ВАМП3

ВАМП3
Идентификаторы
Псевдонимы	VAMP3 , CEB, мембранный белок 3, связанный с везикулами
Внешние идентификаторы	Опустить : 603657 ; МГИ : 1321389 ; Гомологен : 3511 ; Генные карты : ВАМП3 ; ОМА : ВАМП3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	7,781,432 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	151,142,420 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	inferior olivary nucleus; ; parietal pleura; ; visceral pleura; ; optic nerve; ; gingival epithelium; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; dorsal motor nucleus of vagus nerve; ; C1 segment; ; palpebral conjunctiva; ; trabecular bone;
	Top expressed in
	endothelial cell of lymphatic vessel; ; ciliary body; ; primitive streak; ; iris; ; retinal pigment epithelium; ; conjunctival fornix; ; epithelium of lens; ; stroma of bone marrow; ; Paneth cell; ; epithelium of stomach;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	SNAP receptor activity; protein binding; SNARE binding; syntaxin-1 binding;
Cellular component	integral component of membrane; recycling endosome; cytosol; intracellular membrane-bounded organelle; membrane; synapse; intracellular anatomical structure; secretory granule; cell surface; cell junction; SNARE complex; apical plasma membrane; intracellular organelle; neuron projection; cytoplasmic vesicle; clathrin-coated vesicle; trans-Golgi network membrane; transport vesicle; plasma membrane; clathrin-coated vesicle membrane; phagocytic vesicle membrane; perinuclear region of cytoplasm; recycling endosome membrane; phagocytic vesicle; integral component of synaptic vesicle membrane;
Biological process	Golgi to plasma membrane protein transport; mucus secretion; regulation of histamine secretion by mast cell; membrane fusion; vesicle docking involved in exocytosis; retrograde transport, endosome to Golgi; negative regulation of secretion by cell; protein transport; substrate adhesion-dependent cell spreading; vesicle fusion; vesicle-mediated transport; calcium-ion regulated exocytosis; positive regulation of receptor recycling; exocytosis; SNARE complex assembly; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; membrane organization; cellular response to interferon-gamma; protein-containing complex assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9341
	22319
	ENSG00000049245
	ENSMUSG00000028955
	Q15836 ; Q6FGG2
	P63024
	НМ_004781
	НМ_009498
	НП_004772 ; НП_004772.1
	НП_033524
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Мембранный белок 3, ассоциированный с везикулами, представляет собой белок , который у человека кодируется VAMP3 геном . ^[5]^[6]

Функция

Синаптобревины/ВАМП, синтаксины и синаптосомально-ассоциированный белок массой 25 кДа являются основными компонентами белкового комплекса, участвующих в стыковке и/или слиянии синаптических везикул с пресинаптической мембраной. Этот ген является членом семейства мембранных белков, ассоциированных с везикулами (VAMP)/синаптобревинов. Было показано, что из-за его высокой гомологии с другими известными VAMP, широкого распределения в тканях и субклеточной локализации белок, кодируемый этим геном, является человеческим эквивалентом целлубревина грызунов. В тромбоцитах белок находится в компартменте, который не мобилизуется на плазматическую мембрану при стимуляции кальцием или тромбином. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что VAMP3 взаимодействует с

