Археоглобовые
| Археоглобовые | |
|---|---|
 | |
| Домен PIWI белка argonaute из A. fulgidus , связанный с коротким двухцепочечным фрагментом РНК и иллюстрирующий стабилизацию связанной конформации спариванием оснований и ароматической укладкой. | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Архея |
| Королевство: | Эвриархеота |
| Сорт: | Археоглоби |
| Заказ: | Археоглобальные |
| Семья: | Археоглобовые Хубер и Стеттер, 2002 г. |
| Роды | |
| |
| Синонимы | |
| |
Archaeoglobalaceae — семейство Archaeoglobales . [1] Все известные роды Archaeoglobaceae являются гипертермофильными и могут быть найдены вблизи подводных гидротермальных источников . Archaeoglobaceae — единственное семейство в отряде Archaeoglobales , который является единственным порядком в классе Archaeoglobi .
Режим обмена веществ
[ редактировать ]Хотя все роды Archaeoglobaceae филогенетически связаны друг с другом, способ метаболизма, используемый каждым из этих организмов, уникален. Archaeoglobus — хемоорганотрофные сульфатредуцирующие археи, единственный известный представитель архей , обладающий таким типом метаболизма. Ferroglobus , напротив, являются хемолитотрофными организмами, которые связывают окисление двухвалентного железа с восстановлением нитратов . Геоглобусы — это археи, восстанавливающие железо, которые используют газообразный водород или органические соединения в качестве источников энергии. [2]
Характеристика и роды
[ редактировать ]У Archaeoglobaceae есть три рода, и вот некоторые краткие различия между ними:
- Archaeoglobus : Этот род содержит наиболее известных и изученных представителей семейства Archaeoglobus. Это термофильные сульфатредуцирующие бактерии, обитающие в гидротермальных источниках и нефтяных резервуарах. Они могут расти при высоких температурах и использовать различные органические соединения в качестве доноров электронов. [3]
- Ferroglobus : Этот род содержит единственный вид Ferroglobus placidus, который встречается в гидротермальных источниках. Они теплолюбивы и могут расти при высоких температурах, но отличаются от других представителей семейства тем, что используют в качестве донора электронов вместо органических соединений железо. [3]
- Geoglobus : Этот род содержит единственный вид, Geoglobus acetivorans, который встречается в гидротермальных источниках. Они термофилы и могут расти при высоких температурах, а от других представителей семейства отличаются тем, что используют ацетат в качестве донора электронов. [3]
среда обитания
[ редактировать ]Archaeoglobus Виды встречаются в различных экстремальных условиях, включая глубоководные гидротермальные источники, нефтяные резервуары и горячие источники. Эти среды характеризуются высокими температурами, высоким давлением и низкой концентрацией кислорода, что делает их непригодными для большинства других форм жизни (Topçuoğlu et al 2019). [4] Они способны процветать в такой среде, используя различные метаболические пути для получения энергии, а также производя ряд белков теплового шока и других механизмов реакции на стресс, которые помогают им выживать в этих экстремальных условиях. Они являются экстремофилами, а это означает, что их также можно найти в средах с высоким содержанием соли, например, на солончаках или в Соленом озере. Archaeoglobaceae способны процветать в таких экстремальных условиях, поскольку они способны использовать различные минералы и газы для производства энергии. Например, некоторые виды Archaeoglobaceae способны использовать серу в процессе, называемом диссимиляционной сульфатредукцией , который позволяет им производить энергию без необходимости использования кислорода. Другие виды Archaeoglobaceae способны использовать углекислый газ или газообразный водород в качестве источника энергии (Topçuoğlu et al 2019). [4]
Известно, что некоторые виды Archaeoglobaceae не только способны использовать различные источники энергии, но и образуют симбиотические отношения с другими организмами. Например, было обнаружено, что некоторые виды Archaeoglobaceae живут вместе с трубчатыми червями, которые способны извлекать питательные вещества из среды гидротермальных источников и предоставлять их бактериям в обмен на энергию. Считается, что эти симбиотические отношения важны для выживания как бактерий, так и трубчатых червей в этих экстремальных условиях (Topçuoğlu et al 2019). [4]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [5] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [1]
| на основе 16S рРНК ДП _06_2022 [6] [7] [8] | 53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 [9] [10] [11] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Сэйерс; и др. «Археоглобовые» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2021 г.
- ^ Мэдиган, М.Т. и Мартинко, Дж.М. (2005). Брок Биология микроорганизмов (11-е изд.). Пирсон Прентис Холл .
- ^ Перейти обратно: а б с Брилея, Кристен; Рейзенбах, Анна-Луиза (2014). «Класс Археоглоби». Прокариоты . стр. 15–23. дои : 10.1007/978-3-642-38954-2_323 . ISBN 978-3-642-38953-5 .
- ^ Перейти обратно: а б с «Archaeoglobales — обзор | Темы ScienceDirect» . www.sciencedirect.com . Проверено 27 апреля 2023 г.
- ^ Ж. П. Эзеби. «Археоглобовые» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 17 ноября 2021 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Хубер Х; Стеттер КО (2001). «Семейство I. Archaeoglobaceae fam. ноябрь Стеттер 1989, 2216» . В Докторе Буне; Р.В. Кастенхольц (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag . п. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .
