✖


Jump to content

Сплайсинг белков

(Перенаправлено с Inteins )
механизм сплайсинга белков с участием интеинов
Механизм сплайсинга белков с участием интеинов. На этой схеме N-экстеин показан красным, интеин - черным, а С-экстеин - синим. X представляет собой атом кислорода или серы.

Сплайсинг белка — это внутримолекулярная реакция определенного белка , при которой внутренний сегмент белка (называемый интеином ) удаляется из белка-предшественника путем лигирования С-концевых и N-концевых внешних белков (называемых экстеинами ) с обеих сторон. Соединение сплайсинга белка-предшественника представляет собой в основном цистеин или серин , которые представляют собой аминокислоты, содержащие нуклеофильную боковую цепь . Известные в настоящее время реакции сплайсинга белков не требуют экзогенных кофакторов или источников энергии, таких как аденозинтрифосфат (АТФ) или гуанозинтрифосфат (ГТФ). В норме сплайсинг связан только со сплайсингом пре-мРНК . Этот белок-предшественник содержит три сегмента: N-экстеин , за которым следует интеин, за которым следует C-экстеин . После сплайсинга полученный белок содержит N-экстеин, связанный с C-экстеином; этот продукт сплайсинга также называют экстеином.

История

[ редактировать ]

Первый интеин был обнаружен в 1988 году путем сравнения последовательностей Neurospora crassa. [ 1 ] и морковь [ 2 ] вакуольная АТФаза (без интеина) и гомологичный ген дрожжей (с интеином), который впервые был описан как предполагаемый переносчик ионов кальция . [ 3 ] В 1990 году Хирата и др. [ 4 ] продемонстрировали, что дополнительная последовательность дрожжевого гена транскрибируется в мРНК и удаляется из белка-хозяина только после трансляции. С тех пор интеины были обнаружены во всех трех сферах жизни (эукариоты, бактерии и археи) и в вирусах .

Сплайсинг белков был неожиданным, и его механизмы были открыты двумя группами (Анраку [ 5 ] и Стивенс [ 6 ] ) в 1990 году. Они оба обнаружили Saccharomyces cerevisiae VMA1 в предшественнике вакуолярного H. + -фермент АТФаза . Аминокислотная последовательность N- и C-концев на 70% соответствовала последовательности ДНК вакуолярного H. + -АТФазы из других организмов, при этом аминокислотная последовательность центрального положения соответствовала 30% общей последовательности ДНК дрожжевой НО нуклеазы .

Многие гены имеют несвязанные сегменты, кодирующие интеин, вставленные в разные позиции. По этим и другим причинам интеины (или, точнее, сегменты генов, кодирующие интеины) иногда называют эгоистичными генетическими элементами , но правильнее было бы называть их паразитическими . Согласно геноцентрированному взгляду на эволюцию, большинство генов «эгоистичны» лишь постольку, поскольку они конкурируют с другими генами или аллелями , но обычно они выполняют функцию для организмов, тогда как «паразитические генетические элементы», по крайней мере на начальном этапе, не создают положительный вклад в тренированность организма. [ 7 ] [ 8 ]

По состоянию на декабрь 2019 года база данных UniProtKB содержит 188 записей, вручную аннотированных как интеины, начиная от десятков аминокислотных остатков до тысяч. [ 9 ] Первый интеин был обнаружен закодированным в гене VMA Saccharomyces cerevisiae . Позже они были обнаружены в грибах ( аскомицеты , базидиомицеты , зигомицеты и хитриды ), а также в различных белках. Было описано , что белок, отдаленно родственный известному белку, содержащему интеины, но тесно связанный с белками многоклеточных ежей , имеет последовательность интеина из Glomeromycota . Многие из недавно описанных интеинов содержат хоминг-эндонуклеазы, и некоторые из них, по-видимому, активны. [ 10 ] Обилие интеина у грибов указывает на латеральный перенос интеинсодержащих генов. Тогда как у эубактерий и архей на сегодняшний день известно 289 и 182 интеина. Неудивительно, что большая часть интеина у эубактерий и архей встроена в метаболический белок нуклеиновых кислот, например, у грибов. [ 10 ]

