ГНАТ1

ГНАТ1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3RBQ
Идентификаторы
Псевдонимы	GNAT1 , CSNBAD3, GBT1, GNATR, CSNB1G, субъединица G-белка альфа-трансдуцин 1, HG1F
Внешние идентификаторы	Опустить : 139330 ; МГИ : 95778 ; Гомологен : 20084 ; Генные карты : GNAT1 ; ОМА : GNAT1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 3 (human) Band 3p21.31 Start 50,191,610 bp End 50,197,696 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 9 (mouse) Band 9 F1|9 58.86 cM Start 107,551,673 bp End 107,556,911 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in choroid right lobe of liver retina retinal pigment epithelium mucosa of nose right testis left testis prefrontal cortex spinal cord C1 segment Top expressed in blastocyst neural layer of retina retinal pigment epithelium epithelium of lens iris morula embryo ciliary body outer nuclear layer conjunctival fornix More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function nucleotide binding GDP binding metal ion binding acyl binding guanyl nucleotide binding G protein-coupled receptor binding protein kinase binding signal transducer activity GTP binding G-protein beta/gamma-subunit complex binding GTPase activity Cellular component cytoplasm cytosol plasma membrane photoreceptor connecting cilium neuronal cell body apical plasma membrane photoreceptor disc membrane photoreceptor outer segment membrane photoreceptor outer segment heterotrimeric G-protein complex photoreceptor inner segment membrane cell projection Biological process response to light stimulus response to stimulus regulation of rhodopsin mediated signaling pathway detection of chemical stimulus involved in sensory perception of bitter taste detection of light stimulus involved in visual perception retina development in camera-type eye eye photoreceptor cell development response to light intensity negative regulation of cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity cell population proliferation positive regulation of cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity phototransduction cellular response to electrical stimulus signal transduction protein folding adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway phototransduction, visible light rhodopsin mediated signaling pathway sensory perception of umami taste visual perception G protein-coupled receptor signaling pathway Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 2779 14685 Вместе ENSG00000114349 ENSMUSG00000034837 ЮниПрот P11488 P20612 RefSeq (мРНК) НМ_000172 НМ_144499 НМ_008140 RefSeq (белок) НП_000163 НП_653082 НП_032166 Местоположение (UCSC) Chr 3: 50,19 – 50,2 Мб Чр 9: 107,55 – 107,56 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица альфа-1 белка G(t), связывающего гуаниновые нуклеотиды, представляет собой белок , который у человека кодируется GNAT1 геном .

Трансдуцин представляет собой трехсубъединичный белок, связывающий гуаниновые нуклеотиды ( G-белок ), который стимулирует соединение родопсина и цГМФ- фосфодиэстеразы во время зрительных импульсов. Альфа-субъединицы трансдуцина в палочках и колбочках кодируются отдельными генами. Этот ген кодирует альфа-субъединицу палочек. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию двух вариантов транскрипта.

