АРФ6

АРФ6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1E0S, 2A5D, 2A5F, 2A5G, 2BAO, 2BAU, 2J5X, 2W83, 3LVQ, 3LVR, 4FME, 3N5C, 3PCR, 4KAX
Идентификаторы
Псевдонимы	ARF6 , фактор рибозилирования АДФ 6, фактор рибозилирования АДФ 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 600464 ; МГИ : 99435 ; Гомологен : 1256 ; Генные карты : ARF6 ; ОМА : ARF6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	49,897,054 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	69,420,557 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; oral cavity; ; amniotic fluid; ; buccal mucosa cell; ; human penis; ; vulva; ; germinal epithelium; ; trabecular bone; ; mucosa of sigmoid colon; ; parietal pleura;
	Top expressed in
	conjunctival fornix; ; cumulus cell; ; hair follicle; ; Paneth cell; ; condyle; ; endocardial cushion; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; seminal vesicula; ; semi-lunar valve; ; motor neuron;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; protein N-terminus binding; GTP binding; protein binding; GTPase activity; thioesterase binding;
Cellular component	cytoplasm; recycling endosome; endosome; Golgi apparatus; cell projection; membrane; focal adhesion; ruffle; myelin sheath; plasma membrane; endocytic vesicle; intracellular anatomical structure; cell cortex; early endosome; endosome membrane; extracellular exosome; filopodium membrane; recycling endosome membrane; cleavage furrow; cytosol; Flemming body; early endosome membrane; presynapse; glutamatergic synapse;
Biological process	establishment of epithelial cell polarity; cell differentiation; regulation of filopodium assembly; positive regulation of actin filament polymerization; ruffle organization; small GTPase mediated signal transduction; regulation of Rac protein signal transduction; nervous system development; negative regulation of dendrite development; cell division; negative regulation of receptor-mediated endocytosis; cell adhesion; protein localization to cell surface; protein transport; protein localization to endosome; cell cycle; liver development; myeloid cell apoptotic process; cortical actin cytoskeleton organization; vesicle-mediated transport; regulation of dendritic spine development; hepatocyte apoptotic process; transport; positive regulation of protein localization to plasma membrane; intracellular protein transport; regulation of neuron projection development; endocytic recycling; synaptic vesicle endocytosis; positive regulation of keratinocyte migration; ruffle assembly; maintenance of postsynaptic density structure; positive regulation of adherens junction organization; regulation of presynapse assembly; cellular response to nerve growth factor stimulus; negative regulation of protein localization to cell surface; positive regulation of protein secretion; positive regulation of protein homodimerization activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	382
	11845
	ENSG00000165527
	ENSMUSG00000044147
	P62330
	P62331
	НМ_001663
	НМ_007481
	НП_001654
	НП_031507
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор АДФ-рибозилирования 6 ( ARF6 ) является членом факторов АДФ-рибозилирования семейства GTP -связывающих белков . ARF6 выполняет множество клеточных функций, которые часто участвуют в транспортировке биологических мембран и трансмембранного белкового груза. ARF6 конкретно участвует в эндоцитозе белков плазматической мембраны , а также, в меньшей степени, в рециркуляции белков плазматической мембраны.

Функция

Этот ген кодирует члена человеческого семейства генов ARF, которое является частью суперсемейства Ras . Гены ARF кодируют небольшие белки, связывающие гуаниновые нуклеотиды, которые стимулируют АДФ-рибозилтрансферазную активность холерного токсина и играют роль в везикулярном транспорте, а также в качестве активаторов фосфолипазы D. Продукт этого гена локализован на плазматической мембране и регулирует везикулярный транспорт. , ремоделирование мембранных липидов и сигнальные пути, которые приводят к ремоделированию актина. Псевдоген . этого гена расположен на 7-й хромосоме ^{[ 5 ]}

ARF6 может взаимодействовать с β- аррестином при активации рецептора .

