Supt5h

Supt5h
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2DO3, 2E6Z, 2E70, 3H7H, 4L1U
Идентификаторы
Псевдонимы	SUPT5H , SPT5, SPT5H, TAT-CT1, гомолог SPT5, субъединица фактора удлинения DSIF
Внешние идентификаторы	Омим : 602102 ; MGI : 1202400 ; Гомологен : 2384 ; GeneCards : Supt5h ; OMA : SUPT5H - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	39,476,670 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	28,038,171 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right testis; ; left testis; ; anterior pituitary; ; sural nerve; ; right hemisphere of cerebellum; ; right lobe of thyroid gland; ; right uterine tube; ; left lobe of thyroid gland; ; apex of heart; ; right frontal lobe;
	Top expressed in
	adrenal gland; ; Gonadal ridge; ; internal carotid artery; ; external carotid artery; ; fossa; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; lacrimal gland; ; tail of embryo; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; motor neuron;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; protein heterodimerization activity; enzyme binding; chromatin binding; RNA binding; DNA binding; mRNA binding;
Cellular component	nucleoplasm; DSIF complex; nucleus;
Biological process	chromatin remodeling; negative regulation of mRNA polyadenylation; regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription elongation from RNA polymerase II promoter; regulation of DNA-templated transcription, elongation; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; 7-methylguanosine mRNA capping; transcription by RNA polymerase II; response to organic substance; transcription, DNA-templated; negative regulation of DNA-templated transcription, elongation; positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; positive regulation of macroautophagy; DNA-templated transcription, elongation; single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; positive regulation of viral transcription; cell cycle; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6829
	20924
	ENSG00000196235
	Ensmusg00000003435
	O00267
	O55201
showNM_001111020 ; NM_001130824 ; NM_001130825 ; NM_003169 ; NM_001319990 ;
	NM_001319991
	NM_013676
showNP_001104490 ; NP_001124296 ; NP_001124297 ; NP_001306919 ; NP_001306920 ;
	NP_003160
	NP_038704
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Фактор удлинения транскрипции SPT5 - это белок , который у людей кодируется SUPT5H геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SUPT5H взаимодействует :

CDK9 , ^{[ 7 ]}
Циклин-зависимая киназа 7 , ^{[ 7 ]}
Htatsf1 , ^{[ 8 ]}
PIN1 , ^{[ 9 ]}
Polr2a , ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]}
PRMT1 ^{[ 11 ]} и
Белок -аргинин метилтрансфераза 5 . ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000196235 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003435 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Chiang PW, Fogel E, Jackson CL, Lieuallen K, Lennon G, Qu X, Wang SQ, Kurnit DM (декабрь 1996 г.). «Выделение, секвенирование и картирование человеческого гомолога транскрипционного фактора дрожжей, SPT5». Геномика . 38 (3): 421–4. doi : 10.1006/geno.1996.0646 . PMID 8975720 .
^ «Ген Entrez: Supt5h подавитель TY 5 гомолога (S. cerevisiae)» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Garber Me, Mayall TP, Suess EM, Meisenhelder J, Thompson NE, Jones Ka (сентябрь 2000). «Аутофосфорилирование CDK9 регулирует высокоаффинное связывание вируса иммунодефицита человека типа 1 TAT-P-TEFB с TAR РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (18): 6958–69. doi : 10.1128/mcb.20.18.6958-6969.2000 . PMC 88771 . PMID 10958691 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ким Дж. Б., Ямагучи Ю., Вада Т., Ханда Х, Шарп Па (сентябрь 1999). «Белок TAT-SF1 ассоциируется с белками RAP30 и человеком SPT5» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (9): 5960–8. doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC 84462 . PMID 10454543 .
^ Lavoie SB, Albert AL, Handa H, Vincent M, Bensaude O (сентябрь 2001 г.). «PEPTIDYL-пролилзомераза PIN1 взаимодействует с HSPT5, фосфорилированным CDK9». Журнал молекулярной биологии . 312 (4): 675–85. doi : 10.1006/jmbi.2001.4991 . PMID 11575923 .
^ Нет т, иммутию, фердоу, а, «DSIF, составлен из домашнего камня SEXT и SPT4 » ген и развитие 12 (3): 343–56. doi : 10.1101/gad . PMC 316480 . PMID 940929 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Kwak YT, Guo J, Prajapati S, Park KJ, Surabhi RM, Miller B, Gehrig P, Gaynor RB (апрель 2003 г.). «Метилирование SPT5 регулирует его взаимодействие с РНК -полимеразой II и свойствами удлинения транскрипции» . Молекулярная клетка . 11 (4): 1055–66. doi : 10.1016/s1097-2765 (03) 00101-1 . PMID 12718890 .

