SNX2

SNX2
Идентификаторы
Псевдонимы	SNX2 , TRG-9, сортировка Nexin 2
Внешние идентификаторы	Омим : 605929 ; MGI : 1915054 ; Гомологен : 2332 ; GeneCards : SNX2 ; OMA : SNX2 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 5 (human) Band 5q23.2 Start 122,775,079 bp End 122,834,543 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 18 (mouse) Band 18|18 D1 Start 53,309,388 bp End 53,353,937 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in monocyte Achilles tendon islet of Langerhans ventricular zone gallbladder rectum ganglionic eminence Descending thoracic aorta popliteal artery tibial arteries Top expressed in blastocyst yolk sac spleen sciatic nerve placenta morula morula olfactory epithelium uterus stomach More reference expression data BioGPS More reference expression data
showДжин Онтология Molecular function protein homodimerization activity insulin receptor binding leptin receptor binding epidermal growth factor receptor binding protein binding phosphatidylinositol binding protein heterodimerization activity transferrin receptor binding lipid binding cadherin binding Cellular component cytoplasm cell projection early endosome membrane membrane retromer, tubulation complex retromer complex endosome membrane lamellipodium extrinsic component of membrane cytosol lysosome endosome protein-containing complex Biological process endocytosis vesicle organization early endosome to Golgi transport retrograde transport, endosome to Golgi protein complex oligomerization protein transport intracellular protein transport lamellipodium morphogenesis Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6643 67804 Набор ENSG00000205302 Ensmusg00000034484 Uniprot O60749 Q9CWK8 Refseq (мРНК) NM_003100 NM_001278199 NM_026386 NM_001357463 Refseq (белок) NP_001265128 NP_003091 NP_080662 NP_001344392 Расположение (UCSC) Chr 5: 122,78 - 122,83 МБ CHR 18: 53,31 - 53,35 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Сортировка Nexin-2 -это белок , который у людей кодируется SNX2 геном .

Функция

Этот ген кодирует члена семейства сортировки Nexin . Члены этого семейства содержат домен PHOX (PX), который представляет собой домен связывания фосфоинозитида и участвует во внутриклеточном транспорте. Этот белок ассоциируется с форман-связывающим белком 17, но его функция неизвестна. Этот белок может образовывать олигомерные комплексы с членами семьи.

Взаимодействия

Было показано, что SNX2 взаимодействует с FNBP1 .

Дальнейшее чтение

• Maruyama K, Sugano S (январь 1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID   8125298 .
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (октябрь 1997 г.). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID   9373149 .
• Haft CR, De la Luz Sierra M, Bafford R, Lesniak MA, Barr Va, Taylor Si (Dec 2000). «Ортологи человека из дрожжевых вакуолярных белков, сортирующих белки VPS26, 29 и 35: сборка в мультимерные комплексы» . Молекулярная биология клетки . 11 (12): 4105–16. doi : 10.1091/mbc.11.12.4105 . PMC   15060 . PMID   11102511 .
• Паркс В.Т., Фрэнк Д.Б., Хафф С., Ренфру Хэфт С., Мартин Дж., Мэн Х, де Каестекер М.П., ​​МакНалли Дж.Г., Редди А., Тейлор С.И., Робертс А.Б., Ван Т., Лехлейдер Р.Дж. (июнь 2001 г.). «Сортировка Nexin 6, новая SNX, взаимодействует с трансформирующим семейством фактора роста-бета-рецептора серино-треонинкиназ» . Журнал биологической химии . 276 (22): 19332–9. doi : 10.1074/jbc.m100606200 . PMID   11279102 .
• Fuchs U, Rehkamp G, Haas Oa, Slany R, Kōnig M, Bojesen S, Bohle RM, Damm-Welk C, Ludwig WD, Harbott J, Borkhardt A (Jul 2001). «Связывающий лифрамный белок человека 17 (FBP17) взаимодействует с сортировкой Nexin, SNX2 и является партнером MLL-фьюжн при остром миелогенном лейкозе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (15): 8756–61. Bibcode : 2001pnas ... 98.8756f . doi : 10.1073/pnas.121433898 . PMC   37508 . PMID   11438682 .
• Teasdale RD, Loci D, Houghton F, Karlsson L, Gleeson PA (август 2001 г.). «Большое семейство эндосомы-локализованных белков, связанных со сортировкой Nexin 1» . Биохимический журнал . 358 (Pt 1): 7–16. doi : 10.1042/0264-6021: 3580007 . PMC   1222026 . PMID   11485546 .
• Fuchs U, Rehkamp GF, Slany R, Follo M, Borkhardt A (ноябрь 2003 г.). «Связывающий форман белок 17, FBP17, связывается через мотиву связывания TNKS с танковой картой, белок, участвующий в поддержании теломер». Письма Febs . 554 (1–2): 10–6. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 01063-9 . PMID   14596906 . S2CID   19552309 .
• Gullapalli A, Garrett TA, Paing MM, Griffin CT, Yang Y, Trejo J (май 2004). «Роль сортировки нексина 2 в понижении рецептора эпидермального фактора роста: доказательства различных функций сортировки нексина 1 и 2 при транспортировке белка» . Молекулярная биология клетки . 15 (5): 2143–55. doi : 10.1091/mbc.e03-09-0711 . PMC   404011 . PMID   14978220 .
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC   514446 . PMID   15302935 .
• Schaaf CP, Benzing J, Schmitt T, ERZ DH, Tewes M, Bartram CR, Janssen JW (февраль 2005 г.). «Новые партнеры по взаимодействию TPR/MET Тирозинкиназы» . FASEB Journal . 19 (2): 267–9. doi : 10.1096/fj.04-1558fje . PMID   15546961 . S2CID   17142907 .
• Абдул-Гани М., Хартман К.Л., Нгсее Дж.К. (июль 2005). «Abstrakt взаимодействует и регулирует выражение сортировки Nexin-2» . Журнал клеточной физиологии . 204 (1): 210–8. doi : 10.1002/jcp.20285 . PMC   2963638 . PMID   15690390 .
• Carlton JG, Bujny MV, Peter BJ, Oorschot VM, Rutherford A, Arkell RS, Klumperman J, McMahon HT, Cullen PJ (октябрь 2005 г.). «Сортировка Nexin-2 связана с трубчатыми элементами ранней эндосомы, но не является необходимой для ретромеров-опосредованного транспорта эндосомы к TGN» . Журнал сотовой науки . 118 (Pt 19): 4527–39. doi : 10.1242/jcs.02568 . PMC   1904489 . PMID   16179610 .
• Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (октябрь 2006 г.). «Основанный на вероятности подход для высокопроизводительного анализа фосфорилирования белка и локализации сайта». Nature Biotechnology . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID   16964243 . S2CID   14294292 .
• Rojas R, Kametaka S, Haft CR, Bonifacino JS (февраль 2007 г.). «Взаимозаменяемые, но важные функции SNX1 и SNX2 в ассоциации ретромеров с эндосомами и транспортировкой маннозы 6-фосфатных рецепторов» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (3): 1112–24. doi : 10.1128/mcb.00156-06 . PMC   1800681 . PMID   17101778 .
• Skånland SS, Wälchli S, Utskarpen A, Wandinger-Aness A, Sandvig K (март 2007 г.). «Фосфоинозитид-регулируемый ретроградный транспорт рицина: перекрестные помехи между HVPS34 и сортировкой нексинов». Трафик . 8 (3): 297–309. doi : 10.1111/j.1600-0854.2006.00527.x . HDL : 10852/11339 . PMID   17319803 . S2CID   21600584 .