Интеины сильно различаются, но многие из одних и тех же интеинсодержащих белков встречаются у ряда видов. Например, фактора процессинга пре-мРНК 8 ( Prp8 белок ), играющий важную роль в сплайсосоме , имеет семь различных сайтов вставки в интеин у эукариотических видов. [ 11 ] Интеин-содержащий Prp8 чаще всего встречается у грибов, но также встречается у Amoebozoa , Chlorophyta , Capsaspora и Choanoflagellida . Многие микобактерии содержат интеины в составе DnaB (бактериальная репликативная геликаза), RecA (бактериальная ДНК-рекомбиназа) и SufB ( белок сборки кластера FeS ). [ 12 ] [ 13 ] Существует удивительное разнообразие структуры и количества интеинов DnaB как внутри рода микобактерий, так и за его пределами. Интересно, что интеинсодержащая DnaB обнаружена и в хлоропластах водорослей. [ 14 ] Интеинсодержащие белки, обнаруженные у архей, включают RadA (гомолог RecA), RFC, PolB, RNR. [ 15 ] Многие из одних и тех же интеинсодержащих белков (или их гомологов) встречаются в двух или даже во всех трех сферах жизни. Интеины также встречаются в протеомах, кодируемых бактериофагами и эукариотическими вирусами. Вирусы могли выступать в качестве векторов распространения интеина среди самых разных интеинсодержащих организмов. [ 15 ]

Механизм

[ редактировать ]

Процесс для интеинов класса 1 начинается со сдвига NO или NS, когда боковая цепь первого остатка ( серина , треонина или цистеина ) интеиновой части белка-предшественника нуклеофильно атакует пептидную связь остатка, расположенного непосредственно выше (что то есть конечный остаток N-экстеина) с образованием линейного сложноэфирного (или тиоэфирного ) промежуточного соединения. Переэтерификация происходит , когда боковая цепь первого остатка С-экстеина атакует вновь образовавшийся (тио)эфир, освобождая N-концевой конец интеина. При этом образуется разветвленный промежуточный продукт, в котором N-экстеин и C-экстеин присоединены, хотя и не через пептидную связь. Последним остатком интеина всегда является аспарагин ( Asn), и амидный атом азота этой боковой цепи расщепляет пептидную связь между интеином и С-экстеином, в результате чего образуется свободный сегмент интеина с концевым циклическим имидом . Наконец, свободная аминогруппа C-экстеина теперь атакует (тио)эфир, связывающий N- и C-экстеины вместе. Сдвиг ON или SN приводит к образованию пептидной связи и функционального лигированный белок. [ 16 ]

Интеины класса 2 не имеют нуклеофильной первой боковой цепи, есть только аланин. Вместо этого реакция начинается непосредственно с нуклеофильного замещения, когда первый остаток C-экстеина присоединяет карбоксильный пептид на конечном остатке N-экстеина. Дальше происходит как обычно, начиная с превращения Asn в циклический имид. [ 17 ]

Интеины класса 3 не имеют нуклеофильной первой боковой цепи, есть только аланин, но у них есть внутренний несмежный мотив «WCT». Внутренний остаток C (цистеин) атакует карбоксил пептида на конечном остатке N-экстеина (нуклеофильное замещение). Переэтерификация происходит, когда первый остаток С-экстеина атакует вновь образовавшийся тиоэфир. Остальное происходит как обычно. [ 18 ]

Механизм эффекта сплайсинга представляет собой естественную аналогию с методом химического создания белков среднего размера, называемым нативным химическим лигированием .

Интеин

[ редактировать ]

Интеин — это сегмент белка , который способен вырезать себя и соединять оставшиеся части ( экстеины ) пептидной связью во время сплайсинга белка. [ 19 ] Интеины также называют белковыми интронами (РНК) по аналогии с интронами .

Сплайсинг интеина происходит посттрансляционно в результате самокаталитического процесса. Здесь экстеин показан красным, а интеин — синим. Изображение создано с помощью Biorender.com.

Соглашения об именах

[ редактировать ]

Первая часть названия интеина основана на научном названии организма , в котором он обнаружен, а вторая часть — на названии соответствующего гена или экстеина. Например, интеин, обнаруженный у Thermoplasma acidophilum и связанный с субъединицей А вакуолярной АТФазы (VMA), называется «Tac VMA».

Обычно, как в этом примере, для обозначения организма достаточно всего трех букв, но есть и вариации. Например, для обозначения штамма могут быть добавлены дополнительные буквы. Если в соответствующем гене закодировано более одного интеина, интеинам присваивается числовой суффикс, начиная с 5 ’ до 3 ’ или в порядке их идентификации (например, «Msm dnaB-1»).

