ПАК3

ПАК3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1EES
Идентификаторы
Псевдонимы	PAK3 , CDKN1A, MRX30, MRX47, OPHN3, PAK3beta, bPAK, hPAK-3, бета-PAK, ARA, активируемая киназа 3 p21 (RAC1), XLID30
Внешние идентификаторы	Опустить : 300142 ; МГИ : 1339656 ; Гомологен : 55664 ; Генные карты : PAK3 ; ОМА : ПАК3 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	111,227,361 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	142,580,792 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; Brodmann area 23; ; endothelial cell; ; entorhinal cortex; ; orbitofrontal cortex; ; postcentral gyrus; ; Brodmann area 46; ; superior frontal gyrus; ; lateral nuclear group of thalamus; ; Region I of hippocampus proper;
	Top expressed in
	ventromedial nucleus; ; lateral septal nucleus; ; Rostral migratory stream; ; anterior amygdaloid area; ; arcuate nucleus; ; ventral tegmental area; ; lateral hypothalamus; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; subiculum;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; protein kinase activity; SH3 domain binding; metal ion binding; kinase activity; protein binding; catalytic activity; GTPase binding; ATP binding; MAP kinase kinase activity; protein serine/threonine kinase activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; endosome; plasma membrane; postsynaptic density; glutamatergic synapse;
Biological process	regulation of neuron projection development; phosphorylation; ephrin receptor signaling pathway; dendrite development; T cell costimulation; synapse organization; cellular response to organic cyclic compound; stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; multicellular organism development; protein phosphorylation; regulation of actin filament polymerization; positive regulation of neuron apoptotic process; dendritic spine development; positive regulation of DNA biosynthetic process; metabolism; T cell receptor signaling pathway; positive regulation of dendritic spine morphogenesis; MAPK cascade; regulation of actin cytoskeleton organization; positive regulation of fibroblast migration; dendritic spine morphogenesis; Rho protein signal transduction; regulation of mitotic cell cycle; axonogenesis; cell migration; stress-activated protein kinase signaling cascade; regulation of axonogenesis; regulation of apoptotic process; signal transduction; activation of protein kinase activity; regulation of MAPK cascade;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5063
	18481
	ENSG00000077264
	ENSMUSG00000031284
	О75914
	Q61036
showНМ_001128166 ; НМ_001128167 ; НМ_001128168 ; НМ_001128172 ; НМ_001128173 ;
	NM_002578; NM_001324325; NM_001324326; NM_001324327; NM_001324328; NM_001324329; NM_001324330; NM_001324331; NM_001324332; NM_001324333; NM_001324334
	НМ_001195046 ; НМ_001195047 ; НМ_001195048 ; НМ_001195049 ; НМ_008778
showНП_001121638 ; НП_001121639 ; НП_001121640 ; НП_001121644 ; НП_001121645 ;
	NP_001311254; NP_001311255; NP_001311256; NP_001311257; NP_001311258; NP_001311259; NP_001311260; NP_001311261; NP_001311262; NP_001311263; NP_002569
	НП_001181975 ; НП_001181976 ; НП_001181977 ; НП_001181978 ; НП_032804
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

PAK3 (p21-активируемая киназа 2, бета-PAK) является одним из трех членов семейства PAK группы I эволюционно консервативных серин/треониновых киназ . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} PAK3 преимущественно экспрессируется в нейрональных клетках. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} и участвует в формировании синапсов , пластичности и умственной отсталости . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Открытие

PAK3 первоначально был клонирован из библиотеки кДНК фибробластов мыши и библиотеки кДНК эмбрионов мышей. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Как и другие PAK группы I, PAK3 стимулируется активированными Cdc42 и Rac1 .

Генные и сплайсированные варианты

Ген PAK3 человека, самый длинный представитель семейства группы I, имеет длину 283 т.п.н. Ген PAK3 состоит из 22 экзонов , из которых 6 экзонов относятся к 5'-UTR, и генерирует 13 альтернативных сплайсированных транскриптов . Среди транскриптов PAK3 11 транскриптов кодируют белки длиной от 181 до 580 аминокислот, а остальные два транскрипта представляют собой некодирующие РНК . ^{[ 12 ]} Ген PAK3 мыши содержит 10 транскриптов, кодирующих шесть белков длиной от 544 аминокислот и 559 аминокислот, а также четыре более мелких полипептида от 23 до 366 аминокислот.

