил Международную премию по биологии от императора Японии в 2004 году и медаль Линнея в области зоологии в 2007 году. В период с 1998 по 2007 год он был назначен научным сотрудником Канадского института перспективных исследований (CIFAR) и советником Интегрированного микробного биоразнообразия. СИФАР. [32] В 2007 году он выиграл медаль Фринка общества Лондонского зоологического . [5]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Салдарриага, Хуан Ф. (2021). «Томас Кавальер-Смит (21 октября 1942 г. - 19 марта 2021 г.)». Протист (Некролог). 172 (3): 125807. doi : 10.1016/j.protis.2021.125807 . S2CID 235321431 .
- ^ «Профессор доктор Том Кавальер-Смит, FRS, FRSC, профессор эволюционной биологии и научный сотрудник NERC на факультете зоологии Оксфордского университета» . Кавали . Архивировано из оригинала 4 марта 2016 года . Проверено 11 февраля 2016 г. .
- ^ Брак Алана К. Смита и Мэри Мод Брэтт, 1-й квартал 1942 г., Вэйланд-рег. (GRO Ref 4b/743). Рождение Томаса С. Смита (девичья фамилия матери Брэтт) в последнем квартале 1942 года, Гринвичский р-н. (GRO Ref 1d/650). Источник www.freebmd.org.uk.
- ^ Кавалер-Смит, Томас (1967). Развитие органелл у Chlamydomonasrainhardii (кандидатская диссертация). Лондонский университет . OCLC 731219097 .
- ^ Jump up to: а б «Томас (Том) КАВАЛЕР-СМИТ» . Дебретта. Архивировано из оригинала 15 марта 2016 года . Проверено 11 февраля 2016 г. .
- ^ Руджеро, Майкл А.; Гордон, Деннис П.; Оррелл, Томас М.; Байи, Николя; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард К.; Кавалер-Смит, Томас; Гири, Майкл Д.; Кирк, Пол М. (29 апреля 2015 г.). Туесен, Эрик В. (ред.). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня» . ПЛОС ОДИН . 10 (4): e0119248. Бибкод : 2015PLoSO..1019248R . дои : 10.1371/journal.pone.0119248 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4418965 . ПМИД 25923521 .
- ^ Маргулис, Л .; МакХанн, Гавайи; Олендзенски Л., ред. (1993). Иллюстрированный словарь Protoctista: словарь водорослей, Apicomplexa, инфузорий, фораминифер, микроспоры, водяных плесеней, слизевиков и других протоктистов . Джонс и Бартлетт.
- ^ Маргулис, Линн; Шварц, Карлин В., ред. (1997). Пять королевств: иллюстрированный путеводитель по типам жизни на Земле . WH Freeman & Company. ISBN 0-613-92338-3 .
- ^ Паттерсон, ди-джей (1985). «Тонкая структура Opalina ranarum (семейство Opalinidae): филогения и классификация опалинид». Протистологическая . 21 : 413–428.
- ^ Риппель, Оливье (2008). «Гипотетико-дедуктивизм в систематике: факт или вымысел?» . Отдельные статьи по зоологии . 48 (23): 263–273. дои : 10.1590/S0031-10492008002300001 . ISSN 1807-0205 .
- ^ Бурки, Ф.; Роджер, Эй Джей; Браун, Миссури; Симпсон, AGB (2020). «Новое дерево эукариот» . Тенденции экологии и эволюции . 35 (1): 43–55. дои : 10.1016/j.tree.2019.08.008 . ПМИД 31606140 . S2CID 204545629 .
- ^ эль-Баваб, Ф. (2020). «Глава 3 – Тип Простейшие». Эмбриология и размножение беспозвоночных . Академическая пресса. стр. 68–102. дои : 10.1016/B978-0-12-814114-4.00003-5 . S2CID 240900596 .
- ^ Зрзавы, Ю (2001). «Взаимоотношения многоклеточных паразитов: обзор гипотез типа и более высокого уровня на основе недавних морфологических и молекулярно-филогенетических анализов» . Фолиа Паразитологическая . 48 (2): 81–103. дои : 10.14411/fp.2001.013 . ПМИД 11437135 .
- ^ Паттерсон, Дэвид Дж. (1999). «Разнообразие эукариотов». Американский натуралист . 154 (С4): С96–С124. дои : 10.1086/303287 . ПМИД 10527921 . S2CID 4367158 .
- ^ «Апусомонадида» . Архивировано из оригинала 7 сентября 2008 года . Проверено 11 февраля 2016 г. .
- ^ Эукария. Архивировано 20 декабря 2010 г. в Wayback Machine .
- ^ «Происхождение эукариев» . Архивировано из оригинала 20 декабря 2010 года . Проверено 9 февраля 2009 г.
- ^ Jump up to: а б Кавалер-Смит, Т. (1981). «Царства эукариот: семь или девять?». Биосистемы . 14 (3–4): 461–481. дои : 10.1016/0303-2647(81)90050-2 . ПМИД 7337818 .
