CDKN2D

CDKN2D
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1BD8, 1BI8
Идентификаторы
Псевдонимы	CDKN2D , INK4D, p19, p19-INK4D, ингибитор циклинзависимой киназы 2D, ингибитор циклинзависимой киназы 2D
Внешние идентификаторы	Опустить : 600927 ; МГИ : 105387 ; Гомологен : 36081 ; Генные карты : CDKN2D ; ОМА : CDKN2D — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	10,569,059 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	21,202,703 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; granulocyte; ; right frontal lobe; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; prefrontal cortex; ; amygdala; ; nucleus accumbens; ; dorsolateral prefrontal cortex; ; caudate nucleus;
	Top expressed in
	granulocyte; ; tibiofemoral joint; ; atrium; ; thymus; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; medial ganglionic eminence; ; saccule; ; endocardial cushion; ; human fetus; ; cingulate gyrus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity; protein kinase binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; nucleus; cytosol; cyclin D2-CDK4 complex;
Biological process	DNA synthesis involved in DNA repair; regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; response to vitamin D; response to retinoic acid; negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; negative regulation of cell growth; cell cycle; negative regulation of phosphorylation; response to UV; autophagic cell death; negative regulation of cell population proliferation; hearing; negative regulation of cell cycle G1/S phase transition; G1/S transition of mitotic cell cycle; negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1032
	12581
	ENSG00000129355
	ENSMUSG00000096472
	P55273
	Q60773
	НМ_079421 ; НМ_001800
	НМ_009878
	НП_001791 ; НП_524145
	НП_034008
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ингибитор циклинзависимой киназы 4 D представляет собой фермент , который у человека кодируется CDKN2D геном . ^[5]^[6]

Белок , кодируемый этим геном, является членом INK4 циклин-зависимых киназ семейства ингибиторов . Было показано, что этот белок образует стабильный комплекс с CDK4 или CDK6 и предотвращает активацию киназ CDK , таким образом, действует как регулятор роста клеток, который контролирует развитие клеточного цикла G1 . Было обнаружено, что численность транскрипта этого гена колеблется в зависимости от клеточного цикла с самой низкой экспрессией в середине G1 и максимальной экспрессией во время S-фазы. Было показано, что негативная регуляция клеточного цикла, участвующая в этом белке, участвует в подавлении пролиферации нейронов , а также сперматогенеза . Экспрессия этого гена и его белкового продукта (p19) наблюдается в нейронах с нейрофибриллярными клубками (NFT) и предлагается в качестве маркера стареющих нейронов. ^[7] Сообщалось о двух альтернативно сплайсированных вариантах этого гена, которые кодируют идентичный белок. ^[6]

Обратите внимание: этот белок не следует путать с p19-ARF (мышиный) или человеческим эквивалентом p14ARF , которые являются альтернативными продуктами гена CDKN2A .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000129355 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000096472 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Окуда Т., Хираи Х., Валентайн В.А., Шертлефф С.А., Кидд В.Дж., Лахти Дж.М., Шерр С.Дж., Даунинг Дж.Р. (март 1996 г.). «Молекулярное клонирование, характер экспрессии и хромосомная локализация человеческого CDKN2D/INK4d, ингибитора циклин D-зависимых киназ». Геномика . 29 (3): 623–30. дои : 10.1006/geno.1995.9957 . ПМИД 8575754 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ингибитор циклинзависимой киназы CDKN2D 2D (p19, ингибирует CDK4)» .
^ Дехкорди, Шива Каземпур; Уокер, Джейми; Сах, Эрик; Беннетт, Эмма; Атриан, Фарзане; Фрост, Бесс; Вуст, Бенджамин; Беннетт, Рэйчел Э.; Орр, Тимоти С.; Чжоу, Инъюэ; Анджей, Прабхакар С.; Колонна, Марко; Судмант, Питер Х.; Сюй, Пэн; Ван, Минхуэй; Чжан, Бинь; Заре, Хабиль; Орр, Миранда Э. (декабрь 2021 г.). «Профилирование стареющих клеток в мозге человека выявляет нейроны с CDKN2D/p19 и тау-невропатологией» . Природное старение . 1 (12): 1107–1116. дои : 10.1038/s43587-021-00142-3 . ПМЦ 9075501 . ПМИД 35531351 . S2CID 245059153 .

