АТФ2В4

АТФ2В4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1CFF, 2KNE
Идентификаторы
Псевдонимы	ATP2B4 , ATP2B2, MXRA1, PMCA4, PMCA4b, PMCA4x, АТФаза плазматическая мембрана, транспортирующая Ca2+ 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 108732 ; МГИ : 88111 ; Гомологен : 48034 ; Генные карты : ATP2B4 ; ОМА : ATP2B4 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	203,744,081 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	133,728,779 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	saphenous vein; ; tail of epididymis; ; body of uterus; ; myometrium; ; epithelium of colon; ; smooth muscle tissue; ; left uterine tube; ; muscle layer of sigmoid colon; ; superficial temporal artery; ; skin of arm;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lip; ; spermatid; ; Rostral migratory stream; ; esophagus; ; genital tubercle; ; ascending aorta;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; PDZ domain binding; sodium channel regulator activity; nitric-oxide synthase binding; scaffold protein binding; metal ion binding; calmodulin binding; nitric-oxide synthase inhibitor activity; protein binding; protein phosphatase 2B binding; ATP binding; hydrolase activity; P-type calcium transporter activity; protein kinase binding;
Cellular component	integral component of membrane; cell projection; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; T-tubule; plasma membrane; integral component of plasma membrane; sperm flagellum; sperm principal piece; basolateral plasma membrane; Z discdkac; caveola; neuron projection; sarcolemma; cilium; motile cilium; protein-containing complex; glutamatergic synapse; integral component of presynaptic active zone membrane;
Biological process	negative regulation of nitric oxide mediated signal transduction; flagellated sperm motility; regulation of cardiac conduction; negative regulation of nitric-oxide synthase activity; negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade; negative regulation of citrulline biosynthetic process; negative regulation of peptidyl-cysteine S-nitrosylation; regulation of transcription by RNA polymerase II; calcium ion import across plasma membrane; response to hydrostatic pressure; cellular calcium ion homeostasis; ion transport; positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; cellular response to epinephrine stimulus; ion transmembrane transport; negative regulation of nitric oxide biosynthetic process; calcium ion transmembrane transport; calcium ion transmembrane import into cytosol; spermatogenesis; positive regulation of cAMP-dependent protein kinase activity; regulation of cell cycle G1/S phase transition; regulation of sodium ion transmembrane transport; calcium ion export; hippocampus development; negative regulation of arginine catabolic process; neural retina development; negative regulation of the force of heart contraction; calcium ion transport; negative regulation of cardiac muscle hypertrophy in response to stress; transport; regulation of cytosolic calcium ion concentration; negative regulation of adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway involved in heart process; urinary bladder smooth muscle contraction; cellular response to acetylcholine;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	493
	381290
	ENSG00000058668
	ENSMUSG00000026463
	P23634
	Q6Q477
	НМ_001684 ; НМ_001001396 ; НМ_001365783 ; НМ_001365784
	НМ_001167949 ; НМ_213616
	НП_001001396 ; НП_001675 ; НП_001352712 ; НП_001352713
	НП_001161421 ; НП_998781
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

АТФаза 4, транспортирующая кальций в плазматической мембране, представляет собой фермент , который у человека кодируется АТФ2В4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству первичных ионтранспортных АТФаз Р-типа, характеризующихся образованием промежуточного аспартилфосфата в ходе реакционного цикла. Эти ферменты удаляют двухвалентные ионы кальция из эукариотических клеток против очень больших градиентов концентрации и играют решающую роль во внутриклеточном гомеостазе кальция. Изоформы кальциевой АТФазы плазматической мембраны млекопитающих кодируются по меньшей мере четырьмя отдельными генами, и разнообразие этих ферментов дополнительно увеличивается за счет альтернативного сплайсинга транскриптов. Экспрессия различных изоформ и вариантов сплайсинга регулируется в зависимости от развития, ткани и типа клеток, что позволяет предположить, что эти насосы функционально адаптированы к физиологическим потребностям конкретных клеток и тканей. Этот ген кодирует изоформу 4 кальций-АТФазы плазматической мембраны. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ATP2B4 взаимодействует с CASK . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000058668 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026463 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Олсон С., Ван М.Г., Карафоли Э., Стрелер Э.Э., МакБрайд О.В. (апрель 1991 г.). «Локализация двух генов, кодирующих Са2(+)-транспортирующие АТФазы плазматической мембраны, в хромосомах человека 1q25-32 и 12q21-23». Геномика . 9 (4): 629–41. дои : 10.1016/0888-7543(91)90356-J . ПМИД 1674727 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: АТФаза ATP2B4, перенос Са++, плазматическая мембрана 4» .
^ Шух К., Ульдриан С., Гамбарян С., Ретлейн Н., Нейсес Л. (март 2003 г.). «Взаимодействие плазматического мембранного Ca2+-насоса 4b/CI с Ca2+/кальмодулин-зависимой мембраносвязанной киназой CASK» . Журнал биологической химии . 278 (11): 9778–83. дои : 10.1074/jbc.M212507200 . ПМИД 12511555 .

