SNAP29

SNAP29
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4WY4
Идентификаторы
Псевдонимы	SNAP29 , CEDNIK, SNAP-29, синаптосом-ассоциированный белок 29 кДа, синаптосом-ассоциированный белок 29
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 604202 ; МГИ : 1914724 ; Гомологен : 3512 ; GeneCards : SNAP29 ; OMA : SNAP29 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	20,891,214 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	17,248,691 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; gonad; ; buccal mucosa cell; ; monocyte; ; tendon of biceps brachii; ; islet of Langerhans; ; gastrocnemius muscle; ; stromal cell of endometrium; ; liver;
	Top expressed in
	zygote; ; spermatocyte; ; secondary oocyte; ; muscle of thigh; ; gastrula; ; spermatid; ; granulocyte; ; esophagus; ; yolk sac; ; blood;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	SNAP receptor activity; protein binding; syntaxin binding;
Cellular component	cytoplasm; centrosome; Golgi apparatus; cell projection; membrane; plasma membrane; cilium; autophagosome membrane; SNARE complex; ciliary membrane; ciliary pocket membrane; cytoplasmic vesicle; presynapse; Golgi membrane; nucleoplasm; autophagosome; cytosol; azurophil granule membrane; synapse;
Biological process	vesicle targeting; synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane; membrane fusion; autophagy; autophagosome maturation; cell projection organization; synaptic vesicle priming; protein transport; exocytosis; autophagosome membrane docking; neutrophil degranulation; cilium assembly; vesicle fusion;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	9342
	67474
	ENSG00000099940
	ENSMUSG00000022765
	О95721
	Q9ERB0
	НМ_004782
	НМ_023348
	НП_004773
	НП_075837
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Синаптосомально-ассоциированный белок 29 — это белок , который у человека кодируется SNAP29 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген, член семейства генов SNAP25, кодирует белок, участвующий в нескольких этапах мембранного транспорта. Два других члена этого семейства генов, SNAP23 и SNAP25, кодируют белки, которые связывают белок синтаксин и опосредуют стыковку мембраны синаптических везикул и слияние с плазматической мембраной. Белок, кодируемый этим геном, прочно связывается с множеством синтаксинов и локализуется во внутриклеточных мембранных структурах, а не в плазматической мембране. Хотя белок в основном связан с мембраной, значительная его часть находится в цитоплазме в свободном виде. Для этого гена было отмечено использование множественных сайтов полиаденилирования. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что SNAP29 взаимодействует с синтаксином 3. ^[5] и ЭГД1 . ^[8]

Было показано, что SNAP29 взаимодействует с вирусной протеазой 3C CVB3 и EV-D68. ^[9]^[10]

См. также

Синдром ЦЕДНИКА

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000099940 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022765 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж.С., Хуан Б., Шен М., Ю С., Ло Й., Шеллер Р.Х. (январь 1999 г.). «Три новых белка семейства синтаксинов/SNAP-25» . J Биол Хим . 273 (51): 34171–9. дои : 10.1074/jbc.273.51.34171 . ПМИД 9852078 .
^ Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнскоу Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: синаптосомально-ассоциированный белок SNAP29, 29 кДа» .
^ Ротем-Йегудар Р., Гальперин Э., Горовиц М. (август 2001 г.). «Ассоциация рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 с EHD1 и SNAP29» . Ж. Биол. Хим . 276 (35): 33054–60. дои : 10.1074/jbc.M009913200 . ПМИД 11423532 .
^ Мохамуд, Ясир; Ши, Джуньян; Цюй, Джуньян; Пун, Так; Сюэ, Юань Чао; Дэн, Хаоюй; Чжан, Цзинчунь; Ло, Хунлинь (20 марта 2018 г.). «Энтеровирусная инфекция подавляет аутофагический поток посредством разрушения комплекса SNARE для усиления репликации вируса» . Отчеты по ячейкам . 22 (12): 3292–3303. дои : 10.1016/j.celrep.2018.02.090 . ISSN 2211-1247 . ПМИД 29562184 .
^ Корона, Эбигейл К.; Солсбери, Холли М.; Корона Веласкес, Анхель Ф.; Джексон, Уильям Т. (20 марта 2018 г.). «Энтеровирусы реконструируют аутофагический трафик посредством регуляции белков SNARE хозяина, чтобы способствовать репликации вируса и выходу клеток» . Отчеты по ячейкам . 22 (12): 3304–3314. дои : 10.1016/j.celrep.2018.03.003 . ISSN 2211-1247 . ПМЦ 5894509 . ПМИД 29562185 .

