CDK13

CDK13
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB показывать Список идентификационных кодов PDB 5EFQ
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK13 , CDC2L, CDC2L5, CHED, hcyclin-зависимая киназа 13, циклин-зависимая киназа 13, CHDFIDD
Внешние идентификаторы	Опустить : 603309 ; МГИ : 1916812 ; Гомологен : 135707 ; Генные карты : CDK13 ; ОМА : CDK13 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 7 (human) Band 7p14.1 Start 39,950,121 bp End 40,099,580 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 13 (mouse) Band 13|13 A2 Start 17,884,900 bp End 17,979,682 bp
показывать экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in buccal mucosa cell renal medulla visceral pleura pylorus nipple cardia endothelial cell ventral tegmental area inferior ganglion of vagus nerve parietal pleura Top expressed in genital tubercle tail of embryo spermatocyte Rostral migratory stream hand granulocyte spermatid thymus gastrula neural layer of retina More reference expression data BioGPS More reference expression data
показывать Генная онтология Molecular function transferase activity protein kinase activity nucleotide binding kinase activity protein serine/threonine kinase activity protein binding RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity ATP binding cyclin binding cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity transcription factor binding protein kinase binding RNA binding Cellular component Golgi apparatus nuclear speck nuclear cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex cyclin K-CDK13 complex nucleus extracellular region extracellular space nucleoplasm chromosome cytosol cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex ficolin-1-rich granule lumen cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex Biological process hemopoiesis phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain phosphorylation mRNA processing multicellular organism development protein phosphorylation RNA splicing positive regulation of cell population proliferation viral process alternative mRNA splicing, via spliceosome regulation of mitotic nuclear division transcription elongation from RNA polymerase II promoter neutrophil degranulation positive regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of stem cell differentiation positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи Разновидность Человек Мышь Входить 8621 69562 Вместе ENSG00000065883 ENSMUSG00000041297 ЮниПрот Q14004 Q69ZA1 RefSeq (мРНК) НМ_003718 НМ_031267 НМ_001081058 НМ_027118 RefSeq (белок) НП_003709 НП_112557 НП_001074527 НП_081394 Местоположение (UCSC) Чр 7: 39,95 – 40,1 Мб Чр 13: 17,88 – 17,98 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Циклинзависимая киназа 13 — это фермент , который у человека кодируется CDK13 геном .

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства циклин -зависимых серин/ треониновых протеинкиназ. Члены этого семейства хорошо известны своей важной ролью главных переключателей в контроле клеточного цикла. Некоторые из киназ, контролирующих клеточный цикл, способны фосфорилировать белки, которые важны для дифференцировки и апоптоза клеток , тем самым обеспечивая связь между пролиферацией, дифференцировкой и апоптозом клеток. Белки этого семейства могут также участвовать в функциях, не связанных с клеточным циклом, таких как нейроцитоскелета динамика . Точная функция этого белка еще не определена. Он имеет необычно большие N- и C-концы и повсеместно экспрессируется во многих тканях. Описаны два варианта альтернативного сплайсинга.

Клиническое значение

Мутации CDK13 вызывают расстройства, связанные с CDK13 . Исследование детей с редкими нарушениями развития, проведенное в 2017 году , выявило в Соединенном Королевстве 11 детей с дефектом гена CDK13 . Эта ошибка повлияла на коммуникативные и языковые навыки детей, а также вызвала трудности в обучении.

Внешние ссылки

• человека Местоположение генома CDK13 и CDK13 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q14004 (циклин-зависимая киназа 13) на PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Маккензи Л.Ф., Брук Г.С., Катфилд Дж.Ф., Салливан П.А., Уизерс С.Г. (1997). «Идентификация Glu-330 как каталитического нуклеофила экзо-бета-(1,3)-глюканазы Candida albicans» . Ж. Биол. Хим . 272 (6): 3161–7. дои : 10.1074/jbc.272.6.3161 . ПМИД   9013549 .
• Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• <Пожалуйста, добавьте первых недостающих авторов для заполнения метаданных.> (1999). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геном Рез . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД   9847074 .
• Маркес Ф., Моро Дж.Л., Поселье Дж., Лозано Х.К., Шатт П., Пикард А. и др. (2001). «Новое подсемейство высокомолекулярных киназ, родственных CDC2, с мотивами PITAI/VRE». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 279 (3): 832–7. дои : 10.1006/bbrc.2000.4042 . ПМИД   11162436 .
• Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д., Кикуно Р., Охара О (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 8 (2): 85–95. дои : 10.1093/dnares/8.2.85 . ПМИД   11347906 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А., Грейвс Т.А., Пепин К.Х., Вагнер-Макферсон С. и др. (2003). «Последовательность ДНК 7-й хромосомы человека» . Природа . 424 (6945): 157–64. Бибкод : 2003Natur.424..157H . дои : 10.1038/nature01782 . ПМИД   12853948 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т., Оцуки Т., Сугияма Т., Ири Р. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б., Мукерджи М., Стеттлер-Гилл М., Питерс ЕС (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованными металлами и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Хим . 76 (10): 2763–72. дои : 10.1021/ac035352d . ПМИД   15144186 .
• Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМЦ   442148 . ПМИД   15231748 .
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК   514446 . ПМИД   15302935 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К., Онг С.Е., Лион К.Э., Ламонд А.И. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Эвен Ю, Дюрье С., Эсканде М.Л., Лозано Дж.К., Поселье Г., Вейль Д. и др. (2007). «CDC2L5, Cdk-подобная киназа с доменом RS, взаимодействует с ASF/SF2-ассоциированным белком p32 и влияет на сплайсинг in vivo». Дж. Селл. Биохим . 99 (3): 890–904. дои : 10.1002/jcb.20986 . ПМИД   16721827 . S2CID   21022091 .
• Цанг Х.Т., Коннелл Дж.В., Браун С.Е., Томпсон А., Рид Э., Сандерсон СМ (2006). «Систематический анализ взаимодействий белков CHMP человека: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с несколькими компонентами комплекса ESCRT III человека». Геномика . 88 (3): 333–46. дои : 10.1016/j.ygeno.2006.04.003 . ПМИД   16730941 .
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД   16964243 . S2CID   14294292 .
• Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД   17081983 .