Дальнейшее чтение

Andersson B, Wendland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод" двойного адаптера "для улучшения строительства библиотеки ружья». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wendland MA, Lennon G, Gibbs RA (апрель 1997). «Крупномасштабное секвенирование кДНК конкатенации» . Исследование генома . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Stachora AA, Schäfer RE, Pohlmeier M, Maier G, Ponstingl H (Jun 1997). «Белок SUPT5H человека, предполагаемый модулятор структуры хроматина, обратимо фосфорилируется при митозе» . Письма Febs . 409 (1): 74–8. doi : 10.1016/s0014-5793 (97) 00486-9 . PMID 9199507 . S2CID 43730950 .
Нет т, иммутию, фердоу, а, «DSIF, составлен из домашнего камня SEXT и SPT4 » ген и развитие 12 (3): 343–56. doi : 10.1101/gad . PMC 316480 . PMID 940929 .
Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (март 1998 г.). «Роль человеческого гомолога транскрипционного фактора дрожжей SPT5 в TAT-активации ВИЧ-1». Журнал молекулярной биологии . 277 (2): 179–97. doi : 10.1006/jmbi.1997.1601 . PMID 9514752 .
Вада Т., Такаги Т., Ямагучи Ю., Ватанабе Д., Ханда Х (декабрь 1998). «Доказательства того, что P-TEFB облегчает негативное влияние DSIF на РНК-полимеразу II-зависимую транскрипцию in vitro» . Embo Journal . 17 (24): 7395–403. doi : 10.1093/emboj/17.24.7395 . PMC 1171084 . PMID 9857195 .
Yamaguchi Y, Wada T, Watanabe D, Takagi T, Hasegawa J, Handa H (Mar 1999). «Структура и функция фактора удлинения транскрипции человека DSIF» . Журнал биологической химии . 274 (12): 8085–92. doi : 10.1074/jbc.274.12.8085 . PMID 10075709 .
Yamaguchi Y, Takagi T, Wada T, Tano K, Furuya A, Sugimoto S, Hasewaga J, Handa H (Apr 1999). «Неллф, мультиспасный комплекс, содержащий RD, сотрудничает с DSIF для подавления элегации РНК -полимеразы II » Ячейка 97 (1): 41–5 Doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80713-8 PMID 10199401 S2CID 168555257
Parada CA, Roeder RG (Jul 1999). «Новая РНК-полимераза II-содержащая комплекс усиливает транскрипцию ВИЧ-1 с усиленной TAT» . Embo Journal . 18 (13): 3688–701. doi : 10.1093/emboj/18.13.3688 . PMC 1171446 . PMID 10393184 .
Вэнь Й, Шаткин А.Дж. (июль 1999). «Фактор удлинения транскрипции HSPT5 стимулирует ограничение мРНК» . Гены и развитие . 13 (14): 1774–9. doi : 10.1101/gad.13.14.1774 . PMC 316881 . PMID 10421630 .
Ким Дж. Б., Ямагучи Ю., Вада Т., Ханда Х, Шарп Па (сентябрь 1999). «Белок TAT-SF1 ассоциируется с белками RAP30 и человеком SPT5» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (9): 5960–8. doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC 84462 . PMID 10454543 .
Иванов Д., Квак Ют, Го Дж, Гейнор Р.Б. (май 2000). «Домены в белке SPT5, которые модулируют его транскрипционные регуляторные свойства» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (9): 2970–83. doi : 10.1128/mcb.20.9.2970-2983.2000 . PMC 85557 . PMID 10757782 .
Wada T, Orphanides G, Hasegawa J, Kim DK, Shima D, Yamaguchi Y, Fukuda A, Hysatake K, Oh S, Reinberg D, Handa H (Jun 2000). «Факт снимает DSIF/NELF-опосредованное ингибирование удлинения транскрипции и выявляет функциональные различия между P-TEFB и TFIIH» . Молекулярная клетка . 5 (6): 1067–72. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80272-5 . PMID 10912001 .
Ping YH, Rana TM (апрель 2001 г.). «DSIF и NELF взаимодействуют с комплексом удлинения РНК-полимеразы II, а ВИЧ-1 ТАТ стимулирует P-TEFB-опосредованное фосфорилирование РНК-полимеразы II и DSIF во время удлинения транскрипции» . Журнал биологической химии . 276 (16): 12951–8. doi : 10.1074/jbc.m006130200 . PMID 11112772 .
Ким Дж.Б., Шарп П.А. (апрель 2001 г.). «Положительный фактор удлинения транскрипции B фосфорилирует HSPT5 и РНК-полимеразу II, карбоксильно-концевой домен независимо от циклин-зависимой киназы киназы» . Журнал биологической химии . 276 (15): 12317–23. doi : 10.1074/jbc.m010908200 . PMID 11145967 .
Renner DB, Yamaguchi Y, Wada T, Handa H, Price DH (ноябрь 2001 г.). «Высокочищенная система управления удлинением РНК -полимеразы II» . Журнал биологической химии . 276 (45): 42601–9. doi : 10.1074/jbc.m104967200 . PMID 11553615 .
Lavoie SB, Albert AL, Handa H, Vincent M, Bensaude O (сентябрь 2001 г.). «PEPTIDYL-пролилзомераза PIN1 взаимодействует с HSPT5, фосфорилированным CDK9». Журнал молекулярной биологии . 312 (4): 675–85. doi : 10.1006/jmbi.2001.4991 . PMID 11575923 .
Буржуазный CF, Ким Й.К., Черчер М.Дж., Запад М.Дж., Карн Дж. (Февраль 2002 г.). «SPT5 сотрудничает с TAT вируса иммунодефицита человека типа 1 путем предотвращения преждевременного высвобождения РНК в последовательностях терминатора» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (4): 1079–93. doi : 10.1128/mcb.22.4.1079-1093.2002 . PMC 134635 . PMID 11809800 .
Yamaguchi Y, Inukai N, Narita T, Wada T, Handa H (май 2002). «Свидетельство о том, что отрицательный фактор удлинения подавляет удлинение транскрипции путем связывания с фактором чувствительности, индуцирующего чувствительность DRB/комплекс и РНК-полимеразы и РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (9): 2918–27. doi : 10.1128/mcb.22.9.2918-2927.2002 . PMC 133766 . PMID 11940650 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000196235 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000003435 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8975720-5] Chiang PW, Fogel E, Jackson CL, Lieuallen K, Lennon G, Qu X, Wang SQ, Kurnit DM (декабрь 1996 г.). «Выделение, секвенирование и картирование человеческого гомолога транскрипционного фактора дрожжей, SPT5». Геномика . 38 (3): 421–4. doi : 10.1006/geno.1996.0646 . PMID 8975720 .