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000049245 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028955 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бернштейн А.М., Уайтхарт SW (январь 1999 г.). «Идентификация гомолога мембранного белка 3, связанного с целлубревином / пузырьками, в тромбоцитах человека». Кровь . 93 (2): 571–9. дои : 10.1182/blood.V93.2.571 . ПМИД 9885218 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: мембранный белок 3, связанный с пузырьками VAMP3 (целлубревин)» .
^ Аннаерт В.Г., Беккер Б., Кистнер У., Рет М., Ян Р. (декабрь 1997 г.). «Экспорт целлубревина из эндоплазматической сети контролируется BAP31» . Журнал клеточной биологии . 139 (6): 1397–410. дои : 10.1083/jcb.139.6.1397 . ПМЦ 2132629 . ПМИД 9396746 .
^ Хагер Х.А., Робертс Р.Дж., Кросс Э.Э., Пру-Жиллардо В., Бадер Д.М. (февраль 2010 г.). «Идентификация новой функции Bves: регуляция везикулярного транспорта» . Журнал ЭМБО . 29 (3): 532–45. дои : 10.1038/emboj.2009.379 . ПМЦ 2830705 . ПМИД 20057356 .
^ Jump up to: ^а ^б Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Симомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии . 48 (8): 597–604. дои : 10.1016/S0003-9969(03)00116-X . ПМИД 12828989 .
^ Jump up to: ^а ^б Поме Ф., Ле Мао Дж., Мартин С., Галли Т., Дэвид Б., Бланк У., Роа М. (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNARE) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, связанного с везикулами мембранного белка 8» . Журнал иммунологии . 164 (11): 5850–7. дои : 10.4049/jimmunol.164.11.5850 . ПМИД 10820264 .
^ Фридман С.Дж., Сонг Х.К., Сюй Ю, Сунь З.Ю., Эк М.Дж. (апрель 2003 г.). «Гомотетрамерная структура N-концевого спирального домена SNAP-23» . Журнал биологической химии . 278 (15): 13462–7. дои : 10.1074/jbc.M210483200 . ПМИД 12556468 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Полгар Дж., Чунг С.Х., Рид Г.Л. (август 2002 г.). «Везикулоассоциированный мембранный белок 3 (VAMP-3) и VAMP-8 присутствуют в тромбоцитах человека и необходимы для секреции гранул». Кровь . 100 (3): 1081–3. дои : 10.1182/blood.V100.3.1081 . ПМИД 12130530 . S2CID 36597939 .
^ Маллард Ф, Тан БЛ, Галли Т, Тенза Д, Сен-Поль А, Юэ Х, Энтони С, Хонг В, Гауд Б, Йоханнес Л (февраль 2002 г.). «Ранний транспорт эндосом к TGN включает два комплекса SNARE и изоформу Rab6» . Журнал клеточной биологии . 156 (4): 653–64. дои : 10.1083/jcb.200110081 . ПМК 2174079 . ПМИД 11839770 .

