КСОБ2

КСОБ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Идентификаторы
Псевдонимы	COPB2 , бета'-COP, субъединица бета 2 коатомерного белкового комплекса, MCPH19, субъединица бета 2 комплекса COPI
Внешние идентификаторы	Опустить : 606990 ; МГИ : 1354962 ; Гомологен : 3499 ; Генные карты : COPB2 ; ОМА : COPB2 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	139,389,736 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	98,470,435 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	parotid gland; ; stromal cell of endometrium; ; beta cell; ; oral cavity; ; body of pancreas; ; mucosa of sigmoid colon; ; bronchial epithelial cell; ; smooth muscle tissue; ; Achilles tendon; ; rectum;
	Top expressed in
	ascending aorta; ; aortic valve; ; lobe of prostate; ; Paneth cell; ; Rostral migratory stream; ; vas deferens; ; fossa; ; seminal vesicula; ; calvaria; ; pituitary gland;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	structural molecule activity; protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; Golgi apparatus; membrane; Golgi membrane; COPI-coated vesicle membrane; transport vesicle; membrane coat; COPI vesicle coat; cytoplasmic vesicle; endoplasmic reticulum membrane;
Biological process	retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; toxin transport; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; protein transport; intracellular protein transport; intra-Golgi vesicle-mediated transport; vesicle-mediated transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9276
	50797
	ENSG00000184432
	ENSMUSG00000032458
	P35606
	О55029
	НМ_004766
	НМ_015827
	НП_004757
	НП_056642
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бета-субъединица коатомера представляет собой белок , который у человека кодируется COPB2 геном . ^[5]^[6]

Функция

Коатомерный комплекс Гольджи (см. MIM 601924) представляет собой оболочку не покрытых клатрином везикул и необходим для почкования Гольджи и везикулярного транспорта. Он состоит из 7 белковых субъединиц, включая COPB2. [поставлено OMIM] ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что COPB2 взаимодействует с:

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000184432 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032458 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Де Бэре Э., Спелеман Ф., Ван Рой Н., Де Паепе А., Мессиан Л. (февраль 1999 г.). «Присвоение гена клеточного ретинол-связывающего белка 1 (RBP1) и гена бета-субъединицы коатомера (COPB2) полосе хромосомы человека 3q23 путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 82 (3–4): 226–7. дои : 10.1159/000015107 . ПМИД 9858824 . S2CID 46851294 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белковый комплекс коатомера COPB2, субъединица бета 2 (бета-прайм)» .
^ Югстер А., Фригерио Г., Дейл М., Дуден Р. (август 2000 г.). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера, и новые взаимодействия с ARF и ARF-GAP» . ЭМБО Дж . 19 (15): 3905–17. дои : 10.1093/emboj/19.15.3905 . ПМК 306616 . ПМИД 10921873 .
^ Лоу М., Крейс Т.Э. (ноябрь 1996 г.). «Сборка коатомера, предшественника покрытия COP-I, in vivo» . Ж. Биол. Хим . 271 (48): 30725–30. дои : 10.1074/jbc.271.48.30725 . ПМИД 8940050 .
^ Англия К., Эшфорд Д., Кидд Д., Рамсби М. (июнь 2002 г.). «PKC-эпсилон связан с миозином IIA и актином в фибробластах». Клетка. Сигнал . 14 (6): 529–36. дои : 10.1016/s0898-6568(01)00277-7 . ПМИД 11897493 .
^ Салливан Б.М., Харрисон-Лавуа К.Дж., Маршанский В., Лин Х.И., Керл Дж.Х., Озиелло Д.А., Браун Д., Друи К.М. (сентябрь 2000 г.). «RGS4 и RGS2 связывают коатомер и ингибируют ассоциацию COPI с мембранами Гольджи и внутриклеточным транспортом» . Мол. Биол. Клетка . 11 (9): 3155–68. дои : 10.1091/mbc.11.9.3155 . ПМК 14982 . ПМИД 10982407 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома COPB2 и страница сведений о гене COPB2 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O55029 (бета-субъединица Mouse Coatomer) на PDBe-KB .

