Археоглобус
| Археоглобус | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Архея |
| Королевство: | Эвриархеота |
| Сорт: | Археоглоби |
| Заказ: | Археоглобальные |
| Семья: | Археоглобовые |
| Род: | Археоглобус Стеттер 1988 г. |
| Типовой вид | |
| Блестящий археоглобус Стеттер 1988 г.
| |
| Разновидность | |
| |
Archaeoglobus — род рода Euryarchaeota . [ 1 ] Археоглобусов можно встретить на высокотемпературных нефтяных месторождениях, где они могут способствовать закислению нефтяных месторождений.
Метаболизм
[ редактировать ]Archaeoglobus растут анаэробно при чрезвычайно высоких температурах от 60 до 95 ° C, с оптимальным ростом при 83 ° C (вид A. fulgidus VC-16). [ 2 ] Это сульфатредуцирующие археи , сочетающие восстановление сульфата до сульфида с окислением многих различных источников органического углерода, включая сложные полимеры.
A.lithotropicus живут хемолито-автотрофно за счет водорода , сульфата и углекислого газа . Также A. profundus растут литотрофно , но, хотя этот вид нуждается в ацетате и CO 2 для биосинтеза , они гетеротрофны . [ 3 ]
Полная последовательность генома A. fulgidus выявила наличие почти полного набора генов метаногенеза . Функция этих генов у A. fulgidus остается неизвестной, а отсутствие фермента метил-СоМ-редуктазы не позволяет осуществлять метаногенез по механизму, аналогичному обнаруженному у других метаногенов .
Описание и значение
[ редактировать ]Члены Archaeoglobus — это гипертермофилы, которых можно найти в гидротермальных источниках, нефтяных месторождениях и горячих источниках. Они могут образовывать биопленку под воздействием стрессов окружающей среды, таких как экстремальные значения pH или температуры, высокие концентрации металлов или добавление антибиотиков, ксенобиотиков или кислорода. Известно, что эти археоны вызывают коррозию железа и стали в системах переработки нефти и газа, образуя сульфид железа. Однако их биопленки могут найти промышленное или исследовательское применение в виде детоксикации загрязненных металлами образцов или сбора металлов в экономически выгодной форме.
Структура генома
[ редактировать ]Геном Archaeoglobus fulgidus представляет собой кольцевую хромосому, примерно вдвое меньшую по размеру, чем E. coli, с длиной 2 178 000 пар оснований. Хотя это бактерии, археоглобусы могут вырасти до размера четверти, если их правильно кормить. Четверть генома кодирует сохранившиеся белки, функции которых еще не определены, но экспрессируются у других архей, таких как Methanococcus jannaschii . Другая четверть кодирует белки, уникальные для домена архей. Одно из наблюдений относительно генома заключается в том, что существует множество дупликаций генов, а дублированные белки не идентичны. Это предполагает метаболическую дифференциацию, особенно в отношении путей разложения и рециркуляции углерода через очищенные жирные кислоты. Дублированные гены также придают геному больший размер, чем у его собратья-архея M. jannaschii . Также отмечено, что Archaeoglobus не содержал интеинов в кодирующих регионах, где у M. jannaschii их было 18.
Молекулярные сигнатуры, показывающие связь с метаногенами и термококками.
[ редактировать ]Сравнительные геномные исследования геномов архей свидетельствуют о том, что представители рода Archaeoglobus являются ближайшими родственниками метаногенных архей. Это подтверждается наличием 10 консервативных сигнатурных белков, которые уникально обнаружены во всех метаногенах и Archaeoglobus . 18 белков, которые уникально обнаружены у представителей Thermococci , Archaeoglobus и метаногенов Кроме того, были идентифицированы , что позволяет предположить, что эти три группы архей, возможно, имели общего родственника, за исключением других архей. Однако нельзя исключать возможность того, что общее присутствие этих сигнатурных белков в этих архейных линиях обусловлено латеральным переносом генов. [ 4 ]
Экология
[ редактировать ]Виды Archaeoglobus используют окружающую среду, выступая в роли поглотителей многих потенциальных источников углерода. Они могут получать углерод из жирных кислот, деградации аминокислот, альдегидов, органических кислот и, возможно, также CO. Более высокие температуры (около 83 °C) являются идеальными для роста Archaeoglobus , хотя среда биопленки обеспечивает некоторую экологическую эластичность. Биопленка состоит из полисахаридов, белков и металлов.
Лекарство
[ редактировать ]Клетки, защищенные биопленкой, трудно уничтожить с помощью традиционной антимикробной терапии, что дает им лечебные возможности. [ 2 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [ 5 ] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [ 1 ]
| на основе 16S рРНК ДП _06_2022 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | 53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Сэйерс; и др. «Археоглобовые» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2021 г.
- ^ Перейти обратно: а б Кленк и др. Полная последовательность генома гипертермофильной сульфатредуцирующей археи Archaeoglobus fulgidus PDF Nature 390, 364-370 (ноябрь 1997 г.); дои : 10.1038/37052
- ^ Дж. Форхольт и др. Ферменты и коферменты угледегидрогеназного пути автотрофной фиксации СО2 у Archaeoglobus Lithotropicus и отсутствие угледегидрогеназы у гетеротрофного A. profundus Arch. Микробиол. 163, 112–118 (1995). дои : 10.1007/s002030050179
- ^ Гао Б. и Гупта Р.С. (2007). Филогеномный анализ белков, характерных для архей и ее основных подгрупп, и происхождения метаногенеза. БМК Геномика. 8:86. дои: 10.1186/1471-2164-8-86.
- ^ Ж. П. Эзеби. «Археоглобовые» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 17 ноября 2021 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии геномов . Проверено 10 мая 2023 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]Научные журналы
[ редактировать ]- Стеттер, нокаут (1988). «Archaeoglobus fulgidus gen. nov., sp. nov., новый таксон чрезвычайно термофильных архебактерий». Сист. Прил. Микробиол . 10 (2): 172–173. дои : 10.1016/s0723-2020(88)80032-8 .
Научные книги
[ редактировать ]- Мэдиган, Монтана; Мартинко, Дж. М. (2005). Брок Биология микроорганизмов, 11-е изд . Пирсон Прентис Холл.
- Хубер Х, Стеттер КО (2001). «Семейство I. Archaeoglobaceae fam. ноябрь Стеттер 1989, 2216» . В Д. Р. Буне, Р. В. Кастенхольце (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. ISBN 978-0-387-98771-2 .
- Стеттер, нокаут (1989). «Группа II. Археобактерии сульфатредукторы. Отряд Archaeoglobales». В Джей Ти Стейли; член парламента Брайант; Н. Пфенниг; Дж. Г. Холт (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 3 (1-е изд.). Балтимор: The Williams & Wilkins Co.