ЛИМК2

ЛИМК2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1X6A, 4TPT
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMK2 , киназа 2 домена LIM
Внешние идентификаторы	Опустить : 601988 ; МГИ : 1197517 ; Гомологен : 55911 ; Генные карты : LIMK2 ; ОМА : LIMK2 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	31,280,080 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	3,359,189 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; blood; ; skin of abdomen; ; skin of leg; ; hair follicle; ; right uterine tube; ; palpebral conjunctiva; ; minor salivary glands; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; mucosa of transverse colon;
	Top expressed in
	lip; ; corneal stroma; ; gastrula; ; neural layer of retina; ; decidua; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; esophagus; ; yolk sac; ; granulocyte;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein serine/threonine kinase activity; ATP binding; protein binding; protein heterodimerization activity; nucleotide binding; kinase activity; metal ion binding; protein kinase activity; transferase activity; signal transducer activity;
Cellular component	nucleus; cytoplasm; cis-Golgi network;
Biological process	protein phosphorylation; spermatogenesis; phosphorylation; intracellular signal transduction; head development; cornea development in camera-type eye; actin cytoskeleton organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3985
	16886
	ENSG00000182541
	ENSMUSG00000020451
	P53671
	О54785
	НМ_016733 ; НМ_001031801 ; НМ_005569
	НМ_001034030 ; НМ_010718 ; НМ_173053 ; НМ_001361623
	НП_001026971 ; НП_005560 ; НП_057952
показывать НП_001029202 ; НП_034848 ; НП_774958 ; НП_001348552 ; НП_001389789 ;
	NP_001389790; NP_001389791; NP_001389792; NP_001389793
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Киназа 2 домена LIM представляет собой фермент , который у человека кодируется LIMK2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Существует около 40 известных эукариотических белков LIM, названных так в честь содержащихся в них доменов LIM . Домены LIM представляют собой высококонсервативные богатые цистеином структуры, содержащие 2 цинковых пальца. Хотя цинковые пальцы обычно функционируют путем связывания с ДНК или РНК, мотив LIM, вероятно, опосредует белок-белковые взаимодействия. Киназа LIM-1 и киназа LIM-2 принадлежат к небольшому подсемейству с уникальной комбинацией двух N-концевых мотивов LIM и C-концевого протеинкиназного домена. Белок, кодируемый этим геном, фосфорилируется и активируется ROCK, нижестоящим эффектором Rho, а кодируемый белок, в свою очередь, фосфорилирует кофилин, ингибируя его актин-деполимеризующую активность. Считается, что этот путь способствует Rho-индуцированной реорганизации актинового цитоскелета. Для этого гена обнаружено как минимум три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182541 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020451 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Окано И., Хираока Дж., Отера Х., Нуноуэ К., Охаси К., Ивашита С., Хираи М., Мизуно К. (декабрь 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового семейства серин/треониновых киназ, содержащих два N-концевых мотива LIM» . Журнал биологической химии . 270 (52): 31321–30. дои : 10.1074/jbc.270.52.31321 . ПМИД 8537403 .
^ Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнско Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: киназа 2 домена LIMK2 LIM» .