Взаимодействия

Было показано, что ARF6 взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165527 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000044147 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: фактор АДФ-рибозилирования ARF6 6» .
^ Клэйнг А., Чен В., Миллер В.Е., Витале Н., Мосс Дж., Премонт Р.Т., Лефковиц Р.Дж. (ноябрь 2001 г.). «Бета-аррестин-опосредованная активация фактора АДФ-рибозилирования 6 и эндоцитоз бета-2-адренергических рецепторов» . Ж. Биол. Хим . 276 (45): 42509–13. дои : 10.1074/jbc.M108399200 . ПМИД 11533043 .
^ Д'Суза-Шори С., Бошанс Р.Л., Макдоно М., Шталь П.Д., Ван Алст Л. (сентябрь 1997 г.). «Роль POR1, белка, взаимодействующего с Rac1, в ARF6-опосредованных перестройках цитоскелета» . ЭМБО Дж . 16 (17): 5445–54. дои : 10.1093/emboj/16.17.5445 . ПМК 1170175 . ПМИД 9312003 .
^ Шин О, Экстон Дж. Х. (август 2001 г.). «Дифференциальное связывание арфаптина 2/POR1 с факторами ADP-рибозилирования и Rac1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 285 (5): 1267–73. дои : 10.1006/bbrc.2001.5330 . ПМИД 11478794 .
^ Митчелл Р., Робертсон Д.Н., Холланд П.Дж., Коллинз Д., Лутц Э.М., Джонсон М.С. (сентябрь 2003 г.). «ADP-зависимая от фактора рибозилирования активация фосфолипазы D мускариновым рецептором M3» . Ж. Биол. Хим . 278 (36): 33818–30. дои : 10.1074/jbc.M305825200 . ПМИД 12799371 .
^ Приджент М., Дюбуа Т., Рапозо Г., Дерриен В., Тенза Д., Россе К., Камони Дж., Шаврье П. (декабрь 2003 г.). «ARF6 контролирует постэндоцитарную рециркуляцию через эффектор нижележащего комплекса экзоцист» . Дж. Клеточная Биол . 163 (5): 1111–21. дои : 10.1083/jcb.200305029 . ПМК 2173613 . ПМИД 14662749 .
^ Прието С., Де Лас Ривас Дж. (июль 2006 г.). «APID: анализатор данных о гибком взаимодействии белков» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (проблема с веб-сервером): W298–302. дои : 10.1093/нар/gkl128 . ПМЦ 1538863 . ПМИД 16845013 . Архивировано из оригинала 9 апреля 2010 г.
^ Перу и Колон де Португалия Р.Л., Асеведо С.Ф., Родан А.Р., Чанг Л.И., Итон Б.А., Ротенфлу А. (декабрь 2012 г.). «Взрослый нейрон Arf6 контролирует поведение, вызванное этанолом, с помощью арфаптина, расположенного ниже Rac1 и RhoGAP18B» . Дж. Нейроски . 32 (49): 17706–13. doi : 10.1523/JNEUROSCI.1944-12.2012 . ПМЦ 3535434 . ПМИД 23223291 .