Дальнейшее чтение

Вонг С.Х., Сюй Ю., Чжан Т., Гриффитс Г., Лоу С.Л., Субраманиам В.Н., Сеоу К.Т., Хонг В. (1999). «GS32, новый SNARE Гольджи массой 32 кДа, преимущественно взаимодействует с синтаксином 6» . Мол. Биол. Клетка . 10 (1): 119–34. дои : 10.1091/mbc.10.1.119 . ПМЦ 25158 . ПМИД 9880331 .
Весы С.Дж., Чен Ю.А., Ю Б.И., Патель С.М., Дунг Ю.К., Шеллер Р.Х. (2000). «SNARE способствуют специфичности слияния мембран» . Нейрон . 26 (2): 457–64. дои : 10.1016/S0896-6273(00)81177-0 . ПМИД 10839363 .
Ротем-Йегудар Р., Гальперин Э., Горовиц М. (2001). «Ассоциация рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 с EHD1 и SNAP29» . Ж. Биол. Хим . 276 (35): 33054–60. дои : 10.1074/jbc.M009913200 . ПМИД 11423532 .
Хоэнштайн AC, Рош PA (2001). «SNAP-29 представляет собой беспорядочную SNARE, связывающую синтаксис». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 285 (2): 167–71. дои : 10.1006/bbrc.2001.5141 . ПМИД 11444821 .
Су Ц, Мочида С., Тянь Дж. Х., Мехта Р., Шэн Ч. Ж. (2002). «SNAP-29: общий белок SNARE, который ингибирует разборку SNARE и участвует в синаптической передаче» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (24): 14038–43. дои : 10.1073/pnas.251532398 . ПМК 61163 . ПМИД 11707603 .
Мартинес-Арка С., Радж Р., Вакка М., Рапозо Г., Камонис Дж., Пру-Жиллардо В., Давиет Л., Формстехер Э., Гамбургер А., Филиппини Ф., Д'Эспозито М., Галли Т. (2003). «Двойной механизм, контролирующий локализацию и функцию экзоцитарных v-SNARE» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 100 (15): 9011–6. Бибкод : 2003PNAS..100.9011M . дои : 10.1073/pnas.1431910100 . ПМК 166429 . ПМИД 12853575 .
Сюй Ю, Ши Х, Вэй С, Вонг Ш, Хун В (2005). «Взаимоисключающие взаимодействия EHD1 с GS32 и синдапином II» . Мол. Член Биол . 21 (4): 269–77. дои : 10.1080/09687680410001716871 . ПМИД 15371016 . S2CID 22820496 .
Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А., Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб Ю., Хакл Э. Дж., Беар Д. М., Данэм I (2005). «Подход к клонированию ORFeome человека на основе аннотаций генома» . Геном Биол . 5 (10): Р84. дои : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . ПМК 545604 . ПМИД 15461802 .
Пан П.Ю., Цай Ц., Линь Л., Лу П.Х., Дуань С., Шэн Ч.Ж. (2005). «SNAP-29-опосредованная модуляция синаптической передачи в культивируемых нейронах гиппокампа» . Ж. Биол. Хим . 280 (27): 25769–79. дои : 10.1074/jbc.M502356200 . ПМК 1864940 . ПМИД 15890653 .
Спречер Э, Исида-Ямамото А, Мизрахи-Корен М, Рапапорт Д, Голдшер Д, Индельман М, Топаз О, Чефец И, Керен Х, О'Брайен ТДж, Беркович Д, Шалев С, Гейгер Д, Бергман Р, Горовиц М , Мандель Х (2005). «Мутация в SNAP29, кодирующем белок SNARE, участвующий во внутриклеточном транспорте, вызывает новый нейрокожный синдром, характеризующийся церебральной дисгенезией, нейропатией, ихтиозом и ладонно-подошвенной кератодермией» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 77 (2): 242–51. дои : 10.1086/432556 . ПМЦ 1224527 . ПМИД 15968592 .
Кэрролл Дж.С., Лю XS, Бродский А.С., Ли В., Мейер К.А., Шари А.Дж., Экхаут Дж., Шао В., Хестерманн Е.В., Гейстлингер Т.Р., Фокс Э.А., Сильвер П.А., Браун М. (2005). «По всей хромосоме картирование связывания рецепторов эстрогена показывает долгосрочную регуляцию, требующую наличия белка FoxA1» . Клетка . 122 (1): 33–43. дои : 10.1016/j.cell.2005.05.008 . ПМИД 16009131 . S2CID 16841542 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O95721 (синаптосомально-ассоциированный белок 29) на PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000099940 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022765 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9852078-5] Перейти обратно: ^а ^б Стигмайер М., Ян Б., Ю Дж.С., Хуан Б., Шен М., Ю С., Ло Й., Шеллер Р.Х. (январь 1999 г.). «Три новых белка семейства синтаксинов/SNAP-25» . J Биол Хим . 273 (51): 34171–9. дои : 10.1074/jbc.273.51.34171 . ПМИД 9852078 .

[pmid10591208-6] Данхэм И, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж.Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Клэмп М., Сминк Л.Дж., Эйнскоу Р., Алмейда Дж.П., Бэббидж А., Бэггули С., Бэйли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК 22 хромосомы человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. Бибкод : 1999Natur.402..489D . дои : 10.1038/990031 . ПМИД 10591208 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: синаптосомально-ассоциированный белок SNAP29, 29 кДа» .

[pmid11423532-8] Ротем-Йегудар Р., Гальперин Э., Горовиц М. (август 2001 г.). «Ассоциация рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 с EHD1 и SNAP29» . Ж. Биол. Хим . 276 (35): 33054–60. дои : 10.1074/jbc.M009913200 . ПМИД 11423532 .

[9] Мохамуд, Ясир; Ши, Джуньян; Цюй, Джуньян; Пун, Так; Сюэ, Юань Чао; Дэн, Хаоюй; Чжан, Цзинчунь; Ло, Хунлинь (20 марта 2018 г.). «Энтеровирусная инфекция подавляет аутофагический поток посредством разрушения комплекса SNARE для усиления репликации вируса» . Отчеты по ячейкам . 22 (12): 3292–3303. дои : 10.1016/j.celrep.2018.02.090 . ISSN 2211-1247 . ПМИД 29562184 .

[10] Корона, Эбигейл К.; Солсбери, Холли М.; Корона Веласкес, Анхель Ф.; Джексон, Уильям Т. (20 марта 2018 г.). «Энтеровирусы реконструируют аутофагический трафик посредством регуляции белков SNARE хозяина, чтобы способствовать репликации вируса и выходу клеток» . Отчеты по ячейкам . 22 (12): 3304–3314. дои : 10.1016/j.celrep.2018.03.003 . ISSN 2211-1247 . ПМЦ 5894509 . ПМИД 29562185 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]