Сегменту гена, кодирующему интеин, обычно присваивают то же имя, что и интеину, но во избежание путаницы название самого интеина обычно пишется с заглавной буквы ( например , Pfu RIR1-1), тогда как название соответствующего сегмента гена пишется с заглавной буквы. выделено курсивом ( например , Pfu rir1-1 ). Другое соглашение, устраняющее неоднозначность, заключается в размещении строчной буквы «i» после названия исходного белка, например «Msm DnaBi1». [ 20 ]

Виды интеинов

[ редактировать ]

Интеины можно классифицировать по многим критериям.

  • В зависимости от того, как они сращиваются, их можно разделить на цис-сплайсинговые (что означает, что они сращиваются) или транс-сплайсинговые (что означает, что им нужна помощь извне). Большинство изученных интеинов подвергаются цис-сплайсингу. Разделенные интеины (см. ниже) обычно состоят из двух половин, помогающих друг другу, поэтому они подвергаются транс-сплайсингу . [ 17 ]
  • В зависимости от того, содержат ли они эндонуклеазный домен. Те, которые имеют домен эндонуклеазы, называются «макси-интеинами», иначе «мини-интеинами». [ 17 ]
  • На основе их механизма сращивания, который может быть частично [ 18 ] вывод сделан на основе последовательности. Интеин класса 1 является наиболее изученным типом и отмечен цистеином или серином в качестве первого остатка. Интеин класса 2, или «аланин-интеин», содержит аланин в качестве первого остатка и не имеет мотива WCT. Интеин класса 3 имеет аланин в качестве первого остатка и несмежный мотив «WCT». [ 17 ] Также было предложено относить к классу 3 интеины, начинающиеся с серина и содержащие мотив «WCT». [ 18 ]

Полные и мини-интеины

[ редактировать ]

Интеины могут содержать домен самонаводящегося гена эндонуклеазы (HEG) в дополнение к доменам сплайсинга. Этот домен отвечает за распространение интеина путем расщепления ДНК по свободной от интеина аллели на гомологичной хромосоме , запуская систему восстановления двухцепочечного разрыва ДНК (DSBR), которая затем восстанавливает разрыв, копируя таким образом ДНК, кодирующую интеин. в сайт, ранее свободный от интеина. [ 17 ] Домен HEG не является необходимым для сплайсинга интеина, поэтому он может быть потерян, образуя минимальный или мини - интеин . Несколько исследований продемонстрировали модульную природу интеинов путем добавления или удаления доменов HEG и определения активности новой конструкции. [ нужна ссылка ]

Сплит интеины

[ редактировать ]

Иногда интеин белка-предшественника происходит от двух генов. В этом случае интеин называют расщепленным интеином . Например, у цианобактерий DnaE dnaE , ​​каталитическая субъединица α ДНК-полимеразы III , кодируется двумя отдельными генами, -n и dnaE-c . Продукт dnaE-n . состоит из последовательности N-экстеина, за которой следует последовательность интеина 123-AA, тогда как продукт dnaE-c состоит из последовательности интеина 36-AA, за которой следует последовательность C-экстеина [ 21 ]

Приложения в биотехнологии

[ редактировать ]

Интеины очень эффективны при сплайсинге белков и, соответственно, нашли важную роль в биотехнологии . На сегодняшний день идентифицировано более 200 интеинов; размеры варьируются от 100 до 800 AA . Интеины были разработаны для конкретных применений, таких как полусинтез белка. [ 22 ] и избирательное мечение сегментов белка, что полезно для ЯМР- исследований крупных белков. [ 23 ]

Фармацевтическое ингибирование удаления интеина может быть полезным инструментом для разработки лекарств ; белок, содержащий интеин, не будет выполнять свою нормальную функцию, если интеин не иссекается, так как его структура будет нарушена.

Было высказано предположение, что интеины могут оказаться полезными для достижения аллотопической экспрессии некоторых высокогидрофобных белков , обычно кодируемых митохондриальным геномом, например, в генной терапии . [ 24 ] Гидрофобность этих белков является препятствием для их импорта в митохондрии. Следовательно, вставка негидрофобного интеина может позволить продолжить этот импорт. Удаление интеина после импорта восстановило бы белок дикого типа .

