Археоглобус
| Археоглобус | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Археи |
| Королевство: | Erycharchaet |
| Сорт: | Археоглоби |
| Заказ: | Археоглобалес |
| Семья: | Археоглобасеа |
| Род: | Археоглобус Stetter 1988 |
| Тип видов | |
| Археоглобус сияет Stetter 1988
| |
| Разновидность | |
| |
Археоглобус является родом филома Euryarchaeota . [ 1 ] Археоглобус можно найти на высокотемпературных нефтяных месторождениях, где они могут внести свой вклад в утилизацию нефтяного поля.
Метаболизм
[ редактировать ]Археоглобус растут анаэробно при чрезвычайно высоких температурах между 60 и 95 ° C, с оптимальным ростом при 83 ° C (Ssp. A. Fulgidus VC-16). [ 2 ] Они представляют собой сульфат-восстановительную архей , связывающие восстановление сульфата с сульфидом с окислением многих различных органических источников углерода, включая сложные полимеры.
A. Lithotrophicus живет хемолито-аутотрофически из водорода , сульфата и углекислого газа . Также A. profundus расти литотрофически , но хотя этот вид нуждается в ацетате и CO 2 для биосинтеза, они являются гетеротрофными . [ 3 ]
Полная последовательность генома A. fulgidus выявила присутствие почти полного набора генов для метаногенеза . Функция этих генов в A. fulgidus остается неизвестной, в то время как отсутствие фермента метилкокредуктазы не позволяет возникать метаногенез с помощью механизма, сходного с тем, который обнаружен в других метаногенах .
Описание и значение
[ редактировать ]Членами археоглобуса являются гипертермофилы, которые можно найти в гидротермальных вентиляционных отверстиях, отложениях нефти и горячих источниках. Они могут производить биопленку при подверженности стрессам окружающей среды, такими как экстремальный рН или температура, высокие концентрации металла или добавление антибиотиков, ксенобиотиков или кислорода. Известно, что эти археоны вызывают коррозию железа и стали в системах переработки нефти и газа путем производства сульфида железа. Их биопленки, однако, могут иметь промышленные или исследовательские применения в виде детоксифицирующих образцов, загрязненных металлами, или для сбора металлов в экономически восстанавливаемой форме.
Структура генома
[ редактировать ]Геном археоглобуса Fulgidus представляет собой круглую хромосому примерно в половине размера E. coli в 2178 000 пар оснований. Хотя это бактерий археоглобус может вырасти до четверти, если его правильно питаться. Четверть генома кодирует консервированные белки, чьи функции еще не определены, но экспрессируются в других археонах, таких как Methanococcus jannaschii . Другая четверть кодирует белки, уникальные для архейного домена. Одним из наблюдений о геноме является то, что существует много дупликаций генов, и дублированные белки не идентичны. Это предполагает метаболическую дифференцировку конкретно относительно разлагающихся и переработанных углеродных путей с помощью жирных кислот с вытирающимися жирными кислотами. Дублированные гены также придают геному больший размер генома, чем его коллега -археон М. Джаннашии . Также отмечено, что археоглобус не содержал Inteins в кодирующих областях, где у М. Джаннашии было 18.
Молекулярные сигнатуры, показывающие родственность с метаногенами и термококками
[ редактировать ]Сравнительные геномные исследования геномов архей дают доказательства того, что члены рода археоглобуса являются самыми близкими родственниками метаногенной археи. Это подтверждается присутствием 10 консервативных подписных белков, которые уникально обнаружены во всех метаногенах и археоглобусе . 18 белков, которые уникально обнаружены у членов термококков , археоглобуса и метаногенов Кроме того, были идентифицированы , что свидетельствует о том, что эти три группы археи могли поделиться общим относительным, исключительным из других археи. Тем не менее, вероятность того, что общее присутствие этих подписных белков в этих архиальных линии обусловлена боковым переносом генов, не может быть исключено. [ 4 ]
Экология
[ редактировать ]Виды Archaeoglobus используют их окружающую среду, выступая в качестве мусорщиков со многими потенциальными источниками углерода. Они могут получать углерод из жирных кислот, деградацию аминокислот, альдегидов, органических кислот и, возможно, CO. Более высокие температуры (около 83 ° C) являются идеальными температурами роста для археоглобуса , хотя среда биопленки обеспечивает некоторую эластичность окружающей среды. Биопленка состоит из полисахаридов, белков и металлов.
Лекарство
[ редактировать ]Клетки, защищенные биопленкой, трудно уничтожить с помощью обычной антимикробной терапии, что дает им лекарственные возможности. [ 2 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) [ 5 ] и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI). [ 1 ]
| 16S RRNA на основе LTP _06_2022 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | 53 маркерные белки на основе GTDB 08-RS214 [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный Sayers; и др. "Archaeoglobaceae" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2021-06-05 .
- ^ Jump up to: а беременный Klenk et al. Полная последовательность генома гипертермофильного, сульфатного восстановления археонов археоглобуса Fulgidus Pdf Nature 390, 364-370 (ноябрь 1997 г.); doi : 10.1038/37052
- ^ J. Vorholt et al. Ферменты и коэнзименты пути монооксида углерода дегидрогеназы для фиксации аутотрофической CO2 в археоглобусе литотрофикус и отсутствие угарной газоксиддегидрогеназы в гетеротрофической A. Arrak Arch. Микробиол. 163, 112–118 (1995). doi : 10.1007/s002030050179
- ^ Гао, Б. и Гупта, Р.С. (2007). Филогеномный анализ белков, которые отличаются архей и ее основными подгруппами и происхождением метаногенеза. BMC Genomics. 8:86. doi: 10.1186/1471-2164-8-86.
- ^ JP Euzéby. "Archaeoglobaceae" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2021-11-17 .
- ^ "LTP" . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «LTP_06_2022 Notes» (PDF) . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ "AR53_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]Научные журналы
[ редактировать ]- Stetter, KO (1988). «Archaeoglobus fulgidus Gen. Nov., Sp. Nov. Новый таксон чрезвычайно термофильных архебактерий». Система Приложение Микробиол . 10 (2): 172–173. doi : 10.1016/s0723-2020 (88) 80032-8 .
Научные книги
[ редактировать ]- Мэдиган, MT; Martinko, JM (2005). Брок биология микроорганизмов, 11 -е изд . Пирсон Прентис Холл.
- Huber H, Stetter KO (2001). «Семейство I. Archaeoglobaceae Fam. Nov. Stetter 1989, 2216» . В докторе Бун, RW Castenholz (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко разветвленные и фототрофные бактерии (2 -е изд.). Нью -Йорк: Springer Verlag. ISBN 978-0-387-98771-2 .
- Stetter, KO (1989). «Группа II. Археобактериальные сульфатные редукторы. Заказ археоглобал». В JT Staley; Депутат Брайант; N pfennig; JG HOLT (Eds.). Руководство по систематической бактериологии Берджи, том 3 (1 -е изд.). Балтимор: Williams & Wilkins Co.