Белковые домены

Подобно PAK1 , PAK2 содержит p21-связывающий домен (PBD) и аутоингибирующий домен (AID) и существует в неактивной конформации. ^{[ 13 ]}

Активаторы и ингибиторы

Активность PAK3 стимулируется Dbl, Cdc42 и Cool-2, ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} и фактором транскрипции AP1 . ^{[ 16 ]} Стимуляция активности PAK3 вышестоящими стимуляторами, такими как Dbl или Cdc42, ингибируется p50 (Cool-1). ^{[ 15 ]} Активность PAK3 ингибируется FRAX597, ингибитором PAN PAK. ^{[ 17 ]}

Функции

PAK3 сверхэкспрессируется в нейроэндокринных/карциноидных опухолях . ^{[ 18 ]} Было показано, что PAK3 важен для формирования и пластичности синапсов, а также способствует умственной отсталости. ^{[ 10 ]} Кроме того, каждая мутация гена PAK3 связана с несиндромальной Х-сцепленной умственной отсталостью. ^{[ 11 ]}

Примечания

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000077264 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031284 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кнаус Ю.Г., Моррис С., Донг Х.Дж., Чернофф Дж., Бокоч Г.М. (июль 1995 г.). «Регуляция киназ, активируемых лейкоцитами p21 человека, через рецепторы, связанные с G-белком». Наука . 269 (5221): 221–3. Бибкод : 1995Sci...269..221K . дои : 10.1126/science.7618083 . ПМИД 7618083 .
^ Мансер Э., Чонг С., Чжао З.С., Люнг Т., Майкл Дж., Холл С., Лим Л. (октябрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование нового члена семейства p21-Cdc42/Rac-активируемых киназ (PAK)» . Журнал биологической химии . 270 (42): 25070–8. дои : 10.1074/jbc.270.42.25070 . ПМИД 7559638 .
^ Кумар А., Молли П.Р., Пакала С.Б., Буй Нгуен Т.М., Раяла С.К., Кумар Р. (июль 2009 г.). «Нить ПАК от амебы до млекопитающих» . Журнал клеточной биохимии . 107 (4): 579–85. дои : 10.1002/jcb.22159 . ПМЦ 2718766 . ПМИД 19350548 .
^ Jump up to: ^а ^б Бародиа С., Тейлор С.Дж., Кризи К.Л., Чернофф Дж., Черионе Р.А. (сентябрь 1995 г.). «Идентификация мышиной киназы p21Cdc42/Rac, активированной» . Журнал биологической химии . 270 (39): 22731–7. дои : 10.1074/jbc.270.39.22731 . ПМИД 7559398 .
^ Jump up to: ^а ^б Бурбело П.Д., Козак К.А., Файнголд А.А., Зал А, Пироне Д.М. (май 1999 г.). «Клонирование, экспрессия центральной нервной системы и хромосомное картирование мышиных генов PAK-1 и PAK-3» . Джин . 232 (2): 209–15. дои : 10.1016/s0378-1119(99)00110-9 . ПМИД 10352232 .
^ Jump up to: ^а ^б Бода Б., Альбери С., Никоненко И., Нод-Ланглуа Р., Журден П., Мусмайер М., Паризи-Журден Л., Мюллер Д. (декабрь 2004 г.). «Белок умственной отсталости PAK3 способствует образованию и пластичности синапсов в гиппокампе» . Журнал неврологии . 24 (48): 10816–25. doi : 10.1523/jneurosci.2931-04.2004 . ПМК 6730202 . ПМИД 15574732 .
^ Jump up to: ^а ^б Аллен К.М., Глисон Дж.Г., Бародиа С., Партингтон М.В., Макмиллан Дж.К., Серионе Р.А., Малли Дж.К., Уолш Калифорния (сентябрь 1998 г.). «Мутация PAK3 при несиндромальной Х-сцепленной умственной отсталости». Природная генетика . 20 (1): 25–30. дои : 10.1038/1675 . ПМИД 9731525 . S2CID 16041444 .
