Ферментибактерии
Ферментибактерии | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Супертип: | |
Тип: | « Ферментибактерита » правильный. Киркегор 2016
|
Сорт: | «Ферментибактерии»
|
Заказ: | «Ферментибактерилес»
|
Семья: | «Ферментибактериальные»
|
Род | |
|
Ферментибактерии (ранее Hyd24-12) — это тип бактерий со статусом кандидата . Входит в группу FCB . [ 1 ]
Исходная последовательность клона, используемая для определения Fermentibacteria как типа ( AJ535232 ), была получена из среды холодного просачивания Гидрат-Ридж (Cascadia Margin, на шельфе штата Орегон, США). [ 2 ] Первые геномы этого типа были получены из образцов полномасштабных мезофильных анаэробных варочных котлов на датских очистных сооружениях. [ 1 ] Было высказано предположение, что все три восстановленных генома представляют собой организмы, которые полагаются на ферментацию простых сахаров в качестве источника энергии, поэтому было предложено название «ферментибактерии» (что означает «брожение»). [ 1 ]
Представители этого типа были обнаружены в широком диапазоне сред, включая выходы метана, [ 3 ] пески коралловых рифов, [ 4 ] и рот дельфина. [ 5 ]
Таксономия
[ редактировать ]- Класс «Ферментибактерии» Киркегор 2016г.
- Заказ "Fermentibacterales" Киркегор 2016 г.
- Семейство "Fermentibacteraceae" Киркегор 2016 г.
- Род Candidatus Fermentibacter Киркегор 2016 г.
- Вид " Ca. F. daniensis" Киркегор, 2016 г. [ 1 ]
- Род « Candida Sabulitectum » Saad et al. 2017 год
- Вид « Ca.S.silens » Saad et al. 2017 год [ 6 ]
- Род Candidatus Fermentibacter Киркегор 2016 г.
- Семейство "Fermentibacteraceae" Киркегор 2016 г.
- Заказ "Fermentibacterales" Киркегор 2016 г.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д Киркегор, Расмус Хансен; Дюхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Нерихло, Марта; Карст, Сорен Майкл; Альбертсен, Мэдс; Нильсен, Пер Халкьер (октябрь 2016 г.). «Геномная информация о членах кандидатного типа Hyd24-12, распространенного в мезофильных анаэробных ферментерах» . Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. дои : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . ПМК 5030696 . ПМИД 27058503 .
- ^ Книттель, Кэтрин; Боэций, Антье; Лемке, Эндрю; Эйлерс, Хайке; Лохте, Карин; Пфанкуче, Олаф; Линке, Питер; Аманн, Рудольф (июль 2003 г.). «Активность, распределение и разнообразие сульфатредукторов и других бактерий в отложениях над газовыми гидратами (Каскадия-Мардж, Орегон)». Журнал геомикробиологии . 20 (4): 269–294. дои : 10.1080/01490450303896 . hdl : 21.11116/0000-0001-D20F-2 . ISSN 0149-0451 . S2CID 140639772 .
- ^ Рафф, С. Эмиль; Биддл, Дженнифер Ф.; Теске, Андреас П.; Книттел, Катрин; Боэций, Антье; Раметт, Альбан (16 марта 2015 г.). «Глобальное рассеяние и локальная диверсификация микробиома метанового просачивания» . Труды Национальной академии наук . 112 (13): 4015–4020. Бибкод : 2015PNAS..112.4015R . дои : 10.1073/pnas.1421865112 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 4386351 . ПМИД 25775520 .
- ^ Шёттнер, Сандра; Пфицнер, Барбара; Грюнке, Стефани; Рашид, Мохаммед; Дикий, христианин; Раметт, Альбан (9 мая 2011 г.). «Драйверы динамики бактериального разнообразия в проницаемых карбонатных и силикатных песках коралловых рифов Красного моря» . Экологическая микробиология . 13 (7): 1815–1826. дои : 10.1111/j.1462-2920.2011.02494.x . ISSN 1462-2912 . ПМК 3207121 . ПМИД 21554515 .
- ^ Дудек, Наташа К.; Сан, Кристин Л.; Бурштейн, Дэвид; Кантор, Роуз С.; Алиага Гольцман, Даниэла С.; Бик, Элизабет М.; Томас, Брайан С.; Банфилд, Джиллиан Ф.; Релман, Дэвид А. (18 декабря 2017 г.). «Новое микробное разнообразие и функциональный потенциал микробиома полости рта морских млекопитающих» . Современная биология . 27 (24): 3752–3762.e6. дои : 10.1016/j.cub.2017.10.040 . ISSN 1879-0445 . ПМИД 29153320 .
- ^ Саад, Сайнаб; Бхатнагар, Шриджак; Тегетмейер, Халина Э.; Гилхуд, Джанин С.; Страус, Марк; Рафф, С. Эмиль (2017). «Переходное воздействие кислорода или нитратов раскрывает экофизиологию ферментативных и сульфатредуцирующих донных микробных популяций» . Экологическая микробиология . 19 (12): 4866–4881. дои : 10.1111/1462-2920.13895 . ISSN 1462-2920 . ПМЦ 5763382 . ПМИД 28836729 .