КСОБ1

КСОБ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Идентификаторы
Псевдонимы	COPB1 , COPB, субъединица бета 1 коатомерного белкового комплекса, субъединица бета 1 комплекса COPI, BARMACS
Внешние идентификаторы	Опустить : 600959 ; МГИ : 1917599 ; Гомологен : 5664 ; Генные карты : COPB1 ; ОМА : COPB1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	14,500,027 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	113,853,946 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Epithelium of choroid plexus; ; pancreatic ductal cell; ; corpus epididymis; ; caput epididymis; ; endothelial cell; ; germinal epithelium; ; epithelium of nasopharynx; ; tibia; ; tail of epididymis; ; jejunal mucosa;
	Top expressed in
	parotid gland; ; basilar part of occipital bone; ; secondary oocyte; ; dermis; ; molar; ; calvaria; ; islet of Langerhans; ; endocardial cushion; ; submandibular gland; ; atrioventricular valve;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	structural molecule activity; protein binding;
Cellular component	Golgi apparatus; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; Golgi membrane; COPI-coated vesicle membrane; transport vesicle; Golgi-associated vesicle; membrane coat; cytoplasmic vesicle; COPI-coated vesicle; endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; endoplasmic reticulum membrane; cytoplasm; cytosol; plasma membrane; COPI vesicle coat; secretory granule membrane; tertiary granule membrane; ficolin-1-rich granule membrane;
Biological process	protein transport; intracellular protein transport; viral process; vesicle-mediated transport; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; intra-Golgi vesicle-mediated transport; neutrophil degranulation; transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1315
	70349
	ENSG00000129083
	ENSMUSG00000030754
	P53618
	Q9JIF7
	НМ_016451 ; НМ_001144061 ; НМ_001144062
	НМ_033370
	НП_001137533 ; НП_001137534 ; НП_057535
	НП_203534
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бета-субъединица коатомера представляет собой белок , который у человека кодируется COPB1 геном . ^[5]

См. также

Коатомер COPI , белковый комплекс

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000129083 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030754 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бенишу С., Бомсель М., Бодеус М., Дюран Х., Доут М., Летурнер Ф., Камонис Дж., Бенарус Р. (декабрь 1994 г.). «Физическое взаимодействие белка Nef ВИЧ-1 с бета-COP, компонентом везикул, не покрытых клатрином, необходимым для мембранного транспорта» . J Биол Хим . 269 (48): 30073–6. дои : 10.1016/S0021-9258(18)43773-8 . ПМИД 7982906 .