Дальнейшее чтение

Сабе Х (2004). «Потребность в Arf6 при клеточной адгезии, миграции и инвазии раковых клеток». Дж. Биохим . 134 (4): 485–9. дои : 10.1093/jb/mvg181 . ПМИД 14607973 .
Джозеф А.М., Кумар М., Митра Д. (2005). «Нэф: «необходимый и принудительный фактор» при ВИЧ-инфекции». Курс. ВИЧ Рез . 3 (1): 87–94. дои : 10.2174/1570162052773013 . ПМИД 15638726 .
Цучия М., Прайс С.Р., Цай С.К., Мосс Дж., Воган М. (1991). «Молекулярная идентификация мРНК фактора АДФ-рибозилирования и их экспрессия в клетках млекопитающих» . Ж. Биол. Хим . 266 (5): 2772–7. дои : 10.1016/S0021-9258(18)49913-9 . ПМИД 1993656 .
Стернс Т., Уиллингем М.К., Ботштейн Д., Кан Р.А. (1990). «Фактор АДФ-рибозилирования функционально и физически связан с комплексом Гольджи» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (3): 1238–42. Бибкод : 1990PNAS...87.1238S . дои : 10.1073/pnas.87.3.1238 . ПМК 53446 . ПМИД 2105501 .
Д'Суза-Шори С., Шталь П.Д. (1995). «Миристоилирование необходимо для внутриклеточной локализации и эндоцитарной функции ARF6». Эксп. Сотовый Res . 221 (1): 153–9. дои : 10.1006/excr.1995.1362 . ПМИД 7589240 .
Д'Суза-Шори С., Ли Дж., Коломбо М.И., Шталь П.Д. (1995). «Регуляторная роль ARF6 в рецептор-опосредованном эндоцитозе». Наука . 267 (5201): 1175–8. Бибкод : 1995Sci...267.1175D . дои : 10.1126/science.7855600 . ПМИД 7855600 . S2CID 23249341 .
Уэльсский CF, Мосс Дж., Воган М. (1995). «Факторы АДФ-рибозилирования: семейство белков, связывающих гуаниновые нуклеотиды массой около 20 кДа, которые активируют холерный токсин» . Мол. Клетка. Биохим . 138 (1–2): 157–66. дои : 10.1007/BF00928458 . ПМИД 7898460 . S2CID 42819002 .
Амор Дж.К., Харрисон Д.Х., Кан Р.А., Ринге Д. (1995). «Структура человеческого фактора АДФ-рибозилирования 1 в комплексе с ВВП». Природа . 372 (6507): 704–8. Бибкод : 1994Natur.372..704C . дои : 10.1038/372704a0 . ПМИД 7990966 . S2CID 4362056 .
Оркл Л., Палмер Д.Д., Амхердт М., Ротман Дж.Э. (1993). «Сборка покрытых оболочкой пузырьков в аппарате Гольджи требует только коатомера и белков ARF из цитозоля». Природа . 364 (6439): 732–4. Бибкод : 1993Natur.364..732O . дои : 10.1038/364732a0 . ПМИД 8355790 . S2CID 4348442 .
Хелмс Дж.Б., Палмер DJ, Ротман Дж.Э. (1993). «Две отдельные популяции ARF, связанные с мембранами Гольджи» . Дж. Клеточная Биол . 121 (4): 751–60. дои : 10.1083/jcb.121.4.751 . ПМК 2119793 . ПМИД 8491770 .
Кавена М.М., Уитни Дж.А., Кэрролл К., Чжан СиДжей, Боман А.Л., Розенвальд А.Г., Меллман И., Кан Р.А. (1996). «Внутриклеточное распределение белков Arf в клетках млекопитающих. Arf6 уникально локализован в плазматической мембране» . Ж. Биол. Хим . 271 (36): 21767–74. дои : 10.1074/jbc.271.36.21767 . ПМИД 8702973 .
Д'Суза-Шори С., Бошанс Р.Л., Макдонаф М., Шталь П.Д., Ван Алст Л. (1997). «Роль POR1, белка, взаимодействующего с Rac1, в ARF6-опосредованных перестройках цитоскелета» . ЭМБО Дж . 16 (17): 5445–54. дои : 10.1093/emboj/16.17.5445 . ПМК 1170175 . ПМИД 9312003 .
Фрэнк С., Упендер С., Хансен Ш., Казанова Дж. Э. (1998). «ARNO представляет собой фактор обмена гуаниновых нуклеотидов для фактора АДФ-рибозилирования 6» . Ж. Биол. Хим . 273 (1): 23–7. дои : 10.1074/jbc.273.1.23 . ПМИД 9417041 .
Ян Ч.З., Хаймберг Х., Д'Суза-Шори С., Мюклер М.М., Шталь П.Д. (1998). «Субклеточное распределение и дифференциальная экспрессия эндогенного фактора АДФ-рибозилирования 6 в клетках млекопитающих» . Ж. Биол. Хим . 273 (7): 4006–11. дои : 10.1074/jbc.273.7.4006 . ПМИД 9461590 .
Мао М, Фу Г, Ву Дж.С., Чжан QH, Чжоу Дж, Кан LX, Хуан QH, Хэ К.Л., Гу БВ, Хань ЗГ, Шэнь Ю, Гу Цзюнь, Юй Ю.П., Сюй Ш, Ван YX, Чен С.Дж., Чэнь Z. (1998). «Идентификация генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках CD34(+) человека, с помощью меток экспрессируемых последовательностей и эффективного клонирования кДНК полной длины» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (14): 8175–80. Бибкод : 1998PNAS...95.8175M . дои : 10.1073/pnas.95.14.8175 . ЧВК 20949 . ПМИД 9653160 .
Андреев Дж., Саймон Дж.П., Сабатини Д.Д., Кам Дж., Плауман Г., Рандаццо П.А., Шлессингер Дж. (1999). «Идентификация нового целевого белка Pyk2 с активностью Arf-GAP» . Мол. Клетка. Биол . 19 (3): 2338–50. дои : 10.1128/MCB.19.3.2338 . ПМК 84026 . ПМИД 10022920 .
Радхакришна Х., Аль-Авар О., Хачикян З., Дональдсон Дж.Г. (1999). «Требование ARF6 для взъерошивания Rac предполагает роль мембранного транспорта в перестройках коркового актина». Дж. Клеточная наука . 112 (6): 855–66. дои : 10.1242/jcs.112.6.855 . ПМИД 10036235 .
Ким ХС (1999). «Присвоение гена человеческого фактора АДФ-рибозилирования 6 (ARF6) хромосоме 7q22.1 путем радиационного гибридного картирования». Цитогенет. Клеточная генетика . 84 (1–2): 94. дои : 10.1159/000015225 . ПМИД 10343114 . S2CID 31452287 .
Ланжиль С.Е., Патки В., Кларлунд Дж.К., Бакстон Дж.М., Холик Дж.Дж., Чавла А., Корвера С., член парламента Чехии (1999). «Фактор АДФ-рибозилирования 6 как мишень фактора обмена гуаниновых нуклеотидов GRP1» . Ж. Биол. Хим . 274 (38): 27099–104. дои : 10.1074/jbc.274.38.27099 . ПМИД 10480924 .
Хонда А., Ногами М., Юсеки Т., Ямазаки М., Накамура Х., Ватанабэ Х., Кавамото К., Накаяма К., Моррис А.Дж., Фроман М.А., Канахо Ю. (1999). «Фосфатидилинозит-4-фосфат-5-киназа альфа является нижестоящим эффектором небольшого G-белка ARF6 при формировании мембранных рябей» . Ячейка 99 (5): 521–32. дои : 10.1016/S0092-8674(00) 81540-8 ПМИД 10589680 .
Икеда С., Ушио-Фукай М., Цзо Л., Тодзё Т., Дикалов С., Патрушев Н.А., Александр Р.В. (2005). «Новая роль ARF6 в передаче сигналов, индуцированной фактором роста эндотелия сосудов, и ангиогенезе» . Цирк. Рез 96 (4): 467–75. дои : 10.1161/01.RES.0000158286.51045.16 . ПМИД 15692085 .