Дальнейшее чтение

Мёллер Й.В., Юул Б., Ле Мэр М. (май 1996 г.). «Структурная организация, транспорт ионов и передача энергии АТФаз Р-типа». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) — Обзоры биомембран . 1286 (1): 1–51. дои : 10.1016/0304-4157(95)00017-8 . ПМИД 8634322 .
Стрелер Э.Э., Захариас Д.А. (январь 2001 г.). «Роль альтернативного сплайсинга в создании разнообразия изоформ среди кальциевых насосов плазматической мембраны». Физиологические обзоры . 81 (1): 21–50. дои : 10.1152/physrev.2001.81.1.21 . ПМИД 11152753 . S2CID 9062253 .
Стрелер Э.Э., Трейман М. (май 2004 г.). «Кальциевые насосы плазматической мембраны и внутренней части клетки». Современная молекулярная медицина . 4 (3): 323–35. дои : 10.2174/1566524043360735 . ПМИД 15101689 .
Хейм Р., Хуг М., Ивата Т., Стрелер Э.Э., Карафоли Э. (апрель 1992 г.). «Микроразнообразие изоформы 2 кальциевого насоса плазматической мембраны человека, созданной путем альтернативного сплайсинга РНК в N-концевой кодирующей области» . Европейский журнал биохимии . 205 (1): 333–40. дои : 10.1111/j.1432-1033.1992.tb16784.x . ПМИД 1313367 .
Брандт П., Нив Р.Л., Каммешейдт А., Роудс Р.Э., Ванаман Т.К. (март 1992 г.). «Анализ тканеспецифического распределения мРНК, кодирующих АТФазы, перекачивающие кальций плазматической мембраны, и характеристика альтернативно сплайсированной формы PMCA4 на уровне кДНК и геноме» . Журнал биологической химии . 267 (7): 4376–85. дои : 10.1016/S0021-9258(18)42846-3 . ПМИД 1531651 .
Стрелер Э., Джеймс П., Фишер Р., Хайм Р., Форхерр Т., Филотео А.Г., Пеннистон Дж.Т., Карафоли Э. (февраль 1990 г.). «Анализ пептидной последовательности и молекулярное клонирование выявили две изоформы кальциевого насоса в мембране эритроцитов человека» . Журнал биологической химии . 265 (5): 2835–42. дои : 10.1016/S0021-9258(19)39877-1 . ПМИД 2137451 .
Джеймс П., Маэда М., Фишер Р., Верма А.К., Кребс Дж., Пеннистон Дж.Т., Карафоли Э. (февраль 1988 г.). «Идентификация и первичная структура кальмодулинсвязывающего домена Ca2+-насоса эритроцитов человека» . Журнал биологической химии . 263 (6): 2905–10. дои : 10.1016/S0021-9258(18)69154-9 . ПМИД 2963820 .
Брандт П., Зурини М., Нив Р.Л., Роудс Р.Э., Ванаман Т.К. (май 1988 г.). «С-концевой кальмодулинподобный регуляторный домен АТФазы плазматической мембраны, перекачивающей Са2+» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (9): 2914–8. Бибкод : 1988PNAS...85.2914B . дои : 10.1073/pnas.85.9.2914 . ПМК 280113 . ПМИД 2966397 .
Ховард А., Барли Н.Ф., Легон С., Уолтерс-младший (октябрь 1994 г.). «Изоформы плазмомембранного кальциевого насоса в печени человека и крысы» . Биохимический журнал . 303 (Часть 1) (Часть 1): 275–9. дои : 10.1042/bj3030275 . ПМЦ 1137587 . ПМИД 7945253 .
Стауффер Т.П., Хилфикер Х., Карафоли Э., Стрелер Э.Э. (декабрь 1994 г.). «Количественный анализ альтернативных вариантов сплайсинга генов кальциевого насоса плазматической мембраны человека» . Журнал биологической химии . 269 (50): 32022. doi : 10.1016/S0021-9258(18)31797-6 . ПМИД 7989379 .
Штауффер Т.П., Хилфикер Х., Карафоли Э., Стрелер Э.Э. (декабрь 1993 г.). «Количественный анализ альтернативных вариантов сплайсинга генов кальциевого насоса плазматической мембраны человека» . Журнал биологической химии . 268 (34): 25993–6003. дои : 10.1016/S0021-9258(19)74484-6 . ПМИД 8245032 .