Аффинные метки широко используются для очистки рекомбинантных белков, поскольку они позволяют накапливать рекомбинантный белок с небольшим количеством примесей. Однако аффинная метка должна быть удалена протеазами на заключительном этапе очистки. Дополнительный этап протеолиза поднимает проблемы специфичности протеазы при удалении аффинных меток из рекомбинантного белка и удалении продукта расщепления. Этой проблемы можно избежать путем слияния аффинной метки с саморасщепляющимися интеинами в контролируемой среде. В первом поколении векторов экспрессии такого типа использовался модифицированный интеин Saccharomyces cerevisiae VMA (Sce VMA). Чонг и др. [ 25 ] использовали хитин-связывающий домен (CBD) из Bacillus circulans в качестве аффинной метки и соединили эту метку с модифицированным интеином Sce VMA. Модифицированный интеин подвергается реакции саморасщепления по N-концевой пептидной связи с 1,4-дитиотреитолом (ДТТ), β-меркаптоэтанолом (β-ME) или цистином при низких температурах в широком диапазоне pH. После экспрессии рекомбинантного белка гомогенат клеток пропускают через колонку, содержащую хитин . Это позволяет CBD химерного белка связываться с колонкой. Более того, когда температура снижается и молекулы, описанные выше, проходят через колонку, химерный белок подвергается самосплайсингу и элюируется только целевой белок. Этот новый метод исключает необходимость этапа протеолиза, а модифицированный Sce VMA остается в колонке, прикрепленной к хитину через CBD. [ 25 ]

Недавно интеины стали использовать для очистки белков на основе самоагрегирующихся пептидов. Эластиноподобные полипептиды (ELP) являются полезным инструментом в биотехнологии. Сливаясь с белком-мишенью, они имеют тенденцию образовывать агрегаты внутри клеток. [ 26 ] Это исключает хроматографический этап, необходимый для очистки белка. Метки ELP использовались в слитом белке интеина, так что агрегаты можно было выделить без хроматографии (путем центрифугирования), а затем интеин и метку можно было расщепить контролируемым образом с высвобождением целевого белка в раствор. Выделение белка можно проводить с использованием непрерывного потока среды, что дает большие количества белка, что делает этот процесс более экономически эффективным, чем традиционные методы. [ 26 ] Другая группа исследователей использовала более мелкие самоагрегирующиеся метки для выделения целевого белка. Небольшие амфипатические пептиды 18А и ELK16 (рис. 5) использовали для образования саморасщепляющегося агрегирующего белка. [ 27 ]

Применение в разработке противомикробных препаратов

[ редактировать ]

За последние двадцать лет возрос интерес к использованию интеинов в антимикробных целях. [ 12 ] Сплайсинг интеина встречается исключительно у одноклеточных организмов, особенно высокая численность у патогенных микроорганизмов. [ 28 ] Кроме того, интеины обычно обнаруживаются в составе белков домашнего хозяйства и/или белков, участвующих в выживании организма в организме человека-хозяина. Посттрансляционное удаление интеина необходимо для правильного сворачивания и функционирования белка. Например, Гаэль Юэ и др. продемонстрировали, что в Mycobacterium Tuberculosis несплайсированный SufB предотвращает образование комплекса SufBCD, компонента механизма SUF. [ 29 ] Таким образом, ингибирование сплайсинга интеина может служить мощной платформой для разработки противомикробных препаратов.

