ЛИМК1

ЛИМК1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3S95, 5L6W, 5HVK, 5HVJ
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMK1 , LIMK, LIMK-1, киназа домена LIM 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 601329 ; МГИ : 104572 ; Гомологен : 1738 ; Генные карты : LIMK1 ; ОМА : LIMK1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	74,122,525 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	134,717,452 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; right frontal lobe; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; prefrontal cortex; ; amygdala; ; Brodmann area 9; ; granulocyte; ; ganglionic eminence; ; monocyte;
	Top expressed in
	motor neuron; ; gastrula; ; internal carotid artery; ; decidua; ; substantia nigra; ; external carotid artery; ; pontine nuclei; ; medial vestibular nucleus; ; anterior horn of spinal cord; ; supraoptic nucleus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; heat shock protein binding; metal ion binding; kinase activity; protein binding; protein heterodimerization activity; ATP binding; protein kinase activity; protein serine/threonine kinase activity; signal transducer activity;
Cellular component	membrane; focal adhesion; cytoplasm; nucleus; Golgi apparatus; cytosol; nuclear speck; neuron projection; lamellipodium; cell projection;
Biological process	Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; phosphorylation; nervous system development; negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity; Rho protein signal transduction; positive regulation of actin filament bundle assembly; actin cytoskeleton organization; signal transduction; positive regulation of axon extension; protein phosphorylation; positive regulation of stress fiber assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3984
	16885
	ENSG00000106683
	ENSMUSG00000029674
	P53667
	P53668
	НМ_016735 ; НМ_001204426 ; НМ_002314
	НМ_010717 ; НМ_001305875
	НП_001191355 ; НП_002305
	НП_001292804 ; НП_034847
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Киназа домена LIM 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется LIMK1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Существует около 40 известных эукариотических белков LIM, названных так в честь содержащихся в них доменов LIM . Домены LIM представляют собой высококонсервативные богатые цистеином структуры, содержащие 2 цинковых пальца . Хотя цинковые пальцы обычно функционируют путем связывания с ДНК или РНК , мотив LIM, вероятно, опосредует белок-белковые взаимодействия . LIM-киназа-1 и LIM-киназа-2 принадлежат к небольшому подсемейству с уникальной комбинацией двух N-концевых мотивов LIM, центрального домена PDZ и C-концевого протеинкиназного домена. LIMK1, вероятно, является компонентом внутриклеточного сигнального пути и может участвовать в развитии мозга. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

LIMK1 Гемизиготность вовлечена в нарушение зрительно-пространственной конструктивной когнитивной деятельности при синдроме Вильямса . ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что LIMK1 взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106683 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029674 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Тассабеджи М., Меткалф К., Фергюссон В.Д., Каретт М.Дж., Доре Дж.К., Доннаи Д., Рид А.П., Прешель К., Гутовски Н.Дж., Мао Х, Шир Д. (август 1996 г.). «Удаленная LIM-киназа при синдроме Вильямса». Нат. Жене . 13 (3): 272–3. дои : 10.1038/ng0796-272 . ПМИД 8673124 . S2CID 138698 .
^ Осборн Л.Р., Мартиндейл Д., Шерер С.В., Ши К.М., Хуйзенга Дж., Хенг Х.Х., Коста Т., Побер Б., Лью Л., Бринкман Дж., Ромменс Дж., Куп Б., Цуй Л.С. (январь 1997 г.). «Идентификация генов из области размером 500 т.п.н. на участке 7q11.23, которая обычно удаляется у пациентов с синдромом Вильямса» . Геномика . 36 (2): 328–36. дои : 10.1006/geno.1996.0469 . ПМИД 8812460 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: киназа 1 домена LIMK1 LIM» .
^ Фолетта В.К., Лим М.А., Сусайраджа Дж., Келли А.П., Стэнли Э.Г., Шеннон М., Хе В., Дас С., Массаг Дж., Бернард О., Сусарайя Дж. (сентябрь 2003 г.). «Прямая передача сигналов рецептором BMP типа II через цитоскелетный регулятор LIMK1» . Дж. Клеточная Биол . 162 (6): 1089–98. дои : 10.1083/jcb.200212060 . ПМК 2172847 . ПМИД 12963706 .
^ Маэкава М, Ишизаки Т, Боку С, Ватанабэ Н, Фудзита А, Ивамацу А, Обината Т, Охаси К, Мизуно К, Нарумия С (август 1999 г.). «Передача сигнала от Rho к актиновому цитоскелету через протеинкиназы ROCK и LIM-киназу». Наука 285 (5429): 895–8. дои : 10.1126/science.285.5429.895 . ПМИД 10436159 .
^ Ёко Т, Тоёшима Х, Миура М, Ван Ю, Иида КТ, Сузуки Х, Соне Х, Шимано Х, Готода Т, Нисимори С, Танака К, Ямада Н (декабрь 2003 г.). «p57Kip2 регулирует динамику актина путем связывания и транспортировки LIM-киназы 1 в ядро» . Ж. Биол. Хим . 278 (52): 52919–23. дои : 10.1074/jbc.M309334200 . ПМИД 14530263 .
^ Ван Цзюй, Френцель К.Э., Вэнь Д., Фоллс Д.Л. (август 1998 г.). «Трансмембранные нейрегулины взаимодействуют с киназой LIM 1, цитоплазматической протеинкиназой, участвующей в развитии зрительно-пространственного познания» . Ж. Биол. Хим . 273 (32): 20525–34. дои : 10.1074/jbc.273.32.20525 . ПМИД 9685409 .
^ Эдвардс Д.С., Сандерс Л.К., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (сентябрь 1999 г.). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 пары Rac/Cdc42 GTPase, передающая сигнал динамике актинового цитоскелета». Нат. Клеточная Биол . 1 (5): 253–9. дои : 10.1038/12963 . ПМИД 10559936 . S2CID 25250183 .
^ Дэн С., Келли А., Бернард О., Минден А. (август 2001 г.). «Изменения цитоскелета, регулируемые серин/треониновой киназой PAK4, опосредуются киназой LIM 1 и кофилином» . Ж. Биол. Хим . 276 (34): 32115–21. дои : 10.1074/jbc.M100871200 . ПМИД 11413130 .
^ Биркенфельд Дж., Бетц Х., Рот Д. (январь 2003 г.). «Идентификация кофилина и протеинкиназы 1, содержащей LIM-домен, как новых партнеров по взаимодействию 14-3-3 дзета» . Биохим. Дж . 369 (Часть 1): 45–54. дои : 10.1042/BJ20021152 . ПМК 1223062 . ПМИД 12323073 .

Дальнейшее чтение

Скотт Р.В., Олсон М.Ф. (2007). «LIM-киназы: функция, регуляция и связь с болезнями человека». Дж. Мол. Мед . 85 (6): 555–68. дои : 10.1007/s00109-007-0165-6 . ПМИД 17294230 . S2CID 8881246 .
Мизуно К., Окано И., Охаси К., Нуноуэ К., Кума К., Мията Т., Накамура Т. (1994). «Идентификация человеческой кДНК, кодирующей новую протеинкиназу с двумя повторами мотива LIM/двойного цинкового пальца». Онкоген . 9 (6): 1605–12. ПМИД 8183554 .
Окано И, Хираока Дж, Отера Х, Нуноуэ К, Охаси К, Ивашита С, Хираи М, Мизуно К (1995). «Идентификация и характеристика нового семейства серин/треониновых киназ, содержащих два N-концевых мотива LIM» . Ж. Биол. Хим . 270 (52): 31321–30. дои : 10.1074/jbc.270.52.31321 . ПМИД 8537403 .
Франгискакис Дж.М., Юарт А.К., Моррис К.А., Мервис С.Б., Бертран Дж., Робинсон Б.Ф., Кляйн Б.П., Энсинг Г.Дж., Эверетт Л.А., Грин Э.Д., Прешель К., Гутовски Н.Дж., Ноубл М., Аткинсон Д.Л., Одельберг С.Дж., Китинг М.Т. (1996) . «Гемизиготность LIM-киназы 1 связана с нарушением зрительно-пространственного конструктивного познания» . Клетка . 86 (1): 59–69. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80077-X . ПМИД 8689688 . S2CID 17786888 .
Небл Г., Мейер С.К., Самстаг Ю. (1996). «Дефосфорилирование серина 3 регулирует ядерную транслокацию кофилина» . Ж. Биол. Хим . 271 (42): 26276–80. дои : 10.1074/jbc.271.42.26276 . ПМИД 8824278 .
Хираока Дж., Окано И., Хигучи О., Ян Н., Мизуно К. (1996). «Самоассоциация LIM-киназы 1, опосредованная взаимодействием между N-концевым доменом LIM и C-концевым киназным доменом» . ФЭБС Летт . 399 (1–2): 117–21. дои : 10.1016/S0014-5793(96)01303-8 . ПМИД 8980133 . S2CID 2815035 .
Ян Н, Хигучи О, Охаси К, Нагата К, Вада А, Кангава К, Нисида Э, Мизуно К (1998). «Фосфорилирование кофилина LIM-киназой 1 и его роль в Rac-опосредованной реорганизации актина». Природа . 393 (6687): 809–12. Бибкод : 1998Natur.393..809Y . дои : 10.1038/31735 . ПМИД 9655398 . S2CID 4326365 .
Ван Цзюй, Френцель К.Э., Вэнь Д., Фоллс Д.Л. (1998). «Трансмембранные нейрегулины взаимодействуют с киназой LIM 1, цитоплазматической протеинкиназой, участвующей в развитии зрительно-пространственного познания» . Ж. Биол. Хим . 273 (32): 20525–34. дои : 10.1074/jbc.273.32.20525 . ПМИД 9685409 .
Эдвардс, округ Колумбия, Гилл Г.Н. (1999). «Структурные особенности киназы LIM, контролирующие воздействие на актиновый цитоскелет» . Ж. Биол. Хим . 274 (16): 11352–61. дои : 10.1074/jbc.274.16.11352 . ПМИД 10196227 .
Сотиропулос А., Гинейтис Д., Коупленд Дж., Трейсман Р. (1999). «Сигнально-регулируемая активация сывороточного фактора ответа опосредована изменениями в динамике актина» . Клетка . 98 (2): 159–69. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81011-9 . ПМИД 10428028 . S2CID 15781260 .
Бах I, Родригес-Эстебан С, Каррьер С, Бхушан А, Кронес А, Роуз Д.В., Гласс С.К., Андерсен Б., Изписуа Бельмонте Х.К., Розенфельд М.Г. (1999). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Нат. Жене . 22 (4): 394–9. дои : 10.1038/11970 . ПМИД 10431247 . S2CID 22326394 .
Маэкава М, Ишизаки Т, Боку С, Ватанабэ Н, Фудзита А, Ивамацу А, Обината Т, Охаси К, Мизуно К, Нарумия С (1999). «Передача сигнала от Rho к актиновому цитоскелету через протеинкиназы ROCK и LIM-киназу». Наука 285 (5429): 895–8. дои : 10.1126/science.285.5429.895 . ПМИД 10436159 .
Эдвардс Д.С., Сандерс Л.К., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (1999). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 пары Rac/Cdc42 GTPase, передающая сигнал динамике актинового цитоскелета». Нат. Клеточная Биол . 1 (5): 253–9. дои : 10.1038/12963 . ПМИД 10559936 . S2CID 25250183 .
Охаси К., Нагата К., Маекава М., Ишизаки Т., Нарумия С., Мизуно К. (2000). «Rho-ассоциированная киназа ROCK активирует LIM-киназу 1 путем фосфорилирования по треонину 508 внутри петли активации» . Ж. Биол. Хим . 275 (5): 3577–82. дои : 10.1074/jbc.275.5.3577 . ПМИД 10652353 .
Мартиндейл Д.В., Уилсон М.Д., Ван Д., Берк Р.Д., Чен X, Дуронио В., Куп Б.Ф. (2000). «Сравнительный анализ геномной последовательности области синдрома Вильямса (LIMK1-RFC2) хромосомы 7q11.23 человека». Мамм. Геном . 11 (10): 890–8. дои : 10.1007/s003350010166 . ПМИД 11003705 . S2CID 8575994 .
Суми Т., Мацумото К., Сибуя А., Накамура Т. (2001). «Активация киназ LIM с помощью Cdc42-связывающей киназы альфа, связанной с киназой миотонической дистрофии» . Ж. Биол. Хим . 276 (25): 23092–6. дои : 10.1074/jbc.C100196200 . ПМИД 11340065 .
Дэн С., Келли А., Бернард О., Минден А. (2001). «Изменения цитоскелета, регулируемые серин/треониновой киназой PAK4, опосредуются киназой LIM 1 и кофилином» . Ж. Биол. Хим . 276 (34): 32115–21. дои : 10.1074/jbc.M100871200 . ПМИД 11413130 .
Тошима Дж., Тошима Дж.Ю., Такеучи К., Мори Р., Мизуно К. (2001). «Активность фосфорилирования кофилина и реорганизации актина тестикулярной протеинкиназы 2 и ее преобладающая экспрессия в клетках Сертоли яичек» . Ж. Биол. Хим . 276 (33): 31449–58. дои : 10.1074/jbc.M102988200 . ПМИД 11418599 .

Внешние ссылки

LIMK1 Информация со ссылками на шлюзе Cell Migration Gateway. Архивировано 11 декабря 2014 г. на Wayback Machine.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106683 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029674 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8673124-5] Тассабеджи М., Меткалф К., Фергюссон В.Д., Каретт М.Дж., Доре Дж.К., Доннаи Д., Рид А.П., Прешель К., Гутовски Н.Дж., Мао Х, Шир Д. (август 1996 г.). «Удаленная LIM-киназа при синдроме Вильямса». Нат. Жене . 13 (3): 272–3. дои : 10.1038/ng0796-272 . ПМИД 8673124 . S2CID 138698 .

[pmid8812460-6] Осборн Л.Р., Мартиндейл Д., Шерер С.В., Ши К.М., Хуйзенга Дж., Хенг Х.Х., Коста Т., Побер Б., Лью Л., Бринкман Дж., Ромменс Дж., Куп Б., Цуй Л.С. (январь 1997 г.). «Идентификация генов из области размером 500 т.п.н. на участке 7q11.23, которая обычно удаляется у пациентов с синдромом Вильямса» . Геномика . 36 (2): 328–36. дои : 10.1006/geno.1996.0469 . ПМИД 8812460 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: киназа 1 домена LIMK1 LIM» .

[pmid12963706-8] Фолетта В.К., Лим М.А., Сусайраджа Дж., Келли А.П., Стэнли Э.Г., Шеннон М., Хе В., Дас С., Массаг Дж., Бернард О., Сусарайя Дж. (сентябрь 2003 г.). «Прямая передача сигналов рецептором BMP типа II через цитоскелетный регулятор LIMK1» . Дж. Клеточная Биол . 162 (6): 1089–98. дои : 10.1083/jcb.200212060 . ПМК 2172847 . ПМИД 12963706 .

[pmid10436159-9] Маэкава М, Ишизаки Т, Боку С, Ватанабэ Н, Фудзита А, Ивамацу А, Обината Т, Охаси К, Мизуно К, Нарумия С (август 1999 г.). «Передача сигнала от Rho к актиновому цитоскелету через протеинкиназы ROCK и LIM-киназу». Наука 285 (5429): 895–8. дои : 10.1126/science.285.5429.895 . ПМИД 10436159 .

[pmid14530263-10] Ёко Т, Тоёшима Х, Миура М, Ван Ю, Иида КТ, Сузуки Х, Соне Х, Шимано Х, Готода Т, Нисимори С, Танака К, Ямада Н (декабрь 2003 г.). «p57Kip2 регулирует динамику актина путем связывания и транспортировки LIM-киназы 1 в ядро» . Ж. Биол. Хим . 278 (52): 52919–23. дои : 10.1074/jbc.M309334200 . ПМИД 14530263 .

[pmid9685409-11] Ван Цзюй, Френцель К.Э., Вэнь Д., Фоллс Д.Л. (август 1998 г.). «Трансмембранные нейрегулины взаимодействуют с киназой LIM 1, цитоплазматической протеинкиназой, участвующей в развитии зрительно-пространственного познания» . Ж. Биол. Хим . 273 (32): 20525–34. дои : 10.1074/jbc.273.32.20525 . ПМИД 9685409 .

[pmid10559936-12] Эдвардс Д.С., Сандерс Л.К., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (сентябрь 1999 г.). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 пары Rac/Cdc42 GTPase, передающая сигнал динамике актинового цитоскелета». Нат. Клеточная Биол . 1 (5): 253–9. дои : 10.1038/12963 . ПМИД 10559936 . S2CID 25250183 .

[pmid11413130-13] Дэн С., Келли А., Бернард О., Минден А. (август 2001 г.). «Изменения цитоскелета, регулируемые серин/треониновой киназой PAK4, опосредуются киназой LIM 1 и кофилином» . Ж. Биол. Хим . 276 (34): 32115–21. дои : 10.1074/jbc.M100871200 . ПМИД 11413130 .

[pmid12323073-14] Биркенфельд Дж., Бетц Х., Рот Д. (январь 2003 г.). «Идентификация кофилина и протеинкиназы 1, содержащей LIM-домен, как новых партнеров по взаимодействию 14-3-3 дзета» . Биохим. Дж . 369 (Часть 1): 45–54. дои : 10.1042/BJ20021152 . ПМК 1223062 . ПМИД 12323073 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]