Атрибактериота
| Атрибактериота | |
|---|---|
 | |
| Морфология и структура мембран Atribacter laminatus (типовой штамм RT761) | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Супертип: | |
| Тип: | Атрибактериота Катаяма 2021 [1] |
| Синонимы | |
| |
Atribacterota – это тип бактерий , которые распространены в бескислородных отложениях, богатых метаном . Они распространены по всему миру и в некоторых случаях изобилуют анаэробными морскими отложениями, геотермальными источниками и нефтяными месторождениями . Генетический анализ предполагает гетеротрофный метаболизм , который приводит к образованию продуктов ферментации , таких как ацетат , этанол и CO 2 . Эти продукты, в свою очередь, могут поддерживать метаногены в микробном сообществе отложений и объяснять частое появление Atribacterota в богатых метаном бескислородных отложениях. [2] [3] Согласно филогенетическому анализу, Atribacterota, по-видимому, связана с несколькими термофильными типами Terrabacteria. [4] или может находиться в основе Gracilicutes . [5] Согласно исследованиям, Atribacterota демонстрирует закономерности экспрессии генов, которые включают ферментативный ацетогенный метаболизм. Эти экспрессии позволяют Atribacterota выполнять катаболические и анаболические функции, необходимые для воспроизводства клеток, даже когда уровни энергии ограничены из-за истощения растворенного кислорода в районах морских, пресных или грунтовых вод. [6]
Таксономия
[ редактировать ]Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [7] таксономия и Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) [8] использовались в качестве основного таксономического авторитета для установления приоритетов в наименовании. Также веб-сайт Annotree , [9] который использует версию GTDB 06-RS202. [10] была проведена консультация.
- Класс Atribacteria Katayama et al. 2021 год
- Порядок Atribacterales Katayama et al. 2021 год
- Семейство Atribacteraceae Katayama et al. 2021 год
- Род Atribacter Katayama et al. 2021 год
- Вид A. laminatus Katayama et al. 2021 год
- Род Atribacter Katayama et al. 2021 год
- Семейство Калдатрибактериевые .
- Род « Candidatus Caldatribacterium » Dodsworth et al. 2013 год
- Вид « Ca.C.californiense », корриг. Додсворт и др. 2013 год
- Вид « Ca.C. saccharofermentans» Dodsworth et al. 2013 год
- Род « Candidatus Caldatribacterium » Dodsworth et al. 2013 год
- Семейство Atribacteraceae Katayama et al. 2021 год
- Порядок Atribacterales Katayama et al. 2021 год
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 . S2CID 239887308 .
- ^ Нобу, М.К., Додсворт, Дж.А., Муругапиран, С.К., Ринке, К., Гис, Э.А., Вебстер, Г., ... и Йоргенсен, Б.Б. (2016) Филогения и физиология типа-кандидата «Atribacteria» (OP9/JS1) ) выведено из независимой от культивирования геномики . Журнал ISME, 10(2), 273-286.
- ^ Карр, С.А., Оркатт, Б.Н., Мандернак, К.В., и Спир, младший (2015). Обилие атрибактерий в глубоководных морских отложениях бассейна Адели, Антарктида . Границы микробиологии, 6.
- ^ Кристиан Ринке и др. 2013. Взгляд на филогению и кодирующий потенциал микробной темной материи. Природа Том: 499, Страницы: 431–437 doi:10.1038/nature12352
- ^ Хаг, Лос-Анджелес и др. 2016, Новый взгляд на древо жизни . Природная микробиология, 1, 16048.
- ^ Вийемен, Орель; Варгас, Серджио; Джошкун, Омер К.; Покальный, Роберт; Мюррей, Ричард В.; Смит, Дэвид К.; Д'Ондт, Стивен; Орси, Уильям Д. (11 июля 2020 г.). «Атрибактерии, размножающиеся миллионы лет на абиссальном дне Атлантического океана» . мБио . 11 (5). bioRxiv 10.1101/2020.07.10.198200 . дои : 10.1128/mbio.01937-20 . ПМЦ 7542362 . ПМИД 33024037 .
- ^ Сэйерс; и др. «Атрибактерита» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2021 г.
- ^ Ж. П. Эзеби. «Атрибактерита» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 27 июня 2021 г.
- ^ Мендлер, К; Чен, Х; Паркс, ДХ; Хаг, Лос-Анджелес; Докси, AC (2019). «AnnoTree: визуализация и исследование функционально аннотированного микробного древа жизни» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (9): 4442–4448. дои : 10.1093/nar/gkz246 . ПМК 6511854 . ПМИД 31081040 . Архивировано из оригинала 23 апреля 2021 г. Проверено 15 июля 2021 г.
- ^ «Выпуск GTDB 06-RS202» . База данных геномной таксономии .
 | Эта бактериях статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |