КУБОК (ген)

ЧАШКА
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Идентификаторы
Псевдонимы	COPA , HEP-COP, AILJK, субъединица альфа комплекса коатомерного белка, альфа-COP, субъединица альфа комплекса COPI
Внешние идентификаторы	Опустить : 601924 ; МГИ : 1334462 ; Гомологен : 3218 ; GeneCards : COPA ; OMA : COPA – ортологи
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	171,949,897 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; islet of Langerhans; ; pituitary gland; ; ganglionic eminence; ; anterior pituitary; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; corpus callosum; ; smooth muscle tissue; ; pylorus; ; cardia;
	Top expressed in
	calvaria; ; molar; ; ascending aorta; ; dermis; ; aortic valve; ; parotid gland; ; stroma of bone marrow; ; genital tubercle; ; lacrimal gland; ; foot;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	hormone activity; structural molecule activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; Golgi apparatus; membrane; Golgi membrane; COPI-coated vesicle membrane; transport vesicle; extracellular region; membrane coat; COPI vesicle coat; extracellular exosome; cytoplasmic vesicle; endoplasmic reticulum membrane; extracellular space;
Biological process	retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; pancreatic juice secretion; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; protein transport; intracellular protein transport; intra-Golgi vesicle-mediated transport; vesicle-mediated transport; transport; regulation of signaling receptor activity; signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1314
	12847
	н/д
	ENSMUSG00000026553
	P53621
	Q8CIE6
	НМ_004371 ; НМ_001098398
	НМ_009938
	НП_001091868 ; НП_004362
	НП_034068
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица альфа коатомера представляет собой белок , который у человека кодируется COPA геном . ^[4]^[5]

Функция

В эукариотических клетках транспорт белков между эндоплазматическим ретикулумом и компартментами Гольджи частично опосредован не покрытыми клатрином белками везикулярной оболочки (COP). Идентифицировано семь белков оболочки, которые представляют собой субъединицы комплекса, известного как коатомер. Субъединицы обозначаются альфа-COP, бета-COP , бета-прайм-COP , гамма-COP , дельта-COP , эпсилон-COP и зета-COP . Альфа-COP, кодируемый COPA, имеет высокое сходство последовательности с RET1, гомологичной альфа-субъединицей коатомерного комплекса дрожжей. ^[6] Кроме того, 25 N-концевых аминокислот альфа-COP кодируют биологически активный пептид ксенин , который стимулирует экзокринную секрецию поджелудочной железы и может действовать как желудочно-кишечный гормон. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества форм сплайсинга, кодирующих разные изоформы. ^[5]