Дальнейшее чтение

Хираи Х., Руссель М.Ф., Като Дж.Ю. и др. (1995). «Новые белки INK4, p19 и p18, являются специфическими ингибиторами циклин D-зависимых киназ CDK4 и CDK6» . Мол. Клетка. Биол . 15 (5): 2672–81. дои : 10.1128/MCB.15.5.2672 . ПМК 230497 . ПМИД 7739547 .
Чан Ф.К., Чжан Дж., Ченг Л. и др. (1995). «Идентификация p19 человека и мыши, нового ингибитора CDK4 и CDK6, гомологичного p16ink4» . Мол. Клетка. Биол . 15 (5): 2682–8. дои : 10.1128/MCB.15.5.2682 . ПМК 230498 . ПМИД 7739548 .
Гуань К.Л., Дженкинс К.В., Ли Ю и др. (1996). «Выделение и характеристика p19INK4d, связанного с p16 ингибитора, специфичного для CDK6 и CDK4» . Мол. Биол. Клетка . 7 (1): 57–70. дои : 10.1091/mbc.7.1.57 . ПМК 278612 . ПМИД 8741839 .
Шваллер Дж., Пабст Т., Коффлер Х.П. и др. (1997). «Экспрессия и регуляция ингибиторов клеточного цикла G1 (p16INK4A, p15INK4B, p18INK4C, p19INK4D) в остром миелолейкозе человека и нормальных миелоидных клетках» . Лейкемия . 11 (1): 54–63. дои : 10.1038/sj.leu.2400522 . ПМИД 9001419 .
Руссо А.А., Тонг Л., Ли Дж.О. и др. (1998). «Структурная основа ингибирования циклинзависимой киназы Cdk6 супрессором опухоли p16INK4a». Природа . 395 (6699): 237–43. Бибкод : 1998Natur.395..237R . дои : 10.1038/26155 . ПМИД 9751050 . S2CID 204997058 .
Браттон Д.Х., Дханарадж В., Вик С. и др. (1998). «Кристаллическая структура комплекса циклин D-зависимой киназы Cdk6, связанной с ингибитором клеточного цикла p19INK4d». Природа . 395 (6699): 244–50. Бибкод : 1998Natur.395..244B . дои : 10.1038/26164 . ПМИД 9751051 . S2CID 13337394 .
Баумгартнер Р., Фернандес-Каталан С., Виното А. и др. (1998). «Структура человеческого ингибитора циклин-зависимой киназы p19INK4d: сравнение с известными структурами, содержащими анкириновые повторы, и последствия для дисфункции опухолевого супрессора p16INK4a» . Структура . 6 (10): 1279–90. дои : 10.1016/S0969-2126(98)00128-2 . ПМИД 9782052 .
Шрайбер М., Мюллер В.Дж., Сингх Дж., Грэм Флорида (1999). «Сравнение эффективности аденовирусных векторов, экспрессирующих ингибиторы циклинкиназы p16INK4A, p18INK4C, p19INK4D, p21(WAF1/CIP1) и p27KIP1, в индукции остановки клеточного цикла, апоптоза и ингибировании онкогенности» . Онкоген . 18 (9): 1663–76. дои : 10.1038/sj.onc.1202466 . ПМИД 10208428 .
Ньютон Бишоп Дж.А., Харланд М., Беннетт Д.С. и др. (1999). «Тестирование мутаций в семействах меланомы: INK4A, CDK4 и INK4D» . Бр. Дж. Рак . 80 (1–2): 295–300. дои : 10.1038/sj.bjc.6690354 . ПМК 2363010 . ПМИД 10390011 .
Зинди Ф., Каннингем Дж.Дж., Шерр С.Дж. и др. (1999). «Постнатальная пролиферация нейронов у мышей, у которых отсутствуют ингибиторы Ink4d и Kip1 циклин-зависимых киназ» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (23): 13462–7. Бибкод : 1999PNAS...9613462Z . дои : 10.1073/pnas.96.23.13462 . ПМК 23970 . ПМИД 10557343 .
Таллберг М., Барткова Дж., Хан С. и др. (2000). «Отличительные и избыточные свойства членов семейства ингибиторов циклин-зависимых киназ INK4» . ФЭБС Летт . 470 (2): 161–6. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01307-7 . ПМИД 10734227 . S2CID 45439595 .
Барткова Дж., Туллберг М., Райперт-Де Мейтс Е. и др. (2000). «Отсутствие p19INK4d в опухолях зародышевых клеток яичка контрастирует с высокой экспрессией во время нормального сперматогенеза» . Онкоген . 19 (36): 4146–50. дои : 10.1038/sj.onc.1203769 . ПМИД 10962575 .
Финк-младший, ЛеБьен Т.В. (2001). «Новая экспрессия ингибиторов циклин-зависимой киназы в предшественниках B-клеток человека» . Эксп. Гематол . 29 (4): 490–8. дои : 10.1016/S0301-472X(01)00619-1 . ПМИД 11301189 .
Зееб М., Рёснер Х., Зеславски В. и др. (2002). «Сворачивание белка и стабильность человеческого ингибитора CDK p19 (INK4d)». Дж. Мол. Биол . 315 (3): 447–57. дои : 10.1006/jmbi.2001.5242 . ПМИД 11786024 .
Мацузаки Ю., Миядзава К., Ёкота Т. и др. (2002). «Молекулярное клонирование и характеристика промотора гена p19 (INK4d) человека» . ФЭБС Летт . 517 (1–3): 272–6. дои : 10.1016/S0014-5793(02)02647-9 . ПМИД 12062451 . S2CID 82054693 .
Арчеллана-Панлилио М.Ю., Эгелер Р.М., Уджак Э. и др. (2002). «Доказательства роли ингибиторов циклин-зависимых киназ семейства INK4 в гранулезоклеточных опухолях яичников». Гены Хромосомы Рак . 35 (2): 176–81. дои : 10.1002/gcc.10108 . ПМИД 12203782 . S2CID 27477191 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Геверт К., Готалс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Нат. Биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Комата Т., Канзава Т., Такеучи Х. и др. (2004). «Противоопухолевое действие ингибиторов циклин-зависимых киназ (p16(INK4A), p18(INK4C), p19(INK4D), p21(WAF1/CIP1) и p27(KIP1)) на клетки злокачественной глиомы» . Бр. Дж. Рак . 88 (8): 1277–80. дои : 10.1038/sj.bjc.6600862 . ПМЦ 2747579 . ПМИД 12698196 .

Внешние ссылки

CDKN2D Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека CDKN2D в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P55273 (ингибитор циклин-зависимой киназы 4 D) на PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000129355 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000096472 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8575754-5] Окуда Т., Хираи Х., Валентайн В.А., Шертлефф С.А., Кидд В.Дж., Лахти Дж.М., Шерр С.Дж., Даунинг Дж.Р. (март 1996 г.). «Молекулярное клонирование, характер экспрессии и хромосомная локализация человеческого CDKN2D/INK4d, ингибитора циклин D-зависимых киназ». Геномика . 29 (3): 623–30. дои : 10.1006/geno.1995.9957 . ПМИД 8575754 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ингибитор циклинзависимой киназы CDKN2D 2D (p19, ингибирует CDK4)» .

[7] Дехкорди, Шива Каземпур; Уокер, Джейми; Сах, Эрик; Беннетт, Эмма; Атриан, Фарзане; Фрост, Бесс; Вуст, Бенджамин; Беннетт, Рэйчел Э.; Орр, Тимоти С.; Чжоу, Инъюэ; Анджей, Прабхакар С.; Колонна, Марко; Судмант, Питер Х.; Сюй, Пэн; Ван, Минхуэй; Чжан, Бинь; Заре, Хабиль; Орр, Миранда Э. (декабрь 2021 г.). «Профилирование стареющих клеток в мозге человека выявляет нейроны с CDKN2D/p19 и тау-невропатологией» . Природное старение . 1 (12): 1107–1116. дои : 10.1038/s43587-021-00142-3 . ПМЦ 9075501 . ПМИД 35531351 . S2CID 245059153 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]