СМИД3

СМИД3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3MEK, 3OXF, 3OXG, 3OXL, 3PDN, 3QWP, 3RU0, 5CCL, 5CCM, 5EX0, 5EX3, 5HI7, 5HQ8
Идентификаторы
Псевдонимы	SMYD3 , KMT3E, ZMYND1, ZNFN3A1, bA74P14.1, SET и домен MYND, содержащий 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 608783 ; МГИ : 1916976 ; Гомологен : 41491 ; Генные карты : SMYD3 ; OMA : SMYD3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	246,507,312 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	179,345,606 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	corpus epididymis; ; gonad; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; stromal cell of endometrium; ; testicle; ; prefrontal cortex; ; Achilles tendon; ; cerebellar cortex; ; cerebellar hemisphere; ; epithelium of colon;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; zygote; ; primary oocyte; ; blastocyst; ; morula; ; lumbar spinal ganglion; ; genital tubercle; ; otic vesicle; ; neural tube; ; tail of embryo;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; methyltransferase activity; transferase activity; RNA polymerase II complex binding; RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding; histone-lysine N-methyltransferase activity; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nucleoplasm; cytosol;
Biological process	cellular response to dexamethasone stimulus; nucleosome assembly; histone lysine methylation; methylation; myotube cell development; negative regulation of protein kinase activity; positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; establishment of protein localization; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	64754
	69726
	ENSG00000185420
	ENSMUSG00000055067
	Q9H7B4
	Q9CWR2
	НМ_001167740 ; НМ_022743
	НМ_027188
showНП_001161212 ; НП_073580 ; НП_001362891 ; НП_001362892 ; НП_001362894 ;
	NP_001362895
	НП_081464
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 3, содержащий домен SET (супрессор пестролистности, Enhancer of Zeste, Trithorax) и MYND (myeloid-Nervy-DEAF-1), представляет собой белок , который у человека кодируется SMYD3 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

SMYD3 — лизинметилтрансфераза . ^{[ 6 ]} который специфически метилирует H3K4 и H4K5. ^{[ 7 ]} SMYD3 играет роль в регуляции транскрипции как член комплекса РНК-полимеразы. ^{[ 5 ]} Он также участвует в регуляции рака. ^{[ 6 ]}

Выражение

SMYD3 преимущественно экспрессируется в скелетных мышцах и яичках.

Взаимодействия

Было показано, что SMYD3 взаимодействует с белком теплового шока 90 кДа альфа (цитозольным), членом A1. ^{[ 8 ]} и ПОЛР2А . ^{[ 8 ]}

SMYD3 триметилирует остаток лизина на MAP3K2 , что вызывает перекрестные помехи в сигнальном пути MAP-киназы при Ras -зависимом раке. ^{[ 9 ]}

Связь с раком

SMYD3 играет важную роль в развитии рака у человека. Его избыточная экспрессия наблюдается при ряде видов рака, таких как рак печени, молочной железы и колоректальный рак. ^{[ 10 ]} Известно, что SMYD3 также играет роль в развитии рака легких, пищевода и простаты. ^{[ 11 ]}

Было отмечено, что при раке легких и колоректальном раке метилирование MAP3K2 с помощью SMYD3 улучшает ингибирующий контроль PPA2, что приводит к подавлению сигналов апоптоза посредством активации сигнального каскада MEK/ERK . ^{[ 12 ]} Между тем, при раке толстой кишки и печени SMYD3-опосредованное метилирование H3 способствует рекрутированию RNAP II и связанных с ним факторов транскрипции из протоонкогенных областей. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185420 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055067 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: SMYD3 SET и домен MYND, содержащий 3» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ван Аллер Г.С., Рейнуард Н., Барбаш О., Хаддлстон М., Лю С., Змоос А.Ф. и др. (апрель 2012 г.). «Smyd3 регулирует фенотипы раковых клеток и катализирует метилирование лизина 5 гистона H4» . Эпигенетика . 7 (4): 340–3. дои : 10.4161/epi.19506 . ПМЦ 3368817 . ПМИД 22419068 .
^ Лю Ю, Лю Х, Луо Икс, Дэн Дж, Пан Ю, Лян Х (июнь 2015 г.). «Сверхэкспрессия SMYD3 и матриксной металлопротеиназы-9 связана с плохим прогнозом для пациентов с раком желудка». Биология опухолей . 36 (6): 4377–86. дои : 10.1007/s13277-015-3077-z . ПМИД 25627005 . S2CID 21827212 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Хамамото Р., Фурукава Ю., Морита М., Иимура Ю., Сильва Ф.П., Ли М. и др. (август 2004 г.). «SMYD3 кодирует гистон-метилтрансферазу, участвующую в пролиферации раковых клеток». Природная клеточная биология . 6 (8): 731–40. дои : 10.1038/ncb1151 . ПМИД 15235609 . S2CID 13456531 .
^ Мазур П.К., Рейнуард Н., Хатри П., Янсен П.В., Уилкинсон А.В., Лю С. и др. (июнь 2014 г.). «SMYD3 связывает метилирование лизина MAP3K2 с раком, вызванным Ras» . Природа . 510 (7504): 283–7. Бибкод : 2014Natur.510..283M . дои : 10.1038/nature13320 . ПМЦ 4122675 . ПМИД 24847881 .
^ Хамамото Р., Фурукава Ю., Морита М., Иимура Ю., Сильва Ф.П., Ли М. и др. (август 2004 г.). «SMYD3 кодирует гистон-метилтрансферазу, участвующую в пролиферации раковых клеток». Природная клеточная биология . 6 (8): 731–40. дои : 10.1038/ncb1151 . ПМИД 15235609 . S2CID 13456531 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Гиакунтис А., Мулос П., Саррис М.Э., Хацис П., Талианидис I (февраль 2017 г.). «Связанные с Smyd3 регуляторные пути при раке». Семинары по биологии рака . 42 : 70–80. doi : 10.1016/j.semcancer.2016.08.008 . ПМИД 27554136 .
^ Колон-Болеа П., Креспо П. (декабрь 2014 г.). «Метилирование лизина при раке: SMYD3-MAP3K2 преподает нам новые уроки в пути Ras-ERK». Биоэссе . 36 (12): 1162–9. doi : 10.1002/bies.201400120 . ПМИД 25382779 . S2CID 25659263 .