Взаимодействия

Было показано, что COPA (ген) взаимодействует с COPE. ^[7]^[8]^[9] и COPB1 . ^[10]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026553 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Чоу В.Т., Квек Х.Х. (июль 1996 г.). «HEP-COP, новый человеческий ген, продукт которого очень гомологичен альфа-субъединице белкового комплекса дрожжевого коатомера». Джин . 169 (2): 223–7. дои : 10.1016/0378-1119(95)00738-5 . ПМИД 8647451 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белковый комплекс коатомера COPA, субъединица альфа» .
^ Герих Б., Орчи Л., Чохнер Х., Лотспайх Ф., Раваццола М., Амхердт М., Виланд Ф., Хартер К. (апрель 1995 г.). «Белок альфа, не относящийся к клатриновой оболочке, является консервативной субъединицей коатомера и у Saccharomyces cerevisiae необходим для роста» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (8): 3229–33. Бибкод : 1995PNAS...92.3229G . дои : 10.1073/pnas.92.8.3229 . ПМЦ 42139 . ПМИД 7724544 .
^ Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
^ Югстер А., Фригерио Г., Дейл М., Дуден Р. (август 2000 г.). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера, и новые взаимодействия с ARF и ARF-GAP» . ЭМБО Дж . 19 (15): 3905–17. дои : 10.1093/emboj/19.15.3905 . ПМК 306616 . ПМИД 10921873 .
^ Фаульштих Д., Ауэрбах С., Орчи Л., Раваццола М., Вегчингель С., Лотспейх Ф., Стенбек Г., Хартер С., Виланд Ф.Т., Чохнер Х. (октябрь 1996 г.). «Архитектура коатомера: молекулярная характеристика дельта-COP и белковых взаимодействий внутри комплекса» . Дж. Клеточная Биол . 135 (1): 53–61. дои : 10.1083/jcb.135.1.53 . ПМК 2121028 . ПМИД 8858162 .
^ Лоу М., Крейс Т.Э. (ноябрь 1996 г.). «Сборка коатомера, предшественника покрытия COP-I, in vivo» . Ж. Биол. Хим . 271 (48): 30725–30. дои : 10.1074/jbc.271.48.30725 . ПМИД 8940050 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома COPA и страница сведений о гене COPA в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Ферле Г.Е. (1998). «Ксенин-обзор». Пептиды . 19 (3): 609–15. дои : 10.1016/S0196-9781(97)00378-1 . ПМИД 9533652 . S2CID 43430216 .
Feurle GE, Hamscher G, Kusiek R и др. (1992). «Идентификация ксенина, родственного ксенопсину пептида, в слизистой оболочке желудка человека и его влияние на экзокринную секрецию поджелудочной железы» . Ж. Биол. Хим . 267 (31): 22305–9. дои : 10.1016/S0021-9258(18)41670-5 . ПМИД 1429581 .
Оркл Л., Палмер Д.Д., Амхердт М., Ротман Дж.Э. (1993). «Сборка покрытых оболочкой пузырьков в аппарате Гольджи требует только коатомера и белков ARF из цитозоля». Природа . 364 (6439): 732–4. Бибкод : 1993Natur.364..732O . дои : 10.1038/364732a0 . ПМИД 8355790 . S2CID 4348442 .
Лоу М., Крейс Т.Е. (1996). «Сборка и разборка коатомера in vitro» . Ж. Биол. Хим . 270 (52): 31364–71. дои : 10.1074/jbc.270.52.31364 . ПМИД 8537409 .
Фидлер К., Вейт М., Стамнес М.А., Ротман Дж.Э. (1996). «Бимодальное взаимодействие коатомера с семейством предполагаемых рецепторов груза p24». Наука . 273 (5280): 1396–9. Бибкод : 1996Sci...273.1396F . дои : 10.1126/science.273.5280.1396 . ПМИД 8703076 . S2CID 13159384 .
Фаулстих Д., Ауэрбах С., Орси Л. и др. (1996). «Архитектура коатомера: молекулярная характеристика дельта-COP и белковых взаимодействий внутри комплекса» . Дж. Клеточная Биол . 135 (1): 53–61. дои : 10.1083/jcb.135.1.53 . ПМК 2121028 . ПМИД 8858162 .
Лоу М., Крейс Т.Е. (1997). «Сборка коатомера, предшественника покрытия COP-I, in vivo» . Ж. Биол. Хим . 271 (48): 30725–30. дои : 10.1074/jbc.271.48.30725 . ПМИД 8940050 .
Квек Х.Х., Чоу В.Т. (1997). «Молекулярные и клеточные исследования человеческого гомолога альфа-субъединицы белкового комплекса коатомера массой 160 кДа». ДНК Клеточная Биол . 16 (3): 275–80. дои : 10.1089/dna.1997.16.275 . ПМИД 9115636 .
Квек Х.Х., Чоу В.Т. (1997). «Геномная организация и картирование человеческого гена HEP-COP (COPA) до 1q». Цитогенет. Клеточная генетика . 76 (3–4): 139–43. дои : 10.1159/000134532 . ПМИД 9186507 .
Хансен К., Рённстранд Л., Рорсман С. и др. (1997). «Ассоциация коатомерных белков с бета-рецептором фактора роста тромбоцитов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 235 (3): 455–60. дои : 10.1006/bbrc.1997.6821 . ПМИД 9207175 .
Чоу В.Т., Квек Х.Х. (1997). «Белок альфа-оболочки COPA (HEP-COP): наличие повтора Alu в кДНК и идентичность аминоконца ксенину». Энн. Хм. Жене . 61 (Часть 4): 369–73. дои : 10.1046/j.1469-1809.1997.6140369.x . ПМИД 9365789 . S2CID 41227737 .
Павел Дж., Хартер С., Виланд Ф.Т. (1998). «Обратимая диссоциация коатомера: функциональная характеристика подкомплекса белка β/δ-оболочки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (5): 2140–5. Бибкод : 1998PNAS...95.2140P . дои : 10.1073/pnas.95.5.2140 . ЧВК 19276 . ПМИД 9482852 .
Хартер С., Виланд FT (1998). «Единый сайт связывания для мотивов извлечения дилизина и p23 в субъединице γ коатомера» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (20): 11649–54. Бибкод : 1998PNAS...9511649H . дои : 10.1073/pnas.95.20.11649 . ПМК 21695 . ПМИД 9751720 .
Чжан Т., Хун В. (2001). «Ykt6 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Bet1 и участвует на поздней стадии транспорта эндоплазматической сети-Гольджи» . Ж. Биол. Хим . 276 (29): 27480–7. дои : 10.1074/jbc.M102786200 . ПМИД 11323436 .
Ян Дж.С., Ли С.Ю., Гао М. и др. (2002). «ARFGAP1 способствует образованию везикул COPI, что предполагает его функцию в качестве компонента шерсти» . Дж. Клеточная Биол . 159 (1): 69–78. дои : 10.1083/jcb.200206015 . ПМК 2173491 . ПМИД 12379802 .
Сюй Ю, Мартин С., Джеймс Д.Э., Хонг В. (2003). «GS15 образует комплекс SNARE с синтаксином 5, GS28 и Ykt6 и участвует в движении в ранних цистернах аппарата Гольджи» (PDF) . Мол. Биол. Клетка . 13 (10): 3493–507. дои : 10.1091/mbc.E02-01-0004 . ПМК 129961 . ПМИД 12388752 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Вонг Н., Чан А., Ли С.В. и др. (2003). «Позиционное картирование амплифицированных последовательностей ДНК на участках 1q21-q22 при гепатоцеллюлярной карциноме указывает на сверхэкспрессию генов-кандидатов». Дж. Гепатол . 38 (3): 298–306. дои : 10.1016/S0168-8278(02)00412-9 . ПМИД 12586295 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCm38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026553 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8647451-4] Чоу В.Т., Квек Х.Х. (июль 1996 г.). «HEP-COP, новый человеческий ген, продукт которого очень гомологичен альфа-субъединице белкового комплекса дрожжевого коатомера». Джин . 169 (2): 223–7. дои : 10.1016/0378-1119(95)00738-5 . ПМИД 8647451 .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белковый комплекс коатомера COPA, субъединица альфа» .

