Piggybac Transposable Element получен 5

PGBD5
Идентификаторы
Псевдонимы	PGBD5 , Piggybac Transposable Element, полученный 5, Piggybac Transposable Element, полученный 5
Внешние идентификаторы	Омим : 616791 ; MGI : 2429955 ; Гомологен : 11583 ; GeneCards : PGBD5 ; OMA : PGBD5 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	230,426,332 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	125,166,397 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	frontal pole; ; entorhinal cortex; ; middle temporal gyrus; ; postcentral gyrus; ; superior frontal gyrus; ; Brodmann area 46; ; Brodmann area 10; ; orbitofrontal cortex; ; cerebellar vermis; ; Brodmann area 23;
	Top expressed in
	dentate gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; piriform cortex; ; olfactory tubercle; ; hippocampus proper; ; dorsal striatum; ; cingulate gyrus; ; primary visual cortex; ; medial dorsal nucleus; ; prefrontal cortex;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	nuclease activity; endonuclease activity; hydrolase activity; transposase activity;
Cellular component	nucleus;
Biological process	transposition; nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; non-replicative transposition, DNA-mediated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	79605
	209966
	ENSG00000177614
	Ensmusg0000000050751
	Q8N414
	D3yzi9
	NM_024554 ; NM_001258311
	NM_171824
	NP_001245240
	NP_741958
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Полученное 5 -й пиггибак -элемент 5 является ферментом , который у людей кодируется PGBD5 геном . ^{[ 5 ]} PGBD5 является транспозазой ДНК, связанной с древней транспозазой Piggybac, впервые идентифицированной в моли Capbage Looper , Trichoplusia ni. ^{[ 6 ]} Считается, что этот ген был одомашнен более 500 миллионов лет назад в общем предке цефалохордатов и позвоночных . ^{[ 7 ]} Предполагаемая каталитическая триада белка, состоящий из трех остатков аспарагиновой кислоты , сохраняется среди генов, подобных PGBD5, посредством эволюции, ^{[ 8 ]} и отличается от других пиггибаков, похожих на гены. ^{[ 7 ]} Было показано, что PGBD5 способен транспонировать ДНК в специфической последовательности, моде с вырезанными и вставками. ^{[ 8 ]} PGBD5 также был предложен для опосредованных сайтов-специфических перестроек ДНК в опухолях человека. ^{[ 9 ]}

Человеческий PGBD5 может мобилизовать транспозоны Piggybac насекомых в культуре клеток человека. ^{[ 10 ]}

Выражение в мозге

У зрелых мышей ткани головного мозга PGBD5 обнаруживается в основном в областях обонятельной лампы , гиппокампа и мозжечка . У эмбриональных мышей ткани мозга PGBD5 обнаружен не только в медиальном паллиуме и препонтине -перешейке , которые представляют собой эмбриональные области мозга, которые приводят к развитию гиппокампа и мозжечка, но также в областях эмбрионального мозга, которые приводят к гипоталамусу и медулле. Полем ^{[ 11 ]}^{[ Лучший источник необходим ]}

Болезни ассоциации

PGBD5 экспрессируется в большинстве детских солидных опухолей человека. ^{[ 12 ]} Это активируется при спорадической болезни Крецфельдта-Якоба. ^{[ 13 ]} PGBD5 связан с лобно -височной деменцией, где он наиболее экспрессируется в нейронах, за которыми следуют эндотелиальные клетки, астроциты плода, эндотелиальные клетки, астроциты плода, эндотелиальные клетки, а затем микроглия/макрофаги. ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000177614 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000050751 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «PGBD5 Piggybac Transposable Element, полученный 5 [Homo sapiens (Human)] - ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 8 апреля 2017 года .
^ Томан Дж. (1979). «Курс для проведения». Время ухода . 75 (17): 694–695. PMID 255260 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Павелц Т., Грей Л.Т., Падилла С.Л., Бейли А.Д., Вейнер А.М. (ноябрь 2013). «PGBD5: нейронная интронсодержащая интронсодержащая транспосаза Piggybac одомашнилась более 500 миллионов лет назад и консервативно от головокружительных до людей» . Мобильная ДНК . 4 (1): 23. doi : 10.1186/1759-8753-4-23 . PMC 3902484 . PMID 24180413 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Хенссен А.Г., Хенафф Е., Цзян Э., Эйзенберг А.Р., Карсон Дж.Р., Вилласант К.М., Рэй М., все еще Е, Бернс М., Гандара Дж., Фесшотт С., Мейсон К.Е., Кентсис А (сентябрь 2015). «Транспозиция геномной ДНК, индуцированную человеком PGBD5» . элиф . 4 doi : 10.7554/elife.10565 . PMC 4625184 . PMID 26406119 .
^ Henssen AG, Koche R, Zhuang J, Jiang E, Reed C, Eisenberg A, Still E, Macarthur IC, Rodríguez-Fos E, Gonzalez S, Puiggròs M, Blackford AN, Mason CE, De Strachina E, Gönen M, Emde Ak, E. , Shah M, Arora K, Reeves C, Socci ND, Perlman E, Antonoscu CR, Roberts CW, Steen H, Mullen E, Jackson SP, Torrents D, Weng Z, Armstrong SA, Kentsis A (июль 2017 г.). «PGBD5 способствует специфичным для сайтов онкогенных мутаций в человеческом тканях» . Природа генетика . 49 (7): 1005–1014. Doi : 10.1038/ng.3866 . PMC 5489359 . PMID 28504702 .
^ IVICS, Zoltán (май 2016 г.). «Эндогенный источник транспозазы в клетках человека мобилизует транспозоны Piggybac» . Молекулярная терапия . 24 (5): 851–854. doi : 10.1038/mt.2016.76 . PMC 4881781 . PMID 27198853 .
^ Шао, Бенджамин (май 2018). Эффекты транспонируемого элемента Piggybac, полученного 5 (PGBD5) в ткани коры (тезис BS). Университет Коннектикута.
^ Исследования, Американская ассоциация рака (2018-01-01). «ДНК транспозаза PGBD5 сенсибилизирует опухоли до ингибирования репарации ДНК» . Открытие рака . 8 (1): OF17. doi : 10.1158/2159-8290.cd-rw2017-213 . ISSN 2159-8274 . PMID 29127084 .
^ Вастрад, Басаварадж; Вастрад, Чанабасайя; Коттурсетти, Иранна (2020-12-24). «Идентификация потенциальных ключевых генов и пути, связанных с спорадическим заболеванием Creutzfeldt-Jakob на основе интегрированного анализа биоинформатики». Medrxiv 10.1101/2020.12.21.20248688V1 .
^ Бросе, Айрис; Karch, Celeste M.; Вэнь, Натали; Фан, Чун С.; Ван, Юнпенг; Тан, Чин Хонг; Кури, Наоми; Росс, Оуэн А.; Höglinger, Günter U.; Мюллер, Ульрих; Харди, Джон (2018-01-09). «Иммуновое генетическое обогащение в лобно-височной деменции: анализ исследований ассоциаций по всему геному» . PLOS Medicine . 15 (1): E1002487. doi : 10.1371/journal.pmed.1002487 . ISSN 1549-1676 . PMC 5760014 . PMID 29315334 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000177614 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000050751 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] «PGBD5 Piggybac Transposable Element, полученный 5 [Homo sapiens (Human)] - ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 8 апреля 2017 года .