Внешние ссылки

ARF6 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека ARF6 Расположение генома и страница сведений о гене ARF6 в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165527 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000044147 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «Ген Энтрез: фактор АДФ-рибозилирования ARF6 6» .

[pmid11533043-6] Клэйнг А., Чен В., Миллер В.Е., Витале Н., Мосс Дж., Премонт Р.Т., Лефковиц Р.Дж. (ноябрь 2001 г.). «Бета-аррестин-опосредованная активация фактора АДФ-рибозилирования 6 и эндоцитоз бета-2-адренергических рецепторов» . Ж. Биол. Хим . 276 (45): 42509–13. дои : 10.1074/jbc.M108399200 . ПМИД 11533043 .

[pmid9312003-7] Д'Суза-Шори С., Бошанс Р.Л., Макдоно М., Шталь П.Д., Ван Алст Л. (сентябрь 1997 г.). «Роль POR1, белка, взаимодействующего с Rac1, в ARF6-опосредованных перестройках цитоскелета» . ЭМБО Дж . 16 (17): 5445–54. дои : 10.1093/emboj/16.17.5445 . ПМК 1170175 . ПМИД 9312003 .

[pmid11478794-8] Шин О, Экстон Дж. Х. (август 2001 г.). «Дифференциальное связывание арфаптина 2/POR1 с факторами ADP-рибозилирования и Rac1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 285 (5): 1267–73. дои : 10.1006/bbrc.2001.5330 . ПМИД 11478794 .

[pmid12799371-9] Митчелл Р., Робертсон Д.Н., Холланд П.Дж., Коллинз Д., Лутц Э.М., Джонсон М.С. (сентябрь 2003 г.). «ADP-зависимая от фактора рибозилирования активация фосфолипазы D мускариновым рецептором M3» . Ж. Биол. Хим . 278 (36): 33818–30. дои : 10.1074/jbc.M305825200 . ПМИД 12799371 .

[pmid14662749-10] Приджент М., Дюбуа Т., Рапозо Г., Дерриен В., Тенза Д., Россе К., Камони Дж., Шаврье П. (декабрь 2003 г.). «ARF6 контролирует постэндоцитарную рециркуляцию через эффектор нижележащего комплекса экзоцист» . Дж. Клеточная Биол . 163 (5): 1111–21. дои : 10.1083/jcb.200305029 . ПМК 2173613 . ПМИД 14662749 .

[pmid16845013-11] Прието С., Де Лас Ривас Дж. (июль 2006 г.). «APID: анализатор данных о гибком взаимодействии белков» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (проблема с веб-сервером): W298–302. дои : 10.1093/нар/gkl128 . ПМЦ 1538863 . ПМИД 16845013 . Архивировано из оригинала 9 апреля 2010 г.

[pmid23223291-12] Перу и Колон де Португалия Р.Л., Асеведо С.Ф., Родан А.Р., Чанг Л.И., Итон Б.А., Ротенфлу А. (декабрь 2012 г.). «Взрослый нейрон Arf6 контролирует поведение, вызванное этанолом, с помощью арфаптина, расположенного ниже Rac1 и RhoGAP18B» . Дж. Нейроски . 32 (49): 17706–13. doi : 10.1523/JNEUROSCI.1944-12.2012 . ПМЦ 3535434 . ПМИД 23223291 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]