- ^ Кавальер-Смит, Томас (1983). «Классификация из 6 царств и единая филогения». Эндоцитобиология II : 1027–1034.
- ^ Jump up to: а б Кавальер-Смит, Томас (1987). «Эукариоты без митохондрий». Природа . 326 (6111): 332–333. Бибкод : 1987Natur.326..332C . дои : 10.1038/326332a0 . ПМИД 3561476 . S2CID 4351363 .
- ^ Роджер, Эндрю Дж. (1999). «Реконструкция ранних событий эволюции эукариот» . Американский натуралист . 154 (С4): С146–С163. дои : 10.1086/303290 . ISSN 0003-0147 . ПМИД 10527924 . S2CID 32138852 .
- ^ Кавальер-Смит, Т. (1993). «Царство простейших и его 18 типов» . Микробиологические обзоры . 57 (4): 953–994. doi : 10.1128/mmbr.57.4.953-994.1993 . ПМК 372943 . ПМИД 8302218 .
- ^ Кавальер-Смит, Т.; Чао, Э.Э. (1996). «Молекулярная филогения свободноживущих архезоа Trepomonas agilis и природа первых эукариот». Журнал молекулярной эволюции . 43 (6): 551–562. Бибкод : 1996JMolE..43..551C . дои : 10.1007/BF02202103 . ПМИД 8995052 . S2CID 28992966 .
- ^ Симпсон, AGB; Бернар, К.; Фенчел, Т.; Паттерсон DJ (1997). «Организация шизофрении Mastigamoeba n. sp.: Еще больше свидетельств ультраструктурной идиосинкразии и простоты у пелобионтных протистов». Европейский журнал протистологии . 33 : 87–98. дои : 10.1016/S0932-4739(97)80024-7 .
- ^ Кавальер-Смит, Т. (2004). «Всего шесть царств жизни» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 271 (1545): 1251–62. дои : 10.1098/rspb.2004.2705 . ПМК 1691724 . ПМИД 15306349 .
- ^ Jump up to: а б Кавалер-Смит, Т. (2007). «Пересмотренная система жизни шести королевств». Биологические обзоры . 73 (3): 203–266. дои : 10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x . ПМИД 9809012 . S2CID 6557779 .
- ^ Кавальер-Смит, Т. (1983). «Классификация из 6 царств и единая филогения». В Шенк, HEA; Швеммлер, WS (ред.). Классификация из 6 царств и единая филогения . Эндоцитобиология II: Внутриклеточное пространство как олигогенетика. Берлин, Германия: Walter de Gruyter & Co., стр. 1027–1034. дои : 10.1515/9783110841237-104 . ISBN 9783110841237 .
- ^ Кавальер-Смит, Томас (2003). «Филогения протистов и классификация простейших высокого уровня». Европейский журнал протистологии . 39 (4): 338–348. дои : 10.1078/0932-4739-00002 .
- ^ Руджеро, Майкл А.; Гордон, Деннис П.; Оррелл, Томас М.; Байи, Николя; Бургуэн, Тьерри; Бруска, Ричард К.; Кавалер-Смит, Томас; Гири, Майкл Д.; Кирк, Пол М.; Туесен, Эрик В. (2015). «Классификация всех живых организмов более высокого уровня» . ПЛОС ОДИН . 10 (4): e0119248. Бибкод : 2015PLoSO..1019248R . дои : 10.1371/journal.pone.0119248 . ПМЦ 4418965 . ПМИД 25923521 .
- ^ Кавальер-Смит, Томас (2006). «Укоренение древа жизни посредством анализа переходов» . Биология Директ . 1:19 . дои : 10.1186/1745-6150-1-19 . ПМК 1586193 . ПМИД 16834776 .
- ^ «Награды и отличия» . Кавали. Архивировано из оригинала 23 июля 2016 года . Проверено 11 февраля 2016 г. .
- ^ «Томас Кавальер-Смит» . Канадский институт перспективных исследований . Проверено 11 февраля 2016 г. .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- «Т. Кавальер-Смит» . Зоология (веб-страница факультета). Оксфордский университет . Архивировано из оригинала 1 мая 2008 года.
- «академические ссылки на «Т. Кавальер-Смит" " – через Google Scholar.
- «Томас Кавальер-Смит» (биография). Лондон, Великобритания: Королевское общество .
- английские биологи
- Протистологи
- 1942 года рождения
- Британские биологи-эволюционисты
- Английские гуманисты
- Английские микробиологи
- Английские систематики
- Члены Королевского общества
- Люди, получившие образование в Нориджской школе
- Выпускники колледжа Гонвилл и Кайус в Кембридже
- Выпускники Королевского колледжа Лондона
- Преподаватели Королевского колледжа Лондона
- Академики Оксфордского университета
- Биологи 20-го века
- Биологи XXI века
- Британские учёные XX века
- Британские учёные XXI века
- 2021 смертей
- Томас Кавальер-Смит