СИТ13

СИТ13
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1WFM
Идентификаторы
Псевдонимы	SYT13 , синаптотагмин 13
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 607716 ; МГИ : 1933945 ; Гомологен : 10823 ; Генные карты : SYT13 ; OMA : SYT13 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	45,286,341 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	92,786,403 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; Brodmann area 23; ; endothelial cell; ; lateral nuclear group of thalamus; ; islet of Langerhans; ; pons; ; Pars compacta; ; superior frontal gyrus; ; postcentral gyrus; ; entorhinal cortex;
	Top expressed in
	islet of Langerhans; ; medial dorsal nucleus; ; habenula; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; visual cortex; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; primary visual cortex; ; central gray substance of midbrain; ; medial geniculate nucleus; ; ventral tegmental area;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	calcium-dependent phospholipid binding; clathrin binding; calcium ion binding; syntaxin binding; SNARE binding; phosphatidylserine binding;
Cellular component	integral component of membrane; integral component of plasma membrane; transport vesicle; intracellular membrane-bounded organelle; membrane; plasma membrane; presynapse; synapse; exocytic vesicle;
Biological process	vesicle-mediated transport; vesicle fusion; regulation of calcium ion-dependent exocytosis; calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter; regulation of dopamine secretion; synaptic vesicle exocytosis; calcium-ion regulated exocytosis; cellular response to calcium ion;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	57586
	80976
	ENSG00000019505
	ENSMUSG00000027220
	Q7L8C5
	Q9EQT6
	НМ_020826 ; НМ_001247987
	НМ_030725
	НП_001234916 ; НП_065877
	НП_109650
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Синаптотагмин-13 — это белок , который у человека кодируется SYT13 геном . ^[5]^[6]

Функция

SYT13 принадлежит к большому семейству белков синаптотагмина. Все синаптотагмины имеют топологию мембраны типа I с внеклеточным N-концом, единственной трансмембранной областью и цитоплазматическим С-концом, содержащим тандемные домены C2. Основные функции синаптотагминов включают везикулярный транспорт, экзоцитоз и секрецию. [предоставлено OMIM] ^[6]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000019505 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027220 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фукуда М., Микосиба К. (март 2001 г.). «Характеристика белка KIAA1427 как атипичного синаптотагмина (Syt XIII)» . Биохимический журнал . 354 (Часть 2): 249–57. дои : 10.1042/0264-6021:3540249 . ПМК 1221650 . ПМИД 11171101 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: синаптотагмин XIII SYT13» .

Дальнейшее чтение

Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О (февраль 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 7 (1): 65–73. дои : 10.1093/dnares/7.1.65 . ПМИД 10718198 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Отчеты ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Крэкстон М. (сентябрь 2001 г.). «Геномный анализ генов синаптотагмина». Геномика . 77 (1–2): 43–9. дои : 10.1006/geno.2001.6619 . ПМИД 11543631 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q7L8C5 (Human Synaptotagmin-13 (SYT13)) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000019505 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027220 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11171101-5] Фукуда М., Микосиба К. (март 2001 г.). «Характеристика белка KIAA1427 как атипичного синаптотагмина (Syt XIII)» . Биохимический журнал . 354 (Часть 2): 249–57. дои : 10.1042/0264-6021:3540249 . ПМК 1221650 . ПМИД 11171101 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: синаптотагмин XIII SYT13» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]