- Хубер Х; Стеттер КО (2001). «Орден I. Archaeoglobales ord. nov.» . В Докторе Буне; Р.В. Кастенхольц (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. п. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .
- Стеттер, нокаут (1989). «Группа II. Археобактерии сульфатредукторы. Отряд Archaeoglobales». В Джей Ти Стейли; член парламента Брайант; Н. Пфенниг; Дж. Г. Холт (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 3 (1-е изд.). Балтимор: The Williams & Wilkins Co. p. 169.
- Шайни, Рашми; Капур, Рупам; Кумар, Рита; Сиддики, ТО; Кумар, Анил (ноябрь 2011 г.). " КО
2 с использованием микробов — Всесторонний обзор». Biotechnology Advances . 29 (6): 949–960. doi : 10.1016/j.biotechadv.2011.08.009 . PMID 21856405 . - Мариету, Анжелики (2021). «Сульфатредуцирующие микроорганизмы в высокотемпературных нефтяных пластах». Достижения прикладной микробиологии . Том. 116. С. 99–131. дои : 10.1016/bs.aambs.2021.03.004 . ISBN 978-0-12-824594-1 . ПМИД 34353505 . S2CID 235081283 .
- Топчуоглу, Бегум Д.; Холден, Джеймс Ф. (2019). «Экстремофилы: жаркая среда». Справочный модуль по наукам о жизни . дои : 10.1016/B978-0-12-809633-8.90683-6 . ISBN 978-0-12-809633-8 .
- Шайни, Рашми; Капур, Рупам; Кумар, Рита; Сиддики, ТО; Кумар, Анил (2011). " КО
2 с использованием микробов – Всесторонний обзор». Biotechnology Advances . 29 (6): 949–960. doi : 10.1016/j.biotechadv.2011.08.009 . PMID 21856405 .
Библиография
[ редактировать ]- Хубер, Харальд; Хон, Майкл Дж.; Рэйчел, Рейнхард; Фукс, Таня; Виммер, Верена К.; Стеттер, Карл О. (май 2002 г.). «Новый тип архей, представленный наноразмерным гипертермофильным симбионтом». Природа . 417 (6884): 63–67. Бибкод : 2002Natur.417...63H . дои : 10.1038/417063а . ПМИД 11986665 . S2CID 4395094 .
- Кленк, Ханс-Петер; Клейтон, Ребекка А.; Могила, Жан-Франсуа; Уайт, Оуэн; Нельсон, Карен Э.; Кетчум, Карен А.; Додсон, Роберт Дж.; Гвинн, Мишель; Хики, Эрин К.; Петерсон, Джереми Д.; Ричардсон, Делвуд Л.; Керлаваж, Энтони Р.; Грэм, Дэвид Э.; Кирпидес, Никос К.; Флейшманн, Роберт Д.; Квакенбуш, Джон; Ли, Норман Х.; Саттон, Грейнджер Г.; Гилл, Стивен; Киркнесс, Юэн Ф.; Догерти, Брайан А.; Маккенни, Кейт; Адамс, Марк Д.; Лофтус, Брендан; Петерсон, Скотт; Райх, Клаудия И.; Макнил, Лесли К.; Бэджер, Джонатан Х.; Глодек, Анна; Чжоу, Лисинь; Овербик, Росс; Гокейн, Жаннин Д.; Вайдман, Дженис Ф.; Макдональд, Лиза; Аттербек, Тереза; Коттон, Мэтью Д.; Сприггс, Трейси; Артиах, Патрисия; Кейн, Брайан П.; Сайкс, Шон М.; Садоу, Пол В.; Д'Андреа, Курт П.; Боуман, Шерил; Фуджи, Клэр; Гарланд, Стейси А.; Мейсон, Таня М.; Олсен, Гэри Дж.; Фрейзер, Клэр М.; Смит, Гамильтон О.; Вёзе, Карл Р.; Вентер, Дж. Крейг (ноябрь 1997 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильной сульфатредуцирующей археи Archaeoglobus fulgidus» . Природа . 390 (6658): 364–370. Бибкод : 1997Natur.390..364K . дои : 10.1038/37052 . ПМИД 9389475 . S2CID 83683005 .
- Слободкина Галина; Аллиу, Максим; Меркель, Александр; Камбон-Бонавита, Мари-Анн; Ален, Карин; Джеббар, Мохамед; Слободкин, Александр (16 июля 2021 г.). «Физиологическая и геномная характеристика гипертермофильного архея Archaeoglobus neptunius sp. nov., выделенного из глубоководного гидротермального источника, требует реклассификации рода Archaeoglobus» . Границы микробиологии . 12 : 679245. doi : 10.3389/fmicb.2021.679245 . ПМЦ 8322695 . ПМИД 34335500 .
- Ким, Дэхён Д.; О'Фаррелл, Коринн; Тот, Кортни Р.А.; Монтойя, Оскар; Гиг, Лиза М.; Квон, Тэ Хёк; Юн, Сукхван (июль 2018 г.). «Анализ микробного сообщества добываемых вод из высокотемпературных нефтяных пластов обнаруживает неожиданное сходство между географически удаленными нефтяными пластами» . Микробная биотехнология . 11 (4): 788–796. дои : 10.1111/1751-7915.13281 . ПМК 6011920 . ПМИД 29806176 . S2CID 44082150 .
 | Эта эвриархеотами статья, связанная с , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |