Ингибитор циклинзависимой киназы 1С
| CDKN1C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | CDKN1C , BWCR, BWS, KIP2, WBS, p57, p57Kip2, ингибитор циклинзависимой киназы 1C, ингибитор циклинзависимой киназы 1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | ОМИМ : 600856 ; МГИ : 104564 ; Гомологен : 133549 ; GeneCards : CDKN1C ; ОМА : CDKN1C — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ингибитор циклин-зависимой киназы 1C (p57, Kip2) , также известный как CDKN1C , представляет собой белок , который у человека кодируется CDKN1C импринтированным геном . [5]
Функция
[ редактировать ]Ингибитор циклин-зависимой киназы 1C является ингибитором прочного связывания нескольких комплексов G1 циклин/Cdk и негативным регулятором пролиферации клеток. Мутации CDKN1C причастны к спорадическому раку и синдрому Беквита-Видемана, что позволяет предположить, что он является кандидатом в супрессоры опухолей. [5]
CDKN1C представляет собой супрессор опухоли человеческий ген- на хромосоме 11 (11p15) и принадлежит к семейству генов cip/kip . Он кодирует ингибитор клеточного цикла , который связывается с комплексами G1 циклин-CDK . [6] Таким образом, p57KIP2 вызывает остановку клеточного цикла в фазе G1 .
Было обнаружено, что CDKN1C приводит к состоянию покоя раковых клеток ; экспрессия его гена регулируется посредством активности глюкокортикоидных рецепторов (GR) посредством ремоделирования хроматина , опосредованного SWI/SNF . [7]
Методы исследования
[ редактировать ]Поскольку было установлено, что мутация этого гена, подавляющего опухоль, может иметь драматические последствия у новорожденного, такие как макроглоссия, было проведено большое исследование для определения генетического значения. CDKN1C склонен к ошибкам в процессе импринтинга генов. Процесс импринтинга генов сочетается с метилированием ДНК. Это приводит к тому, что ген становится транскрипционно молчащим с отцовской стороны, позволяя материнскому гену быть активным. [8] Если этот ген не будет должным образом метилирован или получит мутацию, произойдет отсутствие подавления клеточного цикла, что приведет к росту педиатрической опухоли. [9]
Методы исследования этого гена включали различные методы секвенирования, такие как секвенирование по Сэнгеру . Этот метод секвенирования представляет собой трехэтапный процесс, который включает ПЦР, гель-электрофорез и компьютерный анализ для определения последовательностей ДНК. [10] Секвенирование может быть полезным при выявлении мутаций пар оснований. Исследование, проведенное для оценки фенотипических эффектов мутаций этого гена, потребовало генетического секвенирования когорты людей, о которых известно, что на них повлияла мутация этого гена. [11] В этом исследовании они обнаружили 37 мутаций, связанных с 38 различными родословными. Это доказывало, что мутации CDKN1C на хромосоме 11 на самом деле будут иметь фенотипические эффекты на людей. Эти эффекты далее обсуждаются на примере различных клинических случаев, которые могут возникнуть.
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутация . этого гена может привести к потере контроля над клеточным циклом, что приведет к неконтролируемой клеточной пролиферации p57KIP2 связан с синдромом Беквита-Видемана (СБВ), который характеризуется повышенным риском образования опухолей в детстве. [12] Также было показано, что мутации потери функции в этом гене связаны с синдромом IMAGe (задержка внутриутробного развития, метафизарная дисплазия, врожденная гипоплазия надпочечников и аномалии гениталий). [13] Полные пузырные заносы состоят только из отцовской ДНК, и, таким образом, в клетках отсутствует экспрессия p57, поскольку ген импринтируется по отцовской линии (замалчивается). Иммуногистохимическое окрашивание на р57 может помочь в диагностике пузырных заносов. [14]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что ингибитор циклинзависимой киназы 1C взаимодействует с:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с ENSG00000129757 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000273707, ENSG00000129757 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037664 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: ингибитор циклинзависимой киназы CDKN1C 1C (p57, Kip2)» .
- ^ Мацуока С., Эдвардс М.К., Бай С., Паркер С., Чжан П., Балдини А., Харпер Дж.В., Элледж С.Дж. (март 1995 г.). «p57KIP2, структурно отличающийся член семейства ингибиторов Cdk p21CIP1, является кандидатным геном-супрессором опухоли» . Гены и развитие . 9 (6): 650–62. дои : 10.1101/gad.9.6.650 . ПМИД 7729684 .