Текущие исследования ингибиторов сплайсинга интеина сосредоточены на разработке антимикобактерий ( M. tb. содержит три интеинсодержащих белка), а также агентов, активных против патогенных грибов Cryptococcus и Aspergillus. [ 13 ] Цисплатин и подобные платиносодержащие соединения ингибируют сплайсинг M. tb. Интеин RecA посредством координации с каталитическими остатками. [ 30 ] Двухвалентные катионы, такие как ионы меди (II) и цинка (II), действуют аналогичным образом, обратимо ингибируя сплайсинг. [ 12 ] Однако ни один из этих методов в настоящее время не подходит для создания эффективного и безопасного антибиотика. Грибной интеин Prp8 также ингибируется двухвалентными катионами и цисплатином за счет воздействия на каталитический остаток Cys1. [ 12 ] В 2021 году Ли и др. показали, что низкомолекулярные ингибиторы сплайсинга интеина Prp8 были селективными и эффективными в замедлении роста C. neoformans и C. gattii , что предоставило убедительные доказательства противомикробного потенциала ингибиторов сплайсинга интеина. [ 31 ]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Боуман, Э.Дж.; Тенни, К; Боуман, Би Джей (октябрь 1988 г.). «Выделение генов, кодирующих вакуольную АТФазу Neurospora. Анализ vma-1, кодирующего субъединицу 67 кДа, обнаруживает гомологию с другими АТФазами» . J Биол Хим . 263 (28): 13994–4001. дои : 10.1016/S0021-9258(18)68175-X . ПМИД   2971651 .
  2. ^ Зимняк, Л; Диттрих, П; Гогартен, JP; Кибак, Х; Таиз, Л. (июль 1988 г.). «Последовательность кДНК субъединицы 69-кДа вакуолярной H +-АТФазы моркови. Гомология с бета-цепью F0F1-АТФазы» . J Биол Хим . 263 (19): 9102–12. дои : 10.1016/S0021-9258(19)76514-4 . ПМИД   2897965 .
  3. ^ Ши, СК; Вагнер, Р; Файнштейн, С; Каник-Эннулат, К; Нефф, Н. (август 1988 г.). «Доминантный ген устойчивости к трифлуоперазину из Saccharomyces cerevisiae гомологичен с АТФ-синтазой F0F1 и обеспечивает чувствительный к кальцию рост» . Мол Клеточная Биол . 8 (8): 3094–103. дои : 10.1128/mcb.8.8.3094 . ПМЦ   363536 . ПМИД   2905423 .
  4. ^ Хирата, Р; Осумк, Ю; Накано, А; Кавасаки, Х; Сузуки, К; Анраку, Ю. (апрель 1990 г.). «Молекулярная структура гена VMA1, кодирующего каталитическую субъединицу H (+)-транслоцирующей аденозинтрифосфатазы из вакуолярных мембран Saccharomyces cerevisiae» . J Биол Хим . 265 (12): 6726–33. дои : 10.1016/S0021-9258(19)39210-5 . ПМИД   2139027 .
  5. ^ Хирата Р., Осумк Ю., Накано А., Кавасаки Х., Сузуки К., Анраку Ю. (апрель 1990 г.). «Молекулярная структура гена VMA1, кодирующего каталитическую субъединицу H (+)-транслоцирующей аденозинтрифосфатазы из вакуолярных мембран Saccharomyces cerevisiae» . Ж. Биол. Хим . 265 (12): 6726–33. дои : 10.1016/S0021-9258(19)39210-5 . ПМИД   2139027 .
  6. ^ Кейн П.М., Ямаширо К.Т., Вольчик Д.Ф., Нефф Н., Гебл М., Стивенс Т.Х. (ноябрь 1990 г.). «Сплайсинг белка превращает продукт гена дрожжей TFP1 в субъединицу вакуолярной H (+)-аденозинтрифосфатазы массой 69 кДа». Наука . 250 (4981): 651–7. Бибкод : 1990Sci...250..651K . дои : 10.1126/science.2146742 . ПМИД   2146742 .
  7. ^ Суитерс, Кристен С.; Суси, Шеннон М.; Гогартен, Дж. Питер (2012). «Роль сетчатой ​​эволюции в создании инноваций и сложности» . Международный журнал эволюционной биологии . 2012 : 1–10. дои : 10.1155/2012/418964 . ISSN   2090-8032 . ПМЦ   3403396 . ПМИД   22844638 .
  8. ^ Докинз, Ричард (1976). Эгоистичный ген . Издательство Оксфордского университета.
  9. ^ «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. 29 ноября 2016 г. дои : 10.1093/нар/gkw1099 . ISSN   0305-1048 . ПМК   5210571 . ПМИД   27899622 .