Варади А., Молнар Э., Эшкрофт С.Дж. (март 1996 г.). «Уникальная комбинация изоформ Са2+-АТФазы плазматической мембраны экспрессируется в островках Лангерганса и линиях бета-клеток поджелудочной железы» . Биохимический журнал . 314 (Часть 2) (Часть 2): 663–9. дои : 10.1042/bj3140663 . ПМК 1217098 . ПМИД 8670083 .
Сантьяго-Гарсиа Х., Мас-Олива Х., Сааведра Д., Зарайн-Герцберг А. (февраль 1996 г.). «Анализ экспрессии мРНК и клонирование нового варианта сплайсинга Ca (2+)-АТФазы плазматической мембраны в сердце человека». Молекулярная и клеточная биохимия . 155 (2): 173–82. дои : 10.1007/BF00229314 . ПМИД 8700162 . S2CID 33539531 .
Захариас Д.А., ДеМарко С.Дж., Стрелер Э.Э. (апрель 1997 г.). «Экспрессия мРНК четырех изоформ Са (2+)-АТФазы плазматической мембраны человека в гиппокампе человека». Исследования мозга. Молекулярные исследования мозга . 45 (1): 173–6. дои : 10.1016/S0169-328X(97)00009-0 . ПМИД 9105688 .
Дин В.Л., Чен Д., Брандт ПК, Ванаман Т.С. (июнь 1997 г.). «Регуляция Са2+-АТФазы плазматической мембраны тромбоцитов посредством цАМФ-зависимого и тирозинового фосфорилирования» . Журнал биологической химии . 272 (24): 15113–9. дои : 10.1074/jbc.272.24.15113 . ПМИД 9182531 .
Ким Э., ДеМарко С.Дж., Марфатия С.М., Чишти А.Х., Шэн М., Стрелер Э.Э. (январь 1998 г.). «Изоформа 4b Са2+-АТФазы плазматической мембраны связывается с белками мембран-ассоциированной гуанилаткиназы (MAGUK) через их домены PDZ (PSD-95/Dlg/ZO-1)» . Журнал биологической химии . 273 (3): 1591–5. дои : 10.1074/jbc.273.3.1591 . ПМИД 9430700 .
Герини Д., Гарсиа-Мартин Э., Гербер А., Волбрахт С., Лейст М., Мерино К.Г., Карафоли Е. (январь 1999 г.). «Экспрессия изоформ Ca2+-насоса плазматической мембраны в гранулярных нейронах мозжечка модулируется Ca2+» . Журнал биологической химии . 274 (3): 1667–76. дои : 10.1074/jbc.274.3.1667 . ПМИД 9880546 .
Росадо Дж.А., Сейдж С.О. (июнь 2000 г.). «Регуляция Са2+-АТФазы плазматической мембраны малыми ГТФазами и фосфоинозитидами в тромбоцитах человека» . Журнал биологической химии . 275 (26): 19529–35. дои : 10.1074/jbc.M001319200 . ПМИД 10748016 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома ATP2B2 и ATP2B2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
человека Расположение генома ATP2B4 и ATP2B4 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000058668 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026463 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1674727-5] Олсон С., Ван М.Г., Карафоли Э., Стрелер Э.Э., МакБрайд О.В. (апрель 1991 г.). «Локализация двух генов, кодирующих Са2(+)-транспортирующие АТФазы плазматической мембраны, в хромосомах человека 1q25-32 и 12q21-23». Геномика . 9 (4): 629–41. дои : 10.1016/0888-7543(91)90356-J . ПМИД 1674727 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: АТФаза ATP2B4, перенос Са++, плазматическая мембрана 4» .

[pmid12511555-7] Шух К., Ульдриан С., Гамбарян С., Ретлейн Н., Нейсес Л. (март 2003 г.). «Взаимодействие плазматического мембранного Ca2+-насоса 4b/CI с Ca2+/кальмодулин-зависимой мембраносвязанной киназой CASK» . Журнал биологической химии . 278 (11): 9778–83. дои : 10.1074/jbc.M212507200 . ПМИД 12511555 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]