Дальнейшее чтение

• Wilkie TM, Gilbert DJ, Olsen AS и др. (1993). «Эволюция мультигенного семейства альфа-субъединиц G-белка млекопитающих» . Нат. Жене . 1 (2): 85–91. дои : 10.1038/ng0592-85 . ПМИД   1302014 . S2CID   31888533 .
• Борн Х.Р., Сандерс Д.А., Маккормик Ф. (1991). «Суперсемейство ГТФаз: консервативная структура и молекулярный механизм». Природа . 349 (6305): 117–27. Бибкод : 1991Natur.349..117B . дои : 10.1038/349117a0 . ПМИД   1898771 . S2CID   4349901 .
• Фонг С.Л. (1992). «Характеристика гена альфа-субъединицы трансдуцина палочки человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 20 (11): 2865–70. дои : 10.1093/нар/20.11.2865 . ПМК   336934 . ПМИД   1614872 .
• Лерея CL, Бунт-Милам А.Х., Херли Дж.Б. (1990). «Альфа-трансдуцин присутствует в синих, зеленых и красных чувствительных колбочках фоторецепторов сетчатки человека». Нейрон . 3 (3): 367–76. дои : 10.1016/0896-6273(89)90261-4 . ПМИД   2534964 . S2CID   2870440 .
• Ван Доп С., Медынски Д.С., Апоне Л.М. (1989). «Нуклеотидная последовательность кДНК, кодирующей альфа-субъединицу трансдуцина сетчатки (GNAT1), выделенную из человеческого глаза» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (12): 4887. doi : 10.1093/nar/17.12.4887 . ПМК   318051 . ПМИД   2748346 .
• Блатт С., Eversole-Cire P, Кон В.Х. и др. (1988). «Хромосомная локализация генов, кодирующих субъединицы белка, связывающего гуаниновые нуклеотиды, у мыши и человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 85 (20): 7642–6. Бибкод : 1988PNAS...85.7642B . дои : 10.1073/pnas.85.20.7642 . ПМК   282248 . ПМИД   2902634 .
• Нго Дж.Т., Бейтман Дж.Б., Клисак И. и др. (1994). «Региональное картирование гена альфа-трансдуцина палочки человека (GNAT1) на хромосоме 3p22». Геномика . 18 (3): 724–5. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80384-2 . ПМИД   8307584 .
• Дрия Т.П., Хан Л.Б., Ребул Т., Арно Б. (1996). «Миссенс-мутация в гене, кодирующем альфа-субъединицу палочковидного трансдуцина при нугаретской форме врожденной стационарной куриной слепоты». Нат. Жене . 13 (3): 358–60. дои : 10.1038/ng0796-358 . ПМИД   8673138 . S2CID   30551750 .
• Чен К.К., Виланд Т., Саймон М.И. (1996). «RGS-r, специфический для сетчатки белок RGS, связывает промежуточную конформацию трансдуцина и усиливает рециркуляцию» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (23): 12885–9. Бибкод : 1996PNAS...9312885C . дои : 10.1073/pnas.93.23.12885 . ПМК   24015 . ПМИД   8917514 .
• Зайберт С., Хартенек С., Эрнст О.П. и др. (2000). «Активация стержневого G-белка Gt рецептором тромбина (PAR1), экспрессируемым в клетках Sf9». Евро. Дж. Биохим . 266 (3): 911–6. дои : 10.1046/j.1432-1327.1999.00927.x . ПМИД   10583385 .
• Виланд Т., Бахтиджари Н., Чжоу XB и др. (2000). «Обмен полярностей на границе раздела регуляторов передачи сигналов G-белка с альфа-субъединицами G-белка» . Ж. Биол. Хим . 275 (37): 28500–6. дои : 10.1074/jbc.M004187200 . ПМИД   10878019 .
• Белл М.В., Десаи Н., Го XX, Галаини А.Дж. (2000). «Тирозиновое фосфорилирование альфа-субъединицы трансдуцина и его ассоциация с Src во внешних сегментах палочек фоторецепторов». Дж. Нейрохем . 75 (5): 2006–19. дои : 10.1046/j.1471-4159.2000.0752006.x . ПМИД   11032890 . S2CID   17501930 .
• Ху Г, Вензель Т.Г. (2002). «R9AP, мембранный якорь белка, ускоряющего фоторецептор ГТФазу, RGS9-1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (15): 9755–60. Бибкод : 2002PNAS...99.9755H . дои : 10.1073/pnas.152094799 . ПМК   125004 . ПМИД   12119397 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Музный Д.М., Шерер С.Е., Каул Р. и др. (2006). «Последовательность ДНК, аннотация и анализ хромосомы 3 человека» . Природа . 440 (7088): 1194–8. Бибкод : 2006Natur.440.1194M . дои : 10.1038/nature04728 . ПМИД   16641997 .

Внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P11488 (субъединица альфа-1 белка, связывающего гуаниновые нуклеотиды G (t)) на PDBe-KB .