[pmid7724544-6] Герих Б., Орчи Л., Чохнер Х., Лотспайх Ф., Раваццола М., Амхердт М., Виланд Ф., Хартер К. (апрель 1995 г.). «Белок альфа, не относящийся к клатриновой оболочке, является консервативной субъединицей коатомера и у Saccharomyces cerevisiae необходим для роста» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (8): 3229–33. Бибкод : 1995PNAS...92.3229G . дои : 10.1073/pnas.92.8.3229 . ПМЦ 42139 . ПМИД 7724544 .

[pmid16169070-7] Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг К, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .

[pmid10921873-8] Югстер А., Фригерио Г., Дейл М., Дуден Р. (август 2000 г.). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера, и новые взаимодействия с ARF и ARF-GAP» . ЭМБО Дж . 19 (15): 3905–17. дои : 10.1093/emboj/19.15.3905 . ПМК 306616 . ПМИД 10921873 .

[pmid8858162-9] Фаульштих Д., Ауэрбах С., Орчи Л., Раваццола М., Вегчингель С., Лотспейх Ф., Стенбек Г., Хартер С., Виланд Ф.Т., Чохнер Х. (октябрь 1996 г.). «Архитектура коатомера: молекулярная характеристика дельта-COP и белковых взаимодействий внутри комплекса» . Дж. Клеточная Биол . 135 (1): 53–61. дои : 10.1083/jcb.135.1.53 . ПМК 2121028 . ПМИД 8858162 .

[pmid8940050-10] Лоу М., Крейс Т.Э. (ноябрь 1996 г.). «Сборка коатомера, предшественника покрытия COP-I, in vivo» . Ж. Биол. Хим . 271 (48): 30725–30. дои : 10.1074/jbc.271.48.30725 . ПМИД 8940050 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]