Jump to content

Циклинзависимая киназа 9

CDK9
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы CDK9 , C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, циклинзависимая киназа 9, циклинзависимая киназа 9
Внешние идентификаторы ОМИМ : 603251 ; МГИ : 1328368 ; Гомологен : 55566 ; Генные карты : CDK9 ; ОМА : CDK9 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001261

НМ_130860

RefSeq (белок)

НП_001252
НП_001252.1

НП_570930

Местоположение (UCSC) Chr 9: 127,79 – 127,79 Мб Chr 2: 32,6 – 32,6 Мб
в PubMed Поиск [3] [4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Циклинзависимая киназа 9 или CDK9 представляет собой циклинзависимую киназу, связанную с P-TEFb .

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства циклинзависимых киназ (CDK). Члены семейства CDK очень похожи на генные продукты S. cerevisiae cdc28 и S. pombe cdc2 и известны как важные регуляторы клеточного цикла. Было обнаружено, что эта киназа является компонентом мультибелкового комплекса TAK/P-TEFb, который является фактором элонгации для транскрипции, направленной РНК-полимеразой II, и действует путем фосфорилирования С-концевого домена крупнейшей субъединицы РНК-полимеразы II . Этот белок образует комплекс и регулируется его регуляторной субъединицей циклином Т или циклином К. Было обнаружено, что белок Tat ВИЧ-1 взаимодействует с этим белком и циклином Т, что предполагает возможное участие этого белка в развитии СПИДа. [5]

Также известно, что CDK9 связывается с другими белками, такими как TRAF2 , и участвует в дифференцировке скелетных мышц. [6]

Ингибиторы

[ редактировать ]

На основании результатов молекулярного докинга лиганды-3, 5, 14 и 16 были проверены среди 17 различных соединений бензосуберена, конденсированных с пирролоном, как мощные и специфические ингибиторы без какой-либо перекрестной реактивности против различных изоформ CDK. Анализ MD-моделирования и исследований MM-PBSA выявил профили энергии связи всех выбранных комплексов. Выбранные лиганды показали лучшие результаты, чем экспериментальный препарат-кандидат (Росковитин). Лиганды-5 и 16 проявляют специфичность к CDK9. Ожидается, что эти лиганды будут обладать меньшим риском побочных эффектов из-за их природного происхождения. [7]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что CDK9 взаимодействует с:

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000136807 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000009555 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтрез: циклин-зависимая киназа 9 CDK9 (киназа, родственная CDC2)» .
  6. ^ Маклахлан Т.К., Санг Н., Де Лука А., Пури П.Л., Левреро М., Джордано А. (1998). «Привязка CDK9 к TRAF2». Дж. Селл. Биохим . 71 (4): 467–78. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19981215)71:4<467::AID-JCB2>3.0.CO;2-G . ПМИД   9827693 . S2CID   25858837 .
  7. ^ Сингх Р., Бхардвадж В.К., Дас П., Пурохит Р. (ноябрь 2019 г.). «Природные аналоги, ингибирующие селективные изоформы белка циклин-зависимой киназы: вычислительная перспектива». Журнал биомолекулярной структуры и динамики . 38 (17): 5126–5135. дои : 10.1080/07391102.2019.1696709 . ПМИД   3176087 . S2CID   208276454 .
  8. ^ Ли Д.К., Дуань Хо, Чанг С. (март 2001 г.). «Андрогеновый рецептор взаимодействует с фактором положительной элонгации P-TEFb и повышает эффективность элонгации транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 276 (13): 9978–84. дои : 10.1074/jbc.M002285200 . ПМИД   11266437 .
  9. ^ Jump up to: а б с Кирнан Р.Э., Эмилиани С., Накаяма К., Кастро А., Лаббе Х.К., Лорка Т., Накаяма Ки К., Бенкиране М. (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие между циклином Т1 и SCF (SKP2) нацелено на CDK9 для убиквитинирования и деградации протеасомой» . Мол. Клетка. Биол . 21 (23): 7956–70. дои : 10.1128/MCB.21.23.7956-7970.2001 . ПМК   99964 . ПМИД   11689688 .
  10. ^ Jump up to: а б Фу Т.Дж., Пэн Дж., Ли Дж., Прайс Д.Х., Флорес О. (декабрь 1999 г.). «Циклин K действует как регуляторная субъединица CDK9 и участвует в транскрипции РНК-полимеразы II» . Ж. Биол. Хим . 274 (49): 34527–30. дои : 10.1074/jbc.274.49.34527 . ПМИД   10574912 .
  11. ^ Jump up to: а б Пэн Дж., Чжу Ю., Милтон Дж.Т., Прайс Д.Х. (март 1998 г.). «Идентификация множественных субъединиц циклина человеческого P-TEFb» . Генс Дев . 12 (5): 755–62. дои : 10.1101/gad.12.5.755 . ПМК   316581 . ПМИД   9499409 .
  12. ^ Кабарт П., Чу Х.К., Мерфи С. (июль 2004 г.). «BRCA1 взаимодействует с NUFIP и P-TEFb, чтобы активировать транскрипцию РНК-полимеразой II» . Онкоген . 23 (31): 5316–29. дои : 10.1038/sj.onc.1207684 . ПМИД   15107825 .
  13. ^ Янг ТМ, Ван Кью, Пеэри Т, Мэтьюз МБ (сентябрь 2003 г.). «Человеческий белок, содержащий домен I-mfa, HIC, взаимодействует с циклином Т1 и модулирует P-TEFb-зависимую транскрипцию» . Мол. Клетка. Биол . 23 (18): 6373–84. дои : 10.1128/MCB.23.18.6373-6384.2003 . ЧВК   193714 . ПМИД   12944466 .
  14. ^ Михельс А.А., Нгуен В.Т., Фральди А., Лабас В., Эдвардс М., Боннет Ф., Лания Л., Бенсауде О. (июль 2003 г.). «РНК MAQ1 и 7SK взаимодействуют с комплексами CDK9/циклин Т транскрипционно-зависимым образом» . Мол. Клетка. Биол . 23 (14): 4859–69. дои : 10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003 . ПМК   162212 . ПМИД   12832472 .
  15. ^ Хок М., Янг Т.М., Ли К.Г., Серреро Дж., Мэтьюз М.Б., Пеэри Т. (март 2003 г.). «Фактор роста гранулулин взаимодействует с циклином Т1 и модулирует P-TEFb-зависимую транскрипцию» . Мол. Клетка. Биол . 23 (5): 1688–702. дои : 10.1128/MCB.23.5.1688-1702.2003 . ПМК   151712 . ПМИД   12588988 .
  16. ^ Jump up to: а б Де Фалько Дж., Багелла Л., Клаудио П.П., Де Лука А., Фу Ю., Калабретта Б., Сала А., Джордано А. (январь 2000 г.). «Физическое взаимодействие между CDK9 и B-Myb приводит к подавлению ауторегуляции гена B-Myb» . Онкоген . 19 (3): 373–9. дои : 10.1038/sj.onc.1203305 . ПМИД   10656684 .
  17. ^ Jump up to: а б Гарбер М.Э., Мэйалл Т.П., Зюсс Э.М., Мейзенхельдер Дж., Томпсон Н.Е., Джонс К.А. (сентябрь 2000 г.). «Аутофосфорилирование CDK9 регулирует высокоаффинное связывание комплекса tat-P-TEFb вируса иммунодефицита человека типа 1 с РНК TAR» . Мол. Клетка. Биол . 20 (18): 6958–69. дои : 10.1128/MCB.20.18.6958-6969.2000 . ПМК   88771 . ПМИД   10958691 .
  18. ^ Амини С., Клаво А., Надрага Ю., Джордано А., Халили К., Савая Б.Е. (август 2002 г.). «Взаимодействие между факторами cdk9 и NF-kappaB определяет уровень транскрипции гена ВИЧ-1 в астроцитарных клетках» . Онкоген . 21 (37): 5797–803. дои : 10.1038/sj.onc.1205754 . ПМИД   12173051 .
  19. ^ Симоне С., Багелла Л., Беллан С., Джордано А. (июнь 2002 г.). «Физическое взаимодействие между pRb и комплексом cdk9/cyclinT2» . Онкоген . 21 (26): 4158–65. дои : 10.1038/sj.onc.1205511 . ПМИД   12037672 .
  20. ^ Ким Ю.К., Буржуа К.Ф., Изель С., Черчер М.Дж., Карн Дж. (июль 2002 г.). «Фосфорилирование карбоксильного домена РНК-полимеразы II с помощью CDK9 непосредственно ответственно за Tat-активируемую транскрипционную элонгацию вируса иммунодефицита человека типа 1» . Мол Клеточная Биол . 22 (13): 4622–4637. дои : 10.1128/MCB.22.13.4622-4637.2002 . ПМК   133925 . ПМИД   12052871 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]

См. также

[ редактировать ]
[ редактировать ]


Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: f185ba4392782b6f23c137aaaf8717af__1711569780
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/f1/af/f185ba4392782b6f23c137aaaf8717af.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Cyclin-dependent kinase 9 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)