Thermodesulfobacteriota

Thermodesulfobacteriota
	Nitratidesulfovibrio vulgaris
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Thermodesulfobacteriota ; Garrity & Holt 2021
Классы
	« Anaeroferrophillalia » (sic) Murphy et al. 2021 ; Deferrisomatia Waite et al. 2020 ; Desulfarculia Waite et al. 2020 ; Desulfobaccia Waite et al. 2020 ; Desulfobacteria Waite et al. 2020 ; Desulfobulbia Waite et al. 2020 ; « Ca. desulfofervidia » Waite et al. 2020 ; Desulfomonilia Waite et al. 2020 ; Desulfovibrionia Waite et al. 2020 ; DesulfuroMonadia Waite et al. 2020 ; Desulfuctory Waite и Al. 2020 ; Syntrophia Waite et al. 2020 ; Syntrophobacteria Waite et al. 2020 ; Waite и Al. 2020 ; Thermodesulfobacteria chatchikian et al. 2002 ; " Zymogenia " Murphy et al. 2021 ;
Синонимы
	" D. Dadabacteria" Объятие Ал. 2016 ; "Desulfobacterota" Waite et al. 2020 ; "Thermodesulfobacteraeota" Oren et al. 2015 ; Thermodesulfobacteria garrity и Holt 2002 ; «Thermodesulfobacteriota» Whitman et al. 2018 ;

Thermodesulfobacteriota - это тип ^{[ 3 ]} термофильного ^{[ 4 ]} сульфат-восстановительные бактерии . Это грамозаписи бактерии [1]

Недавно был идентифицирован патогенный внутриклеточный термодсульфобактериот. ^{[ 5 ]}

Филогения

Филогения основана на филогеномическом анализе:

120 маркеры с одним копии на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Waite et al. 2020 ^{[ 2 ]}

Термодсульфо

Deferrisomatia	DEFERRISOMATALES

" Дадабактерия "

DesulfuroMonadia

	Geobacterales

	DesulfuroMonadales

Desulfomonilia	Desulfomonilales

Синтрофия	Синтрофалы

Syntrophorhabdia	Syntrophorhabdales

Disulfuribacteria	Disulfuribacterales

" Thermodesulfobacteriia "	Thermodesulfobacteriales

Desulfobulbia	Desulfobulbales

" DeSulfoFervidia "	"DesulfoFervidales"

Desulfovibrionia	Desulfovibrionales

Синтрофобактерии	Синтрофобактерал

Desulfobaccia

Desulfobaccales

Desulfarculia

	"Адиотрический"

	Desulfarculales

Desulfobacteria

	Desulfatiglandales

	Desulfobacterales

Бэктериота

16S RRNA на основе LTP _08_2023 ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Desulfobacterota g

Syntrophorhabdia	Syntrophorhabdales

Thermodesulfobacteriota	Thermodesulfobacteriales
" Thermodesulfobacteriia "

" Deferrisomatota "

Deferrisomatia	DEFERRISOMATALES

" Брдимонадия "

Myxococcota

"Desulfuromonadota"

	Geobacterales

	DesulfuroMonadales

DesulfuroMonadia

Бделловибронота

Desulfobacterota

	Синтрофобактерал

	Desulfobulbales

	Desulfomonilales

	Desulfarculales

Синтрофалы

	Desulfobaccales

	Desulfatiglandales

Desulfobacterales

Desulfobacteria

Desulfobacterota_a

Desulfovibrionia	Desulfovibrionales

Campylobacterota

	Chrysiogenota

	DEFERRIBACTEROTA

Pseudomonadota

" Deltaproteo

	" Lambdaproteobacteria " {sar324}

	Бделловибронота

" Лерналлота " (FEN-1099)

« Бинатота »

"Бинатия"	"Бинаталес"

(Desulfobacterota b)

Myxococcota

" Deferrisomatota "

Deferrisomatia	DEFERRISOMATALES

(Desulfobacterota c)

" DEFERRIMICROBIOTA "

"DEFERRIMICROBIIA"	"DEFERRIMICROBIALES"

"Анаэроферрофилия"	"Anaeroferrophilales"

(Desulfobacterota e)

	" Modulibacteria "

	" Метиломирабилота "

" Schekmanbacteria "

	" Тектомикробия "

	Нитроспинота

Nitrospirota

" Desulfuromonadota "

DesulfuroMonadia

	Geobacterales

	DesulfuroMonadales

(Desulfobacterota f)

Термодсульфо

" Zymogenia "	"Zymogenales"

Desulfomonilia	Desulfomonilales

Синтрофия	Синтрофалы

	Disulfuribacteria Disulfuribacterales

	" Thermodesulfobacteriia " Thermodesulfobacteriales

Desulfobulbia	Desulfobulbales

" DeSulfoFervidia "	"DesulfoFervidales"

Desulfovibrionia	Desulfovibrionales

Desulfobaccia

Desulfobaccales

Desulfarculia

	"Адиотрический"

	Desulfarculales

Синтрофобактерии	Синтрофобактерал

" Desulfatiglandia "	Desulfatiglandales

Desulfobacteria	Desulfobacterales

Бэктериота

-бактерия "

"Aquificida"

Desulfobacterota g

Syntrophorhabdia	Syntrophorhabdales

" Aciculodesulfobacteriota "

"Iciculidesulfobacterales"
(Szua-79)

"Acidulodesulfobacteriia"

" Дадабактериота "

"Дадабактерия"	"Nemesobacterales"

(Desulfobacterota d)

" Калесамантес "

" Thermolfidibacterota "

	Chrysiogenota

	DEFERRIBACTEROTA

	Водоводный

	Campylobacterota

	" Leptospirillaeota "