[6] «Ген Entrez: Supt5h подавитель TY 5 гомолога (S. cerevisiae)» .

[pmid10958691-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Garber Me, Mayall TP, Suess EM, Meisenhelder J, Thompson NE, Jones Ka (сентябрь 2000). «Аутофосфорилирование CDK9 регулирует высокоаффинное связывание вируса иммунодефицита человека типа 1 TAT-P-TEFB с TAR РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (18): 6958–69. doi : 10.1128/mcb.20.18.6958-6969.2000 . PMC 88771 . PMID 10958691 .

[pmid10454543-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Ким Дж. Б., Ямагучи Ю., Вада Т., Ханда Х, Шарп Па (сентябрь 1999). «Белок TAT-SF1 ассоциируется с белками RAP30 и человеком SPT5» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (9): 5960–8. doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC 84462 . PMID 10454543 .

[pmid11575923-9] Lavoie SB, Albert AL, Handa H, Vincent M, Bensaude O (сентябрь 2001 г.). «PEPTIDYL-пролилзомераза PIN1 взаимодействует с HSPT5, фосфорилированным CDK9». Журнал молекулярной биологии . 312 (4): 675–85. doi : 10.1006/jmbi.2001.4991 . PMID 11575923 .

[pmid9450929-10] Нет т, иммутию, фердоу, а, «DSIF, составлен из домашнего камня SEXT и SPT4 » ген и развитие 12 (3): 343–56. doi : 10.1101/gad . PMC 316480 . PMID 940929 .

[pmid12718890-11] Jump up to: ^а ^{беременный} Kwak YT, Guo J, Prajapati S, Park KJ, Surabhi RM, Miller B, Gehrig P, Gaynor RB (апрель 2003 г.). «Метилирование SPT5 регулирует его взаимодействие с РНК -полимеразой II и свойствами удлинения транскрипции» . Молекулярная клетка . 11 (4): 1055–66. doi : 10.1016/s1097-2765 (03) 00101-1 . PMID 12718890 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]