^ Крейс П., Руссо В., Тевено Э., Комбо Дж., Барнье Ж.В. (август 2008 г.). «Четыре варианта сплайсинга млекопитающих, кодируемые геном p21-активируемой киназы 3, обладают разными биологическими свойствами». Журнал нейрохимии . 106 (3): 1184–97. дои : 10.1111/j.1471-4159.2008.05474.x . ПМИД 18507705 . S2CID 6733760 .
^ Кумар Р., Ли ДК (2016). PAK в прогрессировании рака у человека: от начала лечения рака до будущей онкобиологии . Том. 130. стр. 137–209. дои : 10.1016/bs.acr.2016.01.002 . ISBN 9780128047897 . ПМИД 27037753 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )
^ Бародиа С., Бэйли Д., Ленард З., Харт М., Гуан Дж.Л., Премонт Р.Т., Тейлор С.Дж., Серионе Р.А. (август 1999 г.). «Тирозин-фосфорилированный белок, который связывается с важной регуляторной областью классного семейства р21-активируемых киназ-связывающих белков» . Журнал биологической химии . 274 (32): 22393–400. дои : 10.1074/jbc.274.32.22393 . ПМИД 10428811 .
^ Jump up to: ^а ^б Бародиа С., Тейлор С.Дж., Джордон К.А., Ван Алст Л., Черионе Р.А. (сентябрь 1998 г.). «Новый регулятор р21-активируемых киназ» . Журнал биологической химии . 273 (37): 23633–6. дои : 10.1074/jbc.273.37.23633 . ПМИД 9726964 .
^ Холдернесс Паркер Н., Доннингер Х., Биррер М.Дж., Линер В.Д. (2013). «p21-активируемая киназа 3 (PAK3) представляет собой ген, регулируемый AP-1, способствующий организации актина и миграции трансформированных фибробластов» . ПЛОС ОДИН . 8 (6): e66892. Бибкод : 2013PLoSO...866892H . дои : 10.1371/journal.pone.0066892 . ПМЦ 3688571 . ПМИД 23818969 .
^ Личчулли С., Максимоска Дж., Чжоу С., Траутман С., Кота С., Лю К., Дюрон С., Кэмпбелл Д., Чернофф Дж., Филд Дж., Марморштейн Р., Киссил Дж.Л. (октябрь 2013 г.). «FRAX597, низкомолекулярный ингибитор p21-активируемых киназ, ингибирует онкогенез шванном, связанных с нейрофиброматозом 2 типа (NF2)» . Журнал биологической химии . 288 (40): 29105–14. дои : 10.1074/jbc.m113.510933 . ПМК 3790009 . ПМИД 23960073 .
^ Лю RX, Ван WQ, Е L, Би YF, Фанг Х, Цуй Б, Чжоу WW, Дай М, Чжан Дж, Ли XY, Нин G (август 2010 г.). «p21-активируемая киназа 3 сверхэкспрессируется в нейроэндокринных опухолях тимуса (карциноидах) с эктопическим синдромом АКТГ и участвует в миграции клеток». Эндокринный . 38 (1): 38–47. дои : 10.1007/s12020-010-9324-6 . ПМИД 20960100 . S2CID 33359058 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75914 (серин/треонин-протеинкиназа человека PAK 3) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q61036 (мышиная серин/треонин-протеинкиназа PAK 3) на PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000077264 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031284 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Кнаус Ю.Г., Моррис С., Донг Х.Дж., Чернофф Дж., Бокоч Г.М. (июль 1995 г.). «Регуляция киназ, активируемых лейкоцитами p21 человека, через рецепторы, связанные с G-белком». Наука . 269 (5221): 221–3. Бибкод : 1995Sci...269..221K . дои : 10.1126/science.7618083 . ПМИД 7618083 .