Дальнейшее чтение

Тиммерс К.И., Кларк А.Е., Омацу-Канбе М., Уайтхарт С.В., Беннетт М.К., Холман Г.Д., Кушман С.В. (декабрь 1996 г.). «Идентификация SNAP-рецепторов во фракциях мембран жировых клеток крысы и в комплексах SNARE, коиммунопреципитированных с меченным эпитопом гибридным белком, чувствительным к N-этилмалеимиду» . Биохимический журнал . 320. 320 (Часть 2) (2): 429–36. дои : 10.1042/bj3200429 . ПМЦ 1217948 . ПМИД 8973549 .
Аннаерт В.Г., Беккер Б., Кистнер У., Рет М., Ян Р. (декабрь 1997 г.). «Экспорт целлубревина из эндоплазматической сети контролируется BAP31» . Журнал клеточной биологии . 139 (6): 1397–410. дои : 10.1083/jcb.139.6.1397 . ПМЦ 2132629 . ПМИД 9396746 .
Галли Т., Захрауи А., Вайдьянатан В.В., Рапозо Г., Тиан Дж.М., Карин М., Ниманн Х., Лувард Д. (июнь 1998 г.). «Новый нечувствительный к столбнячному нейротоксину мембранный белок, связанный с везикулами, в комплексах SNARE апикальной плазматической мембраны эпителиальных клеток» . Молекулярная биология клетки . 9 (6): 1437–48. дои : 10.1091/mbc.9.6.1437 . ПМК 25366 . ПМИД 9614185 .
Риенто К., Галли Т., Янссон С., Энхольм С., Лехтонен Е., Олкконен В.М. (сентябрь 1998 г.). «Взаимодействие Munc-18-2 с синтаксином 3 контролирует ассоциацию апикальных SNARE в эпителиальных клетках». Журнал клеточной науки . 111. 111 (Часть 17) (17): 2681–8. дои : 10.1242/jcs.111.17.2681 . ПМИД 9701566 .
Прекерис Р., Кламперман Дж., Чен Ю.А., Шеллер Р.Х. (ноябрь 1998 г.). «Синтаксин 13 опосредует круговорот белков плазматической мембраны через эндосомы тубуловезикулярной рециркуляции» . Журнал клеточной биологии . 143 (4): 957–71. дои : 10.1083/jcb.143.4.957 . ПМК 2132958 . ПМИД 9817754 .
Поме Ф., Ле Мао Дж., Мартин С., Галли Т., Дэвид Б., Бланк У., Роа М. (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNARE) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, связанного с везикулами мембранного белка 8» . Журнал иммунологии . 164 (11): 5850–7. дои : 10.4049/jimmunol.164.11.5850 . ПМИД 10820264 .
Антонин В., Холройд С., Фассауэр Д., Пабст С., Фон Моллард Г.Ф., Ян Р. (декабрь 2000 г.). «Комплекс SNARE, опосредующий слияние поздних эндосом, определяет консервативные свойства структуры и функции SNARE» . Журнал ЭМБО . 19 (23): 6453–64. дои : 10.1093/emboj/19.23.6453 . ПМК 305878 . ПМИД 11101518 .
Уэйд Н., Брайант, Нью-Джерси, Коннолли Л.М., Симпсон Р.Дж., Луцио Дж.П., Пайпер Р.К., Джеймс Д.Е. (июнь 2001 г.). «Комплексы синтаксина 7 с хвостовым интерактором 1b Vps10p мыши, синтаксином 6, мембранным белком, связанным с везикулами (VAMP) 8, и VAMP7 в клетках меланомы b16» . Журнал биологической химии . 276 (23): 19820–7. дои : 10.1074/jbc.M010838200 . ПМИД 11278762 .
Антонин В., Фассауэр Д., Беккер С., Ян Р., Шнайдер Т.Р. (февраль 2002 г.). «Кристаллическая структура эндосомального комплекса SNARE раскрывает общие структурные принципы всех SNARE». Структурная биология природы . 9 (2): 107–11. дои : 10.1038/nsb746 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F459-F . ПМИД 11786915 . S2CID 17724790 .
Посчет Дж. Ф., Скидмор Дж., Баучер Дж. К., Фировед А. М., Ван Дайк Р. В., Деретик В. (апрель 2002 г.). «Гиперацидификация эндоцитарных компартментов целлюббревина и дефектная рециркуляция эндосом в респираторных эпителиальных клетках муковисцидоза» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13959–65. дои : 10.1074/jbc.M105441200 . ПМИД 11809765 .
Маллард Ф, Тан БЛ, Галли Т, Тенза Д, Сен-Поль А, Юэ Х, Энтони С, Хонг В, Гауд Б, Йоханнес Л (февраль 2002 г.). «Ранний транспорт эндосом к TGN включает два комплекса SNARE и изоформу Rab6» . Журнал клеточной биологии . 156 (4): 653–64. дои : 10.1083/jcb.200110081 . ПМК 2174079 . ПМИД 11839770 .
Полгар Дж., Чунг С.Х., Рид Г.Л. (август 2002 г.). «Везикулоассоциированный мембранный белок 3 (VAMP-3) и VAMP-8 присутствуют в тромбоцитах человека и необходимы для секреции гранул». Кровь . 100 (3): 1081–3. дои : 10.1182/blood.V100.3.1081 . ПМИД 12130530 . S2CID 36597939 .
Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природная биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Симомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии . 48 (8): 597–604. дои : 10.1016/S0003-9969(03)00116-X . ПМИД 12828989 .
Дай Дж., Ли Дж., Бос Э., Порционатто М., Премонт РТ, Бургуэн С., Питерс П.Дж., Сюй В.В. (ноябрь 2004 г.). «ACAP1 способствует рециркуляции эндоцитов, распознавая сигналы сортировки рециркуляции» . Развивающая клетка . 7 (5): 771–6. дои : 10.1016/j.devcel.2004.10.002 . ПМИД 15525538 .
Боал Ф., Чжан Х., Тессье С., Скотти П., Ланг Дж. (декабрь 2004 г.). «Вариабельный С-конец белков цистеиновой нити модулирует экзоцитоз и белок-белковые взаимодействия». Биохимия . 43 (51): 16212–23. дои : 10.1021/bi048612+ . ПМИД 15610015 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000049245 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028955 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9885218-5] Бернштейн А.М., Уайтхарт SW (январь 1999 г.). «Идентификация гомолога мембранного белка 3, связанного с целлубревином / пузырьками, в тромбоцитах человека». Кровь . 93 (2): 571–9. дои : 10.1182/blood.V93.2.571 . ПМИД 9885218 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: мембранный белок 3, связанный с пузырьками VAMP3 (целлубревин)» .

