Криптония

Криптония
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Супертип:	Группа ФКБ
Тип:	Криптония ; Кастелл и др. 2013 год
Сорт:	«Криптония»
Заказ:	«Криптониалес»
Семья:	«Криптониевые»
Роды
	" Ка. Хризопегоцелла " ; " Ка Криптобактер " ; " Ка. Криптоний " ; " Ка. Термокрипт " ;

Криптония — это тип бактерий со статусом кандидата . Входит в группу FCB . ^{[ 1 ]}

Этот тип был впервые предложен в 2016 году после восстановления геномов в результате крупномасштабных усилий по поиску наборов метагеномных и одноклеточных геномных данных для поиска нового бактериального разнообразия. ^{[ 1 ]} Обширный анализ 5,2 ТБ метагеномных данных со всего мира позволяет предположить, что представители Kryptonia встречаются исключительно в высокотемпературных геотермальных источниках с нейтральным pH, таких как бассейн Цзиньцзэ (провинция Юньнань, Китай), источник Дьюар-Крик (Британская Колумбия, Канада). и Большой Кипящий Источник (Невада, США). ^{[ 1 ]} Из-за несоответствия праймеров представители этого типа практически не выявлялись в 16S рРНК исследованиях состава сообщества, основанных на секвенировании .

Анализ первых геномов, полученных из этой группы (из четырех разных родов), позволяет предположить, что представители Kryptonia являются гетеротрофами с предполагаемой способностью к дыханию железа. ^{[ 1 ]} Предполагается, что они неспособны самостоятельно производить некоторые ключевые метаболические соединения (например, биотин (также известный как витамин B7 или витамин H) и некоторые аминокислоты ) и, таким образом, могут метаболически зависеть от других микробов в их среде обитания. характер такой связи неизвестен. ^{[ 1 ]}

Название «Криптония» происходит от греческого слова «krupton» , что означает «скрытый» или «тайный». Это намек на тип, который до сих пор ускользал от обнаружения из-за ошибок в праймерах SSU рРНК .

Таксономия

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^{[ 2 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 3 ]}

Филогения «Криптонии» ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

" Ка. Криптоний "

" Ка.К.мобилис "

" Ка. К. криптомонас "

	" Ca.K. tengchongensis "

	" Ка. К. Томпсони "

Класс " Криптония "
- Орден Криптониалес .
  - Семейство Криптониевые .
    - Род « Ca. Chrysopegocella » Eloe-Fadrosh et al. Коррекция 2016 г. Орен и др. 2020 [" Ка. Хрисопегис " (так в оригинале)]
      - « Ca. Chrysopegocella kryptomonas » Eloe-Fadrosh et al. 2016 исправлено. Орен и др. 2020 год
    - Род « Ca. Kryptobacter » Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
      - « Ca. Kryptobacter tengchongensis » Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
    - Род « Ca. Kryptonium » Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
      - « Ca. Kryptonium thompsoni » Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
    - Род « Ca. Thermokryptus » Eloe-Fadrosh et al. 2016 год
      - « Ca. Thermocryptus mobile » Eloe-Fadrosh et al. 2016 год

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Элоэ-Фадрош, Эмили А.; Паес-Эспино, Дэвид; Джаретт, Джессика; Данфилд, Питер Ф.; Хедлунд, Брайан П.; Декас, Энн Э.; Грасби, Стивен Э.; Брэди, Эллисон Л.; Донг, Хайлян; Бриггс, Брэндон Р.; Ли, Вэнь-Цзюнь (27 января 2016 г.). «Глобальное метагеномное исследование выявило новый тип бактерий-кандидатов в геотермальных источниках» . Природные коммуникации . 7 (1): 10476. Бибкод : 2016NatCo...710476E . дои : 10.1038/ncomms10476 . ISSN 2041-1723 . ПМЦ 4737851 . ПМИД 26814032 .
^ Эзеби Ж.П., Парте AC. «Криптония» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 7 июня 2021 г.
^ Сэйерс; и др. «Криптония» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2021 г.
^ «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ "ar53_r207.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[:0-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Элоэ-Фадрош, Эмили А.; Паес-Эспино, Дэвид; Джаретт, Джессика; Данфилд, Питер Ф.; Хедлунд, Брайан П.; Декас, Энн Э.; Грасби, Стивен Э.; Брэди, Эллисон Л.; Донг, Хайлян; Бриггс, Брэндон Р.; Ли, Вэнь-Цзюнь (27 января 2016 г.). «Глобальное метагеномное исследование выявило новый тип бактерий-кандидатов в геотермальных источниках» . Природные коммуникации . 7 (1): 10476. Бибкод : 2016NatCo...710476E . дои : 10.1038/ncomms10476 . ISSN 2041-1723 . ПМЦ 4737851 . ПМИД 26814032 .

[LPSN-2] Эзеби Ж.П., Парте AC. «Криптония» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 7 июня 2021 г.

[3] Сэйерс; и др. «Криптония» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2021 г.

[about-4] «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[tree-5] "ar53_r207.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[taxon_history-6] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]