[6] Мансер Э., Чонг С., Чжао З.С., Люнг Т., Майкл Дж., Холл С., Лим Л. (октябрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование нового члена семейства p21-Cdc42/Rac-активируемых киназ (PAK)» . Журнал биологической химии . 270 (42): 25070–8. дои : 10.1074/jbc.270.42.25070 . ПМИД 7559638 .

[7] Кумар А., Молли П.Р., Пакала С.Б., Буй Нгуен Т.М., Раяла С.К., Кумар Р. (июль 2009 г.). «Нить ПАК от амебы до млекопитающих» . Журнал клеточной биохимии . 107 (4): 579–85. дои : 10.1002/jcb.22159 . ПМЦ 2718766 . ПМИД 19350548 .

[RA-8] Jump up to: ^а ^б Бародиа С., Тейлор С.Дж., Кризи К.Л., Чернофф Дж., Черионе Р.А. (сентябрь 1995 г.). «Идентификация мышиной киназы p21Cdc42/Rac, активированной» . Журнал биологической химии . 270 (39): 22731–7. дои : 10.1074/jbc.270.39.22731 . ПМИД 7559398 .

[DM-9] Jump up to: ^а ^б Бурбело П.Д., Козак К.А., Файнголд А.А., Зал А, Пироне Д.М. (май 1999 г.). «Клонирование, экспрессия центральной нервной системы и хромосомное картирование мышиных генов PAK-1 и PAK-3» . Джин . 232 (2): 209–15. дои : 10.1016/s0378-1119(99)00110-9 . ПМИД 10352232 .

[D-10] Jump up to: ^а ^б Бода Б., Альбери С., Никоненко И., Нод-Ланглуа Р., Журден П., Мусмайер М., Паризи-Журден Л., Мюллер Д. (декабрь 2004 г.). «Белок умственной отсталости PAK3 способствует образованию и пластичности синапсов в гиппокампе» . Журнал неврологии . 24 (48): 10816–25. doi : 10.1523/jneurosci.2931-04.2004 . ПМК 6730202 . ПМИД 15574732 .

[CA-11] Jump up to: ^а ^б Аллен К.М., Глисон Дж.Г., Бародиа С., Партингтон М.В., Макмиллан Дж.К., Серионе Р.А., Малли Дж.К., Уолш Калифорния (сентябрь 1998 г.). «Мутация PAK3 при несиндромальной Х-сцепленной умственной отсталости». Природная генетика . 20 (1): 25–30. дои : 10.1038/1675 . ПМИД 9731525 . S2CID 16041444 .

[12] Крейс П., Руссо В., Тевено Э., Комбо Дж., Барнье Ж.В. (август 2008 г.). «Четыре варианта сплайсинга млекопитающих, кодируемые геном p21-активируемой киназы 3, обладают разными биологическими свойствами». Журнал нейрохимии . 106 (3): 1184–97. дои : 10.1111/j.1471-4159.2008.05474.x . ПМИД 18507705 . S2CID 6733760 .

[13] Кумар Р., Ли ДК (2016). PAK в прогрессировании рака у человека: от начала лечения рака до будущей онкобиологии . Том. 130. стр. 137–209. дои : 10.1016/bs.acr.2016.01.002 . ISBN 9780128047897 . ПМИД 27037753 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )

[14] Бародиа С., Бэйли Д., Ленард З., Харт М., Гуан Дж.Л., Премонт Р.Т., Тейлор С.Дж., Серионе Р.А. (август 1999 г.). «Тирозин-фосфорилированный белок, который связывается с важной регуляторной областью классного семейства р21-активируемых киназ-связывающих белков» . Журнал биологической химии . 274 (32): 22393–400. дои : 10.1074/jbc.274.32.22393 . ПМИД 10428811 .

[RAA-15] Jump up to: ^а ^б Бародиа С., Тейлор С.Дж., Джордон К.А., Ван Алст Л., Черионе Р.А. (сентябрь 1998 г.). «Новый регулятор р21-активируемых киназ» . Журнал биологической химии . 273 (37): 23633–6. дои : 10.1074/jbc.273.37.23633 . ПМИД 9726964 .

[16] Холдернесс Паркер Н., Доннингер Х., Биррер М.Дж., Линер В.Д. (2013). «p21-активируемая киназа 3 (PAK3) представляет собой ген, регулируемый AP-1, способствующий организации актина и миграции трансформированных фибробластов» . ПЛОС ОДИН . 8 (6): e66892. Бибкод : 2013PLoSO...866892H . дои : 10.1371/journal.pone.0066892 . ПМЦ 3688571 . ПМИД 23818969 .

[17] Личчулли С., Максимоска Дж., Чжоу С., Траутман С., Кота С., Лю К., Дюрон С., Кэмпбелл Д., Чернофф Дж., Филд Дж., Марморштейн Р., Киссил Дж.Л. (октябрь 2013 г.). «FRAX597, низкомолекулярный ингибитор p21-активируемых киназ, ингибирует онкогенез шванном, связанных с нейрофиброматозом 2 типа (NF2)» . Журнал биологической химии . 288 (40): 29105–14. дои : 10.1074/jbc.m113.510933 . ПМК 3790009 . ПМИД 23960073 .

[18] Лю RX, Ван WQ, Е L, Би YF, Фанг Х, Цуй Б, Чжоу WW, Дай М, Чжан Дж, Ли XY, Нин G (август 2010 г.). «p21-активируемая киназа 3 сверхэкспрессируется в нейроэндокринных опухолях тимуса (карциноидах) с эктопическим синдромом АКТГ и участвует в миграции клеток». Эндокринный . 38 (1): 38–47. дои : 10.1007/s12020-010-9324-6 . ПМИД 20960100 . S2CID 33359058 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]