Дальнейшее чтение

Скотт Р.В., Олсон М.Ф. (июнь 2007 г.). «LIM-киназы: функция, регуляция и связь с болезнями человека». Журнал молекулярной медицины . 85 (6): 555–68. дои : 10.1007/s00109-007-0165-6 . ПМИД 17294230 . S2CID 8881246 .
Осада Х, Хасада К, Инадзава Дж, Учида К, Уэда Р, Такахаши Т, Такахаси Т (13 декабря 1996 г.). «Субклеточная локализация и белковое взаимодействие человеческого гена LIMK2, экспрессирующего альтернативные транскрипты с тканеспецифической регуляцией». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 229 (2): 582–9. дои : 10.1006/bbrc.1996.1847 . ПМИД 8954941 .
Хираока Дж., Окано И., Хигучи О., Ян Н., Мизуно К. (9 декабря 1996 г.). «Самоассоциация LIM-киназы 1, опосредованная взаимодействием между N-концевым доменом LIM и C-концевым киназным доменом» . Письма ФЭБС . 399 (1–2): 117–21. дои : 10.1016/S0014-5793(96)01303-8 . ПМИД 8980133 .
Ян Н., Хигути О, Охаши К., Нагата К., Вада А., Кангава К., Нисида Э., Мизуно К. (июнь 1998 г.). «Фосфорилирование кофилина LIM-киназой 1 и его роль в Rac-опосредованной реорганизации актина». Природа . 393 (6687): 809–12. Бибкод : 1998Natur.393..809Y . дои : 10.1038/31735 . ПМИД 9655398 . S2CID 4326365 .
Номото С., Татемацу Ю., Такахаси Т., Осада Х. (август 1999 г.). «Клонирование и характеристика альтернативных промоторных областей человеческого гена LIMK2, ответственных за альтернативные транскрипты с тканеспецифической экспрессией». Джин . 236 (2): 259–71. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00280-2 . ПМИД 10452946 .
Суми Т., Мацумото К., Такаи Ю., Накамура Т. (27 декабря 1999 г.). «Фосфорилирование кофилина и динамика цитоскелета актина регулируются rho- и Cdc42-активируемой LIM-киназой 2» . Журнал клеточной биологии . 147 (7): 1519–32. дои : 10.1083/jcb.147.7.1519 . ПМК 2174243 . ПМИД 10613909 .
Суми Т., Мацумото К., Накамура Т. (январь 2001 г.). «Специфическая активация киназы LIM 2 посредством фосфорилирования треонина 505 с помощью ROCK, Rho-зависимой протеинкиназы» . Журнал биологической химии . 276 (1): 670–6. дои : 10.1074/jbc.M007074200 . ПМИД 11018042 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Амано Т., Танабэ К., Это Т., Нарумия С., Мизуно К. (февраль 2001 г.). «LIM-киназа 2 индуцирует образование стрессовых волокон, фокальных спаек и мембранных пузырей, в зависимости от ее активации посредством фосфорилирования треонина-505, катализируемого Rho-ассоциированной киназой» . Биохимический журнал . 354 (Часть 1): 149–59. дои : 10.1042/0264-6021:3540149 . ПМЦ 1221639 . ПМИД 11171090 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Суми Т., Мацумото К., Сибуя А., Накамура Т. (июнь 2001 г.). «Активация киназ LIM с помощью Cdc42-связывающей киназы альфа, связанной с киназой миотонической дистрофии» . Журнал биологической химии . 276 (25): 23092–6. дои : 10.1074/jbc.C100196200 . ПМИД 11340065 .
Тошима Дж., Тошима Дж.Ю., Такеучи К., Мори Р., Мизуно К. (август 2001 г.). «Активность фосфорилирования кофилина и реорганизации актина тестикулярной протеинкиназы 2 и ее преобладающая экспрессия в клетках Сертоли яичек» . Журнал биологической химии . 276 (33): 31449–58. дои : 10.1074/jbc.M102988200 . ПМИД 11418599 .
Колланд Ф, Жак Икс, Труплен В, Мужен С, Гроазело С, Гамбургер А, Мейл А, Войчик Дж, Легрен П, Готье ЖМ (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМЦ 442148 . ПМИД 15231748 .
Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А., Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб Ю., Хакл Э. Дж., Беар Д. М., Данэм I (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геномная биология . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК 545604 . ПМИД 15461802 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Вардули Л., Мустакас А., Стурнарас К. (март 2005 г.). «LIM-киназа 2 и фосфорилирование кофилина опосредуют реорганизацию актинового цитоскелета, индуцированную трансформирующим фактором роста-бета» . Журнал биологической химии . 280 (12): 11448–57. дои : 10.1074/jbc.M402651200 . ПМИД 15647284 .

Внешние ссылки

Информация о LIMK2 со ссылками на шлюзе Cell Migration Gateway. Архивировано 11 декабря 2014 г. на Wayback Machine.

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 22 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182541 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020451 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8537403-5] Окано И., Хираока Дж., Отера Х., Нуноуэ К., Охаси К., Ивашита С., Хираи М., Мизуно К. (декабрь 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового семейства серин/треониновых киназ, содержащих два N-концевых мотива LIM» . Журнал биологической химии . 270 (52): 31321–30. дои : 10.1074/jbc.270.52.31321 . ПМИД 8537403 .

[pmid10591208-6] Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнско Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: киназа 2 домена LIMK2 LIM» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]