Не сортировать

Сортирующий нексин, N-концевой домен
Сортирующий нексин, N-концевой домен
Идентификаторы
Символ	Не вводить сортировку
Пфам	PF03700
ИнтерПро	ИПР005329
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

PX-домен
PX-домен
	Структура домена PX p40(phox), связанного с фосфатидилинозитол-3-фосфатом.
Идентификаторы
Символ	ПХ
Пфам	PF00787
ИнтерПро	ИПР001683
УМНЫЙ	ПХ
PROSITE	PDOC50195
СКОП2	1ч6ч / СКОПе / СУПФАМ
Суперсемейство OPM	57
белок OPM	4на3
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Терминал Vps5 C (домен BAR)

Идентификаторы

Символ

Впс5

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Сортировка нексина, C-концевой домен

Идентификаторы

Символ

Нексин_С

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

WASP-связывающий домен белка сортирующего нексина

Идентификаторы

Символ

БАР3-ОСА

Пфам

ПФ10456

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Сортирующие нексины представляют собой большую группу белков, которые локализованы в цитоплазме и обладают потенциалом к мембранной ассоциации либо через свой липидсвязывающий PX-домен ( фосфолипид -связывающий мотив ), либо посредством белок-белковых взаимодействий с мембраносвязанными белковыми комплексами. ^[2]^[3] Было показано, что некоторые члены этого семейства облегчают сортировку белков .

Члены семьи

У человека сортирующие нексины транскрибируются со следующих генов:

Гены	Состав домена
Гены	N-конец	Средний-1	Середина-2	Средний-3	C-терминал
SNX1 , SNX2	Сортировка_следующий_N	–	ПХ	–	БАР ^[4] (Впс5)
SNX4 , SNX7 , SNX8 , SNX30	–	–	ПХ	–	БАР ^[4] (Всп5)
SNX5 , SNX6 , SNX32	–	–	ПХ	–	БАР ^[4]
SNX9 , SNX18 , SNX33	SH3	–	ПХ	–	БАР ^[4] (BAR_3_WASP_bdg) ^[5]
SNX13 , SNX14 , SNX19 , SNX25	ПХА ^[6]	РГО	ПХ	–	Нексин_С
SNX15	–	–	ПХ	–	С ^[7]
SNX17 , SNX31	–	–	ПХ	ДА ^[8]	ФЕРМ_М ^[9]
SNX23	kinesin_motor	SMAD_FHA ^[10]	ПХ	–	–
SNX26	–	–	ПХ	SH3	РоГАП
SNX27	ПДЗ	–	ПХ	-	ФЕРМ_М ^[9]
SNX28	–	–	ПХ	SH3	SH3
SNX3 , SNX10 , SNX11 , SNX12 , SNX16 , SNX20 , SNX21 , SNX22 , SNX24 , SNX29	–	–	ПХ	–	–

Структура

Сортирующие нексины либо состоят исключительно из домена PX (например, SNX3), либо имеют модульную структуру, состоящую из PX и дополнительных доменов .

Подгруппа сортирующих нексинов (включающая у человека SNX1, SNX2, SNX4, SNX5, SNX6, SNX7, SNX8, SNX9, SNX18, SNX30, SNX32 и SNX33) обладает доменом BAR на своем С-конце. (Домен BAR SNX 1, 2, 4, 7, 8 и 30 классифицируется pfam как «концевой C-концевой Vps5».)

Пример доменной структуры сортирующего нексина для SNX1 можно увидеть здесь:

NTD – N-концевой домен
PX-домен
CTD – С-концевой BAR-домен

Ссылки

^ Браво Дж., Каратанассис Д., Паколд С.М. и др. (октябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура домена PX из p40 (phox), связанного с фосфатидилинозитол-3-фосфатом» . Мол. Клетка . 8 (4): 829–39. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00372-0 . ПМИД 11684018 .
^ Диксон Дж. Э., Уорби, Калифорния (2002). «Выяснение клеточных функций сортировки нексинов». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 3 (12): 919–931. дои : 10.1038/nrm974 . ПМИД 12461558 . S2CID 36361630 .
^ Уорби Калифорния, Диксон Дж. Э. (2002). «Выяснение клеточных функций сортировки нексинов». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 3 (12): 919–31. дои : 10.1038/nrm974 . ПМИД 12461558 . S2CID 36361630 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Фрост А., Унгер В.М., Де Камилли П. (апрель 2009 г.). «Суперсемейство доменов BAR: макромолекулы, образующие мембраны» . Клетка . 137 (2): 191–196. дои : 10.1016/j.cell.2009.04.010 . ПМЦ 4832598 . ПМИД 19379681 .
^ BAR_3_WASP_bdg: WASP-связывающий домен белка сортирующего нексина, Pfam PF10456
^ PXA: Домен PXA, Pfam PF02194
^ MIT: домен MIT (взаимодействие и транспорт микротрубочек), Pfam PF04212
^ RA: Домен ассоциации Ras (RalGDS/AF-6), Pfam PF00788
^ Jump up to: ^а ^б FERM_M: центральный домен FERM, Pfam PF00373.
^ SMAD_FHA: домен SMAD/FHA, InterPro : IPR008984

Внешние ссылки

Сортировка + нексины в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid11684018-1] Браво Дж., Каратанассис Д., Паколд С.М. и др. (октябрь 2001 г.). «Кристаллическая структура домена PX из p40 (phox), связанного с фосфатидилинозитол-3-фосфатом» . Мол. Клетка . 8 (4): 829–39. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00372-0 . ПМИД 11684018 .

[PUB00010010-2] Диксон Дж. Э., Уорби, Калифорния (2002). «Выяснение клеточных функций сортировки нексинов». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 3 (12): 919–931. дои : 10.1038/nrm974 . ПМИД 12461558 . S2CID 36361630 .

[3] Уорби Калифорния, Диксон Дж. Э. (2002). «Выяснение клеточных функций сортировки нексинов». Нат. Преподобный мол. Клеточная Биол . 3 (12): 919–31. дои : 10.1038/nrm974 . ПМИД 12461558 . S2CID 36361630 .

[pmid19379681-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Фрост А., Унгер В.М., Де Камилли П. (апрель 2009 г.). «Суперсемейство доменов BAR: макромолекулы, образующие мембраны» . Клетка . 137 (2): 191–196. дои : 10.1016/j.cell.2009.04.010 . ПМЦ 4832598 . ПМИД 19379681 .

[BAR_3_WASP_bdg-5] BAR_3_WASP_bdg: WASP-связывающий домен белка сортирующего нексина, Pfam PF10456

[PXA-6] PXA: Домен PXA, Pfam PF02194

[MIT-7] MIT: домен MIT (взаимодействие и транспорт микротрубочек), Pfam PF04212

[RA-8] RA: Домен ассоциации Ras (RalGDS/AF-6), Pfam PF00788

[FERM_M-9] Jump up to: ^а ^б FERM_M: центральный домен FERM, Pfam PF00373.

[SMAD_FHA-10] SMAD_FHA: домен SMAD/FHA, InterPro : IPR008984

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

v т и Сортировка нексинов
SNX-BAR	SNX1 SNX2 SNX4 SNX5 SNX6 SNX7 SNX8 SNX9 SNX18 SNX30 SNX32 SNX33
SNX-PX	SNX3 SNX10 SNX11 SNX12 SNX16 SNX20 SNX21 SNX22 SNX24 SNX29
SNX-Other	SNX13 SNX14 SNX15 SNX17 SNX19 SNX23 SNX25 SNX26 SNX27 SNX28 SNX31
Related articles	PX domain BAR domain Retromer