Дальнейшее чтение

Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Е., Адвокат Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон К.М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области человеческого MHC класса III». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
Хамамото Р., Фурукава Ю., Морита М., Иимура Ю., Сильва Ф.П., Ли М. и др. (август 2004 г.). «SMYD3 кодирует гистон-метилтрансферазу, участвующую в пролиферации раковых клеток». Природная клеточная биология . 6 (8): 731–40. дои : 10.1038/ncb1151 . ПМИД 15235609 . S2CID 13456531 .
Чжоу Z, Жэнь X, Хуан X, Лу Л, Сюй М, Инь Л и др. (2006). «SMYD3-NY, новый вариант транскрипта мРНК SMYD3, может играть роль в сперматогенезе человека». Анналы клинической и лабораторной науки . 35 (3): 270–7. ПМИД 16081583 .
Цуге М., Хамамото Р., Сильва Ф.П., Ониши Й., Чаяма К., Каматани Н. и др. (октябрь 2005 г.). «Переменное количество полиморфизма тандемных повторов в элементе, связывающем E2F-1, в 5'-фланкирующей области SMYD3 является фактором риска развития рака у человека». Природная генетика . 37 (10): 1104–7. дои : 10.1038/ng1638 . ПМИД 16155568 . S2CID 40468351 .
Хамамото Р., Сильва Ф.П., Цугэ М., Нишидате Т., Катагири Т., Накамура Ю., Фурукава Ю. (февраль 2006 г.). «Усиленная экспрессия SMYD3 необходима для роста клеток рака молочной железы» . Раковая наука . 97 (2): 113–8. дои : 10.1111/j.1349-7006.2006.00146.x . ПМЦ 11159510 . ПМИД 16441421 .
Ван XQ, Мяо X, Цай Q, Гарсия-Барсело ММ, Фань СТ (март 2007 г.). «Полиморфизм тандемных повторов SMYD3 не связан с возникновением и метастазированием гепатоцеллюлярной карциномы в китайской популяции». Экспериментальная онкология . 29 (1): 71–3. ПМИД 17431393 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185420 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055067 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: SMYD3 SET и домен MYND, содержащий 3» .

[Van_Aller_340–343-6] Перейти обратно: ^а ^б Ван Аллер Г.С., Рейнуард Н., Барбаш О., Хаддлстон М., Лю С., Змоос А.Ф. и др. (апрель 2012 г.). «Smyd3 регулирует фенотипы раковых клеток и катализирует метилирование лизина 5 гистона H4» . Эпигенетика . 7 (4): 340–3. дои : 10.4161/epi.19506 . ПМЦ 3368817 . ПМИД 22419068 .

[7] Лю Ю, Лю Х, Луо Икс, Дэн Дж, Пан Ю, Лян Х (июнь 2015 г.). «Сверхэкспрессия SMYD3 и матриксной металлопротеиназы-9 связана с плохим прогнозом для пациентов с раком желудка». Биология опухолей . 36 (6): 4377–86. дои : 10.1007/s13277-015-3077-z . ПМИД 25627005 . S2CID 21827212 .

[pmid15235609-8] Перейти обратно: ^а ^б Хамамото Р., Фурукава Ю., Морита М., Иимура Ю., Сильва Ф.П., Ли М. и др. (август 2004 г.). «SMYD3 кодирует гистон-метилтрансферазу, участвующую в пролиферации раковых клеток». Природная клеточная биология . 6 (8): 731–40. дои : 10.1038/ncb1151 . ПМИД 15235609 . S2CID 13456531 .

[pmid24847881-9] Мазур П.К., Рейнуард Н., Хатри П., Янсен П.В., Уилкинсон А.В., Лю С. и др. (июнь 2014 г.). «SMYD3 связывает метилирование лизина MAP3K2 с раком, вызванным Ras» . Природа . 510 (7504): 283–7. Бибкод : 2014Natur.510..283M . дои : 10.1038/nature13320 . ПМЦ 4122675 . ПМИД 24847881 .

[10] Хамамото Р., Фурукава Ю., Морита М., Иимура Ю., Сильва Ф.П., Ли М. и др. (август 2004 г.). «SMYD3 кодирует гистон-метилтрансферазу, участвующую в пролиферации раковых клеток». Природная клеточная биология . 6 (8): 731–40. дои : 10.1038/ncb1151 . ПМИД 15235609 . S2CID 13456531 .

[Giakountis_70–80-11] Перейти обратно: ^а ^б Гиакунтис А., Мулос П., Саррис М.Э., Хацис П., Талианидис I (февраль 2017 г.). «Связанные с Smyd3 регуляторные пути при раке». Семинары по биологии рака . 42 : 70–80. doi : 10.1016/j.semcancer.2016.08.008 . ПМИД 27554136 .

[12] Колон-Болеа П., Креспо П. (декабрь 2014 г.). «Метилирование лизина при раке: SMYD3-MAP3K2 преподает нам новые уроки в пути Ras-ERK». Биоэссе . 36 (12): 1162–9. doi : 10.1002/bies.201400120 . ПМИД 25382779 . S2CID 25659263 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]