Дальнейшее чтение

Бенишу С., Лю Л.С., Эрдтманн Л. и др. (1997). «Использование двухгибридной системы для идентификации клеточных партнеров белка Nef ВИЧ1». Рез. Вирол . 148 (1): 71–3. дои : 10.1016/S0923-2516(97)81918-8 . ПМИД 9017839 .
Гейер М., Факлер О.Т., Петерлин Б.М. (2001). «Структурно-функциональные взаимоотношения при ВИЧ-1 Nef» . Представитель ЭМБО . 2 (7): 580–5. doi : 10.1093/embo-reports/kve141 . ПМЦ 1083955 . ПМИД 11463741 .
Дуден Р., Гриффитс Г., Фрэнк Р. и др. (1991). «Бета-COP, белок массой 110 кД, связанный с везикулами, не покрытыми клатрином, и комплексом Гольджи, демонстрирует гомологию с бета-адаптином». Клетка . 64 (3): 649–65. дои : 10.1016/0092-8674(91)90248-W . ПМИД 1840503 . S2CID 54293222 .
Уотерс М.Г., Серафини Т., Ротман Дж.Е. (1991). « Коатомер»: цитозольный белковый комплекс, содержащий субъединицы не покрытых клатрином транспортных везикул Гольджи». Природа . 349 (6306): 248–51. Бибкод : 1991Natur.349..248W . дои : 10.1038/349248a0 . ПМИД 1898986 . S2CID 4342145 .
Оркл Л., Палмер Д.Д., Амхердт М., Ротман Дж.Э. (1993). «Сборка покрытых оболочкой пузырьков в аппарате Гольджи требует только коатомера и белков ARF из цитозоля». Природа . 364 (6439): 732–4. Бибкод : 1993Natur.364..732O . дои : 10.1038/364732a0 . ПМИД 8355790 . S2CID 4348442 .
Аниенто Ф, Гу Ф, Партон Р.Г., Грюнберг Дж (1996). «Эндосомальный бета-КОП участвует в рН-зависимом образовании транспортных везикул, предназначенных для поздних эндосом» (PDF) . Дж. Клеточная Биол . 133 (1): 29–41. дои : 10.1083/jcb.133.1.29 . ПМК 2120778 . ПМИД 8601610 .
Лоу М., Крейс Т.Е. (1997). «Сборка коатомера, предшественника покрытия COP-I, in vivo» . Ж. Биол. Хим . 271 (48): 30725–30. дои : 10.1074/jbc.271.48.30725 . ПМИД 8940050 .
Хансен К., Рённстранд Л., Рорсман С. и др. (1997). «Ассоциация коатомерных белков с бета-рецептором фактора роста тромбоцитов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 235 (3): 455–60. дои : 10.1006/bbrc.1997.6821 . ПМИД 9207175 .
Павел Дж., Хартер С., Виланд Ф.Т. (1998). «Обратимая диссоциация коатомера: функциональная характеристика подкомплекса белка β/δ-оболочки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (5): 2140–5. Бибкод : 1998PNAS...95.2140P . дои : 10.1073/pnas.95.5.2140 . ЧВК 19276 . ПМИД 9482852 .
Пиге В., Гу Ф., Фоти М. и др. (1999). «Nef-индуцированная деградация CD4: основанный на двухкислотной основе мотив в Nef действует как сигнал лизосомального нацеливания посредством связывания бета-COP в эндосомах» . Клетка . 97 (1): 63–73. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80715-1 . ПМИД 10199403 . S2CID 14793848 .
Чжао Л., Хелмс Дж.Б., Бруннер Дж., Виланд Ф.Т. (1999). «GTP-зависимое связывание фактора ADP-рибозилирования с коатомером в непосредственной близости от сайта связывания мотивов извлечения дилизина и p23» . Ж. Биол. Хим . 274 (20): 14198–203. дои : 10.1074/jbc.274.20.14198 . ПМИД 10318838 .
Фишер К.Д., Хелмс Дж.Б., Чжао Л., Виланд Ф.Т. (2000). «Сайт-специфическое фотосшивание для исследования взаимодействий Arf1 с белками, участвующими в отпочковывании везикул COPI». Методы . 20 (4): 455–64. дои : 10.1006/meth.2000.0958 . ПМИД 10720466 .
Аллан Б.Б., Мойер Б.Д., Балч МЫ (2000). «Включение Rab1 p115 в комплекс цис-SNARE: программирование почкующихся везикул COPII для слияния». Наука . 289 (5478): 444–8. Бибкод : 2000Sci...289..444A . дои : 10.1126/science.289.5478.444 . ПМИД 10903204 .
Югстер А., Фригерио Г., Дейл М., Дуден Р. (2000). «Домены COP I, необходимые для целостности коатомера, и новые взаимодействия с ARF и ARF-GAP» . ЭМБО Дж . 19 (15): 3905–17. дои : 10.1093/emboj/19.15.3905 . ПМК 306616 . ПМИД 10921873 .
Салливан Б.М., Харрисон-Лавуа К.Дж., Маршанский В. и др. (2000). «RGS4 и RGS2 связывают коатомер и ингибируют ассоциацию COPI с мембранами Гольджи и внутриклеточным транспортом» . Мол. Биол. Клетка . 11 (9): 3155–68. дои : 10.1091/mbc.11.9.3155 . ПМК 14982 . ПМИД 10982407 .
Футацумори М., Касаи К., Такацу Х. и др. (2001). «Идентификация и характеристика новых изоформ субъединиц COP I». Дж. Биохим . 128 (5): 793–801. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022817 . ПМИД 11056392 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома COPB1 и страница сведений о гене COPB1 в браузере генома UCSC .
PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для бета-версии субъединицы Mouse Coatomer.

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000129083 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030754 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7982906-5] Бенишу С., Бомсель М., Бодеус М., Дюран Х., Доут М., Летурнер Ф., Камонис Дж., Бенарус Р. (декабрь 1994 г.). «Физическое взаимодействие белка Nef ВИЧ-1 с бета-COP, компонентом везикул, не покрытых клатрином, необходимым для мембранного транспорта» . J Биол Хим . 269 (48): 30073–6. дои : 10.1016/S0021-9258(18)43773-8 . ПМИД 7982906 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]