- ^ Прекович С., Шурман К., Майайо-Перальта И., Маньон А.Г., Буйс М., Явуз С., Велленштейн М.Д., Баррера А., Монкхорст К., Хубер А., Моррис Б. (июль 2021 г.). «Глюкокортикоидный рецептор вызывает обратимое состояние покоя, толерантное к лекарствам, с приобретенной терапевтической уязвимостью при раке легких» . Природные коммуникации . 12 (1): 4360. Бибкод : 2021NatCo..12.4360P . дои : 10.1038/s41467-021-24537-3 . ПМЦ 8285479 . ПМИД 34272384 .
- ^ Амахер С. «Эпигенетический импринтинг» (PDF) . Калифорнийский университет в Беркли .
- ^ Сидар Х., Бергман Ю. (май 2009 г.). «Связь метилирования ДНК и модификации гистонов: закономерности и парадигмы». Обзоры природы. Генетика . 10 (5): 295–304. дои : 10.1038/nrg2540 . ПМИД 19308066 . S2CID 5450674 .
- ^ «Этапы и метод секвенирования по Сэнгеру» . Мерк КГаА . Дармштадт, Германия.
- ^ Бриуд Ф., Нетчин И., Праз Ф., Ле Жюль М., Калмель С., Лакомб Д. и др. (сентябрь 2015 г.). «Мутации импринтированного гена CDKN1C как причина синдрома избыточного роста Беквита-Видемана: клинический спектр и функциональная характеристика» . Человеческая мутация . 36 (9): 894–902. дои : 10.1002/humu.22824 . ПМИД 26077438 . S2CID 37398295 .
- ^ Хатада И, Набетани А, Морисаки Х, Синь З, Оиси С, Тоноки Х, Ниикава Н, Иноуэ М, Комото Ю, Окада А, Стейхен Е, Охаси Х, Фукусима Ю, Накаяма М, Мукаи Т (октябрь 1997 г.). «Новые мутации p57KIP2 при синдроме Беквита-Видемана». Генетика человека . 100 (5–6): 681–3. дои : 10.1007/s004390050573 . ПМИД 9341892 . S2CID 21120202 .
- ^ Риччио А., Кубеллис М.В. (июль 2012 г.). «Усиление функции в CDKN1C» . Природная генетика . 44 (7): 737–8. дои : 10.1038/ng.2336 . ПМИД 22735584 . S2CID 205345787 .
- ^ ЛеГалло Р.Д., Стелоу Э.Б., Рамирес Н.К., Аткинс К.А. (май 2008 г.). «Диагностика пузырных заносов с использованием иммуногистохимии p57 и флуоресцентной гибридизации HER2 in situ» . Американский журнал клинической патологии . 129 (5): 749–755. дои : 10.1309/7XRL378C22W7APBT . ПМИД 18426735 .
- ^ Ёко Т, Тоёсима Х, Миура М, Ван Ю, Иида КТ, Сузуки Х, Соне Х, Шимано Х, Готода Т, Нисимори С, Танака К, Ямада Н (декабрь 2003 г.). «p57Kip2 регулирует динамику актина путем связывания и транспортировки LIM-киназы 1 в ядро» . Журнал биологической химии . 278 (52): 52919–23. дои : 10.1074/jbc.M309334200 . ПМИД 14530263 .
- ^ Хоакин М., Уотсон Р.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Транскрипционный фактор B-Myb, регулируемый клеточным циклом, преодолевает ингибирующую активность циклин-зависимой киназы p57 (KIP2) путем взаимодействия с его циклин-связывающим доменом» . Журнал биологической химии . 278 (45): 44255–64. дои : 10.1074/jbc.M308953200 . ПМИД 12947099 .
- ^ Рейно Э.Г., Лейбович М.П., Тинтиньяк Л.А., Пелпель К., Гийе М., Лейбович С.А. (июнь 2000 г.). «Стабилизация MyoD путем прямого связывания с p57 (Kip2)» . Журнал биологической химии . 275 (25): 18767–76. дои : 10.1074/jbc.M907412199 . ПМИД 10764802 .
- ^ Ватанабэ Х., Пан ЗК, Шрайбер-Агус Н., ДеПиньо Р.А., Гурвиц Дж., Сюн Ю. (февраль 1998 г.). «Подавление клеточной трансформации ингибитором циклин-зависимой киназы p57KIP2 требует связывания с ядерным антигеном пролиферирующей клетки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (4): 1392–7. Бибкод : 1998PNAS...95.1392W . дои : 10.1073/pnas.95.4.1392 . ЧВК 19016 . ПМИД 9465025 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Зейзингер Б.Р. (декабрь 1991 г.). «Гены, связанные с подавлением опухолей и контролем роста в нервной системе человека». Обзоры рака и метастазов . 10 (4): 281–7. дои : 10.1007/BF00554790 . ПМИД 1786629 . S2CID 22809027 .
- Ли М.Х., Рейнисдоттир I, Массаге Дж. (март 1995 г.). «Клонирование p57KIP2, ингибитора циклин-зависимой киназы с уникальной доменной структурой и распределением в тканях» . Гены и развитие . 9 (6): 639–49. дои : 10.1101/gad.9.6.639 . ПМИД 7729683 .
- Мацуока С., Эдвардс М.К., Бай С., Паркер С., Чжан П., Балдини А., Харпер Дж.В., Элледж С.Дж. (март 1995 г.). «p57KIP2, структурно отличающийся член семейства ингибиторов Cdk p21CIP1, является кандидатным геном-супрессором опухоли» . Гены и развитие . 9 (6): 650–62. дои : 10.1101/gad.9.6.650 . ПМИД 7729684 .
- Мацуока С., Томпсон Дж.С., Эдвардс М.К., Бартлетта Дж.М., Гранди П., Каликин Л.М., Харпер Дж.В., Элледж С.Дж., Фейнберг А.П. (апрель 1996 г.). «Импринтинг гена, кодирующего ингибитор циклин-зависимой киназы человека p57KIP2, на хромосоме 11p15» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (7): 3026–30. Бибкод : 1996PNAS...93.3026M . дои : 10.1073/pnas.93.7.3026 . ПМК 39755 . ПМИД 8610162 .
- Рид Л.Х., Крайдер-Миллер С.Дж., Уэст А., Ли М.Х., Массаге Дж., Вайсман Б.Е. (март 1996 г.). «Геномная организация человеческого гена p57KIP2 и его анализ в анализе опухоли Вильмса G401». Исследования рака . 56 (6): 1214–8. PMID 8640800 .
- Токино Т., Урано Т., Фурухата Т., Мацусима М., Мияцу Т., Сасаки С., Накамура Ю. (май 1996 г.). «Характеристика человеческого гена p57KIP2: альтернативный сплайсинг, полиморфизм вставки / делеции в последовательностях VNTR в кодирующей области и мутационный анализ». Генетика человека . 97 (5): 625–31. дои : 10.1007/BF02281873 . ПМИД 8655143 . S2CID 1833559 .
- Хатада И, Охаси Х, Фукусима Ю, Канеко Ю, Иноуэ М, Комото Ю, Окада А, Оиси С, Набетани А, Морисаки Х, Накаяма М, Ниикава Н, Мукаи Т (октябрь 1996 г.). «Импринтированный ген p57KIP2 мутирует при синдроме Беквита-Видемана». Природная генетика . 14 (2): 171–3. дои : 10.1038/ng1096-171 . ПМИД 8841187 . S2CID 1765772 .
- Фурухата Т., Токино Т., Урано Т., Накамура Ю. (ноябрь 1996 г.). «Выделение нового гена, закрепленного на GPI, специфически регулируемого р53; корреляция между его экспрессией и чувствительностью к противораковым препаратам». Онкоген . 13 (9): 1965–70. ПМИД 8934543 .
- ЛаБаер Дж., Гарретт М.Д., Стивенсон Л.Ф., Слингерленд Дж.М., Сандху С., Чоу Х.С., Фаттей А., Харлоу Э. (апрель 1997 г.). «Новая функциональная активность ингибиторов CDK семейства p21» . Гены и развитие . 11 (7): 847–62. дои : 10.1101/gad.11.7.847 . ПМИД 9106657 .
- Ватанабэ Х., Пан ЗК, Шрайбер-Агус Н., ДеПиньо Р.А., Гурвиц Дж., Сюн Ю. (февраль 1998 г.). «Подавление клеточной трансформации ингибитором циклин-зависимой киназы p57KIP2 требует связывания с ядерным антигеном пролиферирующей клетки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (4): 1392–7. Бибкод : 1998PNAS...95.1392W . дои : 10.1073/pnas.95.4.1392 . ЧВК 19016 . ПМИД 9465025 .
- Бхуян З.А., Яцуки Х., Сасагури Т., Джо К., Соэджима Х., Чжу Х., Хатада И., Морисаки Х., Морисаки Т., Мукаи Т. (март 1999 г.). «Функциональный анализ мутации гена p57KIP2 при синдроме Беквита-Видемана». Генетика человека . 104 (3): 205–10. дои : 10.1007/s004390050937 . ПМИД 10323243 . S2CID 25081259 .
- Лам В.В., Хатада И., Охиши С., Мукаи Т., Джойс Дж.А., Коул Т.Р., Доннаи Д., Рейк В., Шофилд П.Н., Махер Э.Р. (июль 1999 г.). «Анализ мутаций CDKN1C (p57KIP2) зародышевой линии при семейном и спорадическом синдроме Беквита-Видемана (BWS) обеспечивает новую корреляцию генотип-фенотип» . Журнал медицинской генетики . 36 (7): 518–23. дои : 10.1136/jmg.36.7.518 . ПМЦ 1734395 . ПМИД 10424811 .
- Рейно Э.Г., Лейбович М.П., Тинтиньяк Л.А., Пелпель К., Гийе М., Лейбович С.А. (июнь 2000 г.). «Стабилизация MyoD путем прямого связывания с p57 (Kip2)» . Журнал биологической химии . 275 (25): 18767–76. дои : 10.1074/jbc.M907412199 . ПМИД 10764802 .
- Финк-младший, ЛеБьен Т.В. (апрель 2001 г.). «Новая экспрессия ингибиторов циклин-зависимой киназы в предшественниках B-клеток человека» . Экспериментальная гематология . 29 (4): 490–8. дои : 10.1016/S0301-472X(01)00619-1 . ПМИД 11301189 .
- Кидо К., Доркс А., Лочелт М., Флюгель Р.М. (апрель 2002 г.). «Идентификация и функциональная характеристика внутригенного сайта связывания ДНК для спумаретровирусного трансактиватора в гене p57Kip2 человека» . Журнал биологической химии . 277 (14): 12032–9. дои : 10.1074/jbc.M108747200 . ПМИД 11815601 .
- Балинт Э., Филлипс А.С., Козлов С., Стюарт К.Л., Вусден К.Х. (март 2002 г.). «Индукция экспрессии p57 (KIP2) с помощью p73beta» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (6): 3529–34. Бибкод : 2002PNAS...99.3529B . дои : 10.1073/pnas.062491899 . ПМК 122557 . ПМИД 11891335 .
- Ито Ю, Ёсида Х, Накано К, Кобаяши К, Ёкодзава Т, Хираи К, Мацузука Ф, Мацуура Н, Кума К, Мияучи А (апрель 2002 г.). «Экспрессия белка p57/Kip2 в нормальных и неопластических тканях щитовидной железы». Международный журнал молекулярной медицины . 9 (4): 373–6. дои : 10.3892/ijmm.9.4.373 . ПМИД 11891530 .
- Кикучи Т, Тойота М, Ито Ф, Сузуки Х, Обата Т, Ямамото Х, Какиучи Х, Кусано М, Исса Дж. П., Токино Т, Имаи К (апрель 2002 г.). «Инактивация p57KIP2 путем регионального гиперметилирования промотора и деацетилирования гистонов в опухолях человека» . Онкоген . 21 (17): 2741–9. дои : 10.1038/sj.onc.1205376 . ПМИД 11965547 .
- Ли Ю, Нагаи Х, Оно Т, Юге М, Хатано С, Ито Э, Мори Н, Сайто Х, Киносита Т (октябрь 2002 г.). «Аберрантное метилирование ДНК гена p57 (KIP2) в промоторной области при лимфоидных злокачественных новообразованиях B-клеточного фенотипа» . Кровь . 100 (7): 2572–7. дои : 10.1182/кровь-2001-11-0026 . ПМИД 12239171 . S2CID 13999973 .