  10. ^ Jump up to: а б Перлер, ФБ (2002). «InBase: база данных Интеина» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 383–384. дои : 10.1093/нар/30.1.383 . ISSN   1362-4962 . ПМК   99080 . ПМИД   11752343 .
  11. ^ Грин, Кэтлин М.; Ли, Чжун; Смит, Аарон Д.; Новикова, Ольга; Бэкот-Дэвис, Вальжан Р.; Гао, Фэншань; Ху, Сайян; Банавали, Нилеш К.; Тиле, Деннис Дж.; Ли, Хонмин; Белфорт, Марлен (10 октября 2019 г.). «Сплицеосомный интеин Prp8 на перекрестке сплайсинга белка и РНК» . ПЛОС Биология . 17 (10): е3000104. дои : 10.1371/journal.pbio.3000104 . ISSN   1545-7885 . ПМК   6805012 . ПМИД   31600193 .
  12. ^ Jump up to: а б с д Тараппель, Анил Мэтью; Ли, Чжун; Ли, Хунмин (2022). «Интеины как мишени для лекарств и терапевтические инструменты» . Границы молекулярных биологических наук . 9 : 821146. дои : 10.3389/fmolb.2022.821146 . ISSN   2296-889X . ПМЦ   8861304 . ПМИД   35211511 .
  13. ^ Jump up to: а б Уолл, Диана А.; Таррант, Шонан П.; Ван, Чуньюй; Миллс, Кеннет В.; Леннон, Кристофер В. (2021). «Ингибиторы интеина как новые противомикробные препараты: сплайсинг белков в патогенах человека, методы скрининга и нецелевые факторы» . Границы молекулярных биологических наук . 8 : 752824. doi : 10.3389/fmolb.2021.752824 . ISSN   2296-889X . ПМК   8529194 . ПМИД   34692773 .
  14. ^ Грин, Кэтлин М.; Новикова, Ольга; Белфорт, Марлен (24 января 2018 г.). «Динамический интеиновый ландшафт эукариот» . Мобильная ДНК . 9 (1): 4. дои : 10.1186/s13100-018-0111-x . ISSN   1759-8753 . ПМЦ   5784728 . ПМИД   29416568 .
  15. ^ Jump up to: а б Новикова, Ольга; Топилина, Наталья; Белфорт, Марлен (май 2014 г.). «Загадочное распределение, эволюция и функции интеинов» . Журнал биологической химии . 289 (21): 14490–14497. дои : 10.1074/jbc.r114.548255 . ISSN   0021-9258 . ПМК   4031506 . ПМИД   24695741 .
  16. ^ Норен С.Дж., Ван Дж., Перлер Ф.Б. (2000). «Изучение химии сплайсинга белков и ее применения». Angew Chem Int Ed Engl . 39 (3): 450–66. doi : 10.1002/(sici)1521-3773(20000204)39:3<450::aid-anie450>3.3.co;2-6 . ПМИД   10671234 .
  17. ^ Jump up to: а б с д и Нанда, А; Наскер, СС; Мехра, А; Панда, С; Наяк, С (16 декабря 2020 г.). «Интеины в науке: от эволюции к применению» . Микроорганизмы . 8 (12): 2004. doi : 10.3390/microorganisms8122004 . ПМЦ   7765530 . ПМИД   33339089 .
  18. ^ Jump up to: а б с Тори, К; Перлер, FB (апрель 2011 г.). «Расширение определения интеинов класса 3 и их предполагаемого фагового происхождения» . Журнал бактериологии . 193 (8): 2035–41. дои : 10.1128/JB.01407-10 . ПМК   3133030 . ПМИД   21317331 .
  19. ^ Анраку, Ю; Мизутани, Р; Сатоу, Ю (2005). «Сплайсинг белков: его открытие и структурное понимание новых химических механизмов» . ИУБМБ Жизнь . 57 (8): 563–74. дои : 10.1080/15216540500215499 . ПМИД   16118114 .
  20. ^ Келли, Даниэль С.; Леннон, Кристофер В.; Ли, Чжун; Миллер, Майкл Р.; Банавали, Нилеш К.; Ли, Хонмин; Белфорт, Марлен (19 октября 2018 г.). «Микобактериальный интеин DnaB-геликаза как сенсор окислительного стресса» . Природные коммуникации . 9 (1): 4363. Бибкод : 2018NatCo...9.4363K . дои : 10.1038/s41467-018-06554-x . ПМК   6195587 . ПМИД   30341292 .
  21. ^ Ву, Х.; Ху, З.; Лю, XQ (1998). «Трансплайсинг белка с помощью расщепленного интеина, кодируемого расщепленным геном DnaE Synechocystis sp. PCC6803» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (16): 9226–9231. Бибкод : 1998PNAS...95.9226W . дои : 10.1073/pnas.95.16.9226 . ПМК   21320 . ПМИД   9689062 .
