Термодесульфобактерии

Термодесульфобактерии
	Нитратисульфовибрио обыкновенный
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Термодесульфобактерии ; Гаррити и Холт 2021
Классы
	« Анаэроферрофилалия » (так в оригинале) Мерфи и др. 2021 год ; Деферрисоматия Уэйта и др. 2020 год ; Десульфаркулия Уэйт и др. 2020 год ; Десульфобачция Уэйт и др. 2020 год ; Десульфобактерии Уэйта и др. 2020 год ; Десульфобульбия Уэйт и др. 2020 год ; « Ca. Desulfofervidia » Waite et al. 2020 год ; Десульфомонилия Уэйт и др. 2020 год ; Десульфовибриония Уэйт и др. 2020 год ; Десульфуромонадия Уэйт и др. 2020 год ; Дисульфурибактерии Waite et al. 2020 год ; Синтрофия Уэйт и др. 2020 год ; Синтрофобактерии Уэйта и др. 2020 год ; Синтрофорхабдия Уэйт и др. 2020 год ; Термодесульфобактерии Хатчикян и др. 2002 г. ; « Зимогения » Мерфи и др. 2021 год ;
Синонимы
	« Ca. Dadabacteria» Hug et al. 2016 год ; «Десульфобактерита» Уэйта и др. 2020 год ; «Термодесульфобактерии» Орен и др. 2015 год ; Термодесульфобактерии Гаррити и Холт, 2002 г. ; «Термодесульфобактериота» Whitman et al. 2018 год ;

Термодесульфобактерии относятся к типу ^[3] термофильный ^[4] сульфатредуцирующие бактерии .

Недавно был идентифицирован патогенный внутриклеточный термодесульфобактериот. ^[5]

Филогения

Филогения основана на филогеномном анализе:

120 однокопийных маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^[6]^[7]^[8]

Уэйт и др. 2020 год ^[2]

Термодесульфо

Деферрисоматия	Деферрисомалес

« Дадаибактерии »

Десульфуромонадия

	Геобактерии

	Десульфуромонадалес

Десульфомонилия	Десульфомонилялес

Синтрофия	Синтрофалы

Синтрофорабдия	Синтрофорабдалы

Дисульфибактерии	Диссульфурибактерии

« Термодесульфобактерии ».	Термодесульфобактерии

Десульфобульбия	Десульфобульбалы

« Десульфофервидия ».	«Десульфофервидалес»

Десульфовибриония	Десульфовибрионалес

Синтрофобактерии	Синтрофобактерии

Десульфобакчия

Десульфобаккалес

Десульфаркулия

	"Адьютрикалс"

	Десульфаркулалес

Десульфобактерии

	Десульфатигланделес

	Десульфобактерии

‑бактериота

на основе 16S рРНК ДП _08_2023 ^[9]^[10]^[11]

Десульфобактерита G

Синтрофорабдия	Синтрофорабдалы

Термодесульфобактерии	Термодесульфобактерии
« Термодесульфобактерии ».

« Деферрисоматота »

Деферрисоматия	Деферрисомалес

« Брадимонадия »

Миксококкота

«Десульфуромонадота»

	Геобактерии

	Десульфуромонадалес

Десульфуромонадия

Бделловибрионота

Десульфобактерия

	Синтрофобактерии

	Десульфобульбалы

	Десульфомонилялес

	Десульфаркулалес

Синтрофалы

	Десульфобаккалес

	Десульфатигланделес

Десульфобактерии

Десульфобактерита_А

Десульфовибриония	Десульфовибрионалес

Кампилобактерия

	Хризиогенота

	Деферрибактериота

Псевдомонадота

" Дельтапротео

	« Лямбдапротеобактерии » {SAR324}

	Бделловибрионота

« Лернаэллота » (ФЕН-1099)

« Бинатота »

"Бинатия"	"Бинаталес"

(Десульфобактерита Б)

Миксококкота

« Деферрисоматота »

Деферрисоматия	Деферрисомалес

(Десульфобактерита С)

« Деферримикробиота »

«Деферримикробия»	«Деферримикробиалес»

«Анаэроферрофилия»	«Анаэроферрофилы»

(Десульфобактерита Е)

	« Модулибактерии ».

	« Метиломирабилота »

« Шекманбактерии »

	« Тектомикробия »

	Нитроспинота

Нитроспирота

« Десульфуромонадота ».

Десульфуромонадия

	Геобактерии

	Десульфуромонадалес

(Десульфобактерита F)

Термодесульфо

« Зимогения »	«Зимогеналес»

Десульфомонилия	Десульфомонилялес

Синтрофия	Синтрофалы

	Дисульфибактерии Диссульфурибактерии

	« Термодесульфобактерии ». Термодесульфобактерии

Десульфобульбия	Десульфобульбалы

« Десульфофервидия ».	«Десульфофервидалес»

Десульфовибриония	Десульфовибрионалес

Десульфобакчия

Десульфобаккалес

Десульфаркулия

	"Адьютрикалс"

	Десульфаркулалес

Синтрофобактерии	Синтрофобактерии

« Десульфатигландия ».	Десульфатигланделес

Десульфобактерии	Десульфобактерии

‑бактериота

-бактерии "

«Аквифицида»

Десульфобактерита G

Синтрофорабдия	Синтрофорабдалы

« Ацидулодесульфобактериота »

«Ацидулисульфобактерии».
(СЗУА-79)

«Ацидулодесульфобактерии»

« Дадаибактериота »

«Дадабактерии»	«Немезобактерии»

(Десульфобактерита D)

« Калескамантес »

« Термосульфидибактерита ».

	Хризиогенота

	Деферрибактериота

	Аквификота

	Кампилобактерия

	« Лептоспириллеота ».