Дальнейшее чтение

Пелхэм Х.Р., Ротман Дж.Э. (2000). «Спор о транспорте в Гольджи – две стороны одной медали?» . Клетка . 102 (6): 713–9. дои : 10.1016/S0092-8674(00)00060-X . ПМИД 11030615 . S2CID 18044044 .
Стенбек Г., Хартер С., Брехт А., Херрманн Д., Лотспайх Ф., Орси Л., Виланд Ф.Т. (1993). «бета'-КОП, новая субъединица коатомера» . ЭМБО Дж . 12 (7): 2841–5. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05945.x . ПМЦ 413534 . ПМИД 8334999 .
Харрисон-Лавуа К.Дж., Льюис В.А., Хайнс Г.М., Коллисон К.С., Натленд Э., Уиллисон К.Р. (1993). «Субъединица массой 102 кДа ассоциированной с аппаратом Гольджи частицы гомологична бета-субъединицам тримерных G-белков» . ЭМБО Дж . 12 (7): 2847–53. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05946.x . ПМК 413536 . ПМИД 8335000 .
Лоу М., Крейс Т.Е. (1996). «Сборка и разборка коатомера in vitro» . Ж. Биол. Хим . 270 (52): 31364–71. дои : 10.1074/jbc.270.52.31364 . ПМИД 8537409 .
Лоу М., Крейс Т.Е. (1997). «Сборка коатомера, предшественника покрытия COP-I, in vivo» . Ж. Биол. Хим . 271 (48): 30725–30. дои : 10.1074/jbc.271.48.30725 . ПМИД 8940050 .
Цукай М., Чен Ч., Де Маттейс М.А., Мочли-Розен Д. (1997). «Коатомерный белок бета'-COP, белок селективного связывания (RACK) для протеинкиназы Cepsilon» . Ж. Биол. Хим . 272 (46): 29200–6. дои : 10.1074/jbc.272.46.29200 . ПМИД 9360998 .
Югстер А., Фригерио Г., Дейл М., Дуден Р. (2000). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера, и новые взаимодействия с ARF и ARF-GAP» . ЭМБО Дж . 19 (15): 3905–17. дои : 10.1093/emboj/19.15.3905 . ПМК 306616 . ПМИД 10921873 .
Салливан Б.М., Харрисон-Лавуа К.Дж., Маршанский В., Лин Х.И., Керл Дж.Х., Аусиелло Д.А., Браун Д., Друи К.М. (2000). «RGS4 и RGS2 связывают коатомер и ингибируют ассоциацию COPI с мембранами Гольджи и внутриклеточным транспортом» . Мол. Биол. Клетка . 11 (9): 3155–68. дои : 10.1091/mbc.11.9.3155 . ПМК 14982 . ПМИД 10982407 .
Чжан Т., Хун В. (2001). «Ykt6 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Bet1 и участвует на поздней стадии транспорта эндоплазматической сети-Гольджи» . Ж. Биол. Хим . 276 (29): 27480–7. дои : 10.1074/jbc.M102786200 . ПМИД 11323436 .
Сюй Ю, Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (2003). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи» (PDF) . Мол. Биол. Клетка . 13 (10): 3493–507. дои : 10.1091/mbc.E02-01-0004 . ПМК 129961 . ПМИД 12388752 .
Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (2004). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Нат. Биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Роде Х.М., Чеонг Ф.Ю., Конрад Г., Пайха К., Майингер П., Бемельт Г. (2004). «Человеческая фосфатидилинозитолфосфатаза SAC1 взаимодействует с комплексом коатомера I» . Ж. Биол. Хим . 278 (52): 52689–99. дои : 10.1074/jbc.M307983200 . ПМИД 14527956 .
Баумистер Т, Баух А, Раффнер Х, Ангранд П.О., Бергамини Г, Кротон К., Крусиа С, Эберхард Д., Ганьер Дж., Гиделли С., Хопф С., Хузе Б., Мангано Р., Мишон А.М., Ширле М., Шлегль Дж., Шваб М. , Штейн М.А., Бауэр А., Казари Г., Древес Г., Гэвин А.С., Джексон Д.Б., Джоберти Г., Нойбауэр Г., Рик Дж., Кастер Б., Суперти-Фурга Г. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Ту LC, Ян X, Худ Л, Лин Б (2007). «Протеомный анализ интерактома нижестоящего регулируемого N-myc гена 1 и его взаимодействия с программой андрогенного ответа в клетках рака простаты» . Мол. Клетка. Протеомика . 6 (4): 575–88. дои : 10.1074/mcp.M600249-MCP200 . ПМИД 17220478 . S2CID 7203032 .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000184432 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032458 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9858824-5] Де Бэре Э., Спелеман Ф., Ван Рой Н., Де Паепе А., Мессиан Л. (февраль 1999 г.). «Присвоение гена клеточного ретинол-связывающего белка 1 (RBP1) и гена бета-субъединицы коатомера (COPB2) полосе хромосомы человека 3q23 путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 82 (3–4): 226–7. дои : 10.1159/000015107 . ПМИД 9858824 . S2CID 46851294 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белковый комплекс коатомера COPB2, субъединица бета 2 (бета-прайм)» .

[pmid10921873-7] Югстер А., Фригерио Г., Дейл М., Дуден Р. (август 2000 г.). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера, и новые взаимодействия с ARF и ARF-GAP» . ЭМБО Дж . 19 (15): 3905–17. дои : 10.1093/emboj/19.15.3905 . ПМК 306616 . ПМИД 10921873 .

[pmid8940050-8] Лоу М., Крейс Т.Э. (ноябрь 1996 г.). «Сборка коатомера, предшественника покрытия COP-I, in vivo» . Ж. Биол. Хим . 271 (48): 30725–30. дои : 10.1074/jbc.271.48.30725 . ПМИД 8940050 .

[pmid11897493-9] Англия К., Эшфорд Д., Кидд Д., Рамсби М. (июнь 2002 г.). «PKC-эпсилон связан с миозином IIA и актином в фибробластах». Клетка. Сигнал . 14 (6): 529–36. дои : 10.1016/s0898-6568(01)00277-7 . ПМИД 11897493 .

[pmid10982407-10] Салливан Б.М., Харрисон-Лавуа К.Дж., Маршанский В., Лин Х.И., Керл Дж.Х., Озиелло Д.А., Браун Д., Друи К.М. (сентябрь 2000 г.). «RGS4 и RGS2 связывают коатомер и ингибируют ассоциацию COPI с мембранами Гольджи и внутриклеточным транспортом» . Мол. Биол. Клетка . 11 (9): 3155–68. дои : 10.1091/mbc.11.9.3155 . ПМК 14982 . ПМИД 10982407 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]