[6] Томан Дж. (1979). «Курс для проведения». Время ухода . 75 (17): 694–695. PMID 255260 .

[Pavelitz_et_al.-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Павелц Т., Грей Л.Т., Падилла С.Л., Бейли А.Д., Вейнер А.М. (ноябрь 2013). «PGBD5: нейронная интронсодержащая интронсодержащая транспосаза Piggybac одомашнилась более 500 миллионов лет назад и консервативно от головокружительных до людей» . Мобильная ДНК . 4 (1): 23. doi : 10.1186/1759-8753-4-23 . PMC 3902484 . PMID 24180413 .

[:0-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Хенссен А.Г., Хенафф Е., Цзян Э., Эйзенберг А.Р., Карсон Дж.Р., Вилласант К.М., Рэй М., все еще Е, Бернс М., Гандара Дж., Фесшотт С., Мейсон К.Е., Кентсис А (сентябрь 2015). «Транспозиция геномной ДНК, индуцированную человеком PGBD5» . элиф . 4 doi : 10.7554/elife.10565 . PMC 4625184 . PMID 26406119 .

[9] Henssen AG, Koche R, Zhuang J, Jiang E, Reed C, Eisenberg A, Still E, Macarthur IC, Rodríguez-Fos E, Gonzalez S, Puiggròs M, Blackford AN, Mason CE, De Strachina E, Gönen M, Emde Ak, E. , Shah M, Arora K, Reeves C, Socci ND, Perlman E, Antonoscu CR, Roberts CW, Steen H, Mullen E, Jackson SP, Torrents D, Weng Z, Armstrong SA, Kentsis A (июль 2017 г.). «PGBD5 способствует специфичным для сайтов онкогенных мутаций в человеческом тканях» . Природа генетика . 49 (7): 1005–1014. Doi : 10.1038/ng.3866 . PMC 5489359 . PMID 28504702 .

[10] IVICS, Zoltán (май 2016 г.). «Эндогенный источник транспозазы в клетках человека мобилизует транспозоны Piggybac» . Молекулярная терапия . 24 (5): 851–854. doi : 10.1038/mt.2016.76 . PMC 4881781 . PMID 27198853 .

[11] Шао, Бенджамин (май 2018). Эффекты транспонируемого элемента Piggybac, полученного 5 (PGBD5) в ткани коры (тезис BS). Университет Коннектикута.

[12] Исследования, Американская ассоциация рака (2018-01-01). «ДНК транспозаза PGBD5 сенсибилизирует опухоли до ингибирования репарации ДНК» . Открытие рака . 8 (1): OF17. doi : 10.1158/2159-8290.cd-rw2017-213 . ISSN 2159-8274 . PMID 29127084 .

[13] Вастрад, Басаварадж; Вастрад, Чанабасайя; Коттурсетти, Иранна (2020-12-24). «Идентификация потенциальных ключевых генов и пути, связанных с спорадическим заболеванием Creutzfeldt-Jakob на основе интегрированного анализа биоинформатики». Medrxiv 10.1101/2020.12.21.20248688V1 .

[14] Бросе, Айрис; Karch, Celeste M.; Вэнь, Натали; Фан, Чун С.; Ван, Юнпенг; Тан, Чин Хонг; Кури, Наоми; Росс, Оуэн А.; Höglinger, Günter U.; Мюллер, Ульрих; Харди, Джон (2018-01-09). «Иммуновое генетическое обогащение в лобно-височной деменции: анализ исследований ассоциаций по всему геному» . PLOS Medicine . 15 (1): E1002487. doi : 10.1371/journal.pmed.1002487 . ISSN 1549-1676 . PMC 5760014 . PMID 29315334 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]