	Псевдомонадота

См. также

Ссылки

^ Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Уэйт Д.В., Чувочина М., Пеликан С., Паркс Д.Х., Йилмаз П., Вагнер М., Лой А., Наганума Т., Накаи Р., Уитмен В.Б., Хан М.В., Куевер Дж., Хугенхольц П. (2020). «Предложение реклассифицировать классы протеобактерий Deltaproteobacteria и Oligoflexia , а также тип Thermodesulfobacteria на четыре типа, отражающие основные функциональные возможности» . Int J Syst Evol Microbiol . 70 (11): 5972–6016. дои : 10.1099/ijsem.0.004213 . ПМИД 33151140 .
^ Вик Т.Дж., Додсворт Дж.А., Коста К.С., Шок Э.Л., Хедлунд Б.П. (март 2010 г.). «Микробиология и геохимия Литл-Хот-Крик, горячих источников в кальдере Лонг-Вэлли». Геобиология . 8 (2): 140–54. Бибкод : 2010Gbio....8..140V . дои : 10.1111/j.1472-4669.2009.00228.x . ПМИД 20002204 . S2CID 9610725 .
^ Жантон С., Л'Харидон С., Куэфф В., Банта А., Рейсенбах А.Л., Приер Д. (май 2002 г.). « Thermodesulfobacterium Hydrogeniphilum sp. nov., термофильная, хемолитоавтотрофная, сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из глубоководного гидротермального источника в бассейне Гуаймас, и изменение рода Thermodesulfobacterium » . Межд. Дж. Сист. Эвол. Микробиол . 52 (Часть 3): 765–72. дои : 10.1099/ijs.0.02025-0 . ПМИД 12054236 .
^ Шмитц-Эссер С., Хаферкамп И., Кнаб С. и др. (сентябрь 2008 г.). «Lawsonia Intracellis содержит ген, кодирующий функциональную риккетсиоподобную АТФ/АДФ-транслоказу для использования хозяином» . Дж. Бактериол . 190 (17): 5746–52. дои : 10.1128/JB.00391-08 . ПМК 2519521 . ПМИД 18606736 .
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[1] Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 .

[Waite-2] Jump up to: ^а ^б ^с Уэйт Д.В., Чувочина М., Пеликан С., Паркс Д.Х., Йилмаз П., Вагнер М., Лой А., Наганума Т., Накаи Р., Уитмен В.Б., Хан М.В., Куевер Дж., Хугенхольц П. (2020). «Предложение реклассифицировать классы протеобактерий Deltaproteobacteria и Oligoflexia , а также тип Thermodesulfobacteria на четыре типа, отражающие основные функциональные возможности» . Int J Syst Evol Microbiol . 70 (11): 5972–6016. дои : 10.1099/ijsem.0.004213 . ПМИД 33151140 .

[pmid20002204-3] Вик Т.Дж., Додсворт Дж.А., Коста К.С., Шок Э.Л., Хедлунд Б.П. (март 2010 г.). «Микробиология и геохимия Литл-Хот-Крик, горячих источников в кальдере Лонг-Вэлли». Геобиология . 8 (2): 140–54. Бибкод : 2010Gbio....8..140V . дои : 10.1111/j.1472-4669.2009.00228.x . ПМИД 20002204 . S2CID 9610725 .

[pmid12054236-4] Жантон С., Л'Харидон С., Куэфф В., Банта А., Рейсенбах А.Л., Приер Д. (май 2002 г.). « Thermodesulfobacterium Hydrogeniphilum sp. nov., термофильная, хемолитоавтотрофная, сульфатредуцирующая бактерия, выделенная из глубоководного гидротермального источника в бассейне Гуаймас, и изменение рода Thermodesulfobacterium » . Межд. Дж. Сист. Эвол. Микробиол . 52 (Часть 3): 765–72. дои : 10.1099/ijs.0.02025-0 . ПМИД 12054236 .

[pmid18606736-5] Шмитц-Эссер С., Хаферкамп И., Кнаб С. и др. (сентябрь 2008 г.). «Lawsonia Intracellis содержит ген, кодирующий функциональную риккетсиоподобную АТФ/АДФ-транслоказу для использования хозяином» . Дж. Бактериол . 190 (17): 5746–52. дои : 10.1128/JB.00391-08 . ПМК 2519521 . ПМИД 18606736 .

[about-6] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-7] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-8] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[LTP-9] «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[10] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[11] «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Термодесульфобактерии

Нитратисульфовибрио обыкновенный
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Термодесульфобактерии Гаррити и Холт 2021 ^[1]
Классы ^[2]
« Анаэроферрофилалия » (так в оригинале) Мерфи и др. 2021 год Деферрисоматия Уэйта и др. 2020 год Десульфаркулия Уэйт и др. 2020 год Десульфобачция Уэйт и др. 2020 год Десульфобактерии Уэйта и др. 2020 год Десульфобульбия Уэйт и др. 2020 год « Ca. Desulfofervidia » Waite et al. 2020 год Десульфомонилия Уэйт и др. 2020 год Десульфовибриония Уэйт и др. 2020 год Десульфуромонадия Уэйт и др. 2020 год Дисульфурибактерии Waite et al. 2020 год Синтрофия Уэйт и др. 2020 год Синтрофобактерии Уэйта и др. 2020 год Синтрофорхабдия Уэйт и др. 2020 год Термодесульфобактерии Хатчикян и др. 2002 г. « Зимогения » Мерфи и др. 2021 год
Синонимы ^[2]
« Ca. Dadabacteria» Hug et al. 2016 год «Десульфобактерита» Уэйта и др. 2020 год «Термодесульфобактерии» Орен и др. 2015 год Термодесульфобактерии Гаррити и Холт, 2002 г. «Термодесульфобактериота» Whitman et al. 2018 год