[pmid9396746-7] Аннаерт В.Г., Беккер Б., Кистнер У., Рет М., Ян Р. (декабрь 1997 г.). «Экспорт целлубревина из эндоплазматической сети контролируется BAP31» . Журнал клеточной биологии . 139 (6): 1397–410. дои : 10.1083/jcb.139.6.1397 . ПМЦ 2132629 . ПМИД 9396746 .

[pmid20057356-8] Хагер Х.А., Робертс Р.Дж., Кросс Э.Э., Пру-Жиллардо В., Бадер Д.М. (февраль 2010 г.). «Идентификация новой функции Bves: регуляция везикулярного транспорта» . Журнал ЭМБО . 29 (3): 532–45. дои : 10.1038/emboj.2009.379 . ПМЦ 2830705 . ПМИД 20057356 .

[pmid12828989-9] Jump up to: ^а ^б Имаи А., Нашида Т., Йоши С., Симомура Х. (август 2003 г.). «Внутриклеточная локализация белков SNARE в ацинарных клетках околоушной железы крысы: комплексы SNARE на апикальной плазматической мембране». Архивы оральной биологии . 48 (8): 597–604. дои : 10.1016/S0003-9969(03)00116-X . ПМИД 12828989 .

[pmid10820264-10] Jump up to: ^а ^б Поме Ф., Ле Мао Дж., Мартин С., Галли Т., Дэвид Б., Бланк У., Роа М. (июнь 2000 г.). «Растворимые рецепторы белка прикрепления NSF (SNARE) в тучных клетках RBL-2H3: функциональная роль синтаксина 4 в экзоцитозе и идентификация секреторного компартмента, связанного с везикулами мембранного белка 8» . Журнал иммунологии . 164 (11): 5850–7. дои : 10.4049/jimmunol.164.11.5850 . ПМИД 10820264 .

[pmid12556468-11] Фридман С.Дж., Сонг Х.К., Сюй Ю, Сунь З.Ю., Эк М.Дж. (апрель 2003 г.). «Гомотетрамерная структура N-концевого спирального домена SNAP-23» . Журнал биологической химии . 278 (15): 13462–7. дои : 10.1074/jbc.M210483200 . ПМИД 12556468 .

[pmid16189514-12] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid12130530-13] Полгар Дж., Чунг С.Х., Рид Г.Л. (август 2002 г.). «Везикулоассоциированный мембранный белок 3 (VAMP-3) и VAMP-8 присутствуют в тромбоцитах человека и необходимы для секреции гранул». Кровь . 100 (3): 1081–3. дои : 10.1182/blood.V100.3.1081 . ПМИД 12130530 . S2CID 36597939 .

[pmid11839770-14] Маллард Ф, Тан БЛ, Галли Т, Тенза Д, Сен-Поль А, Юэ Х, Энтони С, Хонг В, Гауд Б, Йоханнес Л (февраль 2002 г.). «Ранний транспорт эндосом к TGN включает два комплекса SNARE и изоформу Rab6» . Журнал клеточной биологии . 156 (4): 653–64. дои : 10.1083/jcb.200110081 . ПМК 2174079 . ПМИД 11839770 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]