  22. ^ Шварцер Д., Коул П.А. (2005). «Полусинтез белка и выраженное лигирование белка: в погоне за хвостом белка». Curr Opin Chem Biol . 9 (6): 561–9. дои : 10.1016/j.cbpa.2005.09.018 . ПМИД   16226484 .
  23. ^ Муралидхаран В., Мьюир Т.В. (2006). «Лигирование белков: технология биофизического анализа белков». Нат. Методы . 3 (6): 429–38. дои : 10.1038/nmeth886 . ПМИД   16721376 . S2CID   12550693 .
  24. ^ де Грей, Обри DNJ (2000). «Митохондриальная генная терапия: арена биомедицинского использования интеинов». Тенденции в биотехнологии . 18 (9): 394–399. дои : 10.1016/S0167-7799(00)01476-1 . ISSN   0167-7799 . ПМИД   10942964 .
  25. ^ Jump up to: а б Чонг, Шаоронг; Мерша, Фана Б; Комб, Дональд Дж; Скотт, Мелисса Э; Лэндри, Дэвид; Ванс, Луис М; Перлер, Франсин Б; Беннер, Джек; Кучера, Ребекка Б; Хирвонен, Кристина А; Пеллетье, Джон Дж; Паулюс, Генри; Сюй, Мин-Цюнь (1997). «Очистка свободных рекомбинантных белков в одной колонке с использованием саморасщепляющейся аффинной метки, полученной из элемента сплайсинга белка». Джин . 192 (2): 271–281. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00105-4 . ISSN   0378-1119 . ПМИД   9224900 .
  26. ^ Jump up to: а б Фонг, Бейли А; Вуд, Дэвид В. (2010). «Экспрессия и очистка целевых белков, меченных ELP-интеином, при ферментации E. coli с высокой плотностью клеток» . Заводы по производству микробных клеток . 9 (1): 77. дои : 10.1186/1475-2859-9-77 . ISSN   1475-2859 . ПМЦ   2978133 . ПМИД   20959011 .
  27. ^ Син, Лей; Ву, Вэй; Чжоу, Бихун; Линь, Чжанлинь (2011). «Упрощенная экспрессия и очистка белков с использованием расщепляемых самоагрегирующихся меток» . Заводы по производству микробных клеток . 10 (1): 42. дои : 10.1186/1475-2859-10-42 . ISSN   1475-2859 . ПМК   3124420 . ПМИД   21631955 .
  28. ^ Шах, Нил Х.; Мьюир, Том В. (24 декабря 2013 г.). «Интеины: подарок природы химикам-белкам» . Химическая наука . 5 (2): 446–461. дои : 10.1039/C3SC52951G . ISSN   2041-6539 . ПМЦ   3949740 . ПМИД   24634716 .
  29. ^ Юэ, Гаэль; Кастен, Жан-Филипп; Фурнье, Дидье; Даффе, Мамаду; Сейв, Изабель (май 2006 г.). «Сплайсинг белка SufB имеет решающее значение для функциональности SUF-аппарата микобактерий туберкулеза» . Журнал бактериологии . 188 (9): 3412–3414. дои : 10.1128/JB.188.9.3412-3414.2006 . ISSN   0021-9193 . ПМЦ   1447444 . ПМИД   16621837 .
  30. ^ Чан, Хон; Пирсон, К. Сет; Грин, Кэтлин М.; Ли, Чжун; Чжан, Цзин; Белфор, Жорж; Шехтман, Алекс; Ли, Хонмин; Белфорт, Марлен (октябрь 2016 г.). «Изучение ингибирования интеина соединениями платины как антимикробной стратегии» . Журнал биологической химии . 291 (43): 22661–22670. дои : 10.1074/jbc.m116.747824 . ISSN   0021-9258 . ПМК   5077202 . ПМИД   27609519 .
  31. ^ Ли, Чжун; Тараппель, Анил Мэтью; Сюй, Чимин; Ланг, Юекун; Грин, Кэтлин М.; Чжан, Цзин; Линь, Цишань; Чатурведи, Судха; Чжоу, Цзя; Белфорт, Марлен; Ли, Хунмин (12 января 2021 г.). «Низкомолекулярные ингибиторы интеина Prp8 как противогрибковые средства» . Труды Национальной академии наук . 118 (2): e2008815118. Бибкод : 2021PNAS..11808815L . дои : 10.1073/pnas.2008815118 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   7812778 . ПМИД   33397721 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Protein_splicing&oldid=1190441281#Intein"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: cd7ea72ad26d6663f6b3e1f88854f634__1702842180
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/cd/34/cd7ea72ad26d6663f6b3e1f88854f634.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Protein splicing - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)