	Pseudomonadota

Смотрите также

Ссылки

^ Орен А, Гаррити Г.М. (2021). «Действительная публикация названий сорока двух фил прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Waite DW, Chuvochina M, Pelikan C, Parks DH, Yilmaz P, Wagner M, Loy A, Naganuma T, Nakai R, Whitman WB, Hahn MW, Kuever J, Hugenholtz P. (2020). «Предложение переклассифицировать протеобактериальные классы Deltaproteobacteria и олигофлексию Phylum , а также термодессульфобактерии в четыре фила, отражающие основные функциональные возможности» . Int J Syst Evol Microbiol . 70 (11): 5972–6016. doi : 10.1099/ijsem.0.004213 . PMID 33151140 .
^ Vick TJ, Dodsworth JA, Costa KC, Shock EL, Hedlund BP (март 2010 г.). «Микробиология и геохимия Little Hot Creek, обстановка горячих источников в длинной долине Кальдера». Геобиология . 8 (2): 140–54. Bibcode : 2010gbio .... 8..140V . doi : 10.1111/j.1472-4669.2009.00228.x . PMID 20002204 . S2CID 9610725 .
^ Жантон С., Л'аридон С., Куэфф В., Банта А., Рейсенбах А.Л., Приур Д. (май 2002). « Thermodesulfobacterium Hydrogeniphilum sp. Nov., Термофильный, хемолитоавтотрофный, сульфат-восстановительный бактерия, выделенная из глубоководного гидротермального вентилятора в бассейне Гуайма, и эмдинка рода термодесульфобактерия » . Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 52 (Pt 3): 765–72. doi : 10.1099/ijs.0.02025-0 . PMID 12054236 .
^ Schmitz-Esser S, Haferkamp I, Knab S, et al. (Сентябрь 2008 г.). «Lawsonia intracellularis содержит ген, кодирующий функциональный Rickettsia ATP/ADP-трансаза для эксплуатации хозяина» . J. Bacteriol . 190 (17): 5746–52. doi : 10.1128/jb.00391-08 . PMC 2519521 . PMID 18606736 .
^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .
^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .
^ «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .

[1] Орен А, Гаррити Г.М. (2021). «Действительная публикация названий сорока двух фил прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 .

[Waite-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Waite DW, Chuvochina M, Pelikan C, Parks DH, Yilmaz P, Wagner M, Loy A, Naganuma T, Nakai R, Whitman WB, Hahn MW, Kuever J, Hugenholtz P. (2020). «Предложение переклассифицировать протеобактериальные классы Deltaproteobacteria и олигофлексию Phylum , а также термодессульфобактерии в четыре фила, отражающие основные функциональные возможности» . Int J Syst Evol Microbiol . 70 (11): 5972–6016. doi : 10.1099/ijsem.0.004213 . PMID 33151140 .

[pmid20002204-3] Vick TJ, Dodsworth JA, Costa KC, Shock EL, Hedlund BP (март 2010 г.). «Микробиология и геохимия Little Hot Creek, обстановка горячих источников в длинной долине Кальдера». Геобиология . 8 (2): 140–54. Bibcode : 2010gbio .... 8..140V . doi : 10.1111/j.1472-4669.2009.00228.x . PMID 20002204 . S2CID 9610725 .

[pmid12054236-4] Жантон С., Л'аридон С., Куэфф В., Банта А., Рейсенбах А.Л., Приур Д. (май 2002). « Thermodesulfobacterium Hydrogeniphilum sp. Nov., Термофильный, хемолитоавтотрофный, сульфат-восстановительный бактерия, выделенная из глубоководного гидротермального вентилятора в бассейне Гуайма, и эмдинка рода термодесульфобактерия » . Инт. J. Syst. Эвол. Микробиол . 52 (Pt 3): 765–72. doi : 10.1099/ijs.0.02025-0 . PMID 12054236 .

[pmid18606736-5] Schmitz-Esser S, Haferkamp I, Knab S, et al. (Сентябрь 2008 г.). «Lawsonia intracellularis содержит ген, кодирующий функциональный Rickettsia ATP/ADP-трансаза для эксплуатации хозяина» . J. Bacteriol . 190 (17): 5746–52. doi : 10.1128/jb.00391-08 . PMC 2519521 . PMID 18606736 .

[about-6] "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[tree-7] "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[taxon_history-8] «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[LTP-9] "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .

[10] «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .

[11] «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

Thermodesulfobacteriota

Nitratidesulfovibrio vulgaris
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Thermodesulfobacteriota Garrity & Holt 2021 ^{[ 1 ]}
Классы ^{[ 2 ]}
« Anaeroferrophillalia » (sic) Murphy et al. 2021 Deferrisomatia Waite et al. 2020 Desulfarculia Waite et al. 2020 Desulfobaccia Waite et al. 2020 Desulfobacteria Waite et al. 2020 Desulfobulbia Waite et al. 2020 « Ca. desulfofervidia » Waite et al. 2020 Desulfomonilia Waite et al. 2020 Desulfovibrionia Waite et al. 2020 DesulfuroMonadia Waite et al. 2020 Desulfuctory Waite и Al. 2020 Syntrophia Waite et al. 2020 Syntrophobacteria Waite et al. 2020 Waite и Al. 2020 Thermodesulfobacteria chatchikian et al. 2002 " Zymogenia " Murphy et al. 2021
Синонимы ^{[ 2 ]}
" D. Dadabacteria" Объятие Ал. 2016 "Desulfobacterota" Waite et al. 2020 "Thermodesulfobacteraeota" Oren et al. 2015 Thermodesulfobacteria garrity и Holt 2002 «Thermodesulfobacteriota» Whitman et al. 2018